HG10000438 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10000438
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionF-box domain-containing protein
LocationChr09: 5148980 .. 5156164 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10000438
SyntenyHG10000438
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAGTTTTCACGTTTGGTAGAAGTGGAACCAACCGGTGGAAGCATCTGGACTGCTTGCCTTTTATCATCTACACTGACGGTGCTTACTTGAATGGAGTCATCTATTGGATGGGACAAGTAAAACAAGACGAGTTTTTGATTTATGCTCTTGATGTTGAAACTGAAAAAATTGAATTCATTGCAACCTTAGAAGTTGGCCCTAACTCAAGGTACGGGAAAATTCAGACGTTTAATTCCACCATTTATGCAATTATTATTATGTTCACAACACGTAGTCAAGTTCAACTGTGGAGGATGCAACACAAAGATTCATGGATTAGAGAATTTGTTATTGATGACTTACCGAATAATAGGCTGAATGGATTCTTTCACCTTATTAAGCCCTTTGAAGATGGCGGGATATTATTTTTTACTAATGGATACTTATTTTACTTGGATAAAACTGGGAAGAAGATCAAGATAAAAACATTACTCAATCCATATTCATACAAGACAGAGCTTACAGCAGTTTGTTGTATGGATGAATCTTTGAATTTTAGTTCTCTCCCAACAATTTTGTCCGGAGATGATGGATGCTCTTTCCTAAATTTGTTTAAGGTGAGAAGATTAGATTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTGGGTTTTCGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTGGTTTGTTTGAAGAAACTATGTTCAACCAATCAAGGGTAAGTCTGTGGTTAAGTGGCAAATGATTCAGGATTCTCATTAAAGATGTTTGTTTCTTTTTATTATTACTTTTTTCAATTAATATATTTAGATATTGTTTTGAATTCCAAAGATTTTTCGAGTGTTTTTTTTCTTTTATTTTGATTTATTTTAAATATATATAGATATAGATATTGTTTTTGTAGCACGTATATATATCTTTTAACTCATTATTTACGTGCTACAAAACAATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATCATCGTAATTTTTAAATACACTTCATAATAACAAATCTCATAGAAGTGAAAGATCATGTTAATTTACAAAATTATTATATTGATAGTAATTTAATAATATTAAGAAATTATTTGAATGAATTATTGTAAAACCATTATTCTACCCATTTAATTTGATACTCGTATGTTACAAAAATATGACAACAAAGGTAGATTGATTAGTATGGAGTGTTAAAGAAAGTTTTCAAAACCAATTTTAAACCCTTAAATAAATGATAATTTTTTATATTATATAATTGAGAATGGTTAACATCGTCCAAAAAAAGATATTTCTTCTATATTCGTATACTACACATCGTTATTTTAGTGGTGTATGTGGAGAATAAATGAAAATCATATTGTTGTTGATTTTGTGTATTTATTTGTTAACTTAATTTTGTATTGATGATTCACTTTATTGTAAGAGTTTTTTTAAAAAAAAATTAATAACAATATTGAGAGATAGAGGATACAAAGGGTTATTCCAATTGTTTACCTTATTAAAAGGTAAAAAAAAAAAAAATTGAACTTCCAAAACCATTCAAATTTTCTCACATTAATTTTCTCAAACCAATCCGAACCGATCCATTGGTTTGGTTTGATTTGGTTTTTTAGAATAAAATTAGACGTATTGGTTTTTATTTAGAGAAAACCAAAAAGTATTGGTTCAAATCGGATTTTAATTGGAAAAATCAATCAAAACCGAACCAAACCGAAGCCATGTATACTTTTAAAAATAAACTCTAACAATATTAGGTATTTTTTAGTGTTTTAATTATTATGGTGCAAATATATTTATTGTTTAGAGCAAAGATCAATTATTATGTAGTGTGTATGATATTTATTTAGAAAGTATCCGGAAAAAAAAATATCCAATTTCAATCTATAAAAAAAGAAATGGACCAAATTTTAATTTAAAATTAACAAAAATGACCAGTTCAAAATAAAATTGGAAATAAAATTAAAATTTGGAAGAAAAAAATGTCAAAATTGAAAATCAAATCGATAATAAACCAAACCAAATTTTTATTTAATTTGGTTCTTGGTTGACCCCAAATCCAACCGGAATTGAACCAACCATTACCCCTAATTCGAGATAATGAGTTTGTTGATAATGTTTTTCTTTGCTTTCTAATAAAATTATTGTTTACTGAATTAATTTTAGAAAATCGTAATGAAATTTAGTTGGCACAAAAAATAATCTTGAAAATCGTATATGGGACATTTAAAATTTCGAGTCTGTTTCAGAGTGATTTTAAAATTGTTAAAATCATTTTTATCATGTTTAAAATCACACTTTAATCACTAAAAATTAATTTAATTTTTAATTTTACACTTTGAAAGGCAATTTTCAATCATCAAAATTAATTTTGAAGGATTAAAAATATATTTCTCGATGATTTTAAAAATGACAAAAATTAATTTTAGCTATTTTAAAATTACTCCCAAACATGCTGGACACTAAATTTAGCTAGAAAAAAAAATAGTACATATATGTTCTCATAGTTTAATAATTAGAGTTAACATACCATTTTAGTCTCTCTACTTTGTCATTTACTTTAAAATATCTAATTATAGTGATATCTATACTTTCGATAAATCTTTAAAACAGTTATAGTGGTTAGTTTATTGTTTGTTTGTTTTTTTTTAAAAAAAAATTCAATTTACACTCCCAAGTTTATAAAACATTCTTTATGTCAGTTGAGATATGCTAATTTTGACTTCTTTTTTTTTTTTTTCTCTATTTGCTTTGTTTGCATGTATTATGGCTTGTCGGTAAGGTGACATCCCATCTTTCAAACACTTTGGTTTCTAAGATTTGAAAAAAATGGTTCTAAATGTTACGTAGGATCCGTTTGAATTAACTTGAGAAAAAAATGATTTTCAAAAAAATGATTTTTATTTAAACTCTTTTTGATAAAAATTGTTTAAAATACACTTCAAAAGCTATTTTGAATGGTTTTCAAACACTCCAATATAATTTTTCCTAAAATGACTTATTTTTTAAATTAAACACTTGAAAATGTATTCCAAACACACTTTTATTGACTACAAACTTTATTGTCGTGGTTGGTTAGATTTTTAATTGGGGATATATATTTTTCATAAAAGAAAATTAGGAAATCATTAAGCTGCAAGTTGGACTATCATAAAAAATCAAGTAAAATTGAAATTGATAAACTTATCAAACTTCATAGTTTAAATTGATAGAATCCTATAGGTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATCTCTTTTAGCATTTCCTTGATAAAATTTGTTAATATACTCATATAATTGTGTCTTTTCTTCCGCCCTAAATTGTTGTATTAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGCTTAGAAAGAAAATAAAGAAAACTTGAAATTGAAATAGCTTTCTTTTAAAGTTCAAACACAATTTCTTTTGATTTTCAAGTTGGACAATTGATAAGTCTAACATTTAAAGGAAACGATATCAATTAAATTGCCCAACACATTTGAGAATAATTTTTAGGGTTGTTTTCAAATATAAAAAAATGAGTCAAATTATTTACAAATATAGAAAAATTTTACAGCCTATCAGTGATAGACCGCGATAGAATTCTATTGCTTTCTATAGCTTGAGCGCTAGAATTCTATCACGGTCTAATCACTAATAGACAATGAAATTTTTTTTATATTTGTAAATAGTTTGATTTTTTTTCAGTTTAGTGTAGTTTTTCTAATTTTTATGGCATAAATTTAAATTACTCTTGCGAATTTAGTTTAAGTTCAAAAAATCTAAAGTAATTGAACTTAATACAATTATTGCTAAATTAAATTAAAGAAAAAATTGAAACCGATTTCATAACACTAGTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAATAAAGACTAGCTCACTCTAAAGAATCTACTGCCTTATTAAGAGAAACTAATGTGAAGTAAAATTTCAACATGATCTTTGCCTCCTTTCTTTTTTTCATTGTTTCTAAAATTGAAAGGTTTTTTTTCTAATCTTCAAAGGACTTTATTCTTCAAGGATCATTCGGTTTCGATGGAGTTCTGAATCACTTTTAAAGAGAGAAATCTTCGGAGTCACAGAAATGCTCAAAGAATTTTGTTGATGTAATTTTCTATATTCAGTAAAAGAGGAATAATCTCTTTTATACACAGTGTAATCTAGGGTTTGCATATTTACATAAAAATAATAAATGAAAAAATAAATTACACTTGTCAATTAATAAGACGTCGGCACCATGTGGTTCGAGTTTGTTGAGATATTTTTAGACAGAATGTCTTCTTTACCCTTACTACTTGAATTCTGTTGAGAATTTGTTGAGATAGTTTTAGATCTTCTCTACCCTTGCTATTTGAATAATATACTGTATTACTTCTTATGGGTGAATTCTTTTTAAGTTCTCTTTTGAGCTTTATAAGTTTATGAACCCAAAATTAAGAATTTGTCTATTTATAAGATTCCAATGGGGTAATGTAGGCTTGGGTTTGGATGGTCCTTGGGCCAAATCAATTGAATTTTGAGCTTTCTAGACTAGTTAATAGTATAATTAAATAGGTCCAATTATAAAATGTCTTAAATCTACAATTTTTTTAAATGAATAGGACTACAATATTACATAAAAATCAGGCTTAGAACACTCTTTTATAAATGTATATGAACTCTAAAAATCGAGGGTTGTAGTTACGATTTCAATTCAAATCTAACTTATTTTCGAAACCCATCAATTCTGATTGTTACCAAAAACTCTCAAGTTTTGACAAACGGAATATAATGTGATTCTATGACTAATATACAATGCATTGCTCTGTTTTGTGTAAATGTGTGAGTGAAATTAATTAGTATATTCTATATATTACATGGGTATAATATAGTTCTATTTATATAAAATGTGGGTATATGGATAATATACAAGATATCATGCATTGATTATACTACATTTGAAATAGGAGTGTTCGTGGGTTGGGTTGGGTTCAAAGATTTTTTAGATCCAACCTAGTTGTTCGGGTTGTAAATTTCTTCAACCCAAATAACCCTTAATAAAAAATAACCCAACTATAAAATATTTGGGTTGGGTTGAGTTGGTTCGGATTACTTGAGTCATTTATTTAAATTTGTGTTCTAAAAAGAAATGAAATGTTAATATGTAAAAAATTTATTTAATTATTTTCATATATTAAATTAAAATTAACAACTCAATTTCAATTTATATTTGAATTTTTTTTTTCCAAAATACTAAAAAATTGTTTGTAGGAGTTGTTGGAGAAAAAATTTTCAAAAAAACATGAAAGTAAATAAAACTAAAATAAATCTATTGTACTTTAACTTTGTTCATTTTGGTCCTTATACTTTTAAAAAGTTGTCATTTTGGGTCTCTTCATTTACATTTTTAAATGATAAAAATGGTCACTTTTTCGAAAGTTCAAGAACCAAAATGAAACCAAAGTTAAAAGTACAAAGACCAAAATGAACATTTTTAAAATATAGAGACCAAAATGAACATTTTGAAAGTAGAGAGACCAAAATGAACAAAAACCAAAAGTACAAAGACGAAAGTAGTATTTGAACGGGTTAATTAGGAAATGTAGGTGGTTTTAAGAAAAAATTGGTAAAAAGGGGTGGTTTTAAAATTATTTAGGAAAATAGGGTAGTTTTTTTGTTTTTTTAGTGAAACTCTTCTTAAAAGTTGGAATGGGACCCACATAAGGAAGGAAATGACAATTATTTTTATTTTTTTATTTTTTTACAAATTATTTACTTTATTTTTGTTTAAGGAAATATAATATCACTTTTTTTTTTATATAATTGTTATTTTATTATATCATATAATTTTCTTTCATTTTTCTAGCAAGATTAAATTTAATTAAAAAAATATTACATATTTAATCATTTTATTTATAAAATAATAAACTATTAAATATAAATTAAGATAATACCACTCTTTTTTTTTAATCTTACATCATATTGTAGTATTATTTTAAAGCACGAAAAATTGTAATAGATAGCAAACTCAAGGGAAAAAATCTAAACATATAACACTTCTTTTAAAATGTTTGCAAATATGGCAAATGTTGACAAGTCAACTTTTGAATTTTTTAAAAATTTTAAATTTGTCCTTGTTCGTATGTTAGGAAAGCACATGTTTCCTTTTAATTTTAATTTTATACTTCATTATGAACATATAATAATTATAGATTATTTATAATCAATTAATTATTTATTATGATTAATTTTTATTACTTCATTCATTATTAATATATCATATTTATATAAAAAAAATTAGTATTATTTATTAACATATCATATTTTTATTTGTTTGTTTCACTTTTTATATAATCTATTGTTTATTAAAATATATTTTCTTATATTATTTAATTAATATTAAAATTACTAGTGTTGAACTTAATTAATTATAAAAATGATTAAATAATATATTATAATTAATATGATGTTCATTAAATACGTTAATTGGTTAATTTCAATTATAAATTACTCAATTTTTAAATATTTATAATTAAGATTATTATTGATTCTTAATTAATTATTTTTTTTATCAATGTATTGAATGATGTCTATTGTTTAATTAATTAATCTATTACAATTATATAAGATTGTCATGCTTAATTTTATAAATCCTTAAACCAAATGGCCCCTAATAATTCTGTTATCTAAATGACTAAAATTGAGCATTATTGAAATCTCAGACACAAAAGTGTTAGATTTTGAAACATAGAAACCAAATAGAAACTAAATCCAAATCTAAGAAACCAAAAGATATTTTTTTTCGAAAAATATAACTATCCACTAATTTTACTTAGAAGGATTAGTAATATATTAAAAAAAATTAGAACTTTTGATATTTCCATGCAGCAAGGTTTTAGAATTTTACTTATCTATGTAATAAATTTACTATATCATATTGTAGTTTTCTTTTTAAATATTACCTAGTTTACAAATTTAGTAAAATAAAACTACAACATGATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATGGTATTATCTTTATCCAAGGATAATAATTTATTATTTTATAAATAAAATGATTAAATATATAATTTTTTTAATTAAATTCAATAAGATAATAATTATAAAAAAAAAATGGTATTATGTTTTCTTAAAAAGTTAAAGAGATGA

mRNA sequence

ATGGAAGTTTTCACGTTTGGTAGAAGTGGAACCAACCGGTGGAAGCATCTGGACTGCTTGCCTTTTATCATCTACACTGACGGTGCTTACTTGAATGGAGTCATCTATTGGATGGGACAAGTAAAACAAGACGAGTTTTTGATTTATGCTCTTGATGTTGAAACTGAAAAAATTGAATTCATTGCAACCTTAGAAGTTGGCCCTAACTCAAGGTACGGGAAAATTCAGACGTTTAATTCCACCATTTATGCAATTATTATTATGTTCACAACACGTAGTCAAGTTCAACTGTGGAGGATGCAACACAAAGATTCATGGATTAGAGAATTTGTTATTGATGACTTACCGAATAATAGGCTGAATGGATTCTTTCACCTTATTAAGCCCTTTGAAGATGGCGGGATATTATTTTTTACTAATGGATACTTATTTTACTTGGATAAAACTGGGAAGAAGATCAAGATAAAAACATTACTCAATCCATATTCATACAAGACAGAGCTTACAGCAGTTTGTTGTATGGATGAATCTTTGAATTTTAGTTCTCTCCCAACAATTTTGTCCGGAGATGATGGATGCTCTTTCCTAAATTTGTTTAAGAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGTTTTCACGTTTGGTAGAAGTGGAACCAACCGGTGGAAGCATCTGGACTGCTTGCCTTTTATCATCTACACTGACGGTGCTTACTTGAATGGAGTCATCTATTGGATGGGACAAGTAAAACAAGACGAGTTTTTGATTTATGCTCTTGATGTTGAAACTGAAAAAATTGAATTCATTGCAACCTTAGAAGTTGGCCCTAACTCAAGGTACGGGAAAATTCAGACGTTTAATTCCACCATTTATGCAATTATTATTATGTTCACAACACGTAGTCAAGTTCAACTGTGGAGGATGCAACACAAAGATTCATGGATTAGAGAATTTGTTATTGATGACTTACCGAATAATAGGCTGAATGGATTCTTTCACCTTATTAAGCCCTTTGAAGATGGCGGGATATTATTTTTTACTAATGGATACTTATTTTACTTGGATAAAACTGGGAAGAAGATCAAGATAAAAACATTACTCAATCCATATTCATACAAGACAGAGCTTACAGCAGTTTGTTGTATGGATGAATCTTTGAATTTTAGTTCTCTCCCAACAATTTTGTCCGGAGATGATGGATGCTCTTTCCTAAATTTGTTTAAGAGATGA

Protein sequence

MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIEFIATLEVGPNSRYGKIQTFNSTIYAIIIMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDDLPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCCMDESLNFSSLPTILSGDDGCSFLNLFKR
Homology
[Close]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match: TYK02998.1 (F-box protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 1.9e-37
Identity = 89/189 (47.09%), Postives = 122/189 (64.55%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIEF 60
           M++  F R GTNR K + CLPF I   G+YLNG IYW+G+ +Q +F+IYALDVETEKIE+
Sbjct: 242 MQITKFDRHGTNRCKDIMCLPFNIDGHGSYLNGFIYWIGR-EQTKFVIYALDVETEKIEW 301

Query: 61  IATLEVGPNS-RYGKIQTFNSTIYAIIIMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDDLPNNR 120
             TL+VG  S   G+IQT N +IY  + M+     +Q+WRMQ KDSWIR FVI D+P   
Sbjct: 302 NTTLDVGTLSFCSGEIQTLNGSIYVTVFMYEPSHMLQVWRMQGKDSWIRTFVIYDVPKRW 361

Query: 121 LNG-FFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCCMDESL 180
            +  +F L+K FE G ++F  +G LF +D +GKK+K+ T        T  + +    ++L
Sbjct: 362 WSAEYFQLVKIFEYGTVMFLVDGDLFCIDTSGKKVKMTTFYPDNKLVTRFSNI----DAL 421

Query: 181 NFSSLPTIL 188
           NF SLP +L
Sbjct: 422 NFGSLPAVL 425

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match: XP_004141602.1 (F-box protein At3g07870 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 2.2e-36
Identity = 92/197 (46.70%), Postives = 122/197 (61.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRS-GTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIE 60
           MEV  FG++  T  W+HL CLPF+ Y DG YLNGVIYW+G+ K+++ +IY+L+VETEKIE
Sbjct: 193 MEVMRFGKNEETKEWRHLTCLPFVFYCDGVYLNGVIYWIGRQKENKSVIYSLNVETEKIE 252

Query: 61  FIATLEVGPN---SRYG-KIQTFNSTIYAII-IMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDD 120
            I  L+V P+   S YG  I  +N  +YA I I  T   +VQLW MQ KD W++EFV+ D
Sbjct: 253 SITVLKVDPSYNTSDYGYYIGKYNGNLYATIWIHGTCCKKVQLWMMQGKDCWVKEFVVHD 312

Query: 121 LPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFY-LDKTGKKIKIKTLLNPYSY-KTELTAVC 180
           + +  ++ F  L+K FEDG   F+    L    DKTG +IK K  +   S  +  L    
Sbjct: 313 IEDRYVDAFLVLVKIFEDGERWFYVGSRLILCYDKTGTQIKKKCRMKRVSNGRGNLVGQL 372

Query: 181 CMDESLNFSSLPTILSG 190
           C  +SLNF SLP IL G
Sbjct: 373 CHFDSLNFGSLPNILDG 389

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match: KAE8648955.1 (hypothetical protein Csa_007901 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 2.2e-36
Identity = 92/197 (46.70%), Postives = 122/197 (61.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRS-GTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIE 60
           MEV  FG++  T  W+HL CLPF+ Y DG YLNGVIYW+G+ K+++ +IY+L+VETEKIE
Sbjct: 104 MEVMRFGKNEETKEWRHLTCLPFVFYCDGVYLNGVIYWIGRQKENKSVIYSLNVETEKIE 163

Query: 61  FIATLEVGPN---SRYG-KIQTFNSTIYAII-IMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDD 120
            I  L+V P+   S YG  I  +N  +YA I I  T   +VQLW MQ KD W++EFV+ D
Sbjct: 164 SITVLKVDPSYNTSDYGYYIGKYNGNLYATIWIHGTCCKKVQLWMMQGKDCWVKEFVVHD 223

Query: 121 LPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFY-LDKTGKKIKIKTLLNPYSY-KTELTAVC 180
           + +  ++ F  L+K FEDG   F+    L    DKTG +IK K  +   S  +  L    
Sbjct: 224 IEDRYVDAFLVLVKIFEDGERWFYVGSRLILCYDKTGTQIKKKCRMKRVSNGRGNLVGQL 283

Query: 181 CMDESLNFSSLPTILSG 190
           C  +SLNF SLP IL G
Sbjct: 284 CHFDSLNFGSLPNILDG 300

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match: XP_038890298.1 (F-box protein At3g07870-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 159.5 bits (402), Expect = 3.1e-35
Identity = 94/202 (46.53%), Postives = 123/202 (60.89%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGT----NRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMG--QVKQDEFLIYALDVE 60
           M+V TF RSGT    N+W++L  LP  I+++GAYLNG IYW+G  + K++E+ IY LDVE
Sbjct: 188 MDVLTFSRSGTNANHNQWRYLHYLPLDIHSNGAYLNGFIYWIGKEEEKENEYAIYVLDVE 247

Query: 61  TEKIEFIATLEVGP---NSRYGKIQTFNSTIYAI-IIMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREF 120
           TEKIE    LE+ P    S+ G +Q FN ++YAI +I   T + +Q+WRMQ KD WIREF
Sbjct: 248 TEKIELSIVLEICPPLCTSKVGGMQQFNDSVYAIFLINQPTGNSIQVWRMQEKDLWIREF 307

Query: 121 VIDDLPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTN--GYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTEL 180
           V+DD+PN+       LIK FEDG IL   N   + +Y   TG+K  I        Y    
Sbjct: 308 VVDDIPNDW--NVLTLIKAFEDGEILCMVNFDFFCWYNPLTGRKKIITKNEKKIRY---- 367

Query: 181 TAVCCMDESLNFSSLPTILSGD 191
               C  +SLNF  LP IL+GD
Sbjct: 368 ---VCQIQSLNFGYLPNILAGD 380

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match: XP_008459707.1 (PREDICTED: F-box protein At3g07870-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 156.0 bits (393), Expect = 3.4e-34
Identity = 88/198 (44.44%), Postives = 123/198 (62.12%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQ--VKQDEFLIYALDVETEKI 60
           ME+FTF  +G  +W+H + LPF+++  G YLNGVIYW+G+   K+ E +IYALDV+TE++
Sbjct: 190 MEIFTFD-NGYKQWRHFERLPFVVFHHGQYLNGVIYWIGKKLEKEGEAVIYALDVDTEQM 249

Query: 61  EFIATLEVGPNSRYGKIQTFNSTIYAIIIMF-----TTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVID 120
           E  ATLE+GP+ + G I+ F   +YAII +       T  +++LWRMQ KDSWI+EF ID
Sbjct: 250 ECTATLEIGPSLKNGSIKIFEERVYAIISLMDKRVSPTSYKIELWRMQKKDSWIKEFSID 309

Query: 121 DLPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCC 180
           +         F LI  FEDG +L      +F LDK+ KKIKIKTL    S ++ +  + C
Sbjct: 310 E-------ESFGLITVFEDGELLIAIKDNIFRLDKSRKKIKIKTL---NSSESRIKVIGC 369

Query: 181 MD-ESLNFSSLPTILSGD 191
               S+NF     IL+ D
Sbjct: 370 NTINSINFECFSNILARD 376

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BVH7 (F-box protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G00920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 9.4e-38
Identity = 89/189 (47.09%), Postives = 122/189 (64.55%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIEF 60
           M++  F R GTNR K + CLPF I   G+YLNG IYW+G+ +Q +F+IYALDVETEKIE+
Sbjct: 242 MQITKFDRHGTNRCKDIMCLPFNIDGHGSYLNGFIYWIGR-EQTKFVIYALDVETEKIEW 301

Query: 61  IATLEVGPNS-RYGKIQTFNSTIYAIIIMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDDLPNNR 120
             TL+VG  S   G+IQT N +IY  + M+     +Q+WRMQ KDSWIR FVI D+P   
Sbjct: 302 NTTLDVGTLSFCSGEIQTLNGSIYVTVFMYEPSHMLQVWRMQGKDSWIRTFVIYDVPKRW 361

Query: 121 LNG-FFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCCMDESL 180
            +  +F L+K FE G ++F  +G LF +D +GKK+K+ T        T  + +    ++L
Sbjct: 362 WSAEYFQLVKIFEYGTVMFLVDGDLFCIDTSGKKVKMTTFYPDNKLVTRFSNI----DAL 421

Query: 181 NFSSLPTIL 188
           NF SLP +L
Sbjct: 422 NFGSLPAVL 425

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSJ2 (F-box domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G643290 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.0e-36
Identity = 92/197 (46.70%), Postives = 122/197 (61.93%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRS-GTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKIE 60
           MEV  FG++  T  W+HL CLPF+ Y DG YLNGVIYW+G+ K+++ +IY+L+VETEKIE
Sbjct: 193 MEVMRFGKNEETKEWRHLTCLPFVFYCDGVYLNGVIYWIGRQKENKSVIYSLNVETEKIE 252

Query: 61  FIATLEVGPN---SRYG-KIQTFNSTIYAII-IMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDD 120
            I  L+V P+   S YG  I  +N  +YA I I  T   +VQLW MQ KD W++EFV+ D
Sbjct: 253 SITVLKVDPSYNTSDYGYYIGKYNGNLYATIWIHGTCCKKVQLWMMQGKDCWVKEFVVHD 312

Query: 121 LPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFY-LDKTGKKIKIKTLLNPYSY-KTELTAVC 180
           + +  ++ F  L+K FEDG   F+    L    DKTG +IK K  +   S  +  L    
Sbjct: 313 IEDRYVDAFLVLVKIFEDGERWFYVGSRLILCYDKTGTQIKKKCRMKRVSNGRGNLVGQL 372

Query: 181 CMDESLNFSSLPTILSG 190
           C  +SLNF SLP IL G
Sbjct: 373 CHFDSLNFGSLPNILDG 389

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB99 (F-box protein At3g07870-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498749 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 156.0 bits (393), Expect = 1.7e-34
Identity = 88/198 (44.44%), Postives = 123/198 (62.12%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQ--VKQDEFLIYALDVETEKI 60
           ME+FTF  +G  +W+H + LPF+++  G YLNGVIYW+G+   K+ E +IYALDV+TE++
Sbjct: 190 MEIFTFD-NGYKQWRHFERLPFVVFHHGQYLNGVIYWIGKKLEKEGEAVIYALDVDTEQM 249

Query: 61  EFIATLEVGPNSRYGKIQTFNSTIYAIIIMF-----TTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVID 120
           E  ATLE+GP+ + G I+ F   +YAII +       T  +++LWRMQ KDSWI+EF ID
Sbjct: 250 ECTATLEIGPSLKNGSIKIFEERVYAIISLMDKRVSPTSYKIELWRMQKKDSWIKEFSID 309

Query: 121 DLPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCC 180
           +         F LI  FEDG +L      +F LDK+ KKIKIKTL    S ++ +  + C
Sbjct: 310 E-------ESFGLITVFEDGELLIAIKDNIFRLDKSRKKIKIKTL---NSSESRIKVIGC 369

Query: 181 MD-ESLNFSSLPTILSGD 191
               S+NF     IL+ D
Sbjct: 370 NTINSINFECFSNILARD 376

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T7C6 (F-box protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001850 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 3.7e-34
Identity = 89/195 (45.64%), Postives = 122/195 (62.56%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFGRSGTNRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQ--VKQDEFLIYALDVETEKI 60
           ME+FTF  +G  +W+H + LPF+++  G YLNGVIYW+G+   K+ E +IYALDV+TE++
Sbjct: 123 MEIFTFD-NGYKQWRHFERLPFVVFHHGQYLNGVIYWIGKKLEKEGEAVIYALDVDTEQM 182

Query: 61  EFIATLEVGPNSRYGKIQTFNSTIYAIIIMF-----TTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVID 120
           E IATLE+GP  + G I+ F   +YAII +       T  +++LWRMQ KDSWI+EF ID
Sbjct: 183 ECIATLEIGPFLKNGSIKIFEERVYAIISLMDKRVSPTSYKIELWRMQTKDSWIKEFSID 242

Query: 121 DLPNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCC 180
           +         F LI  FEDG +L      +F LDK+ KKIKIKT LN    + ++   C 
Sbjct: 243 E-------ESFGLITVFEDGELLIAIKDNIFRLDKSRKKIKIKT-LNRSESRIKVIG-CN 302

Query: 181 MDESLNFSSLPTILS 189
              S+NF  L  IL+
Sbjct: 303 TINSINFECLSNILA 307

[Close]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KUJ1 (FBA_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G643280 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 8.3e-34
Identity = 89/194 (45.88%), Postives = 119/194 (61.34%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEVFTFG-RSGT-NRWKHLDCLPFIIYTDGAYLNGVIYWMGQVKQDEFLIYALDVETEKI 60
           ME+  FG RS T   W+H  C P      GAYLNGVIYWMG+ K   ++IYALDVETE++
Sbjct: 110 MEIMRFGDRSETKEEWRHFKCPPISFDDHGAYLNGVIYWMGKEKGKAYVIYALDVETEQM 169

Query: 61  EFIATLEVGP-NSRY-GKIQTFNSTIYAII-IMFTTRSQVQLWRMQHKDSWIREFVIDDL 120
           E +A LEVGP N RY G I T N ++YA + I+    +++Q+W MQ K+ WIREFV+ D 
Sbjct: 170 ELVADLEVGPHNFRYNGYIATLNKSVYAYVPIVGPCCTKIQIWTMQGKEGWIREFVMYDE 229

Query: 121 PNNRLNGFFHLIKPFEDGGILFFTNGYLFYLDKTGKKIKIKTLLNPYSYKTELTAVCCMD 180
            +  L     ++K  +DG   FF  G +   DKTG  IKI++L N    +T    +C + 
Sbjct: 230 VSRGLRMPMQMVKVLKDGERWFFVEGNILCCDKTGMNIKIESLWNS-KIETRFDGLCQI- 289

Query: 181 ESLNFSSLPTILSG 190
           ESLNF S+  IL+G
Sbjct: 290 ESLNFGSIQNILAG 301

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
TYK02998.11.9e-3747.09F-box protein [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_004141602.12.2e-3646.70F-box protein At3g07870 [Cucumis sativus][more]
KAE8648955.12.2e-3646.70hypothetical protein Csa_007901 [Cucumis sativus][more]
XP_038890298.13.1e-3546.53F-box protein At3g07870-like [Benincasa hispida][more]
XP_008459707.13.4e-3444.44PREDICTED: F-box protein At3g07870-like [Cucumis melo][more]
BLAST of HG10000438 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3BVH79.4e-3847.09F-box protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G00920 P... [more]
A0A0A0KSJ21.0e-3646.70F-box domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G643290 PE=4 ... [more]
A0A1S3CB991.7e-3444.44F-box protein At3g07870-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498749 PE=4 SV=1[more]
A0A5A7T7C63.7e-3445.64F-box protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001850... [more]
A0A0A0KUJ18.3e-3445.88FBA_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G643280 PE=4 ... [more]
BLAST of HG10000438 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR017451F-box associated interaction domainTIGRFAMTIGR01640TIGR01640coord: 2..126
e-value: 1.2E-11
score: 42.4
IPR013187F-box associated domain, type 3PFAMPF08268FBA_3coord: 29..138
e-value: 6.7E-7
score: 29.3
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR47993OS09G0372900 PROTEIN-RELATEDcoord: 1..133
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR47993:SF20F-BOX FAMILY PROTEINcoord: 1..133

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10000438.1HG10000438.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016020 membrane