HG10000064 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10000064
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr09: 447636 .. 452230 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10000064
SyntenyHG10000064
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGACCAACACACTCAGCTCAAGGTCGAGGTTGATCTCAGCGTGCAAGATAGAATGTTGGGTGCACTCCTCACATGCCTAGGCCCGATGAGAGAGAAGGTGATCTGAAAGTAACTTGAAAACCTTGAAAGAGAGAGAATCTAAGTCATCAGTCCTTATAAATATACTAAGATAGCTGCAGGGAAGTAAGTTCATTCTCCACTCTAAAACTCTTAACTTGCCGCACATATTCACTATCTAACTTAAGTATCAGAGCATGTATGACAAGCACTACACCAGTGTGCTGATCTTTCTATTTTATGAGTCACGTTCTTCCTCTACGTACCAATTTATTGTTGTTATTGTGAAAATTAGACCATTTTTCCTTTTCATGTTTTCACATTAACGATCTACATTTATTACGTAGTAAAAGTAATTCAATGATATAAAAGAAATTCAATGATAAATAAAAAAAGAACCACTGATGTAAATATAGTAAGTTTTTAACACCTATGGAAAAGTGTTAGAATGTGCCTTTACTAATTTAAATATTTTCTTAATTTTTTTATTCATATGATTTTTTTTCATAAATATATTTCTATTATTTTGATATTTCTATAAAATTGGAACCTCGACATTCATTCATCAACATAAATATTTTAAATTTAGAATTGACATCAAATTCGTGTTGAATACTCACATCAATTAATATTTTTGTATTTTATCTTCTCTTTTTTTTATATAACAAATATATATAATTGGGAATTTCAACTCTCAAATTGAAGAAATAGTAGATGCCTTGATTTTTTGAGCTACACTCATATTTTTCCATTTTGTTTTCAAAAGCTTTCCACTTTTAAATATTATATAATTCAAATTTATAAATGAAGATTTGAACATTATAATTTTAAACAAAAGTTTATTATTAATATCTTAATTAGTGTAATTATGCTATAAAGAAAATAAATCTTTTTTTTTTATGACATAAAAACTAAAGATATTTGATGAAGTGATACGTAACGTAATTTTACTAATTCTAACTTCTCTATATATATTATTCTACTCCATATATACAACCAAATCAACTAACCTTGTTTTTCATTAACAAGATATAAATTTGACAATAAAATTTGACTCTAGAAAGTAAGACTTTGGGATATTAAAATAGCATATTATAAAAATATTTAAGCTACCATCTCTTATGCCAATAGAATTTTGGTCATCCTAAAATATATTATAATATATAAACTTGTTGGCAATTGAAAAATGACGTGTGGGTTGCTACTCTCATATAAATAATCATACAACTACCATACATATAATTATTTTAAGAAATGCATCTACCTTTAATAATTAAATTATTGATACTAATGATGTAAAATGGGTACGTTATTCTTTGTTTTAAATCTTGGAGAAAAAGTTGACCATATATTTCATATATAATAAGATGAGAAATTTGAAAAAAAAAAAAAAAAACATAGATTTAGCATTAAATACATTTACTGAAGGAATTGGGTAGGGTGTTTCGTGTTTCACAAACGAAAAAGGGTTAAGAAATGGACCTTTTATTTATTTATTTATTTATTATTATTATTGTTATTTTTATTTTAATGAACAGTTTCAAAGAATATGTCTTCGATCTAATATATTTTAATTTTTTTATTTTTATGCAGTAGTTTTAAGAGGAATTTTTAAAAATATAAAAATAAGAGAAACTATTTATATAAAATAGCAAAATTTTTAGATAATTGTGATAGACGCGGATAGAAGTTTATCAGAGTCTATCAATGATAGAAATGATAGAAGTCTATCACTAATAGATGCTGATAGGAGTCTATCAATGTCTATCAGTATTTTTTTTTTTTTTCTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTATATGTGAAAGTTTTTCTAGTTTTAAAATGAAGACATTAGAATGAATTCATGATTATGATAGAATTATACATATACACACACCTGTTTTAACTAGTTTAACGGATTAAGGTATTATATCATTCGAAAAAAATATTATATATTGTGGAGATAATTCTAAGATTGTATTATCTAAACTAGGTTGGAGGTTAAAATCTTCATCCAACATTATTCTATATATGTGTTATATTAAAAAACCTGAAAAATATCAATTCTATTTGGATTCATTTAAGAATATATGGCACTTAGGGACCTTTGTTTTTTAGAATATAGATAACCGAAATCTTTAGACGTCCAAAATTATAGATATATGAAATTACAAATATATGGTATATTTAGATAACCATGTTTATTTTATAGGAATATTTTGGCAGATATCTAAAAATACTTTGATAATTGTGTTTATTTCGTAGGATTTCTACTAAAAAATCATGTCTTAAATTTACATAATGTTCCAAGAATATTCTTACGACTATTTATTAATTTGTAATTAATTTAATGTAATTCAAACTTATATAACATACATGTTTTTATCAATTTAAATTTCCTTTCTAAATTAATATGTTGGAAACCTTGTGCATTATGCGTTCAACGCAAGGTGGTCAACGCCTGATGGCCAGTGTCTGATGGTCAACGCTTGATACTCAACTCCTGGTGGTTAACTCAACGGCTGGTATGCGGTGAACTGTGTTGGACGCCTGTTATGCTATGTGATGAACCTGCAAAATAGAAGCTCGTTATGGCTGAGTCGCGGAGCTCGCTCTCTTTAAGACGTTTCGTGGCTCTGCCTAAGGTGCTTGCAGTTCTGACTGAATGTCACACCGTCCCCAAGATAAAACAGCCCAAATAATACTGTCTCGGTCGAAACTCGCACAAGAATCGATCGGTACTCACACTCTTTCTATGTTGCTCGGTATTTAGAGAGAAAAGATTTTTCATTATCCTTTTCAAATCAAGATGGCAGGGCATTTATACTGCGCGAGGCTCAACCGTTGCATGAGGGACGAGCGCTCGGCCACAGAACGTGCGCCGCGCGGTGAGCGCTCGTCTACACCACGTGCGCCGAAAAAGACGGTGTGAACGATGCGGTGAGGGGCAAGACCGTAAATTCTAAAAGAGATTTTATTATTTTTAAAAATTAAAATAAAATAACAACAAATATCTTTATCCCCACCCCACCGACGACGCGTGGAGAAGCCACCATGCCCACCATTGCCTATCTCATTACCCTTTCCAAGACATGGATACCCCTCGGGGCCTAGCCCATCACTAAAGGGAATGGTAAATAAAGTGAGATTTCAATGCTAAACTAAGCAATGTGGGATACTCACTTTTCCAAAAACTCATTTTTTTTTCACCAACAATAATTAATACAATTTATATTATTTTTATATGTTATATTTTCAACAAAATAATATTAATACTTTAAGATTTTTTTATAAATTAAATTTAAATTTGAATATCTAGCTAAGAGTATTTACTTTAATTGTACCATGCAAATAAAGAAGAATTAAATACATACATAAAAGAAAAAAAAGGAAGGACAAAAAAGTAAATGGGGATCTCTTCAACATGGTAATCTAGAAAATCCATGTTTTAGGAGAACATCCAAAACTCTTGAGATGCCTTCTATAAGAGTATCTTAAGATGTCCGAGAATCTCCATATAACAAGACATCTTACAATACTGCAAAACAAACATAGTAATCCAGAGGCTCACTTCATTGGAATCTAGGATGTCCACGAAACAAATGGCTCCTTAAAGTGCGTTTAGATTGGCTATGAAAAAAATATTTTTAAAAGTGCATTTTCTTTTAAATACTTATTTTTATAAAATTGTTTAAAAATAAAATGTTGGTCATATATTTGGTTAATTTTTCTTAATAGTTATTTTATACGTAATGGTTTTCTCTACCTTCAAAATGTTTTTACAAATATCAAATGACTATAAAGGAATACTATTAAATATAATGAAATAATAACTTTAAGAAGGATAACTAAGTCTAACCACTCCCATTTGAAAAATAATTAATCCCACACTTTTTTTTTTTGGGAAAATAGCTAAAACACATCTTCCAATGAAATATCCAAATTCTATTGTGACGATAATGCCCATGCAAGTTACATTTTAAATCACGTAACAAAAAAAAAAAAAATTAAGAGATGAGAGAATGTTGTTTTCAACCAAAGTACAGTCATTGAAAGAAACCTAAAACTTAATTTAGACTTGTTTTCAATTTTTATTTTAAATAAAACCGAGTTATATACTAACTATGAATCACATTATAAATTGGCAAATTAAAAGCACTAATTCTAAAATTCGCAAATTAAAATACTAAAATTGCATAGATAAGATATTTTGGTTCTAAATTAGACATTTTTTTTAGAGAATTTTAGTTCAAATATTTCTCTCAAAATAGCTTATTTCTCAAACTCATTTCCTCTTTTAATAAAACAATTGGATTGTTCTCATCCAAATTCTAAAAAGAAAAACTACTCCATTTTATTATTGGTTTTTTTTAGCACACATGGGGAAAAGAAAGAGGGAGAGGAGAAAAGAGAAAAAGAGGGGGGAAATGTAGGCAGAGAAGATATTGCAACAATGACTCGACTTATGGAAGGACGAGAACCAAAGATGACGGAGAGAGAGATAAAATAGATAAAAGAGACCAAACAAAATGTTACTGA

mRNA sequence

ATGGACCAACACACTCAGCTCAAGGTCGAGGTTGATCTCAGCGTGCAAGATAGAATGTTGGGTGCACTCCTCACATGCCTAGGCCCGATGAGAGAGAAGCACACATGGGGAAAAGAAAGAGGGAGAGGAGAAAAGAGAAAAAGAGGGGGGAAATGTAGGCAGAGAAGATATTGCAACAATGACTCGACTTATGGAAGGACGAGAACCAAAGATGACGGAGAGAGAGATAAAATAGATAAAAGAGACCAAACAAAATGTTACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGACCAACACACTCAGCTCAAGGTCGAGGTTGATCTCAGCGTGCAAGATAGAATGTTGGGTGCACTCCTCACATGCCTAGGCCCGATGAGAGAGAAGCACACATGGGGAAAAGAAAGAGGGAGAGGAGAAAAGAGAAAAAGAGGGGGGAAATGTAGGCAGAGAAGATATTGCAACAATGACTCGACTTATGGAAGGACGAGAACCAAAGATGACGGAGAGAGAGATAAAATAGATAAAAGAGACCAAACAAAATGTTACTGA

Protein sequence

MDQHTQLKVEVDLSVQDRMLGALLTCLGPMREKHTWGKERGRGEKRKRGGKCRQRRYCNNDSTYGRTRTKDDGERDKIDKRDQTKCY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 65..87
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 34..87

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10000064.1HG10000064.1mRNA