Cucsat.G8993 (gene) Cucumber (B10) v3

Overview
NameCucsat.G8993
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationctg1635: 326177 .. 328656 (+)
RNA-Seq ExpressionCucsat.G8993
SyntenyCucsat.G8993
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GAAAGCCCTATTTTCTCCAAAATTACCCCCAATTCACCAAACTTCTCTCAATTTCCAGAATATTTAGCCTCATTCTGCCATTTTCTCCCCATCAATTAAAATTCGAGCAATTTCATGATGGAGGGCTAAAATTCTTCGGGTAAGTGGGCTTAGGTTCATCCATTCTTTGAGAATTTTTCAATTTTTCATGTAATTAGGGTTTGATTCAATCTAAAATTTTGTTGGAATCAACAATTTTTGTATCAAAAAATAGCATCAATTCCTATAATTCTAGTCAATTTCTTTCTTGATTTTCGATTTAGATTTAATATTTGTACGCAAAATACTTAAGTATCATGATTAATGCAAGATTAATTTGATTTCTTTTATTTACACAAAATTTACTTGATTCTTGATTGTCGTTTCTCACCAATTCTTGAAATTGAATGTTGCTCGATGAATTCCTTCGTACCAAATTCTTGGAAATTAATTGCATTTTTTTGTGGCCACAATTAATTCCTTGATTGCAAAATTATGAATGAAGTTATAATTTTTTTTTGAAGAACAAGTTAGGACTTTAGTTAATAGTGCAAGAACTAAACTAACCACATATGGAAATCATCTCTTTTCTTGAACTTTGATCAAAATTCTACCAAGATCAAACAAGTTGATCTTGTGAAGAATATTGAATCAAACAACCCCTCTTAATCATCTTTGATTCAATGATAAGAATAGAATAAGAGTCTAAGCCCATTATGAAATAATAAAAATCCATGGCAGCGGAATATTTTACAAAACCATTTCTCAATTTAATTTGAAAATCACAAAATACTAGTACATTGGTAGTATTTAAAATAAAAAATCTAAATAAAAAACTAAGCATGTTTTTAAATTAAAAGATATAGAAAACTTACTCTTGTTAATGTCCCTAAATCTACAATCCACCGAATTGGGGACACCACCCGTCGAAAATCTTTTTATCCTCTAACATGAGATTGGTTTATGGAAACCAATTGGAATGAAATTTTTTTTAGAGAAACTATTTGGCTTAAAATCAAAATCATTAGTTCTTTATTTATTTATTATTATTTTTATTAAGAAAAAATGTTTTTCTTCAACCTATTTATAACTTTCTTAAAAGAAGAGGAGAGAATCACGAGATTCTATTAATATAAAAAATTTAAATTAATAGAAATTTCAAATCAACTAATTAATTAACAATTAATCAATTAATTAAATCATATTTAATTAATATTTTTATTTAAATCATATTTAATTAATATCTCTCAAATAAAATTTTAAATTAATTTAATCAAATCAAATTAATCTATTAATTAATAGCTAAATTAAGTATTGTATATTTAACTTAATATTTGAATCATATTCAAATATAAATTTTTCTCGTAACCAACAATTTTAATATAAATCCAATTCATAAATTAATTTTGAATCATATCTAAAATTAAATTTATATAGTAAAGTTTGATTAATACATAAACTTTATATTATAATGTATTACCGTACATTATATTAATTTCCAAAGTAAATTTGAACTTGTTAGACAATGGGAGGGAAATAGACTTGAGAGATGATGACCCTTTTCATTAAATCTTATAGTGAAACTTGTTTGCTTTTACCCTTTTGTAGTAGTTGTGGAGTCATTAGGTGAATATTGTTGCCATTTTACAATCAAATAATGTATGATTGAGTGAGTATCTTGCCAAATAAATGAAAATTTTAGATCTTTGAATGCGAGCTTTTTCATCATTCTTTATAGTGAGATTTCGTTAATATATATCCCCATTTTTTGTTCAAGGGATTTTGGTATTTGATGACCTTCTGAATTTTTATAATTTATCACTTAATACATTATAATTTTGAACTTGATTTATGAGATGTTTGAATTTTGAAGTTTAGTTTGAAAAAAAAAACTCATGTGTTATGTATAATTGTTTTCCAAGGATAACGTTAGATCATGATACATGTGAGTTTTTCGATGTATAACAATGACATAGTGGAGTATTTTTCTAATTTTGTGAACATATATATCCCTTTTAAGTGAGTCTATCCCGCACGCATCTCGAACTTATCTCACAACATTTTGCACATTTCAAACTCACTATGAGTTTCACAATCAAATTGCTACCATTCCTAAGCCATTTAGAGTGATTTTATGCATGTTTAGTAAGTTTATTAGGTCCTTGTGTTTTATCTCGCACCTATCTCGCACATTTCAAACTTCATTATAAGTTTCACAATCAAATTGCTATCGACTCTAATCCATTTAGAGTGATTTTATGTATGTTTAGTAAGTTTATTAGGCCCTTGTGTTTTATCTCGCATGCATCTCATACCTATCTCGCACATATCTTGCTCCTATCTCGCACACATTGTTCTTCCTAGTTTTGTGAATGAAAAATGGTAAAGGAAGAAAAAGGAAATAAGAGGTTTTGTGAAAATAGGGGAAAATGGAATAGAGATGAGAGAAAAATGAAATATTTTTTTGGAAAGTAGGAAAATGGGTGGAGAAGGGGATGGAGAAAGAATGCCATAAATTGATTTGTAGGGTTTCTTTAACTGAAGGGCAATATAGTATTTTCCTAGTTAATTTGTCCTAAAAGTCATTTTTTTAAAAAAAAATCTATCCCAAAACTCTTTATACTCTTCAAAATTATCCTATTTTTGGTAATTTCCCCAAGTAGTTTTACATGTAATGAGAGTTTGCTTTGCCTCTTCCTAAAAAATTGAAAAAGTAGGATGTGATCCCACTAGAGATAGAGTTAGGGTTTCTGAGCCCTCTTGAAAGATAGGTGTTGCCAGTAGTGTTGGGAATTTGTTGGTTGAAACTACGTCTGCAATGGTTTCTAGTTCAACTGTATATGTTGATTTTGTTGTTGAACCTAGTGTTGTTGCTTTTGCTGTAACAAACAATCCTATAACCGATCTTCTGCATTTCGATTCTAAAATGATCCTTTTGTTGATGTTGTTAATGATAATGTTGTTTCTGTTTCTAAATATGGTCTGTTAAACACTTTGTCTATTAATCCAACTGAATGTGATCTCTCTTCCATTGTCGTGAATCAAAGTGATAATATCTGCAACGTTGAGGAGCTATCCCCTTGCTTGGATTGTTATGTTGAACCTTCTGGAAATCAAGAGAATATTTTCCCTCCTCATGATGTGGGTGCTCCTATTGAAACGGGTCAAAATGAATAGTGGACATGTTGTCCAAAAAGAAAAGTGTCTCTCAAGATGCTACTTTCTCTATTCCATCCAAAGATAAAGACTATGAAGAGATAACTTATTACGATTTTGATGATTCAACTACTGGTACTTTCAAGGATGATTCTGAAAATATTAACAAAGAAAATGTGAATGACCAAGATGAGAATGTCTACAGTGAGTTAGAAAAATATTGGGGCTTTGTTGAAGAACCTAATGAGGAAGGTCACGTGTCCAAGGTTCTGCCACTCGAGCCTCTGCTAAAAATTCCAAGAATAAGCCTTCCACTGTGTCGGTTCCATCCATTCCATTGGATGAAGTTTCCTTCCATTATGAAAAAGTACAATAACCCTTTGGAAGTATGTTTAGTGAAAAATCTTTCCAGAAAAGGAGTTGTCTGAGAAACCTCATGTCTGCTTGGAGGTCATGGAGCTACATGTGAAAAATCGATATGATGAGGTCTGTGACTAACTTTGGTTCCTGTTGCCCTAAATTTGTAAGGGAGTTTGTTGTTTAATTTATCTCCATTTTTTTATGATGCCAACTCTTCTAATTATCGAAAAGTCCATGTTCGTGGTCACAATAGCTTTGTTTTCACAATGTCATCATCAACAAGTTTCTGGATATAAATGTGCCTCAGGGAATGCATAGACTAATAACCTCTTGAAGGACCTTGTGTCTGAATTGGCAGATGGTCTGCGAGAAAATTTGCTTAAATCTGGGTTACTTGCAACCATTGATCTAAGTGCCAAATATGATATCTTGTTTCACATTAGTTGTGGCAAACTGATGGCCTTCATCTCACCATACAAGGGTGTCACTTTATATGGCTACTTTGATTCTTAAGATTAGCAAATGTTCTACCTTCTGTAAACCATCTCAGATATTGCTAAACCATATTCCAACACTTCTGTAAAAGCCCCCAGTCAATACTTTAGACTACTTTCTCGTTTGGTTGTCATCTTTTTCAGTCACTCTTTGAGAAACTTTAGTCATTGATTGACATTATTGAACTGTGTGCTCCTGAGCATAAACGTGAAGTTTCCAAATGAATTGCCTTAC

Coding sequence (CDS)

ATGTTGTCCAAAAAGAAAAGTGTCTCTCAAGATGCTACTTTCTCTATTCCATCCAAAGATAAAGACTATGAAGAGATAACTTATTACGATTTTGATGATTCAACTACTGGTACTTTCAAGGATGATTCTGAAAATATTAACAAAGAAAATGTGAATGACCAAGATGAGAATGTCTACAGTGAGTTAGAAAAATATTGGGGCTTTGTTGAAGAACCTAATGAGGAAGGTCACGTGTCCAAGGTTCTGCCACTCGAGCCTCTGCTAAAAATTCCAAGAATAAGCCTTCCACTGTGTCGGTTCCATCCATTCCATTGGATGAAGTTTCCTTCCATTATGAAAAAGTACAATAACCCTTTGGAAGTATGTTTAGTGAAAAATCTTTCCAGAAAAGGAGTTGTCTGA

Protein sequence

MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYSELEKYWGFVEEPNEEGHVSKVLPLEPLLKIPRISLPLCRFHPFHWMKFPSIMKKYNNPLEVCLVKNLSRKGVV
Homology
[Close]
BLAST of Cucsat.G8993 vs. NCBI nr
Match: KGN54877.1 (hypothetical protein Csa_012198 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 148 bits (374), Expect = 9.18e-43
Identity = 75/75 (100.00%), Postives = 75/75 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS 60
          MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS
Sbjct: 3  MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS 62

Query: 61 ELEKYWGFVEEPNEE 75
          ELEKYWGFVEEPNEE
Sbjct: 63 ELEKYWGFVEEPNEE 77

[Close]
BLAST of Cucsat.G8993 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L2P5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G571730 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 148 bits (374), Expect = 4.44e-43
Identity = 75/75 (100.00%), Postives = 75/75 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS 60
          MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS
Sbjct: 3  MLSKKKSVSQDATFSIPSKDKDYEEITYYDFDDSTTGTFKDDSENINKENVNDQDENVYS 62

Query: 61 ELEKYWGFVEEPNEE 75
          ELEKYWGFVEEPNEE
Sbjct: 63 ELEKYWGFVEEPNEE 77

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Cucsat.G8993 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Cucsat.G8993 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN54877.19.18e-43100.00hypothetical protein Csa_012198 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Cucsat.G8993 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0L2P54.44e-43100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G571730 PE=4 SV=1[more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cucsat.G8993.T1Cucsat.G8993.T1mRNA
Cucsat.G8993.T2Cucsat.G8993.T2mRNA