Cucsat.G8183 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAATGCATTATTATAACCTAAATAACAAATGCATGTTAATGTCTATCTAGATGGAATCTGCCGTTTACGTTAATTTCCCAAAAGAAATTGAAGAGAAAAGAAAAACCTCGGCAGCCCAGCAGCCCTAATCTATTCACCGTGTTCCACGCCACCTCCTTCTTCACACCATCTCCTCCTCTGTTTTAGCAGCTCAGAGTCACCGGTATCTCCCTACCGTTCACTGTTGCCGCCGCAGCCTCCCTCATAGCGGTTTTACATTGATTTCATATTCTCGCGTTGTTACCGGTATTCTCTCAGTCTCCATCTTTGTCTTTCTTCTCAATCGAAAAAATAAATTAGGACTTGCTCAATGAAAGATTGGAGTAGTCGTTTGATTTTCTAATTTTATTCTTTGTTCAATAAAATAGCCGAATATCATTCTTATTTTTGTGGTAAGTAGGGTCGTGGTTTGTGTTTGGCTGTTTCAATTCGAACGTGGTTGTACCGCCATTTTGATTTGTTGCATATGTCTGTTCCCCCCCATTTGAAGCCCGTCACTTCGTCGCACTCATCGAAACTCAATTGAATAGCGGTAGAAGCAAAGAACTGCGCCTCCCCCCGCTCGTTACTGAGCTTACACTATTCCTCGATTTTGTTTCTCTTGCTCGGTTCTCAACAGTTGGATGTATTAATCTGTCATTTCTTCTTTTTGATTCACCCATTGCCTTTCCAGGTTCACTTCGTTATTTTTGAGATTTAGTAATGGACTTCGAATAGTCGTCTGCCCATGCTTGCCTTGTATTTAATTTTTTTTTATAAAAAAATTGTATCATTTGATGTGTTTTATGCCTATACAGGTGTCAAGGATGCTATAGATTTAATTTTAGATAATGAAACAACAAAATTTTATAGAAAAGTGTCGTGATTGCCTCATTAGACACTCATGTTGGTGAATCAAAGGGAAAACTCCCGGTTAAAGTAGGACTTCTGGGATGGTTTAGATCCCAACTTTATTGAATTCCCACTTCCCATATCTTTCTTCTTAAATACGGGTTTGGCAGATAGAAGTTTTGTCATCTTACTTTCACGTTTGAGAATATATTCTTGAAGTAGAAATGTCCGTATCACCAGTATTTATTCGCATTTTCCCAATAGACCTATTCTACTGTTAACCAAATTTTTGCTCATATTTTCTTACTTATCATTGGTGGATACGATCAAGTACTGGTAGTTCTCGTTATTTTAATGCTTTGTGTATGCACTAAAGATCTTTTTGTGTCGTGCAGCTTTTGAATCATCATGTCTTGGTGCACAATTGAATCTGATCCTGGTATACATTTGTTTGGTCTTTGGTTTTCCTTATTTATTTAATTATTACATTCATGCTTTTCCAATTTCTCTATTTTAACGTTACCTCTTGATTAGATATTAGCAAAAAAAATTGATAACTTGCTCTATAGCATTCTTGTAAAAGTATAACGTCTAATTTATTTTTGTAGCAGTAAAGTAGTCTTAGAAATGGTTTGTATTGCAATTATGATTTTCAATTGACTTAAGGAAATTTTTGGATCATGTTGTTCCCTTTCCAGGTGTCTTTACGGAGCTTATTCAACAGATGCAAGTTAAAGGTGTTCAAGTAGGTTTTATTTGGATGCCAATGTTGTTTTTCTTTTTATATGCCATTGATGTCGTCTTTTGCTCATATCTCTAATTATGCATGCTATTGTAATATGAAGATACATATGTCAAATTCCCCAGAATTAGATTGAAGAGAAGTTGGCCCTATTGAAACGTACTTCAAATACTTTTGATTGATTTATTTGATTTCCTTGTGATTGGAATTTTTGGTTTCACAAAAATGAAAATTGATCAAAGTGGATGTGATAATTGGATATTTCGGATGGAATCCAAATACCATATTCAATCGAAGAGTGACATAAGGCATACATTGGATGGAATCCAAAGCCACTTAAGAACACTTATGAATTTGCATGATTTATGCGGTTTTGTGGCAGATTTGGGGTGAATCAAATGCAAAAATCTTTTAGGATAGTAGCAAGACTTCAAAGGACATTATAGATTCTACCATCTTTAATACCTTTTTTTTGGTGTAAACTTTGAAGATATACTGGCTATAAAAAGCCATAGTTTTCTTTCCTTATTGCAAATGGAAAACGTCTTTTGTATTCCCAATGAATGGTCCCCTTTTGTTTTTTTTTCTTTTTGGCCTTTTTTGAGGAGATGTCGGGGTTAAGAATTAATGGGAGTGAGTGCTGTGTTCTGGGTATTAATAGTGAGGAAGAGAAGATCAAAAGATGGGCTGATTGGATCGGTTGTGGGGTTGGGAGTCTTCCCTCTTCCTATTTGGGCCTTGTGTCTCTTTTTAGGATACTGTGGTGGATAAAATTCACAGAAGGTTGGCTTCATGGAAGAAGAGTTTTTTTTCTAAATCTGCCTGTCACTTTGATTAAGTATATTTTGAGTGGTATTCCGATCTATTTCTTTTCCCACTTTAAACCTTAGGGGAAGTTTGTAAATGTTCGGAGAGGTTGATGTGCGACTTCCGTTGGGAAGGGGTGGGTGAAGGAACAAAGGCTCTCGTCATATAAGATGGGAGGCAATTGAGAAGCTAATATTGTTGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGCTGTGTGAAATTTGAAACCTAAGGACTCGTAATAAAACCCTGTTAGCCAAATGGTTGTGGCACTTCTCTGTTGAGCCCAATTCTCTTTGGCGTAGTATTATTGTGAGTAAACATGGTCTCTATCCTTTTGAGTGGTTAGCTAAAAGGGTTAAAGGCACCTACCGGAATCTTTGGAAGGACATATCGAAAGAGCTTCCTGATTTTATTACTTGGGTTCATTGTGTGGTGGGGGACGGTAGAGAGACATATTTTTGGGAAGATCTTTGGGTGAGGAACAGACCCTTATGTGGGTTATTTTCTTGGTTTTATTAGTTATCTTCTTTGAAAAAGCATTTTGCGATGGATTTTCTATTTTTTGGTGTGGTATGGGAGCTCTTGTTCATTCTCCTTTGGGTTCTATCGGGTTTTTTCCAATTGGAAATGACAGATGTCGTGGCTCTTATTTCTCATCTTGAGAGTCATTCCTTTTGTCTTGGGACCCTTCTGTGTGTAAGTCTTTTTTCTAGTGTTTGGTTAACTCTTCCTCCTTGGGTGAGTCAGTTTTCTCTTCGGTGTGGCAGACTAAGGTCTCCAGAAAGGTGAGGTTTTTTACTTGTCAGGTTCTTCACGACCGCCTTAGCATGTTGGACAGGCTTTTGAGGAAGGTGTCGTTAGTTGAGCCTTTTTGCTAAATTCTTTGTCGGAAGGCGGAGGAAGACTTGGGCTATATTCTTGGGCATTGTGCGTTGGCAAACTTTGTTTGGGATGCCTTTTTCCAGACTTTCAGCATGATGTATGTTCATGCCTTCGTCATAGAGCTGTTAGAGATATGATTGATGAGTTTCTCATGAATTCGCTGTTTGGGAATTGAGGTTGTTTTCTCTAGTGCCTAGTGTTTGTGCCATCCTTTGGGTATTATGGGATGAAAGAAATCAGAGGGCTATCTCACATTCAACTACAGAGAGGAAGAGTTTGAAAGGTAATTTCTCTCCCCTCTCTCCTTTCCTCTACTCTTCCCTTGTTTAGCAAGCCGACGACGAAGCCTCTTCCCTGGAATTTTCTTCAACCGATTGTACCTTTTAGACTAAACAAAAAACATAATGGAAGTGGTCAGCTGTAGAGTTCTCCAGTGGCATTATTGTTTCTGGAAGAAGGAGATAGATTTCATCTCGAAGATGTGGAAGCTCACAGAATTTTGTTAGTTTCTGAAAATCAACTAGTATGGTTCTTCAAAGCAGTCTTTGAATTGTTAAGAGGTCCAACAGATAGATATTACCAAAAGTTTGAGGACTTGGATAGAGGAAGAATTAAGATGTCGAAGTTTAAGACAAAGATTGTTTGGGTTTAAGCTGCAGTCTTGGCCAAAATCAGGAGGTCACTCAATCTTAAAGGTGTGTTCAGAGGAATCAAACAGGGATGGAGGTCTTTTCACATGTTGAAAAATGTCATTTCTAAGGTGGAATATGTTAAATAGTTCTCGCACAAGCACTCCAAGGCTAACATTTTGCCACTAGCCAATATTTCTAGCTATGTAGACAAGGTCAAATCAAAAAACATCAAAGACTTTGTTAAAAAGAAAGGAAAGTTCGATGACAGAAAAACAGAGTCAATGGGTGATTAAAAATACTGAAGTTATTAGAGGAAAGTTTGAATATCTTTGGATTGTTACAAGACTCTTTGCATTCAATGACTGGACTGGAGAGAGATTCGGAAAATGCTGGAAATTTATATTCAAGCAAAAATTATCATCAACCCTCTGTTTGACGAGAATGCCCTCATAAGTCCAGACCAGGGCTTGATAGAGGATTTCACCGTTGAAACAGGGAGATGGGGTCTTTTCATGTCAAATTTGAGAAATAGGATGAATTCAAACATAGTCAGCCGCCTCTTGTTACAAAAGGTTTCGTAGGATGGTTAAGAATAAAAAACCTTTCCTTGGACTATTGGTGTAGAGAAATGTTTGAGTTATTGGTGATCACTTTGATGGTTTGGAGAACATCGCTATAGAAACATCAAACCTCACAAACTGCAATGAGTCATACAAAACAAAGGGTATGAAAGTTCGATTCATCTAAAAATAAACTGCAGTGACGGAAGGATTCAAGTTAAACAAAATTTATGCGGTTTTATGCCTTCTACCATCAAAATTACAGATTTTAATAGGGGCAACATCTTCTTGAATTTTGGTGATATTGAGAATATAGATCCCCCTAGTTCCACCAAAGGTTCTCTTATCATTAAAGACTTTAAAAATCCCATCGATCAATTGAGAGTTAGGGAGGTCTTGAAAGATGAAGAGGTCGATGTTTCCTTCTTCCCCCATGAACTAGACATCCTCAAATCCACCTTTGCAGCTC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ATGTCTTGGTGCACAATTGAATCTGATCCTGGTGTCTTTACGGAGCTTATTCAACAGATGCAAGTTAAAGGTGTTCAAGTTGAAGAGTTGTATTCGTTGGACCTCCACTCTCTTAACAATATGAGGCCTATATATGGTTTGATATTTCTATTCAAATGGCGTCCAGGGGACAAAGATGATCGTCTTGTTATTAAGGATCCTAACCCAAATCTATTTTTTGCGAGTCAGGTAATTAACAATGCTTGTGCAACTCAAGCAATCTTGTCTATTCTGATGAATTGTCCCGATATTGATATTGGCCCGGAGTTATCCAAGTTGAAGGATTTCACTAAGAACTTCCCACCTGAACTCAAAGGTTTGGCTATTAATAATAGTGAAGCTATACGTACGGCCCACAATAGTTTTGCGAGGCCAGAACCCTTCGTTCCTGATGAGCAAAAAGCTTCTAGCAAGGATGATGATGTGTACCATTTTATAAGCTATATACCTATCGAAGGGGTACTTTATGAACTTGATGGGTTGAAGGATGGACCTATTAGCCATGGCCCTTGCCCAGGCAGCCACGGTGACCTTGAGTGGCTGAAGATGGTTCAACCCGTGATTCAAGAACGCATTGAAAGGTACTCAAAGAGTGAGATAAGATTCAACCTCATGGCCATAATTAAGAATCGAAAAGAGATGTATACTGTCGAGCTTAAGGAGCTCCAGAAGAAGAGAGAGCGCATTTTGCAGCAGTTGGCTGCCTTGCAATCAGAAACACTGTTGGAACATAGCAATAACGAGTTTTTGAACAAATCGTTGTCAGAAGTAAATGCTGGGATTGAGAGTGCTACAGAGAAAATCTTGATGGAAGAGGAAAAACTCAAGAAGTGGAGAACTGAAAATATCAGAAGGAAGCACAATTACATACCCTTTTTGTTCAACTTCCTAAAGATTCTTGCGGAAAAAAAACAGTTGAAACCCCTTATCGAGAAGGCTAAGCAGAAAACTGGTGGCCCTAGGTGA MSWCTIESDPGVFTELIQQMQVKGVQVEELYSLDLHSLNNMRPIYGLIFLFKWRPGDKDDRLVIKDPNPNLFFASQVINNACATQAILSILMNCPDIDIGPELSKLKDFTKNFPPELKGLAINNSEAIRTAHNSFARPEPFVPDEQKASSKDDDVYHFISYIPIEGVLYELDGLKDGPISHGPCPGSHGDLEWLKMVQPVIQERIERYSKSEIRFNLMAIIKNRKEMYTVELKELQKKRERILQQLAALQSETLLEHSNNEFLNKSLSEVNAGIESATEKILMEEEKLKKWRTENIRRKHNYIPFLFNFLKILAEKKQLKPLIEKAKQKTGGPR Homology
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04482 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UCH2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 359.8 bits (922), Expect = 2.5e-98 Identity = 177/240 (73.75%), Postives = 213/240 (88.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFF2 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UCH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 320.5 bits (820), Expect = 1.7e-86 Identity = 158/240 (65.83%), Postives = 199/240 (82.92%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y5K5 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UCHL5 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 201.8 bits (512), Expect = 8.7e-51 Identity = 113/242 (46.69%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54N38 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=uch2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 200.7 bits (509), Expect = 1.9e-50 Identity = 110/247 (44.53%), Postives = 157/247 (63.56%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06AT3 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 OS=Sus scrofa OX=9823 GN=UCHL5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 199.9 bits (507), Expect = 3.3e-50 Identity = 112/242 (46.28%), Postives = 163/242 (67.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. NCBI nr
Match: XP_031741653.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 481 bits (1238), Expect = 2.16e-170 Identity = 243/243 (100.00%), Postives = 243/243 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. NCBI nr
Match: XP_004141571.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8649023.1 hypothetical protein Csa_008361 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 481 bits (1238), Expect = 9.15e-170 Identity = 243/243 (100.00%), Postives = 243/243 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. NCBI nr
Match: XP_016902434.1 (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 470 bits (1210), Expect = 3.85e-166 Identity = 239/243 (98.35%), Postives = 242/243 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. NCBI nr
Match: XP_008459685.1 (PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 470 bits (1210), Expect = 1.62e-165 Identity = 239/243 (98.35%), Postives = 242/243 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. NCBI nr
Match: XP_038889112.1 (ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 466 bits (1198), Expect = 2.69e-164 Identity = 235/243 (96.71%), Postives = 238/243 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSX7 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G652300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 481 bits (1238), Expect = 1.05e-170 Identity = 243/243 (100.00%), Postives = 243/243 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E2H2 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498729 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 470 bits (1210), Expect = 1.86e-166 Identity = 239/243 (98.35%), Postives = 242/243 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAA0 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498729 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 470 bits (1210), Expect = 7.86e-166 Identity = 239/243 (98.35%), Postives = 242/243 (99.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJX7 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021226 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 466 bits (1198), Expect = 2.23e-164 Identity = 233/243 (95.88%), Postives = 241/243 (99.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G8183 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHU9 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021226 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 466 bits (1198), Expect = 5.47e-164 Identity = 233/243 (95.88%), Postives = 241/243 (99.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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