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Cucsat.G17265 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACATAATTAATAACCTGTATTAGTTACCATATTTATCAAAGCCTTTTGATGGTTCTGCCGCCGTCCAAACACCGTCTCTGTCCGATGGTTCGTGAGCGATAGAAGAAGGAACTGTGGTAGCTGCCTCCGCCCGTTCGTACGGAGTACGCTTCCGTCTTGAGCTCGGATCGTGGTCGCCGGATGGAAGCTATGGTCTCTGCTGTTTGAGAGGTACAGGTGGAAGAAGGGAGGAACCGCAAAGTTGCAAAGTTTTATTTGTTTTTCGTAATTAAAGGGCAAATTGGACTTTTCCTTACTTATTTGTCCCAAAACTGTTTTCCCCATAAAAAATATATCTTATTTGCTTTTGGTAATTTCCCCTAATTCTTCCCGCTACCCTCGTTGAAAATTTCTTGCATTGGAACTTTAGGGCAAAATCGGTAGATCAACTTAATTTCTTTCTTCATCACCATTTTCTCACGTTCTCAGCAAAATCACAGCAATTATTCAGCTCCGTTCTCTCTCTCTTCAGCATTCCTTGGAGCTTTGGGGACTCAGTTCATCTCCCTCGTCGGTTGGCGAATCAAACATCGGTGATCTCATTTCTTCAGTCAATGTCTCTTGAATAAGGTTTGTTCTCCTGATCTATTCTATCGAATTAAGTTATTTTTTAATGGCTGAGGTTGCTGGTTGCTGGTGAATTATCCTTTTATTGGTAGTTTAATCATGGTTTCTGGGAATTCATGACGTGGGTCTGGTTTTTGGAGTGTGTAATTGTTTTGTAAAGGTTTTAGTTGCTGCCAATCCGTCGTTATTTATGTTCCGAGTTTGTTGTAATGCGTGTAATTGTAGGTCTCTTCCTGCTATCAGTCACTTCCTGGTTGTGGTCGTCTACTACTGTAGTCAGTTGTAACTTGGGAATTTGTGACATTTGATATCTAGAGTGGCCTATGCCCATCACGGTTTTTATCCTACACATTTGGCTGTCAAAAATTTTGTAGGATTTTTTTCCATAAATTTGAACCCATTGCAAAAAAAGGTTTATGCCGAGGAAGTACTCATCCTCGTTGCTTTCATAAATAGTTCTGGGTTTTACCCTTAGTAATCTTAATTCTATAAATGAAATCTGTTTCTTAAAATAAAGGGAAGGAGACATTGCATTCGTGTTGCATTTTGTTTATTTCCCGTAGAGTGCCTATGCTTCTCAAGGAGGAGAGGAAAAGGACGGCATGCACTGGCCTGATTCATTTTAGGAAATGTTATTAGTGAATATCGTGCTGTTCTGTAGTTAGATTATTTGGCCTTTTGAGCTTGGTCTCAAGAATTTTTTGAAAGACTTGAGCTTCCCTTCAATGATACCGGCTTGATATGTTTAGGGAAAGGCTTGAAAATGGGAGAACCAAGAAAGAAGGGAGGCAATATACAAAAACGGCCTCCAATCTAACATTACGGTACCTAATGCGTAATTACAAAAAAGCCAAGTTACCAATATAGGGACATGTTGATCCTAAACCCCTCTAAAAAAATTCTATTGTCTCTTTCTCTCCAAAGCCCCCTAACTATGGCACACATCCCAATGTGCCACAAAAACCTTGCTTTCTCGAAATTTATGAAAAGGAGGATGGAGAAGGAACTCCTTCGTCATCTCTGTACAACCTCTATCTCTGGTCAAACTATACCAATTCTCCAAAAAGCACTAAGATTCCAAACTGCATAATAGGTTTCACTAGCCCAAGAAGATAATCTAGATCTTTTGTTGGCCTCCTGCAAAGAATGCAACAGAACGACCCCATTGTTGGGAATTTACGCAAGACATATAAATGCACTCCTACATCACAAGTTAGAACCAAATAAGCAATCGATCATAAAATTGCAAATACTAAAGTGTAGGGAAAGAGGAGAACGACTCTGGAAAATATATTGGTTCGCCTCAAACTTGGGACTACGTCCAATCTTCTACAAGTGCAGGTTCTACTACAATGTAGATTGAAAAGAAACCCTCAAAACATGCTTACAAATCTCTCTTCCCACATAGCCCAACAAAAGCTATTTGAATCTAGTACCACAACTTGGTATCTTGGCATAAAATAAGAGAAATCCCCAACCAGATAAGAAAAATACACATTGTATTATATAAGAATCACTCACTGTCACACAAATACTGAAGAAATAAAAAACAGAAAAAAATTCCCTGAGACACGACTTCTTTTTTTTTTTCCCTACCTTTTGGCGAAAGAAAATTGAGCTCACTTGAAAATTTTCCTTCCAATTAAACACATATATTAATGTTTGCAGCACTAATAATGGGCCAAACCCAAATTTCAGCAGTTTCTTCTTTACTAAGCCGCCTCATAATTTACCAATCAGGAGACAATTTTTTCCACCTCCATAATTTCCCAATCAAAGAAAAGCTTATGGGTTAAGAAGAAAGAATTGGGCTTTGGAGTTTTGGGCTCCATATCCTAACACCCATCATGTTGGTCATCGTCCTTGAGATTCCATTCAAGGCGTTAATTTTTCCATGGAGAACCTACCAGTCAAAAAACTTAGCCTTACTCTAATTTTCACATTCCATGATGAGGCAAAGACTGAATAACTATTGGGCGATGGGTTTGTTAAACAAAGAAGAAATGATTTACACAAGAACACGTAAGAAGGACTAGGGTTCTAGGAATAAACATCCCCTCTACCTTGGCTACAAAGAAACTCTCCAAGCACCAATAGAAGATTGATAATATCCAACATTTCCCAGTCGTACAAGGCTCGAGTGTTAGAAATGTTATTAGTGGTTAGCTACTGTTTTGTTTGGCTTTGTTTTATTGCTATAATAGGTTGTTTTGCTCATTCAGCCTTGGTTTCGTGAATCGATTGAATGAGTTTAAGTTGTGCTCTAACAGTTACTTGCTTGCTCCTTTTTAGGTAAAGGCTCGAAATGGGAATTTTTGATGGCTTGCCAGTTCCTCCCGAGAAAGATGTGAGTCTTCATTTGGATGCTCATTTTCATGTAGTTTTGGGGTGTTACATGGGTTATGGTTCTTCATTCCTTTCATACGTTGTTATAACTGCCCATCAATTTTGTATTTTATATTTTGCCACATTCAAAAGGAAAAGGTTTTTAATGTGAATACATGATTAGTTGATCACATTGCTGAATGGAAGGATATTTGGAGGTTTAAATTAGTGTTTAGAGTAATAGCTTGTAGCACATTTCATTTACCTTCTGTACATCAGGAAAGGTTCATCGATTCATAGATTGAGTGTTATTTATGATATTTGTATTACTTGCAATGCTTTTATTCACACATTGTAAATTTCTGTTTTTGTATTATATGCTTGACATGACTTCTAGTGATGGCATTTGAAACTTAGTCATGTTTCATTCTTCATATTGGTGCTCCTGCCCAATTATGCCAATTGGGAGCCTTATTTTCTTTAAATCACAGACACATATACATATATGATAGGATACAACTAAGATACAGGGTATTGTAAGTGACAGAGTGGCCTTGCTGCCAAAATCCACTGAGATTCAGCCTTTCGTTGCTCCAAGTTGACTAAATGTAATCTATCAAAGCATAAAATATCAAAATAATAACATAAAGATACTTACTTTAATCCTTCAACAATGGAGGAGATTGAGTTTATGGAAGGATTTATGATTGACCTTGGCTTGAGGATGAAGATGTCGTATTACCTAACTAGGTATCTAATAATTTAAGTTTAAATTAAAGGAGGTTTCAAAAGGAAATGAAAAAAAAAAAAAGAGCTTTGAAACTAGGGGCGACGGCAACGGTGAACGGCTTAGGGAAAATGGCATTTCTTGGTTGAAGAAATGGGAAAAATATGAGAGGGGTGACTTGTTCATTGAAGACGAAAACTGATGAGGATGCGAGGGAAATGAGGAAATCTAATTTTAGGGTTTATTTCTTTTACTTTTCTGATTATTTATTTATTTACTTTCCTTTTGAGGTGTTGTTAATTATAATGCTTTTATGAAATTAAGTGGGTTGTGGGCTTAAAATTCAGCCCAAGTATTCAAAATTTTGTTATTGGCGTGTCCTTTTCATGTATCTGAAAGGGACACTCATATCCGAACAAAAAAAGAAAAAAAAATCAGATACTCTATTTCGCGTATATGGACATAGTAATATTAGATACATATTAACACTGCTTCTTTTCACTATTTGAAGTATTTGTAGTTCATAGCTTATTTGTAATCCCCTTGGCTTTCAGGGATCTTTCATCGCCTCTTTTTGTACACTCCATTTTTTAAAAAATGAATACAGTCGTTTTGTAACAAATAAAACAAAACTAAATCCCGTGGTGACCCTTGCTATTGTGTGCATGTCTCTCTCGTCATTCATTATGGGCCATTTTTTTTGTTTGGGGGGGGTTGAGCATTGAAATTGACACTTTTCGAAAGGCCATTTACTAGCCATCTTTATATTTGGGTATCCATGTGAAATGCAGTATTTAAAGGATGAACTTTCGAGAGTGGATGAGAGCTGGGCTGCTGCAAGGTTTGATTCACTTCCTCATGTTGTTCATATTCTAACGTCAAAAGATCGTGAGGGGGAAGCACAAGTTTTAAAGGAGCAGAGTGATGTTATTGAGGAAGTTGTGGATGAAGTGGTGCATGCTTTTCACAGTGGTTTCAACAAAGCCATTCAAAATTACTCCCAGGTTTATTATCATGATCATTATTTTTGCCTATGTGCTCACTTTTACTATCTGATTAGGGATTCAAATGTTCTCTTATCCTTTCAATTAGTCATTATTCTTGGGTCATATTTTCTTTAGTTGAACCCATTGGCAGCATTGAGATTTCCTTGGCTTGGATAGTGTCTTGTTTCAATATATCTGGAGTGTTGTTGCAGGGATCTCTATAATTCTTATGTATTGTAGAATTCTCTGTAATTTGTTAAACAGCTCTTCTGAAGTTTTTCTCCCTTTCCTTTTTGTATTTGTTGCAGAATTTTATATAATTCATTTATTAAACCAAAGCTTTTTAATTG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MGIFDGLPVPPEKDYLKDELSRVDESWAAARFDSLPHVVHILTSKDREGEAQVLKEQSDVIEEVVDEVVHAFHSGFNKAIQNYSQILRLFSESAESIAVLKVDLADTKKSFSARSKQLHQLWYRSVTLRHIISLLDQIEGIAKVPGRIEKLIAEKQFYAAVQLHVQSALMLEREGLQTVGALQDVRSELTKLRGVIFYKVLEDLHAHLYNKGDYSSAVSIMQERDDDVPTAEAVALSLNSSQSLSRRTRSQRGDSQFGSHVDGSFRTGSVDDGSSYDGHEEASTLELNDEAVSDGQSTFSRVNGGDGGLKEAKLVTRQLPTWLSNSIPDEFLETIKKLDAPVHVKYLQTMIECLCMLGKVAAAGAIICQRLRPTIHELITSKIKAYAEQRNSARLGFGQAVRSGTAAHFTKGQLESFHVPKHKCQNGISLAGTLIAVSPVSPVMAPMGKAQTSARDLLDSVLETIVRVFGQKTFFIYIYFD Homology
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YU5 (Exocyst complex component SEC8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 291.6 bits (745), Expect = 6.7e-78 Identity = 148/194 (76.29%), Postives = 170/194 (87.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54P76 (Exocyst complex component 4 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=exoc4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.2e-10 Identity = 42/168 (25.00%), Postives = 82/168 (48.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96A65 (Exocyst complex component 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.2e-10 Identity = 39/143 (27.27%), Postives = 73/143 (51.05%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35382 (Exocyst complex component 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Exoc4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.2e-10 Identity = 39/143 (27.27%), Postives = 73/143 (51.05%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q62824 (Exocyst complex component 4 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Exoc4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.2e-10 Identity = 39/143 (27.27%), Postives = 73/143 (51.05%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. NCBI nr
Match: XP_004140077.1 (exocyst complex component SEC8 [Cucumis sativus] >KGN48109.2 hypothetical protein Csa_002980 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 345 bits (884), Expect = 1.33e-108 Identity = 182/194 (93.81%), Postives = 185/194 (95.36%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. NCBI nr
Match: XP_008456522.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: exocyst complex component SEC8 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 341 bits (875), Expect = 2.73e-107 Identity = 180/194 (92.78%), Postives = 184/194 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. NCBI nr
Match: XP_038884800.1 (exocyst complex component SEC8 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884801.1 exocyst complex component SEC8 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 338 bits (866), Expect = 5.56e-106 Identity = 179/194 (92.27%), Postives = 182/194 (93.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. NCBI nr
Match: XP_022134188.1 (exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia] >XP_022134189.1 exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia] >XP_022134190.1 exocyst complex component SEC8 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 337 bits (865), Expect = 6.42e-106 Identity = 177/194 (91.24%), Postives = 183/194 (94.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. NCBI nr
Match: XP_022990216.1 (exocyst complex component SEC8-like isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022990217.1 exocyst complex component SEC8-like isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022990218.1 exocyst complex component SEC8-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 331 bits (848), Expect = 1.90e-103 Identity = 170/194 (87.63%), Postives = 184/194 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Q4 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 341 bits (875), Expect = 1.32e-107 Identity = 180/194 (92.78%), Postives = 184/194 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BY37 (Exocyst complex component Sec8 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006511 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 337 bits (865), Expect = 3.11e-106 Identity = 177/194 (91.24%), Postives = 183/194 (94.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSM3 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487175 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 331 bits (848), Expect = 9.21e-104 Identity = 170/194 (87.63%), Postives = 184/194 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6N2M0X2 (Exocyst complex component Sec8 OS=Salix viminalis OX=40686 GN=SVIM_LOCUS302800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 306 bits (783), Expect = 2.34e-103 Identity = 158/194 (81.44%), Postives = 174/194 (89.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G17265 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ECM9 (Exocyst complex component Sec8 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431324 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 329 bits (844), Expect = 3.51e-103 Identity = 169/194 (87.11%), Postives = 183/194 (94.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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