Cucsat.G16188 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATAGATGATTTAACCTTAAAATGATTTTGGAGGGTCAATTTTGTAGAATTTATGTAAAACATATTGTAAAAAAGAGTCAAATTTTCCGTCCATTTGTCAAAAAGGAAAAAGGAAAAAGGAAAAAGGAAGAGACGCTGATTGAAGAAAAAGGCGACATGACTCCTCATTTCGAAGAAGCTTGAATTTCGTAGTTCACCGCCGACTTCGAAGCTTTCAATCTATTAAAAATCCTCTATGAAGTCTCGGATTCATGAAGAAATTCTCAAATTCTGGTGCTAAATTTCAGTATGATTGATGGTTCCAGGCATCATAATGCACCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCGCTGCCCACTCTCCACTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGGTGATTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCCGGGTCCGCTTGTCTGATATTGCCCCCTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGATATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAGAGTGGAGGAAAGGGGCGAAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGGTGGTTAGCTTATACTCTCTGTTTACTATACTACTTGTTTAGTTCTCATTTTTAAGCCAGTTATTTTCTGATACTTCCTGAGTTCTTCCTTCAAGGATCTGTTTCTGGAACCAGGAAAATATTCATGTTGATTTATGCCGCTTTACATGAGCTCAAGTAGAATTACTAGTCAACCAATTTACTGTAATTAAACGGAAAATCATAACAAAGTGGCTTCCATCACCTAGATTGGAGCTTGAGATTAATTTGAACAAAGACAAATCAATTTTTTACCTCTCCCTTAAGTTGCACCCTTTTCATACAGTGAAATTGGCAAATTGTCTAACCGAATATTAGTGATCGGGTTCAAATGAGAAGCCCGTTCCTCACATTATCTCCTTTGCCTACAATGACTAGTCCATCTTTTTAAAAGTATCCTATGCACACATGAGGGGCATGGACATAAGTTTTGTTTTCTGAGGATATGGTTTGAGAGGAACAATCGTAACATCAAGATTGAGAGGAGGTAAGATTATTTGCATGAAGGATAATGAGAAAATAAAGAAAACCTCTTTCTGGAAAAAAAGAATTAAATGGGAAAGGAAAACTCTAACTTGATTGTCTTGGGCAAAAATTATTCAACAAACTTCCAGCTGAGGTATGATCAATCTTCCTCCTAAATGTCCGATTGCAGGTTGAAGTTTGTCCTACCTTCCAGACTCTGTCACTTGATGATATTGGGCATCCATCTTTGTCCTTTGAAAGAGAACTTCCTGTTGCCATTTGAGTTTGGCTCCATTGAGTTTTAATTAATGGTTCCACTTCTTGCTCTATGTTAGCTCCAATTCCATTTGGTATGATACTTAGAGAAAATGTTTATTGAATCATTCAGCTTTTCATAAGCTTAAATAGATTTATCAACCAACTTGCAATTGTAAATCAAGGAGAAAAACTTAACAAGTTGGTTAAGTTGATTTGTGACTTCCTGTCATTGGGTTCTAGCTTGATAAATTCAATTAATTTAAAGATTGCATTGGGTTCTAGGAGATCTCTTTGTGAGGTTCTCAGTCAAGGACGGTTTGTCTATTTATTTATAGGACTATAGGAGGATAGCCTTCTTTGCCATCTTCCATCTCTATTTATTGTGCAATTTTGGTTTAGAGAATTGCCTCTATCCTTGCTTTTTCTGATAATTACATTTTGGTCATTTTGTTTTAGTTGCCCTTTGTTTTATTTTTGTTACAGAGCAGTGGAAGATTGGGACTCTTGTCCTCCGTGTATGGCTGATATTTTTAGATGTATGGGTAAAGCAGCTCGAGCTGCCTTGTGTGCAATAGCTAGGCATCTTCGTTTGAGAAGCGAGTAAGAATGCTGTTGAAATTCATTTCTACTTTTGGTTAGTGTTTGACTTGTGTACCTATCTATACAAACAAATCAATACTTTGCAGTGTTTTCAATAATTTGCTCGATGACACTCCACTTCCTGCTACTGATGTGTCCTCATCAGTGCTTGTTGCAATGCACTTGCATAATAGCTCTTTGCACAATTGCAAGGGTTCTATTGGAGGAGGAAAGTCAGCAATGAATGTTGAGGTTGAGAAGGGGTTATTGACATTGTTTTCCTCAGACAATCCTGGTTTACAGGTGGGACTTCAATGACCTTGATAACTGATCTTTTTTAGATATTAGCATTTAAATTTAATGTCTAGCACCATAAATTCAGTGCATTAAAGCTTTACGATACTTTTAGGAGCCTCAAAGACATGGACGTTATCTTTTCCTCATTGGCAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGCTGGTACCTAGCAGACACTGTCTTGGCACCTGGAGATCTGTTACTGATTACTGGAAAGGCACTTAGCCATGCTACAGCTGGCCTTCGGCCTGCTGCATCATATAGAGTTGCTTCTGATCATTCCTTGGGCTCAAATTGTGTTGGGAGGTATATAATTCTTATAAATCCACATATTTAAAATTTTCCATTTTATTGCATAATCTATACTGTATGAGCAAACCCTTTTAATTGTTTCTTGGATTGAATTACTTTGTTCAGTGTTGTGGTTGTAGGACTTCCCTTGCATTTAGACTCATGCCCCAGACAAATGCCATACTAGACTGTTCTCCCATTGCAGCAGCTGGTCATGTCATTCCCCAAAGATATGGTCCAGTCTCTGTTAGCCAATTCATGGATGATCTTTCTGCTGAGGAAGATGTATTATGCACTCATCTGGATAAGGATAACAATTGTGTAAGTCTTGTACTCTTTTTTGGTAGGAATACTGTTAAAACTTGGATTTCTTGCCACAACAAGCCATGGCGAAGATGCATAGTATGAAAAGCTTGTGCAGATCTTAACACTGTTCTTCATAATATTCAATTCACGCAATCAATTATTTCCTCTATGTGGTATTTCTTTTTGGAAGCTTGTGTTTTTTTTGAAACGGAGAAAAGCAACTTTGTTAATAATATAAGAAACTAATGCTCAAAGTACAAGAGTACTATACTAAGAGCAAAATAAGAAAAAGACACTATCATCCAGACAATATAAAGAAAGATGAACTCAGGCAATACAAATATGAAAGTGACCTACAAACGATCACAAAGGAAAAACAATGAAAGAACCAAAGCAATAGAGAATTGAAACAATAGCAAAGAGCTTCATACAAAGAGAATTTAAACACTTCGTCGAAAACCACCCACTTCCAACTAAAATTTTGTATTCCACATGCTTCAATTTGAAAGGAGAAGGGGAACACGAAGAAGAAAGAATCAGCTGCTTCAAAACTATCCAACCTAAATAATTCTTTGCCCAACGCTTGTGTTTTACCTCTGCTTCATTTTGTTTTTCTCTCTACAAATTATTATGAATTGATAATCTAAAATAGATTTGCATTATACACTTGCTCCCTCCACTTTTGTTGTAAGTCGGTTAAAAACGCAAGTGGGTGGGTTGTGTTATGTTGGTTGGGTGACACTTTTAGACGGGGTGTTTGGGACAAGGAGTGGAATAGTGAGCTCTAGTTTAGGGAGTCGTGCACTCCTAAGACTTATAGTGTAAAGAGTTGATAAGATATAGCTTCCACGTACTATTCTATGGGTACTATTTAATATAGTTGAAGTCCCTTTCCAATAACCCTAATTTATATAATATTACAAAATAATAATTATATAATTTAAACCGTATTAAAAATATTAACAGTAGTTTATTGTTGACTAAATATTAGTGGGTAAGTACAACTAATTTTATATAGTATCAAACACATTTTAAACAATTGTTAGATTAGAAGTTAATTTTTGATCTGCTACCAAACACATATAAAAACATGAAATACACTCCGTTTTCATAAATTCTTTGTTTTCAAATTGTTGATTCCAAATTCTCTACCAAACAGATCCTAAGAGTTTTAGAAGATATACTCATAAGACCTCTTAATTGTCTTTGAATACACAACATTTTTCGTGAAAGGAAGTGGTGAATTCTTAATAAAAATCTTTACCTCATAGCTTCTAATGAATTTTGGCAATGAACGAAATTTTGTGGGCCATTCTTCTATTTTTATGTGCAACTTGCCTAATAATTTCCATTTGCCTGTGTGGATGAGGGGATCAAAATTCCTTGACAACTTAGAAATAGAAGACTGATAACTTTTCTCTCAAAATGTGAGTTTTGTTATGAGATGGGAAAGTTCGTGCTTGATAGAAGGGAATTTAAACTAGGAGCGGTCGAGTCTGATAGGAAGATCTTTATTGAGGACATAATGAAAGGAAACACGGTAGGTTGGAGCTGGATTTAGTTACTTCTACGTGGGTAAGGGATTGTTTAAAGGTAGCGGCGGAAGTGAGTTTCTTCATGGGTTTTTGGCGTAGAAGAAAGTTGGAGTTTGCCATTATCTTTTCTTAGATTCTTTTTTCGAACGGAGACAAGAACTTCTTTATTGATAAAGAACTCAAAGTACAAGAGAGTTATACAAAGAAAGCCATAAAGACGTAGTAATCAAGGGAGTCCTCTATCAGGAGGTGCATCTGGACATTTCAACAAGGTTGACACCCCCTTGGCGCCAAACATTATATCCCGAGCACAAGCAAAACAAAACAATAAAGAAGCAATGATAAAAGCATCCATCTTAGTACAAATGTCCAGAAAACAGTACGGGACCGGAAGAAAACAATAAGAATCTCGGGGGATGGGGGGGTGTGCAAAAAACAAAACTAAAACAGGGGGCAATCCTACAAGGCTT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ATGGTTCCAGGCATCATAATGCACCAGCAATCCTCTTCTGCAGTTTCTCCACACCATATCAATCCTCCGCCTTCCTCTCTTAGGTCACCTTCATCCACACCTCCCGCTGCCCACTCTCCACTGCCTCTCACCACTCACGTCTCCAATTCCCACCGGGAGCCATGCGACCATGTTGCCGGACCAGTGCTGCAATCCGCCGGTGATTCTGCTGTAGCTATGGCTTGCCCACTCGCCCGGGTCCGCTTGTCTGATATTGCCCCCTACGACGGTGCGCCTGCGGGGTCCTACGTGAGGGCGGTTGAGGCTTTGTCCGGATCCTTGACGAGATATAATGCGGCTGTGATTGAATTGGAGAATGAAGCTGCTGCTCTCACTCGTTGCGGTCTTGAAGCGGCTAGGTTGTTTTTCAAAAGTAGAGCGCAGAGTGGAGGAAAGGGGCGAAGTGTTTATATGTATAGAGCTGGAAGAGCAGTGGAAGATTGGGACTCTTGTCCTCCGTGTATGGCTGATATTTTTAGATGTATGGGTAAAGCAGCTCGAGCTGCCTTGTGTGCAATAGCTAGGCATCTTCGTTTGAGAAGCGATGTTTTCAATAATTTGCTCGATGACACTCCACTTCCTGCTACTGATGTGTCCTCATCAGTGCTTGTTGCAATGCACTTGCATAATAGCTCTTTGCACAATTGCAAGGGTTCTATTGGAGGAGGAAAGTCAGCAATGAATGTTGAGGTTGAGAAGGGGTTATTGACATTGTTTTCCTCAGACAATCCTGGTTTACAGGTTTGTGATCCCAATGGTCGCTGGTACCTAGCAGACACTGTCTTGGCACCTGGAGATCTGTTACTGATTACTGGAAAGGCACTTAGCCATGCTACAGCTGGCCTTCGGCCTGCTGCATCATATAGAGTTGCTTCTGATCATTCCTTGGGCTCAAATTGTGTTGGGAGGACTTCCCTTGCATTTAGACTCATGCCCCAGACAAATGCCATACTAGACTGTTCTCCCATTGCAGCAGCTGGTCATGTCATTCCCCAAAGATATGGTCCAGTCTCTGTTAGCCAATTCATGGATGATCTTTCTGCTGAGGAAGATGTATTATGCACTCATCTGGATAAGGATAACAATTGTATAGCTCGAAATGATCAAAACAAGGAAGCCTCGCTAAGAAGTGTTCTCTCAGATCCACTATCAGGTGCATTCCTTGAGGATGCGACGTTTGTTTCATGTGGACATTCATTTGGTGGTCTCATGCTGAGGAGAGTCATTGAGACGTCAAGGTGCACCATTTGCAACTCAGAAATTGATGCTGGGTCTTTGATTCCTAATCTAGCACTTAGAGCCGCAGCCTCAGCTGTGAAGCATGAAGATGATAGGAGGCTATTCCACAATGCTGCATTGAGGAAGCGTAGGAAAGAAATGGGCGACCATATGGATCCAATGAGAAGATTAAACAGGGAAAATGGTGATCTTGCCATCGATGATGGCATCCATCGAGGAGTGCAGTATCCTTTTGCAGAAAATGAAAAGGTTCTAATTAAGGGAAACAGGAGAACACCAGAAAAATTTGTTGGAAAAGAAGCAGTCATTACATCCCAGTGTCTCAATGGCTGGTATTTGCTAAAAATCATTGGTACTGGAGAGAATGTTCGGTTGCAATATCGATCTCTTAGGAAGATCCTTAACACGACACCAGCTAATGACAATAGCTGTCCTCCACAGCCACTTCAGCACAGTTGCTCATAG MVPGIIMHQQSSSAVSPHHINPPPSSLRSPSSTPPAAHSPLPLTTHVSNSHREPCDHVAGPVLQSAGDSAVAMACPLARVRLSDIAPYDGAPAGSYVRAVEALSGSLTRYNAAVIELENEAAALTRCGLEAARLFFKSRAQSGGKGRSVYMYRAGRAVEDWDSCPPCMADIFRCMGKAARAALCAIARHLRLRSDVFNNLLDDTPLPATDVSSSVLVAMHLHNSSLHNCKGSIGGGKSAMNVEVEKGLLTLFSSDNPGLQVCDPNGRWYLADTVLAPGDLLLITGKALSHATAGLRPAASYRVASDHSLGSNCVGRTSLAFRLMPQTNAILDCSPIAAAGHVIPQRYGPVSVSQFMDDLSAEEDVLCTHLDKDNNCIARNDQNKEASLRSVLSDPLSGAFLEDATFVSCGHSFGGLMLRRVIETSRCTICNSEIDAGSLIPNLALRAAASAVKHEDDRRLFHNAALRKRRKEMGDHMDPMRRLNRENGDLAIDDGIHRGVQYPFAENEKVLIKGNRRTPEKFVGKEAVITSQCLNGWYLLKIIGTGENVRLQYRSLRKILNTTPANDNSCPPQPLQHSCS Homology
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DBN5 (U-box domain-containing protein 62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB62 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 1.1e-20 Identity = 53/141 (37.59%), Postives = 83/141 (58.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q58FY4 (U-box domain-containing protein 63 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB63 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 1.2e-19 Identity = 54/142 (38.03%), Postives = 79/142 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. NCBI nr
Match: XP_031741483.1 (uncharacterized protein LOC101206682 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 333 bits (855), Expect = 2.74e-112 Identity = 164/164 (100.00%), Postives = 164/164 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. NCBI nr
Match: XP_004140426.1 (uncharacterized protein LOC101206682 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648109.1 hypothetical protein Csa_004712 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 333 bits (855), Expect = 1.36e-109 Identity = 164/164 (100.00%), Postives = 164/164 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. NCBI nr
Match: TYK14433.1 (RING/U-box superfamily protein isoform 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 1.53e-108 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. NCBI nr
Match: KAA0032189.1 (RING/U-box superfamily protein isoform 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 1.53e-108 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. NCBI nr
Match: XP_008456843.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496673 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 2.14e-108 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SSH6 (RING/U-box superfamily protein isoform 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold452G001180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 7.39e-109 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CRE0 (RING/U-box superfamily protein isoform 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold186G00920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 7.39e-109 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C495 (uncharacterized protein LOC103496673 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 1.03e-108 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3S2 (uncharacterized protein LOC103496673 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 327 bits (837), Expect = 3.36e-107 Identity = 161/164 (98.17%), Postives = 163/164 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G16188 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTN9 (uncharacterized protein LOC111487410 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487410 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 312 bits (799), Expect = 2.81e-101 Identity = 154/164 (93.90%), Postives = 159/164 (96.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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