Cucsat.G12371 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGATGGAAGGGACACGTCATCTCTCTCCCTCTAAAATTGGCCCATTGGATAAGAACCCACCATCTCGGCTCTCCACACCCTCCCTATTCCCAGTCTTCTATATATTTCCCTTCTCCTTCCCCTTCCATTTCCCCCTTCTTCATTCCATTATCACTACACTTTCCTCTTCTTCTCAACACCCTCCCATTTCCGTAATTAATGGCCTCCGTCGCTACTGCTGGATTCATCGCCCCATCTTCCTCTTCATGTTTTCCCCATACTAATCGTCCAAACAAGAATCGAACTTCCACTAATCAATTTAGAGTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCGTCGCCGATCCTTATCGAACTCTTCGGATTCAACCCGGTTCCTCTGAATCTGAAGTCAAAAAAGCCTTCCGACGTCTCGCTCTTAAGGTTTCTTCTTTTCTTTCTTTCCATTTCTTTATATTACAGGATTTGTTCCATCCTACTGATTCTTACGATTTCTTTGATTCTTTTTTTTATCAGTATCATCCTGATGTTTGTAAAGGGAGAAATTGTGGCGTTCAGTTTGAACAAATCAACGAAGCTTACGTTGTACGTGATCACACCCTCTTTTTCTTTTTAATTATTTACTCAAGTTTGAATCAATTATTGAAATGATCAATTGTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATAATAATAATAATTGTGCACCTATTATTGCAATAACTATTTTTCTTTTCTTTCCGCACATAATTACTAAACTAATTAAATATATAGACATTTTTTTAGAGGACATAGTTTGAATTCCACTATATGTAGCGTGTGAAGTTGAGTGTTTGTTTAGGTTCATGTCGGTTTCATAGTGTTTTCGGTCATTCTTTCATTGATTTTCCTTTACCTATTTGTCGTATATCATGTTAGGTTATATTATACACACACACACACTTGCACTATGTCTTTTGCTTTTATTGGGTCCCAGATCGACCCAAATTTGTTCAAGCCTTTTTATGTAAATAGCAAATTTTGATCGTTGCGCTGTGTTGGTTATCATAGATTGGGTAGATATGAAGTTGGGTCCCAAACGCCTCCACCGTCTTTTACATAATTTCTACTCTTGGCCTATTTGTAAATTCTAATAATCGAACAAATTTGTATGTGAATTCAATTCTTGCAACAGATCTGAGCTATGAAGATAGTTTGAATTTTGCTAACGAGGTGATTTTTTATTTGGTGAAACAGATTGTGATGAATAACTTGAGAGGTATAGCAACATCAATAGAGACATATGAAACAAAATATTCTGAAGGGACTGATGAACCGAAGACAAAATATGGGGAACCAGATTGGGACTCGTATGAAGAATGGATGGGATATGAAGGAGCGTGGATGGGTGATTATTCATCTCAATATTAATCCCGAAATTTAAAATCCAAAAACAAAAAATTAGAAATCAGTTGTGATTTGTTCATAGAATTGGTCTTCAATTTATCAACATCATCAACAACCAACGGTTGTGATGATTTGGTTTGGCTTGTATATATGGTGGGAAAAGAGGGGAAGTTGAAAATTGGTATTAATTCATTAATGTGTGCACCCTTTTTTTTCAAGTGGTGGTGGTGTCGTTGTTGTACATATGGTCAAGAGCAGAGGCTTTTGGGTCTTTTAATGATATGAAAAGGCTTTGAAGGAATGGCCTAGCAAAGTTGTGGTGGGACATTTGTGTTTTTATCATTTTAACTCTTTATTTTCTGGTTGTTTCCCCAATCGAACGTGGTTCGTTTCTGTCCAATATTATCCGTTTCTGAATAAAATTAAGAGGTGGGGATAAGAATGACTAATTACCTTTGTTGAGTTCCATTTCAATGAAAAGGAATTGCCTTAATATTCTGGAATTGAGATTTGTAAGATTAACTGGAAACGTATTTTTACTTATTTGAAATCAATTTTGGTGACTTGAAAATTTTCAACTTTTCAAAAATTTCAAGACAGAGTACGTCGAGAAAGTCAAAGTTTTGTCTCTTAATTCAACTTCAACCTGCACTCGGAGAGGTGTGTTGATCCCATTAAATAAAGATGAGAGATTGACGAGATAAAATAGATGAGGAACGATAAAAAAATCCCTGCATTTGGTTTTCTCATTAAAATCATCTCTACATCTTTGGTTAGGTAAAATCACAATCGGTGGTGTGATGTAACAATATTTTTTTAATTTGTAAAAGTTCAATTAAAATTGGTGGTGTGTGATGTCACAACATTTTTTTTAATTTGTAAAAATTGTGGAAAGTAAAGTAGTAACACTATTGGTTGCATGATTTTTGAAAGGGAAAGTAAAGTAGTAACTATTGGTTGCATGATTTTTGTTTCGTTTCAAGGTTCTTAATTTACATTTTGTTGAATTACAAAAAAAAGAATTCATAAATAATAATTGTAATCAAGAGTTTAATTCAATGCCGACAAGGACATTTTTCAATGTGCTTATTTAACATAAATAATAGTATGTATTATTTTTCATTTACTTTTACTATTAAAGTCGGGTGCGAGTGATTTTGAAAAGCTAAAGGTTGGGATCTAGAAGTCTTAACTTAACCCAGATGTTGAATAAGATTGGAGGGATATGAATTTGCTTTGAATGTTTGTCAAAAACAAGAAGAAAAGAACTTTCCTTTTATATATAATTGAAGGGGCAAAAGGGTGGTTTTAGGAATGAGCTAAGACATAAACATGATAAATAAATAATTATACATATACAAAGCCATATATATATATAGCAAATAATGAACAACCAAGCTCAATGAGATATACACGTGTGACGTAGGTTTGAATACTCGAAGGTGAACGTGTCTCATCGAATGTTTTATTTGTTTTCAAAATAAAGTTGTCTTGACACTTTGTTACTCTCTTGCTCTCTTGAATTTTGAATTTGCTTCAACCAACTTATATTTTAGATTGAATCTTCAAGTTCAATTGAAGTCTCGAGGTTTTCAAATATGTACTCGTTTATCTTCTCAAAAAAGTTAAAGTGTGATAAAGAAGAAATAACAAAAAGAAAATTTTGATAACGATGAGAATTTGGTACTCTCTTGAAAAATCCTTTGTGCAACCAATTTCAACTATATGCCAACATTAGATATTAGCAACTAGTACTTTTTGACCAAAACTTCAATGAAGACCATCTTAGACGAACGACTCCACTAGTAGACATTCTTTGATAACCAACGTCAAAATTCACCCTAAGGGACCAACTCTGATGAAACCCAACTCTAATGAGACCTTCGATAACAACCCTATTTTTTTCGTGAACATGCAAAACAATCCCTTAACAAATTATATGGTGTATTGATATGTTGTTTCATCCCTCGTTTTTTAGGCCACCTTCTCTACTTTATCTCCATATTAAGTGTTTTAATCCAAATTCATTCATAACCAGAGCTATGTTGAAATTAAATATGTTTAATTTTAGTTTTATTATTTAATTTTTTTGAAGCTTTATTTGCATTTAACTTTCATTTTAATGCAATTGTAGTTTTTTCATCTTCATTGAAGGCCAATCTAGTAAATGGCACATTTTGTTTAAAACACATAAATATTTAACTAAAAGATTTTACTATTTTGTTTTCCTTTTTTCTTTTCTATTTGGAGCTCTTGTATTTGTTATCTATATTTTTCTCTTTTCTAAAAAAATATCAATTTATACTTTTTTAAAATTTGAAAACGGTGTCAATAATACTAACAGTTATACATCAAATTTAAACCCTAAATATTGTATAATTATATCCATATTGTATTTTCCTTAGGTGAAAAATTAGAGTCTTTTTTAAGAATCATTGATAGAACCAATTTATAATGATATTTGACGTGTAAAATGATATAATTGAAGTTATAAATTAAAAAAGTTGTAGGATTTAGATTTTAAAAGTATAAATGGATTTTTGTAAGCATATATTTTAATCACCTTGTTAAAACTGCTATATTACGAAAATAATAAAAATTAAGATTCACATAAGAAAAACAAAATAAAAAAGGGACAAAATTGTGTGGTAGAGGCAATTAAAGAAAAGATATTAAAATGTGGATATAGTATGAAAACATTAATAAACGTCGACGTTTGAATATATCCAATTTAAATGTCATTACCACCTAATAAATATCTTATTTTCCCATTCTCATTCCACTTCTTGACTTTGACACACATTCTTTTCTTGATTGTTACTTCCTCTTCTCTCAAATTAAAATCACAAATAATTAGCTTTTCTTTTTTAAAAAAAAGAAATTGTTTTATTTTATAAATATTTTTCATCTTAAAATATTATATTTTTTAGTCTGATTTTAAAAATCATTAAAAATTAATAATATTGTTTATTAACACAACTTTCAAAAATCATAAACAAAAAACAAAGCCACACATCATGAAGTGGATTAAGTCCACTCTTTTCTATTTCAAATATTTTCTACCATATATGTTGTTTTTATTTGTGATTATAAAGTTTTAAGAAACATATTTTTAATGCAACTTGGTCCGATATTTTAAATTAAAAATATATATAAATATCTATAATAATTAATAGAATATTCGTTTGAAGTTGTTACTTTTAAAATAATTTTCGGTTTTTGGTTTTTTGTTTTTGAATCTCATCTAACTTTTAAATGGTCTTTAAAAATGACTCGGTTTATGTTTGAACAGGTTTGTTTTTAATTGTGGTGTGTGAGTTTAAAGGGTAAAATATATTAAATTTAATCTAATTACTTAATGAAAATTGAATATTCAAATAACTTTTATTCACTACAGGAATTAAAACACAATCATTTATAAAAACAGAAAATTAAATTGATTTTTCAAACTGGTGGTTAGGAAAATACTATATACTTTTTTAGCTAATGTTAAAGGGAAATATGTTCTTATTCCGTCTATGTGCATTGTTGAATTTGTCATACGAGTATTGTCAAGAAATTGAAGGAATCTTTATGGCAACACAAATATACATGCCATATATATATATAACAAATAGAATAAA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CAAATCAACGAAGCTTACGTTGTACGTGATCATACCCTCTTTTTCTTTTTAATTATTTACTCAAATTTGAATCAATTATTGAAATGATTGATTTTTCTTTCTTTCTTTCTTATAATAATAATAATTGTGCACCTATTATTGCAATAACTAATTTTTGTTTCTTTCCTCACATAATTACTAAACTAATTAAATATATAGACATTTTAGAGGAAATAGTTTGAATTTCACTATATGTAGCGCAATTGAGTGTTTGATTAGGTTCATGTCGGTTTCATAGTGTTTTCGGTCATTCTATCATTGATTTTCCTATACCTATTTGTCGTATATCATATCAGGTTAAATTATATACATACACACACTTGCACTTTGTCTTTTGCTTTTATTGGGTCCCAGATTGACCCAAATTTGTTTAAGCCTTTTTATGTAAGTTGCAAATTTGATCGTAGCGCTGTGTTGGTTATCATAGATTGGGTAGAGATGAAGTTGGGTCCCAAACACTTCCACCGTGTTTGTCTTATACATAATATCTACTATTGGCCTATTTGTAAATTCTAATAATCGATCAAATTTGTATGTGAATTCAATTCTTGCAACAGATCTGAGTTATGAAGATAGTTTGAATTTTGCTAACGAGGTGATTTTTGATTTTGTGAAACAGATTGTGATGAATAACTTAAGAGGTATAGCAACACCAATAGAAGAGACATATGAAACAAAATATTATGAAGGGACTGATGAACCGACGAGAAAATATGGGGAACCAGATTGGGACTCGTATGAAGAATGGATGGGATATGAAGGAGCGTGGATGGGTGATTATTCATCTCAATATTAATCCTGAAATTTAAAACCCAAAAACAAAAAATTAAAAGTCAGTTATGATTTGCACATAGAATTGGTCTTTAATCTATCAACATCATCAACAACCAACGGTTGTGATGATTTGGTTTGGCTATGTATATATGGTGGAAAAAGAGGGGAAGTTGAAAATTGGTATTAATTCACTAATTTGTGTACCCCTTTATTTTAGTGGTGGTGGTGTCGTTGTTGTACATATGGTCAAGAACAGAGCCTTTTGGTCTTTTAATAATATGAAAAGGCTTTGAAGGAATGGCCTATCAAAGTTGTGGTGGGGCATTTGTGTTTTTATCTTTTTTTAAACTCTTGTCTGGTTGTTTGCCCAATAGAGAAGGTGGTGCTTTTTTGTGTACTCGTTTCTGTCCAATATTATCCGTTTGTGAATAAAATTAAAAAGGTGGGGGGTAGGAATATAACTATTACCTCTGTTGAGTT ATGGCCTCCGTCGCTACTGCTGGATTCATCGCCCCATCTTCCTCTTCATGTTTTCCCCATACTAATCGTCCAAACAAGAATCGAACTTCCACTAATCAATTTAGAGTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCCGTCGCCGATCCTTATCGAACTCTTCGGATTCAACCCGGTTCCTCTGAATCTGAAGTCAAAAAAGCCTTCCGACGTCTCGCTCTTAAGTATCATCCTGATGTTTGTAAAGGGAGAAATTGTGGCGTTCAGTTTGAACAAATCAACGAAGCTTACGTTATTGTGATGAATAACTTGAGAGGTATAGCAACATCAATAGAGACATATGAAACAAAATATTCTGAAGGGACTGATGAACCGAAGACAAAATATGGGGAACCAGATTGGGACTCGTATGAAGAATGGATGGGATATGAAGGAGCGTGGATGGGTGATTATTCATCTCAATATTAA MASVATAGFIAPSSSSCFPHTNRPNKNRTSTNQFRVSSSFSSSVADPYRTLRIQPGSSESEVKKAFRRLALKYHPDVCKGRNCGVQFEQINEAYVIVMNNLRGIATSIETYETKYSEGTDEPKTKYGEPDWDSYEEWMGYEGAWMGDYSSQY Homology
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SAG8 (Chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATJ8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 2.6e-21 Identity = 53/82 (64.63%), Postives = 61/82 (74.39%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O66921 (Chaperone protein DnaJ 2 OS=Aquifex aeolicus (strain VF5) OX=224324 GN=dnaJ2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 3.9e-09 Identity = 28/56 (50.00%), Postives = 38/56 (67.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7NS65 (Chaperone protein DnaJ OS=Roseiflexus castenholzii (strain DSM 13941 / HLO8) OX=383372 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.3e-08 Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 36/51 (70.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5UYW4 (Chaperone protein DnaJ OS=Roseiflexus sp. (strain RS-1) OX=357808 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 4.3e-08 Identity = 27/51 (52.94%), Postives = 36/51 (70.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C3P8L9 (Chaperone protein DnaJ OS=Bacillus anthracis (strain A0248) OX=592021 GN=dnaJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 7.4e-08 Identity = 27/54 (50.00%), Postives = 36/54 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. NCBI nr
Match: XP_011651813.1 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN58651.1 hypothetical protein Csa_002647 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 185 bits (469), Expect = 1.48e-57 Identity = 95/100 (95.00%), Postives = 96/100 (96.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. NCBI nr
Match: XP_004137653.2 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN58652.1 hypothetical protein Csa_001598 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 171 bits (433), Expect = 4.46e-52 Identity = 90/99 (90.91%), Postives = 93/99 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. NCBI nr
Match: XP_008465135.1 (PREDICTED: chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic [Cucumis melo] >TYK27005.1 chaperone protein dnaJ 8 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 149 bits (376), Expect = 2.42e-43 Identity = 79/99 (79.80%), Postives = 84/99 (84.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. NCBI nr
Match: XP_038906426.1 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 135 bits (339), Expect = 1.07e-37 Identity = 75/102 (73.53%), Postives = 81/102 (79.41%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. NCBI nr
Match: XP_023525914.1 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG6606847.1 Chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7036551.1 Chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 124 bits (312), Expect = 1.18e-33 Identity = 73/98 (74.49%), Postives = 82/98 (83.67%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LF08 (J domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G710780 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 185 bits (469), Expect = 7.16e-58 Identity = 95/100 (95.00%), Postives = 96/100 (96.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LD63 (Chaperone protein dnaJ 8 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G710790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 171 bits (433), Expect = 2.16e-52 Identity = 90/99 (90.91%), Postives = 93/99 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DUL4 (Chaperone protein dnaJ 8 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold901G00100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 149 bits (376), Expect = 1.17e-43 Identity = 79/99 (79.80%), Postives = 84/99 (84.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPN7 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502812 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 149 bits (376), Expect = 1.17e-43 Identity = 79/99 (79.80%), Postives = 84/99 (84.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G12371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GC69 (chaperone protein dnaJ 8, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452806 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124 bits (312), Expect = 5.71e-34 Identity = 73/98 (74.49%), Postives = 82/98 (83.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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