Cucsat.G10549 (gene) Cucumber (B10) v3

Overview
NameCucsat.G10549
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionAmidohydro_3 domain-containing protein
Locationctg1678: 837172 .. 852147 (+)
RNA-Seq ExpressionCucsat.G10549
SyntenyCucsat.G10549
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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Coding sequence (CDS)

ATGAATCAGATGAAGGAAGTGAACCTTCATGGTGTAAATCATAAACATGAGTTTGTGACAAGGATTGCAGAAGCAGCTAAAAACACTAAGAAAGGAACTTGGGTACTGGGTGGCGGATGGAATAATGATCTTTGGGGAGGTGAATTGCCAATGGCTTCTTGGATTGATGATGTTACGCCATCTAACCCTGTTCTTCTGTCAAGGATTGATGGTCATATGAGTTTGGCTAATAATGTGACACTTAAGTTGGCTGGCATCTCTAATTTAACGGAAGATCCAGAAGGCGGGACCATAGGAAAAACTACTGGTGGAGATCCTACTGGATTGCTGATTGATTCTGCAAGGAAGTTGGTCCTACCTTTTATTCCAAAGGTTGCGGTAGAGGAGAGAAGAGAAGCATTGGTAAGGGCCAGTAGTCTTGCCCTGGCTAGAGGTGTTACAACAATAGTTGATTTTGGAAGATATTATCCAGGAGAATCAGTGGAATTATCATGGGAAGATTTTTCTGATGTGTATCAGTGGGCAGATTCTTCAGGGAAGATGATGATCAGGGTTTGCTTATTTTTTCCAATGGAAACATGGTCATCGCTACATGATCTTATCCACAAAATGGGTCAGGTTGTGAGCCCATGGATGTACTTGGGTGGTGTCAAGGGTTTTGCTGATGGGTCTTTAGGTTCACATACTGCTTTGTTTCATGAGCCTTATGTTGATGAGCCTGGCAACTGTGGCATGCAAATAACAGAACGTGAGAAGCTTTTCAACTTGACCATGGAATCAGATATATCAAAGCTTCAGGTTGCTATTCATGCCATAGGCGACAAAGCAAATGATATGGTCCTTGATATCTACGAATCTGTCATTTCTACAAACGGGCCAAGGGATCGAAGATTTAGGGTCGAGCATGCTCAACATTTGGCACCTGAAGCTCCTCAACGATTTGATCAATGA

Protein sequence

MNQMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSNPVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFIPKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMMIRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGNCGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVAIHAIGDKANDMVLDIYESVISTNGPRDRRFRVEHAQHLAPEAPQRFDQ
Homology
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A1I9LN01 (Protein LONG AFTER FAR-RED 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAF3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 4.9e-95
Identity = 160/269 (59.48%), Postives = 209/269 (77.70%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QM +V L GV+ K EF   + +A +N K+G+W+LGGGWNND WGGELP ASWID+++P N
Sbjct: 122 QMAQVGLRGVSQKDEFCKMVKDAVQNAKEGSWILGGGWNNDFWGGELPSASWIDEISPRN 181

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PV L R+DGHM+LAN++ LK+AG+ +LTEDP GGTI +   G+PTGLLID+A +LV P++
Sbjct: 182 PVWLIRMDGHMALANSLALKIAGVISLTEDPVGGTIMRMPSGEPTGLLIDAAMELVTPWV 241

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
            +++V+ERREAL RAS  AL RGVTT++D GRY+PG + ELSW+DF DVY +ADSS KMM
Sbjct: 242 KEISVDERREALFRASKYALTRGVTTVIDLGRYFPGTTDELSWKDFQDVYLYADSSKKMM 301

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IR CLFFP+ TWS L DL  + G V+S W+YLGGVK F DGSLGS++ALF+E Y+D P N
Sbjct: 302 IRTCLFFPITTWSRLLDLKLQKGSVLSEWLYLGGVKAFIDGSLGSNSALFYEEYIDTPNN 361

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 272
            G+++ + EKL N TM +D S LQV  ++
Sbjct: 362 YGLEVMDPEKLSNFTMAADKSGLQVAIHA 390

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O34355 (Putative amidohydrolase YtcJ OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=ytcJ PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 1.4e-28
Identity = 87/273 (31.87%), Postives = 131/273 (47.99%), Query Frame = 0

Query: 6   EVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWN-NDLWGGELPMASWIDDVTPSNPV 65
           +++L  +  K   +    E  +   K  W++G GWN N     +      +D + P  PV
Sbjct: 78  QLDLSALTSKDSILQAAKERERQLPKNDWLIGEGWNENQFETPDYLTKHDLDRLFPDRPV 137

Query: 66  LLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFIPK 125
           LL RI  H    N+  L+ AGIS  T DP+GG I K   G+PTGLL D A+ L+L  +P 
Sbjct: 138 LLKRICRHAIAVNSAALQAAGISRNTPDPDGGVIVKDANGEPTGLLFDKAQDLILKAVPP 197

Query: 126 VAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDV------YQWADSS 185
           V+     EAL  A      +G+T          G S +LS+  + DV      Y+ A + 
Sbjct: 198 VSQHYVDEALTAAIKDCWTKGLT---------GGHSEDLSY--YGDVSVPMKAYEKAAAG 257

Query: 186 GKMMIRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVD 245
           GK   R  L    E      D   ++ ++  P++  G +K FADG+LG  TAL  EPY D
Sbjct: 258 GKYPFRCHLLVHHEA----VDRWEQLEKLSGPYVEFGAMKIFADGALGGRTALLKEPYQD 317

Query: 246 EPGNCGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 272
           +P   G+Q+ + E L  L  ++    ++V  ++
Sbjct: 318 DPSTNGVQVHDDETLGRLIRKAREKGMEVAVHA 335

BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_004142399.1 (protein LONG AFTER FAR-RED 3 [Cucumis sativus] >KGN52320.1 hypothetical protein Csa_009444 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 544 bits (1402), Expect = 5.73e-191
Identity = 265/269 (98.51%), Postives = 267/269 (99.26%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 84  QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 143

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 144 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 203

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 204 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 263

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN
Sbjct: 264 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 323

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQV  ++
Sbjct: 324 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVAIHA 352

BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_016900239.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.50e-184
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: KAA0034760.1 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.11e-183
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 82  QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 141

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 142 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 201

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 202 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 261

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 262 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 321

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 322 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 350

BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_008446962.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 5.60e-183
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_008446960.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.29e-182
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRQ1 (Amidohydro_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G623830 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 544 bits (1402), Expect = 2.77e-191
Identity = 265/269 (98.51%), Postives = 267/269 (99.26%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 84  QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 143

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 144 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 203

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 204 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 263

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN
Sbjct: 264 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 323

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQV  ++
Sbjct: 324 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVAIHA 352

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DW80 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.21e-184
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SUX5 (Putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G007840 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.02e-183
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 82  QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 141

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 142 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 201

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 202 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 261

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 262 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 321

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 322 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 350

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGY6 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.71e-183
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGA6 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 6.23e-183
Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0

Query: 3   QMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSN 62
           QMK+VNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKG WVLGGGWNNDLWGG+LPMASWIDDVTPSN
Sbjct: 136 QMKQVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGNWVLGGGWNNDLWGGDLPMASWIDDVTPSN 195

Query: 63  PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 122
           PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTI KTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI
Sbjct: 196 PVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIVKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFI 255

Query: 123 PKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 182
           PKV+VEERREAL+RAS+LALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM
Sbjct: 256 PKVSVEERREALLRASNLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMM 315

Query: 183 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGN 242
           IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQV+SPW+YLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEP N
Sbjct: 316 IRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVLSPWIYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPDN 375

Query: 243 CGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVICYS 271
           CGMQITEREKLFNLTMESD SKLQV  ++
Sbjct: 376 CGMQITEREKLFNLTMESDKSKLQVAIHA 404

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1I9LN014.9e-9559.48Protein LONG AFTER FAR-RED 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAF3 PE=2 SV=1[more]
O343551.4e-2831.87Putative amidohydrolase YtcJ OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=ytcJ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_004142399.15.73e-19198.51protein LONG AFTER FAR-RED 3 [Cucumis sativus] >KGN52320.1 hypothetical protein ... [more]
XP_016900239.12.50e-18494.42PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 [Cucumis melo][more]
KAA0034760.12.11e-18394.42putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_008446962.15.60e-18394.42PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 [Cucumis melo][more]
XP_008446960.11.29e-18294.42PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KRQ12.77e-19198.51Amidohydro_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G62383... [more]
A0A1S4DW801.21e-18494.42putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 ... [more]
A0A5A7SUX51.02e-18394.42Putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 G... [more]
A0A1S3BGY62.71e-18394.42putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 ... [more]
A0A1S3BGA66.23e-18394.42putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 ... [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR013108Amidohydrolase 3PFAMPF07969Amidohydro_3coord: 7..106
e-value: 1.9E-14
score: 54.0
NoneNo IPR availableGENE3D3.20.20.140coord: 1..113
e-value: 3.3E-35
score: 123.3
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR22642IMIDAZOLONEPROPIONASEcoord: 5..112
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR22642:SF2PROTEIN LONG AFTER FAR-RED 3coord: 5..112
IPR032466Metal-dependent hydrolaseSUPERFAMILY51556Metallo-dependent hydrolasescoord: 11..111

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cucsat.G10549.T2Cucsat.G10549.T2mRNA
Cucsat.G10549.T1Cucsat.G10549.T1mRNA
Cucsat.G10549.T5Cucsat.G10549.T5mRNA
Cucsat.G10549.T4Cucsat.G10549.T4mRNA
Cucsat.G10549.T7Cucsat.G10549.T7mRNA
Cucsat.G10549.T6Cucsat.G10549.T6mRNA
Cucsat.G10549.T3Cucsat.G10549.T3mRNA
Cucsat.G10549.T9Cucsat.G10549.T9mRNA
Cucsat.G10549.T8Cucsat.G10549.T8mRNA
Cucsat.G10549.T10Cucsat.G10549.T10mRNA
Cucsat.G10549.T15Cucsat.G10549.T15mRNA
Cucsat.G10549.T17Cucsat.G10549.T17mRNA
Cucsat.G10549.T11Cucsat.G10549.T11mRNA
Cucsat.G10549.T12Cucsat.G10549.T12mRNA
Cucsat.G10549.T20Cucsat.G10549.T20mRNA
Cucsat.G10549.T14Cucsat.G10549.T14mRNA
Cucsat.G10549.T19Cucsat.G10549.T19mRNA
Cucsat.G10549.T16Cucsat.G10549.T16mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0016810 hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds