Cucsat.G10549 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAACTGTTAGTAAAATTATAATTTTAGCGCTTAGAATTAATTGCGCGCGCAATGGTCCACTTTGCAACCAAACCATTTCACTCCACTCCACTTCTCGAAGCTTATTTCCATTCCTTTTCTCCATTAATCTTCAACTTGGAGCACCAATCCAAGCTCCCATGGCGATGCTGTCGTCTTCATGTGCGGTCGCCGATTTAGTACTCAAGAACGCACTCATTTTTACCTGCGACGATTCTCTTCCTTTCGCCGATTCCATGGCCATTCTCAACACCAGGATTCTCCGCGTCGGCACCTACTCCGCTGTTCAGGTTCTTCAAACCTCTTCCCTTCCACTTTTATTTACATACCACTAGAACCTGCGCGCTATCTTTTGACAGAGGCATTCGGAGTTATGTACTGGAAGTTATATAGTTTCTGATCATTGTACTCGAGTCTCGTACAGGAGGATTCTAGAATTTCATCCCTCTTTTCACCGTAGCTTACTCTCTGTTTGTGAAATCGAAGCATGTTTTTCGGTTCTCTTATGTAGTATGTCTTCATTTATGTGAATACAGGACTTGGTTGGACCGAGGACAAAAGAGTTGAATCTCGGGGGAAAAGTTGTGGTTCCTGGTTTTATTGATGCACATGGCCACTTAATTTATCAAGGACTGCAGGTTTTAGTGAAGCTTCCTGTATTTCAACTGATTGCGTTACTAACTCACTGAATTCTGCTTCCCTTGTTGAACCGTTTTCAGTTTTATTTTCGGTGGAATCTCCGTATGCTTTTATCGATGTCTCAAAAATTTGATTAGTGATTACTTTTTGTTATTTATTGGCGGCTAACCTCGTATGAATCAGATGAAGGAAGTGAACCTTCATGGTGTAAATCATAAACATGAGTTTGTGACAAGGATTGCAGAAGCAGCTAAAAGTAATTTTCTCTCGTTAAAGTAGTTCACGATTCCAGTGAGAAATGTTATCTCGATTAGTATTTAGTGTGTTTGTTCTATGACGCTTTAAATAGACGTATGCTTTTAAATGAGTTTTTGCCATTTGATTGGTGCAAGATAGAAACAAACCAGAGAATAATTATTATCATAGGTTTAGTCTGGGTGGGATTTATGGAGGCGAGGACAGGTATATAATTTTTCTTGGTTTCCATTTCAATATTTAGATGATCATTTTAAATTATAAATGACTTGGAGGGATTTTTCTTACTTTTTATTGAGTCTCCTAGATCTCAATTAAAAAACCTCCCATGCAGTCATAGTAAATATTCCAAGCTTATTTGTTTGAAATGTGATTTCACCGAAAGATCTTGGAATTACATCTTCCGTTCCTCGATCTTCTCTTAGAAAAATATCTTGCATTCTTCTGGCTTAAATAGGCAATTCTTTCAGCTAAATTAGATTCTTGGTGGAACTGCAATATTTAACGGGGCCTAAAAACCTCAAGCGGGAAGTGACAAGATTTTGGAAAGTGCTGCGTATGGTCAGTTCCAGTTTAGTAATAGCTTGGTTGTGCCTTATCCTATTTTGTACTTGTTTTAAGAAACATTAAGGAACTAATAAAAAAACCTTAATTCAATAGAAAAACAAAGGTACATGATATGGGTAACACATTCTTTTATGGAACCTAGGAGATAGAAAGAACTCCCAATTGGCCAAGTATAATGGAATAAAATTATTTGGAAACTCTTATTAATACAAGACACCTCCTATTATACATTCTGAAAGAAATAGAATACCGAGAAAACAATGACATTTTCTCATACTAATGCAAGTCTAGTGAAAGAAATTATTAAGAAACTGCTAGGCCACCGATATTATTTAAATATAGCTGGAAAAATAATAACAACAGAAATATCAACCCACGCAAGAATATAGGAGAGATTATAGGGGGAGAGAATATCGGGGAAGATCTTTCACAATCGTCAGTGAGTATAACAGATTAAAATGGAGAAAAGAGGAGGAAAGAGGGGAGAAGAAAAATATTCCAGATTAGGAGAAGCTGCTCTCTTTCAGTTCGAGAGAAGCAGAGGATCGAAGTCAAGTTTATTTAATAGTTGTTTGGTCGTTTACATTGTTCTGAGTTTTCCATATTTTATTTGCTTGTTCTGATCTGTTCGGATTAGATTGAGGCTTAGGAGATAGGAGTGTGTGAATTTTTCTTTGATTATTTGATATTGTAATTTGTAAATTCAAGTCAATAAAATAAGATACTATCAGTATCTTTACAGAAACTCTTACTAATTCAAGACCACTCCCATTAGTAATTTTGAAAGAAAAAGAATACTGAGAAAATAACCACATTTTCTACTTTTGTTGGCCTGAGTTTCTTTCATTCTTAATTCTCTTTTTTCCTCAAGTCTTTCTTAAGTTGCCTAGATGGCAGTAGCAACCTTGTACTTCTTTCTTTTGATTTTTTTTCCCTGCTACAAAGTAAAACAAATATATACTAACTATAATGGGTTGACCTAGTGGTAAAAAAGGAGACCTAGCCTCAATAATTAACTAAGAGGTCATGGGTTTCAATAATTAACTAAGAGTCATGGGTTAAATCGTTTCCTACGAGTTACCTTATGTTGTAGGATCAGGATATGTGCATAAGAAGAAAAAAAATAAATAAATAAAATAAATAAAATAAATATATATATATATATACATATAAAATATATATAAATATAAATATACTGTGTTTATAGCTTCTAAATAATTTATTATAATATTTTGGGCGTGTATGTGATGATTCCGAGAGCCATCTAATTTTGAGCTTTACAAAAATATTCAGACACTAAGAAAGGAACTTGGGTACTGGGTGGCGGATGGAATAATGATCTTTGGGGAGGTGAATTGCCAATGGCTTCTTGGATTGATGATGTTACGCCATCTAACCCTGTAAGCCATTTCTTTCTTTAAGGTGACTACTACGAAACGTATCTTCTGTAATTTATTTTTCATTCAAAACTTGGCGTACAGGTTCTTCTGTCAAGGATTGATGGTCATATGAGTTTGGCTAATAATGTGACACTTAAGTTGGCTGGCATCTCTAATTTAACGGAAGATCCAGAAGGCGGGACCATAGGAAAAACTACTGGTGGAGGTGCTGTTTTACAGTTTGGTTGAAATTTAAAATTTTTGTAGGAAGCAAAAATATTTACTATGAAAACATTGAAAAGAACTACGGAGAAATAAGAGGATTGATTATTTTTTATATTACAAGAATTATTTAAAAAATAGTTTCTATTTCAAACACAAAAAGAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGGCCAGGTGTAAATGTTGAGATAATTCAACGTGGTTCAGACATCTAACTTTTGAGTATTACATATGGACTCTAGCTCGACATATGCTAATCATTGCAGTTTATTATATCTGGATGGGCTTGAATTTTGATTGAAGTCTTATCATATTTGATTTAAAATGCCAAATGAACTGCTTAAATAAGCCATTTGGTTAGGCAAACTTCAACATTTAAAAATTCATTACAATCAAGGTCACGCCAATATCAAATATGAAGTTGGCTGGGTGTGTTTCTTTCTTTCATACATTTATTTGTTAGGGAATGAAGCAAAACAAACTTAACGTAAAAAAAAAACTTTTTAGCAGGAAAATTATACCATCTTCTGTTTAAAGGGGTCCCCAAAAGAGCCCCTCATTGTACTATGAAATTTCATTTCCCATTCTTTGTTCTTTTGTGAAGAAAACCAGTCAACTTCATTTCTCTTTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTTGTACGTTTCAGTTGTCAATTGATCTTAATGAGGTCAAATGAAGTTATCTATAATTTAGTTTTTGTGCCCCAGATCCTACTGGATTGCTGATTGATTCTGCAAGGAAGTTGGTCCTACCTTTTATTCCAAAGGTTGCGGTAGAGGAGAGAAGAGAAGCATTGGTAAGGGCCAGTAGTCTTGCCCTGGCTAGAGGTGTTACAACAATAGTTGATTTTGGAAGATATTATCCAGGAGAATCAGTGGAATTATCATGGGAAGATTTTTCTGGTAATTTTTCTATTGTTTTAATTACTAGTTCAGGCCTCTCTCTCTCTCTAACTTATCTTGGTTTGCTTCCTCGATGTCTGCTTATACGGAAGGACTCACAATAGGCAGATATGATTACTTATTATTTTCCTACCTTCTCGTAGTAAATCAATTTTTTTTATCGGTGTGCAATAATTTTAAATGGGCAGATGTGTATCAGTGGGCAGATTCTTCAGGGAAGATGATGATCAGGGTTTGCTTATTTTTTCCAATGGAAACATGGTCATCGCTACATGTATGACACCCAATGGAATGTTATTTAAATGATGTTCGTCATATTTCCCAAGTTTGTGTTGCTAACTTCTTTAATTCGTATCTGGAACATATATATGCCATTTTAGAATATGCTACTTAATTTTACAGTAAGAAACATAAACATGCAAACCAACATTGATATGGGCTGTCTTTATTGAATTGAACTTTTGGCAAATGACTTTATATGTCAACTCATCCCATGTTTTTTTTAAACGGAGACAAGCTTCTTTATTAATAATAAACTCAAAGTACAAAAGAGTTATACAGTGGAAATAATTGAGAAACCTAGAAATGGGAAAGAGGGAGGATTAGTCAACTAGGTTGACACCCCCTTAGCACCCTCGTCATATCAAAATAAGAATAATTCTAAGGTCATGCAAAGACCAAAAATAACAATATAAACTACCTATAGGTAGACAGATGCAAAGGACAATAAAAACCGGAAAGCATAAAACTAAGGATCAAGTGGTGCACCCAAGACATTTCAATTAGATTGACTCTCCATATTGTAAAATGATGGTTGCTTGTTTAATTATTTAAAGGCGCAGGTTTATGTATATTTACTATTTCTTTTTGACAAGTGTTGGAGGCTTATTTGCCCCTCATTTAGAGCTCAAATAATTTGTAAATATTTTCATTGATCAATTTTTAGGGTATTTCATTAATGTTTTTATGTCTTTGTG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ATGAATCAGATGAAGGAAGTGAACCTTCATGGTGTAAATCATAAACATGAGTTTGTGACAAGGATTGCAGAAGCAGCTAAAAACACTAAGAAAGGAACTTGGGTACTGGGTGGCGGATGGAATAATGATCTTTGGGGAGGTGAATTGCCAATGGCTTCTTGGATTGATGATGTTACGCCATCTAACCCTGTTCTTCTGTCAAGGATTGATGGTCATATGAGTTTGGCTAATAATGTGACACTTAAGTTGGCTGGCATCTCTAATTTAACGGAAGATCCAGAAGGCGGGACCATAGGAAAAACTACTGGTGGAGATCCTACTGGATTGCTGATTGATTCTGCAAGGAAGTTGGTCCTACCTTTTATTCCAAAGGTTGCGGTAGAGGAGAGAAGAGAAGCATTGGTAAGGGCCAGTAGTCTTGCCCTGGCTAGAGGTGTTACAACAATAGTTGATTTTGGAAGATATTATCCAGGAGAATCAGTGGAATTATCATGGGAAGATTTTTCTGATGTGTATCAGTGGGCAGATTCTTCAGGGAAGATGATGATCAGGGTTTGCTTATTTTTTCCAATGGAAACATGGTCATCGCTACATGATCTTATCCACAAAATGGGTCAGGTTGTGAGCCCATGGATGTACTTGGGTGGTGTCAAGGGTTTTGCTGATGGGTCTTTAGGTTCACATACTGCTTTGTTTCATGAGCCTTATGTTGATGAGCCTGGCAACTGTGGCATGCAAATAACAGAACGTGAGAAGCTTTTCAACTTGACCATGGAATCAGATATATCAAAGCTTCAGGTTGCTATTCATGCCATAGGCGACAAAGCAAATGATATGGTCCTTGATATCTACGAATCTGTCATTTCTACAAACGGGCCAAGGGATCGAAGATTTAGGGTCGAGCATGCTCAACATTTGGCACCTGAAGCTCCTCAACGATTTGATCAATGA MNQMKEVNLHGVNHKHEFVTRIAEAAKNTKKGTWVLGGGWNNDLWGGELPMASWIDDVTPSNPVLLSRIDGHMSLANNVTLKLAGISNLTEDPEGGTIGKTTGGDPTGLLIDSARKLVLPFIPKVAVEERREALVRASSLALARGVTTIVDFGRYYPGESVELSWEDFSDVYQWADSSGKMMIRVCLFFPMETWSSLHDLIHKMGQVVSPWMYLGGVKGFADGSLGSHTALFHEPYVDEPGNCGMQITEREKLFNLTMESDISKLQVAIHAIGDKANDMVLDIYESVISTNGPRDRRFRVEHAQHLAPEAPQRFDQ Homology
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A1I9LN01 (Protein LONG AFTER FAR-RED 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LAF3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 349.0 bits (894), Expect = 4.9e-95 Identity = 160/269 (59.48%), Postives = 209/269 (77.70%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O34355 (Putative amidohydrolase YtcJ OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=ytcJ PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 1.4e-28 Identity = 87/273 (31.87%), Postives = 131/273 (47.99%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_004142399.1 (protein LONG AFTER FAR-RED 3 [Cucumis sativus] >KGN52320.1 hypothetical protein Csa_009444 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 544 bits (1402), Expect = 5.73e-191 Identity = 265/269 (98.51%), Postives = 267/269 (99.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_016900239.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.50e-184 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: KAA0034760.1 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.11e-183 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_008446962.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 5.60e-183 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. NCBI nr
Match: XP_008446960.1 (PREDICTED: putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.29e-182 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRQ1 (Amidohydro_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G623830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 544 bits (1402), Expect = 2.77e-191 Identity = 265/269 (98.51%), Postives = 267/269 (99.26%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DW80 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.21e-184 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SUX5 (Putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G007840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.02e-183 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGY6 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 2.71e-183 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G10549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGA6 (putative amidohydrolase YtcJ isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489516 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 6.23e-183 Identity = 254/269 (94.42%), Postives = 263/269 (97.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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