Csor.00g226770 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g226770
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr09: 4140924 .. 4144521 (-)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g226770
SyntenyCsor.00g226770
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACGCTTCTCCGGCGAGGAACTCTACGGACTTTCGATCTAGCGACGTTGAAATCAGTATTATTGCGAGGGTAAACTAAAAAATAATTTTAACTTCTTTTAAAATTTATATTTATTCTTATAAAAATTTAATTTTAAAAAATTTTAATGGATATTTTTTATTTTTTTAATTATAATTTCTATTAAAGAATTTAAATTATTCAAACAAATTAAATAACATTTCATAAAAATAAATATAATATCTAGTATAATTTTTAAAGTATAGTGTTCCCCCACTTAAAAAATAATAATTATTATTATATAATATAAATATATAACAAATTAGTTTTGTGTTTTATAAGCGAGACACGGTTAAACTAGATAGGAATTTCGGTGGGGTCGGGGCGATGACAAGATGGAAATATAATCCCTATCTTTAGCCCCGTTTAGCTAATAGAGAGAGATCTTTCTCCACCCCTCTCCTTTTCCCGTTAAATAAAGACTCCCTGATCGTCCGAGATACGAGTTAAACATACCTTTCTTTTTTGAATCGTACCCCTAAATCAATCGTGTTGGTAGAATCCTCGAGTATCAAACAGATAGATGGCGAGCCTACTAAGATGTAGTTACAGTGAAGATTCACAGTCAAATTAACTCTAGTGATCTAACAATGTGTTTTCGGAACGTTATTCGAGGATGAGATTAGTGTTAAGATGCAACCAAATTCCGAGAAAAAGATCGTGGGTATTTATAACTTATGAAAGTTATCTCGATTGACGTAATTTTTTTTTATCCGCTAAAAAACAAATTACGAGAGTTTATATATGTATATAAAAAGCATGTAATATCATACTATCTTAGAGGAACGTACACGATCGTTGTCCCAAAAATATAAATTCTACTAGAATCTCTTCAATTAGTTTGTAGGTAAAAGTCGAGATTTATATGACGTAGTTGAATTTACCGATAAATTTTAGCTTTTTTTTTTATTCGTTATACGGCGCTTTTGACAAAAATATATAATAAAATGGATAGAAGAGAATTTTAATTTTTTCCTTTCTCCCTTCTTTTTCATTCTTTATTGTAAGTAATATAATATTTTATTTTAATTTATTATTTATGAATTTTAAGATATATAATAAACTATGAATTTTACTTTTAAGTTCTAGAAATTTATTTTAATTTTAACTATTTAATGATATTATATATTTACATAATAAATTATTAAAGAAAATAATATATATTGGTAACACTTCTATATTCCTTCTTGTATTATCTCACTTTTCTTAAAATATTATTATTTTTTTATTCAACAAAATATTTTCAATAATAAAGTTACATTAAAAAAATTAAATATTAAAGTAATTCCAAAATTATATTTACTTTTTTTTTTATTAGAATATATTCTTACCTTTTTTCTAAAAAAAATTTATCCTTATCTTAAAAAATAATACTCAAATTCGCTAATTAATAAATTATACTTAATTTTGTATTTGGTCTCAAAAATATTTATGAAATTAAAAAATACAATTTTTTTAATTAAAGGATATTAATGTTATTTTTTAAAGTTAATATTTTTAATTTTTTAAAAAAACTTTAATAAAAAAGTTTAAAAATATTAAGGTTATTCCGGTAATTTCCAATTTTTATTTTAGAAAAAATTGTAAGAAAAAAATATTTTTGAGACAAATTGAGTTTTTTTTTATTTTTAAAAAATAATAAATTCAAGCTATTAAAATTATAAAAATAAAAGCGCGTGCAGTGCACGAATTAGAGAATTAATGGCAATATAACGGAACGGCAGTCGAATGCAGCATGTAGTCCCGCATGTGAGCCCAAATCAAGGGAGGCCATTTTCTTGGCAGGCGCTTGACGCAGCCCCCGGCTAGCGTTGAACTCGATCCAAATTAGTAACTCTTGCGGAAGAAAAATCGAAATTAAATTCTCCATTTTCCTTTGATGCTCTTACTTTCCGCTTTTGTGCAGCTTAAATCATAATTGTTTTTACCAACGCGCAGAATTTATAATGGGGATCCAATGCACTTGGACACTCCAGCGGGTTCAATTCAGGCCTTCCGTTTTGTTCCGGTGTATTAATACTAATTCAAGACCAAATTCTCTTCGCTCATCTGTTTTCGCCACCATGTCCACCGTTTCCACTGAGAAGAGCGTCGATTCGACCAGAAAGGATCGAACAACGACACTCAGAAGCCATTGCAGGTAAATCCTGGCTTCCTAATCTCTTATTCCGTTCTATTTGATGGATTTCTGTTTGATTGCGATGGGGGATTTGATTTTTCATCGCCTGCGGATTCTGTCGCCTCTCGGTGGAAATGGGTTTGGTATTGTCATGTTTTTGTTCTTTGGGTAATGCTTAGATTGTGGATTTTGTTTTCGTTTCTTGCACTATCTTATGCTTGATTATCGAGCTTAATTTACTGTGATTTCATTAGCGAGTGCAAATTTAGGGTTTGTGATTTGTTGGGGGAGCTTGGAAAGGGATTTTGCGATTCTTAATGCAGGAAGAGGTGGGTTTTGATTGGTTTCTGTCTTTTGTGGTCTGTAATCTTTGGGGGTGTTTAGAAATGGATAACTATCTGGTTATTGTGAAAGGTTTTGTTCTGTGCCTTGTGTTACTGCTTCAAGTTCTTTTATGTTCATGGACCCATGGACCCACTCATCAATGAAAGTGTTGATAGGAACCACGACTCTCAATCGTATGATATTGTCCACTTTGAGCATAGGCTCGCGTGGCTTTGCTTTTGGTTTCTCGAAAGATATATTCCTTACTTATAAACCCATGATCAACCCCTTAATTAACTGATGTGGGACTCCACTCCCAACAATCCTCTCCTTGTACAAAATACACCATAGAGTCTCCCCTCAGGCTTATGGAGCCCTCGAATAGTCTCTCCTTAATTGAGGCTCGATTCCTTTTCTTGAGCCCTCGAACAAAGTACGGAATTTCTGTGAGATCCCACCTCGTTTAGAGAGGGAAACAAAACACTTCTTATAAGGATGTGGAAACCTCTCCCTGCGTTTTAAAACCTTGAGAGGAAGTCAAGAGGACAATATCTGCTAGCGGTGGGTTTGGGCTGTTACAAATGGTATCAAAGCCAGATACTGAGCGGTGTGTCAGTGAGGACTTTGGGCCCCAAGGGGTGGATTGTGAGATCCCACATCGTTTAGAGAGGGAACGAAACATTTCTTATAAGGTTGTAGAAACCTCTCCCTACCATACGCATTCTAAAACCTTAAGGGGAAACCTAGAAGGAAAAGTCCTAAGAGGACAATATTTGCTAGCGGTGGGCTTGGGCAGCACTTTCCTTCTCTAATTACAATGTCGAGTGAATATCGATGATGATTGTAATGCTTGGATGCTCATATGTTCTGATGCCTAAATTTTGATTCCTTATTTGGCTGAAGAAGCTTTAGATATTTCATATATGTATATTAGATAACTGGAACTTACATGTTCTCTTTTAGTAAGGACTATGCTTGAATGTAAGGATAGTTCATTGTGAGAACTTCAAAAGTAGGGCAATCTTTAATGTTAGCCTCATATCGATATTGCTTTTGAAATAAACTGTTCTGTTTGGTAGGTTTCGAATCGGCTTGA

mRNA sequence

ATGACGCTTCTCCGGCGAGGAACTCTACGGACTTTCGATCTAGCGACGTTGAAATCAGTATTATTGCGAGGCGGGTTCAATTCAGGCCTTCCGTTTTGTTCCGGTGTATTAATACTAATTCAAGACCAAATTCTCTTCGCTCATCTGTTTTCGCCACCATGTCCACCGTTTCCACTGAGAAGAGCGTCGATTCGACCAGAAAGGATCGAACAACGACACTCAGAAGCCATTGCAGGTTTCGAATCGGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACGCTTCTCCGGCGAGGAACTCTACGGACTTTCGATCTAGCGACGTTGAAATCAGTATTATTGCGAGGCGGGTTCAATTCAGGCCTTCCGTTTTGTTCCGGTGTATTAATACTAATTCAAGACCAAATTCTCTTCGCTCATCTGTTTTCGCCACCATGTCCACCGTTTCCACTGAGAAGAGCGTCGATTCGACCAGAAAGGATCGAACAACGACACTCAGAAGCCATTGCAGGTTTCGAATCGGCTTGA

Protein sequence

MTLLRRGTLRTFDLATLKSVLLRGGFNSGLPFCSGVLILIQDQILFAHLFSPPCPPFPLRRASIRPERIEQRHSEAIAGFESA
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g226770 vs. NCBI nr
Match: KAG6591904.1 (hypothetical protein SDJN03_14250, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 167 bits (423), Expect = 3.92e-52
Identity = 83/83 (100.00%), Postives = 83/83 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTLLRRGTLRTFDLATLKSVLLRGGFNSGLPFCSGVLILIQDQILFAHLFSPPCPPFPLR 60
          MTLLRRGTLRTFDLATLKSVLLRGGFNSGLPFCSGVLILIQDQILFAHLFSPPCPPFPLR
Sbjct: 1  MTLLRRGTLRTFDLATLKSVLLRGGFNSGLPFCSGVLILIQDQILFAHLFSPPCPPFPLR 60

Query: 61 RASIRPERIEQRHSEAIAGFESA 83
          RASIRPERIEQRHSEAIAGFESA
Sbjct: 61 RASIRPERIEQRHSEAIAGFESA 83

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g226770 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g226770 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6591904.13.92e-52100.00hypothetical protein SDJN03_14250, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g226770 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g226770 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g226770.m01Csor.00g226770.m01mRNA