Csor.00g213320 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGCCAGGTTTGTTTGATTCCATTGTTTCTATACCTTGCTTCTATAGGGAAGGCAAGAGACATGGAATCTCTTTTCTTTTCGGGTGGTTTTTTTTTTAATGTTTACTTTCTTTGTCGTGTTTTTAATTATTGTCTATTTGTTTTAGTTTCTTTTGAGTTGTTGTTCATCTCTGTTTTTGGGTGCTTCTGTTTGTCATTTTAAGGATGCAAAATGATCCACTCGTTTGATCTTCAAAATGTGTTGAGATTAAGTGTACTGATAACTATGAATGCTGACAATTAGGATTTCATTTGGCTATACTGATTTTGATTTTTATCTGTTCATTCATTCTTGCATTTCAGTTGAATGTACTTGTTTTTCCCTGTTCTTTCCATGGATTGGATGGCTATGAATGAAAAAGCCAAAGAGATGGAAAGGAAATGGGAACGTTCGAAAAATACTCGAAAGTAGAGACCTAAGCCAATGGATTCCAATGTGATATTCCTCTAACGTTATTCATTCACGAATGATTTGTTAGGAATCACGAACCTTCATAATAGTATGATACTGTTCACTTTGAGTATAAGCTCTCGTGGCTTTGCTTTTAGTTTCCCCAAAACGCCTCATACCAATGGAGATGTATTACTTGCTTATAAACCCGTGATCAAACGCTTAATTAATCGATGTGGGACTCTTCTCCTAACAATCCTCCCCTCAAACAAAGTACACTGTAGAGCTTCCCTTGAGGCATATGGAGCCCTCGAACAGCCTCCCCTTTAATCAAGGCTAGACTCTTTCTCTGGAGGCCTCAAACAAAGTACACCTTTTGTTTGATACTTGAGTCACTTTTGACTACACTTTCGAGGCTCATAACTTCTTTGTTCGATATTTGAGGATTCTATTGACATGGCTAAGTTAAGGGCATGACTCTGATACCATGTTAGGAATCACGGCTCTCGACAATGGTATGATATTGTTCACTCTGAGCATAAGCTCTCATGGCTTTGCTTTGGGCTTCCCCAAAAGGCCTCATACCAATGGAGATGTATTCCTTGCTTATCAACCCATGATCAAACCCTTAATTAACCGATGTGGGACTCTTCTCCCAACAATCCTCCCCTCGAACAAAGTACGCCATAGAGCCTCTCTTGAGGCATATGAAGCCCTCGAACAGCCTCCCTTTAATAAAGGCTCGACCCTTTCTCTGGCTCGAATACTATTTATAACAGCCCAAGCCCACTACTAGTAAATATTGTTCTCTTTGGGCTTTTCCTTCTGGGCTTCCCCTCAAGGTTTTAAAACGCATCTGCTAGGGACAGGTTTTCACACTCTTATAAGGAATGTTTCGTTCTCCTCTCCAACCAATGTGAGATCTCACACTATCTAACTATAGTTTTTAACATCGAGAGGCACTGATACACAAGGCAGGATGAATGAAATGGTATTTGATCTGAACTGTGACAATGGAAGAGGATTAATGCTGCAAATATGATCCAAAGAAAGAGATCCATTCCCATTTGTGATCCATTCCCGCTGGTTTGATATTATCCACTTTGAGCATAAGCTATCGTAACATTGCTTTTGGTTTCCCCAAAAGACCTTGTATGAATGGAGATGTATTCCTTACTTACAAACCCATAATCAACCCGTTGAATAGCCTCCCCTTAATTGAGACTCGACTCCTTTCTCTGGAGCACTCGAACAAAGTACACCCTTTGTTCGACACTTGACTACACCTTCGAGGCTAGCAATTTCTTTGTTCGACACTCGATGATTCTATTGACATGACTAAGTTAAGGGCATGGCTTTGATACCATGTGTTAGGAAACACGACTCTCCATAATGGTATGATAATGTCCACTTTGAGCATAAGCTCTCGTGGGTTTGCTTTTGGTTTCTCCAAAAGGCCTCATACCAACGGAGATGTATTCCCTACTTATAAACTCATGATCATCCCCTTAATTAGCCAATGTGGTACTCCCTCCCAACAATCCTCAACAGTCGTTCCGTTGCCCATGACTTGGAAGCTTTGATCTTTGTGTCTCTGAGAGTCCGGGTATATCACGAGTCTAAAAAAACCTTCAATTATTATTATTATTTCTAAAGAAGTTCACAAGTTCACTTGAAGTTTGCCACTTTTTCCTTTGCTTGTTTTGCCATCATACAACTTCTCTTGTAGCTGTTTTTTGTTCTTGATTTGATTGGAAGTTGTCTCTTTCACTGCCAGGTGTAGAGCAAGGTGATTTGGACTCATCTCCCGTGCAAAGTTTGGATGGAAGTTTTAGAAAGTTCATATCTGGTAACCATTGCTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTGATATTCTCAATAAATATAGTCTCAAATAATGTTGAGGCACACTACAAGAAAGGGCTCGAGTCAAGAGTAATAAGACCTAGCGAATGGTTACAAGAAACCGAACATATCCGAAAAGACTCTCATCCTAAAGTCCCCACAAAATAGCACACACCCCATCTTTGAAGGGTAGATGAAGGAAAAACTCCTCAAATGCCTCCTTACGACTCAAAAATATTGTGCTAGGCTGCTCGAGCACAAGCACAACTCTAGGGACTATCTTGCTTATGCCTCGTCTTTTCCTCAATGTCCACTCTGTGTGGTGTGTTGGATGATGCACTGTTCTCCTTGGTTGCATCATGACACTCGTCTAGGCCCTAGTGTGGCTAGGCTATCTTGCTTATGCCTCGTCTTCTCCTCAATGTCCACTCTGTGTGGTGTGTGGGATGATGCACTATTCTCCCCGATTGCATCATGACACTCGTCTAAGCCCTAGTGTGGCTAGGCTATCTTGCTTATGCGTCGTTTTCTCCCCAATGTCCACTCTGTGTGGTGTGTTGGATGGTGCACTATTCTCCCCGGTTGCATCATGGCACTCCTCTAGGCCTTAGTGTGGCTAGGCTATCTTGCTTATGCCTCTTCTTCTCCTCAATGTCCACTCTGTGTAGTGTGTTGGATGATGCACGTTCTCCCGGTCGCATTATGACACTCGTCTAAGCCCTCGTGTGGTTAGAGGGGTGCCACTTGGAGGTCGTCGTTTTGCTTATTGTAACGTAAGGGTCACTACCTACTCTTTTCATAGTGTGGTTGTGACACCAGACACCAACAGAGACCACATAAGCTAAACAACCCACCCAACTCGTCCCAGAACAACTTCCTCCCTCTTTGTTTGGGAGGCCGGTAAACCCTAGGCATCCACCCTTCGACACCTGGAAGCTGAAGGAAACTCACACTGAAAAGGTCCCTTTAACCATGTTTGGATTTAACAAGAATGACGATGTTGAGGTTTTCCTATGCAATGACCTCTTTAACCAATCTCCTATTCTCCATACCTGTAACAGCCCAAGCCCATGGCTAGCAAATATTGTCCTCTTTGGGCTTTCTTTTCGGGCTTCCCCTCGAGACTTTAAAACACGTCTACTAGGAAAGGTTCCCAAGGGAATGGATTGACTTCCATAAGGGCACTTTGGAATAGATTGACTTCCATAAGGGCACTTTGGAATAAATAATAGTGTGGGGATAGTTGGATATGCAACTAAATGATGCTTCAATTACATTCTTATCCTCACAACGCTTACATCAATATGCTACAGGTTTTCTTCAAAATGGTACAGACTTGTCTCCAGCTCAAAGCTTGGATGGAAGTTTTCGAAAATCACATTCGGGTTTGTACTCCTCGGTTAAAATTCCATTTTTGTCCCTATACTATTCGATGTGTATTACTTTGGTCTCAGTTACCGTACATTCAATAAATCTTAAAATTAGTTCCTACTATTAGCGATCGTTAACTGATTCATATAACATAACGGTCGTCCTCATTGCAGCTCAATCAGGGCGTAGTCCGTCTGCCACTGCCTCATCAGGCAAATTTGTTCCTGTTTCAAGAAGAGTATATAAAGTGCTGAAGGACTTTAAAAGAAAACTCATTGATTTTGATATCTTTAATCAGAGTCTTGAGGATTGGGTTGTGGAGAATACTTCATCCCGTTCTGCGGATGAGGAACCAAATTTTCCATCGCCATTTCCGATCGACGAAATTCACGAGCTCGATTTAGCACTAGAAGGAGTTTTGTTTCAGCAACTGTTTCGTATGCCATGTTCACCGTTCTCTGATGATCTAATCGAAGATGAGTTTCTTGCACTTGAAGACTTCTTTCATGCTATTATCAATGGTTTATGGCGTACGTTTTGGCATAAGAGCAGACCGTTACCTTTCTTTGTATCCTGCCCTCGTCACTTAGGATCGAAATTCTATACCGTTGAAAAGGCGATATCAAGGGGAAAGGTGGGAGAGTTACTAGGCTTAGGCTTGATTTCTAGAGTTGGAGACGAGCTACAAGTACGTTGGGATCAAGTCGTGCAGTTTGCTTTATTCAAGGCTAATGTACTATCAGAAGACGGGTTGAGGTTGTCGGGTCGTGTTGTTTGTGAAGCTCTCTTCTATGGCTTACATTTACTTATTTCTAGGAGTTTAAGCAAAATTGGTACTGTCAAGAACTATGATTCTGTTTTCGTTTTGATATTAGATTCAAAATATGGTGGCGTAGTAAAACTCGGCGGAGATCTTAGCAGGCTCGACATTAACTCGGCTAACCCGTACCAATCAGCAGTGGAATGGATGAGAAACTATGCTGAAGTATGTGTTTCACCGGTCGACCGTATATGGAACAAACTTGGAAATGTAAACTGGGGAGACTTGGGAACTTTACAAATCTTATTGGCAACTTTCTACTCTGTAGTCCAGTGGCATGGTCTGCCAAGACACTCGATTACGTCTTTAGCATCAGACCATGGTTTGCGTTTACAGAAGCGTTGGATCGAGTGTCGAGTGTCGGAGAATGAAAATACAATAGTTCCTTTTGAACAGTTTAATGATCATCCTGGAGAGATCGTTGAACTCGAGCAGATGGATAATGATGTGTACAAGAACCAAGCATTGCGTTTGAAGCTTCGTCCCGGGGAAATACTCG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ATGAAGCCAGGTGTAGAGCAAGGTGATTTGGACTCATCTCCCGTGCAAAGTTTGGATGGAAGTTTTAGAAAGTTCATATCTGGTTTTCTTCAAAATGGTACAGACTTGTCTCCAGCTCAAAGCTTGGATGGAAGTTTTCGAAAATCACATTCGGCTCAATCAGGGCGTAGTCCGTCTGCCACTGCCTCATCAGGCAAATTTGTTCCTGTTTCAAGAAGAGTATATAAAGTGCTGAAGGACTTTAAAAGAAAACTCATTGATTTTGATATCTTTAATCAGAGTCTTGAGGATTGGGTTGTGGAGAATACTTCATCCCGTTCTGCGGATGAGGAACCAAATTTTCCATCGCCATTTCCGATCGACGAAATTCACGAGCTCGATTTAGCACTAGAAGGAGTTTTGTTTCAGCAACTGTTTCGTATGCCATGTTCACCGTTCTCTGATGATCTAATCGAAGATGAGTTTCTTGCACTTGAAGACTTCTTTCATGCTATTATCAATGGTTTATGGCGTACGTTTTGGCATAAGAGCAGACCGTTACCTTTCTTTGTATCCTGCCCTCGTCACTTAGGATCGAAATTCTATACCGTTGAAAAGGCGATATCAAGGGGAAAGGTGGGAGAGTTACTAGGCTTAGGCTTGATTTCTAGAGTTGGAGACGAGCTACAAGTACGTTGGGATCAAGTCGTGCAGTTTGCTTTATTCAAGGCTAATGTACTATCAGAAGACGGGTTGAGGTTGTCGGGTCGTGTTGTTTGTGAAGCTCTCTTCTATGGCTTACATTTACTTATTTCTAGGAGTTTAAGCAAAATTGGTACTGTCAAGAACTATGATTCTGTTTTCGTTTTGATATTAGATTCAAAATATGGTGGCGTAGTAAAACTCGGCGGAGATCTTAGCAGGCTCGACATTAACTCGGCTAACCCGTACCAATCAGCAGTGGAATGGATGAGAAACTATGCTGAAGTATGTGTTTCACCGGTCGACCGTATATGGAACAAACTTGGAAATGTAAACTGGGGAGACTTGGGAACTTTACAAATCTTATTGGCAACTTTCTACTCTGTAGTCCAGTGGCATGGTCTGCCAAGACACTCGATTACGTCTTTAGCATCAGACCATGGTTTGCGTTTACAGAAGCGTTGGATCGAGTGTCGAGTGTCGGAGAATGAAAATACAATAGTTCCTTTTGAACAGTTTAATGATCATCCTGGAGAGATCGTTGAACTCGAGCAGATGGATAATGATGTGTACAAGAACCAAGCATTGCGTTTGAAGCTTCGTCCCGGGGAAATACTCGTTGTTGATGATCAAAGACAAGGGCGAAAAAGCTTCGAGGTGCAGGGATCCTTGGTTGGTGTTAATAACTGTGCTTTATACACTGCTGTTTCTGTTGATTATCCTGCTGAGTTGTTGACGCTTTACGTTGGAGCTCACGTGTCGAAGCTCGAGCCATCTTGGGAGGATATGAGTCTTTGGTATCAAGTACAGAGACAAACAAAAGTACTGAACATCTTCAAGTTACAAGGCATTTCAAGCAGATGCTTACCTGAAATCATTGCCTCGGGCCGAATCCTACATTCTGGTCCGTGTAAGAAGCAGACCGTGGGGGGACGATGTGATCACCCCTGGTGCGGGACACCGGTGCTTTTGACATCACCGGTTGGTGAGCAGCTTTCATCTATAGTTGCTCGGGATGGCTCGTTATCTTCCGAAGAAGCAATTCGTTGTTGCCGGGACTGTCTAGCTGCTCTAAGAAGTGCATCTCTAGCTAGTGTCCAGCATGGTGATATCTGCCCTGAGAATATCATACGTGTTGTCGACGTGCAAGAATCAAGAAACGGTTACTTATACATTCCGATATCGTGGGGACGTGCCGTTTTGGAAGACCGTGACAGCCCGGCTGTGAACTTACAATTCTCATCCTCTCATGCTCTCCAGCATGGGAAACTCTGTCCATCATCGGACGCTGAGAGCGTCATTTATCTCCTCTATTACATTTGCGGTGGATCGATGGAGCAACAAGACTCCATCGAATCGGCATTGCAATGGAGGGAAACAAGCTGGGCGAAACGGATCATTCAGCAGCAGCTGGGCGAGGCGTCAGCCTTGTTGAAGGCATTTGCTGATTATGTTGATAGCCTTTGTGGAACGCCGTACACAGTCGACTACGACATATGGTTGAAGAGACTGAGCAGGGCGGTCGATGGGTCGTCGGATCGAGGCAAAATGGTCGAGGAAGTTGCTATAACATTGAAGCTGGAAGATGTGGCTGAGTCTTCAGGAACATCAGGAGCTGAACCAGCACCAGTCGATTCCCTTCTCCTTCACATACTTGCGGTTATGGCGGAAGTTGGAGAGTGCTCTGCTTCAAATTCCTCCATACAAAACTGGGCGAAGCTAATTTCACTTGATAAAAAATACGCAGATATTGAGATAAACTCGGATGAGGCTGTTATCTTCTCAGAGACAAAGTCCTCATCTGTTGATAAGTATGAATGGTGCAAAATCACAAGGAATTCCGATGTAAACTCTATCACTTTGCAGAATAGAAGTTTCAATGCTATTCTTGTTGATGAGACTCTTGTTCAAAAGGATGACATTGCTTTCATCAAGTGTGGAAGCGAAATTGTTTCTGGTCCGGTCCAAGATGGGCATTTGAGCTATAAATTTGAAATTTTGTCAGACTCAAAAATATACAAGGGCTTAAAGATTTCTATGGATGTTGAACACGCAAAATGCAGTATTTGCTTAAACATTTGGCATGATGTTGTCACAGCTGCTCCTTGCTTTCACAACTTTTGCAATGGATGCTTCTCGGAGTGGTTAAAAAGATCCCAAGAGAAGCGTACAAGTGTACTTTGTCCCCAGTGTAGAGCAGTTGTGCAGTTTGTTGGAAGAAACCACTTCTTGCTGAACATTGCAGAGACTATATTGCAAGAGGACTCTTCCCTTAGACGTTCAGTCGAAGAAATTGCTATTTTGGATTCTTGTTCATTAATACAATCAAATCTGGTCATTGGGTCTGGGAAGAAGCGCACCCAGAAAAGGCCTCATTCAATACTGGGCCAGGAGGAGAGCGGTGTTTTAGAGCTTCCATGCCCTCAATGTGGTACTGAATATGCTGGATTTCGCTGTAATCCAAACGCAGTTCATCTACAATGTCATGGATGTGGAGGAATGATGCCCTCTCGATTTGATATTGGGATACCTCAACATTGTTTAGGATGTGATAGAGCATTTTGTGGTGCATATTGGCAAGCTCAGAGGTTACAAAGAAGTGGTACTTACGCCACGTGCAATCCCGAGACTCTAAAACCAATCTCCAGTCGTACCGTCTCAAGAATTCCACAGTTGACACATGAAAATAATCAACACGAACAGGATATTACAGAGAGGTGCATTAGTCAGATGGGTAAAACATTGCAGGATGTCATCTCTGAATGGATTGTGAAGTTTAACAATAGAGAAATTGATCGAACTCGAATGCCTCTAAACCACGTGGAGATGATAACTGCAGAGACGCATATTTGCAATGAGTGTTATGACAAATTGGTGGGATTTCTACTCTACTGGTTTCGCATTTCAACGCCAAAATATCTTCTTCCAGGAGATGCAACTGAAAGGGAAAATTGTTGGTATGGATATGCATGTCGGACTCAACACCACAACGAAGATCACGCTCGCAAGCGAAACCATGTTTGTCGTCCCACCCGATCCCGATGA MKPGVEQGDLDSSPVQSLDGSFRKFISGFLQNGTDLSPAQSLDGSFRKSHSAQSGRSPSATASSGKFVPVSRRVYKVLKDFKRKLIDFDIFNQSLEDWVVENTSSRSADEEPNFPSPFPIDEIHELDLALEGVLFQQLFRMPCSPFSDDLIEDEFLALEDFFHAIINGLWRTFWHKSRPLPFFVSCPRHLGSKFYTVEKAISRGKVGELLGLGLISRVGDELQVRWDQVVQFALFKANVLSEDGLRLSGRVVCEALFYGLHLLISRSLSKIGTVKNYDSVFVLILDSKYGGVVKLGGDLSRLDINSANPYQSAVEWMRNYAEVCVSPVDRIWNKLGNVNWGDLGTLQILLATFYSVVQWHGLPRHSITSLASDHGLRLQKRWIECRVSENENTIVPFEQFNDHPGEIVELEQMDNDVYKNQALRLKLRPGEILVVDDQRQGRKSFEVQGSLVGVNNCALYTAVSVDYPAELLTLYVGAHVSKLEPSWEDMSLWYQVQRQTKVLNIFKLQGISSRCLPEIIASGRILHSGPCKKQTVGGRCDHPWCGTPVLLTSPVGEQLSSIVARDGSLSSEEAIRCCRDCLAALRSASLASVQHGDICPENIIRVVDVQESRNGYLYIPISWGRAVLEDRDSPAVNLQFSSSHALQHGKLCPSSDAESVIYLLYYICGGSMEQQDSIESALQWRETSWAKRIIQQQLGEASALLKAFADYVDSLCGTPYTVDYDIWLKRLSRAVDGSSDRGKMVEEVAITLKLEDVAESSGTSGAEPAPVDSLLLHILAVMAEVGECSASNSSIQNWAKLISLDKKYADIEINSDEAVIFSETKSSSVDKYEWCKITRNSDVNSITLQNRSFNAILVDETLVQKDDIAFIKCGSEIVSGPVQDGHLSYKFEILSDSKIYKGLKISMDVEHAKCSICLNIWHDVVTAAPCFHNFCNGCFSEWLKRSQEKRTSVLCPQCRAVVQFVGRNHFLLNIAETILQEDSSLRRSVEEIAILDSCSLIQSNLVIGSGKKRTQKRPHSILGQEESGVLELPCPQCGTEYAGFRCNPNAVHLQCHGCGGMMPSRFDIGIPQHCLGCDRAFCGAYWQAQRLQRSGTYATCNPETLKPISSRTVSRIPQLTHENNQHEQDITERCISQMGKTLQDVISEWIVKFNNREIDRTRMPLNHVEMITAETHICNECYDKLVGFLLYWFRISTPKYLLPGDATERENCWYGYACRTQHHNEDHARKRNHVCRPTRSR Homology
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5WW08 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Danio rerio OX=7955 GN=chfr PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 128.3 bits (321), Expect = 6.2e-28 Identity = 98/384 (25.52%), Postives = 153/384 (39.84%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q810L3 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Mus musculus OX=10090 GN=Chfr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 6.9e-27 Identity = 108/420 (25.71%), Postives = 165/420 (39.29%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96EP1 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CHFR PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 2.9e-25 Identity = 98/382 (25.65%), Postives = 153/382 (40.05%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5FWP4 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=chfr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 3.8e-25 Identity = 99/396 (25.00%), Postives = 148/396 (37.37%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RF77 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR OS=Pongo abelii OX=9601 GN=CHFR PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 8.4e-25 Identity = 96/381 (25.20%), Postives = 151/381 (39.63%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. NCBI nr
Match: KAG6603167.1 (E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2529 bits (6556), Expect = 0.0 Identity = 1241/1241 (100.00%), Postives = 1241/1241 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. NCBI nr
Match: CBI27690.3 (unnamed protein product, partial [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1625 bits (4209), Expect = 0.0 Identity = 809/1243 (65.08%), Postives = 948/1243 (76.27%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. NCBI nr
Match: GAY38659.1 (hypothetical protein CUMW_038360 [Citrus unshiu]) HSP 1 Score: 1578 bits (4085), Expect = 0.0 Identity = 783/1238 (63.25%), Postives = 936/1238 (75.61%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. NCBI nr
Match: KAG7033469.1 (hypothetical protein SDJN02_03191 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1543 bits (3995), Expect = 0.0 Identity = 766/766 (100.00%), Postives = 766/766 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. NCBI nr
Match: XP_022933113.1 (uncharacterized protein LOC111439878 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1540 bits (3986), Expect = 0.0 Identity = 764/766 (99.74%), Postives = 765/766 (99.87%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803PXC3 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1583 bits (4099), Expect = 0.0 Identity = 779/1263 (61.68%), Postives = 960/1263 (76.01%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2H5NEQ1 (RING-type domain-containing protein OS=Citrus unshiu OX=55188 GN=CUMW_038360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1578 bits (4085), Expect = 0.0 Identity = 783/1238 (63.25%), Postives = 936/1238 (75.61%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3S8 (uncharacterized protein LOC111439878 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1540 bits (3986), Expect = 0.0 Identity = 764/766 (99.74%), Postives = 765/766 (99.87%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HXK2 (uncharacterized protein LOC111467167 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467167 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1517 bits (3927), Expect = 0.0 Identity = 751/766 (98.04%), Postives = 759/766 (99.09%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: V4SGG1 (RING-type domain-containing protein OS=Citrus clementina OX=85681 GN=CICLE_v10024761mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1510 bits (3909), Expect = 0.0 Identity = 753/1157 (65.08%), Postives = 907/1157 (78.39%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. TAIR 10
Match: AT1G47570.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 584.7 bits (1506), Expect = 1.7e-166 Identity = 273/463 (58.96%), Postives = 341/463 (73.65%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. TAIR 10
Match: AT1G47570.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 4.4e-162 Identity = 263/439 (59.91%), Postives = 328/439 (74.72%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. TAIR 10
Match: AT2G40980.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 561.6 bits (1446), Expect = 1.6e-159 Identity = 293/674 (43.47%), Postives = 416/674 (61.72%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g213320 vs. TAIR 10
Match: AT3G05250.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 44.3 bits (103), Expect = 8.4e-04 Identity = 18/50 (36.00%), Postives = 27/50 (54.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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