Csor.00g211250 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g211250
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr11: 1121053 .. 1124958 (-)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g211250
SyntenyCsor.00g211250
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGGTGGACTAGGAGAGCAACGTTATTAAGGTTGTTCCTCCCTTTTTCACGTGGATATAAGGAATTATGCATTTATCTCGAACATCTGCAGGGGATGGATAGGTGATATATCCAGCGTTCGTAAAATGTGGGTCAGAGTTAAGTCGTGGTCTTGTGGATACTGGAGAAATAATGAAGCTTAAGATATGTTGAGCATCGTGGCCGCTCCAAAATATCGTGTATGTATTTTGTTTTCCTGAAATATTTTGTATCCTTTTTACACTTTCTAGTTATATAATTGATGCAGTAAATGTTTGAATATGATCGTTTGTGGGATTTTTTTCCTTTCAAAATTGTAGTGTAAAGTTATTACAAAAACACTGCTGTTTGTATTAGCACCGAAACACATTTGCTTTATACTTTCTGCAGATTAACTCAAGTAGGATGCATATATATGTTCAAAATTTTGGATTAGCTTGGCTCATGTCTGTATATGCCCTTGTGCTGACTGCTTGAGAAATAGATTCTGGGCCTTGTTTTTGGAACCCTTATCTTTTATCTGCTGCATTTTGATCATGTAATGAAAGGAAAAGAGTTGGACAAGCCTCTGAATTTTTTAGTCTTCGACTTTGGCTGTCTATTTGTTGGAGAATCCTGAAGAGAAATGGAAACTTAAGAGAGTTATGGTATTTGTGGATGAGATTTGACTACCCTGTTCCTGTTGATGTCTTTTAAGGCACACAATAATCTTGTTTACGGTTCGAGAATAAATAGGTTTAGGAGAAAGAATATGCTATATCTCGTGAAATCATAGAAGGGTAGCAGCTTTCCAGCGAATTTTGATTAACTCATGTTGATTTAAAATACCGGAAGATTATAAATAACAATGAGTCTTGGAAATCAAATTTTAGATGAATGCAAATAGAAAATGACCAAAGGTCGATTTTGGGTTAAATAGGAAGAACTTGAAGATTCCACCTCTAAAAGCGCCTATAGCTAATAGCTTAGGACCGAAGGAGGAAGCCAAGACGTCATATATATTTTTTTTGCAAGGGGCTGTAGAGGAATGAGGACAATCTTTGACGGTAGAAGACGTTAGTCTTCATCTTTTTACGATCTTCATCTGCTTTGGGGGTGGTGAGAAAAGGCGTGGCTCGGTTCGAGTTGACTTGACTGTTATGGTTTTATTAGCTAAATTAATAAAAATATTTCTATGTTTTGTTTTTTCTTTTTAAAATATTCCTAAATTTTCAAAATTTTCAATAATACCTTTAGACTTTCAACATTACCGTTAGTTTCCGATAGAAATCGTTACTATTTTACCATATAAATATTCTTAAACTACCTTGAACTTTAAAAAATTCATTAATATCCTTTAACTTTTAAAAAAAATTCGAAATTGTTTTTTCCATCACCTTTACCAAAATACTTTTAAAAATATATATACAATAATGAAACTTTTGAAAATTTAAGGTATTTTTGAAATAGAGTATTAACATTTTCTCTATAAAAAAAATAACTATAATTATATTTTTGAAATTTTTTTTTGTTAAAAGTTTACGGGTATATTTTTCGATTTTTTAAAAATAAAGTACAAATTCAAGGACACTTTTATCAATTTAGTCTAAATTAATGCCGGCACCGGTGAACATTAATTACCATCTCGAAATCAACAATTTAACGTCCATCTTACCATTATTGAACTAAAAAATATCGAATCACATTGGGATAAGTTCCAAACTCGAATGACTCCAAATAATCGCTTTATATAGGCTTTAAATATATATTTAAAATCTTGTGCGTTTTAATAAATAATAATTGAGAATAGATAAGGTAATTTATTAAAAAATTATATTTATATAATTTTTCTTTCATGAGTCTAAAACTACCGACTATTTTGTTTTAGTCCCTTCTAACCGTTTCTATTACTGGGGTCGAGGAGTAAGACTTGTTTGCTGGCATGCATAGCATAATCCTGTCGGAAAATTTAACGAGACCGAACCGGATTATCTTTAATTAGGGACAACGCTTCAGATCCTGTAAGGAATTCTGAAGGTTGCAACCTACGATGAAATAAGTCCCAAGCGCTGCTCGCGGGAGTTCAACTTCTATCTTACAATTGTTGAACTAAAAAATATCGAATCACATTGGAATAAGTTCAAAACTCGAAAATTCGAATGACTCCAAATAATGGCTTTAATAAACTTTAAATATATATTTGAAATTTTGTGTGTTTTAATAAATAATAATTTAAAATAGATAATGTAATTGTATTAAAAAAATTATATTTATATAATTTTTTTTCAAGGTCTAAAACTACCAACTATGGATCTTTATCCGAGGACAACGCTTCAGATCCTGTAAGGAATTCTGAAAGTTACAATCTACGATGAAATAAGTCCCGAGGGCTGCTGGCGTGAGTTCAACTTCTACTCCCACATTCAAATCCTTTTGCCTCTTCCTCTTCCTCTCTTCTTCTGCAAGTTGATAAGAAATTCTCTCTGACTCGTTCAGATCCTAACGACATTCGGAATCTTGAGGTTTCTTTTTCCTCTCTAACTTTCGTTTTCTCTTGATATTTTTCTTGCGTTAATTGTCGCTTTGTAGCACTTCGATTTGCGCGGTTCATTTCCTGCCTTTTCTGATATGGAAAATTACCGTTTAGTGATTATTCATTGACCAATTGATAATTTAGTTGCCTTTTGGTGTTGATCTCTGCTTCCGAGTTCTGGAATTCTTCTCCCTGTTCTTGACATTTATTCTTGGCTTTGTCGTCTTGACCTACTTTACGATTTCGAGTGAGGATTGTAATTTTAGGATGCGAATTCTTGTAAATGTTTAACTTCGTTTGGTGTTGATGGTAGAATGGAGTCATGATTGTGCTTTTCAAGATTTAAGAATTTAATTATATTGATTTTGGAGGAAAACATTTTGGTTTATTTAGTCTACTATTAGGAGCCAGGGTCTGGTAAACAGTTGATAATAGTGTGAATTGGATATGTAAAGACCATATACTCAAGGGCAGTGGACGTGCAGAGTAATTTGCAATTAAGAATTTGAATTCATTACATCTGATGCACTTGGGATTGCCTTAGTCGTGTAGGCAAATACTTTGAATTTTACAGTACCTGGATACCTACTAATAGTGTTCATTGGCGTTAAGATAATCAAATGTAAATTCTGTTTTAGATATTCAATTGTAGTGGTTCTGTAATGGGTAAATTGGACAGTGCTAAGAAACTGAGATTATTATTATTATTTTGTTGTATATGTTGGATTCTCTCAGGACACACTTGAGATAGTAAGAGAAACTAGTTTTGAATTTTTTATTCTAGATTTCAGTGCTATTTCACCTCATAGCAGTAGTGATGAAAGAATTTTTTTTTTTTTGGAAAATTCATTTCTTCCATGTTTCCATCTGTTCTCTCTTCAAATTATATATGGGTTGATGTTAGTTGTGTGCTGGCTTTTCGTGATTAGACTCGTGGGCAGAGAAAACTTGAGTTCTGGTATTTAGGATGTTTTTTTTACACTAATGGAATGGTTTTCTTTTATTACAAATGTATTTCATTGATTAAATGAAACAAAATAAGGTTGAAGCCCCACAAACCCAAAGGAGATGAAAAACATCCCTCTTGCGCATTTTGGAGAATCTGTAACTAGTGGATCCATTTTTATTCAATACGATTTTGTTCACGTATCGCATGTTTTGAAGTCTTCACTGTTTTCATCAGTACATGTAGAATTATTTCAATTTTCAATGAAAAGCTTGTGGACTTCTGTCTCATGCAGCTTATTTGGTCTCTTTCCTCTGTTTTGTTTGCTGCTGCTATTTAAGTTTACAAATTACAAGGAAGTAAAAGGACGGGATTCTGAAACAGCTTATACCATTTACCTTCACAACCTCACTAGTCTTAAGCTTTGA

mRNA sequence

ATGAGGTGGACTAGGAGAGCAACGTTATTAAGGGGATGGATAGGTGATATATCCAGCGTTCGTAAAATGTGGATCCTAACGACATTCGGAATCTTGAGCTTATTTGGTCTCTTTCCTCTGTTTTGTTTGCTGCTGCTATTTAAGTTTACAAATTACAAGGAAGTAAAAGGACGGGATTCTGAAACAGCTTATACCATTTACCTTCACAACCTCACTAGTCTTAAGCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTGGACTAGGAGAGCAACGTTATTAAGGGGATGGATAGGTGATATATCCAGCGTTCGTAAAATGTGGATCCTAACGACATTCGGAATCTTGAGCTTATTTGGTCTCTTTCCTCTGTTTTGTTTGCTGCTGCTATTTAAGTTTACAAATTACAAGGAAGTAAAAGGACGGGATTCTGAAACAGCTTATACCATTTACCTTCACAACCTCACTAGTCTTAAGCTTTGA

Protein sequence

MRWTRRATLLRGWIGDISSVRKMWILTTFGILSLFGLFPLFCLLLLFKFTNYKEVKGRDSETAYTIYLHNLTSLKL
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g211250 vs. NCBI nr
Match: KAG6587591.1 (hypothetical protein SDJN03_16156, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 155 bits (391), Expect = 1.82e-47
Identity = 76/76 (100.00%), Postives = 76/76 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MRWTRRATLLRGWIGDISSVRKMWILTTFGILSLFGLFPLFCLLLLFKFTNYKEVKGRDS 60
          MRWTRRATLLRGWIGDISSVRKMWILTTFGILSLFGLFPLFCLLLLFKFTNYKEVKGRDS
Sbjct: 1  MRWTRRATLLRGWIGDISSVRKMWILTTFGILSLFGLFPLFCLLLLFKFTNYKEVKGRDS 60

Query: 61 ETAYTIYLHNLTSLKL 76
          ETAYTIYLHNLTSLKL
Sbjct: 61 ETAYTIYLHNLTSLKL 76

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g211250 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g211250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6587591.11.82e-47100.00hypothetical protein SDJN03_16156, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g211250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g211250 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g211250.m01Csor.00g211250.m01mRNA