Csor.00g207000 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTATGGCTTCCTGTTTATTAAGAACGGTGGCTGCCGCCGCCGCCGCCGGCGGTTCTCAGAGCTTTGATCCGACGTCGTATCGTAAAAGAAAAATAGCCGTTAAAACCCTCAAAAGCTTCCAAACACCTCTTCCTTATTGTTCTCCATCTCACTTGCTCAACCCTCCTCTTCCGGTTTGTACATTTTTTGGATCCTCACTCTAAATTTTTATTAAAAATACAAATTTTCTCCATATTTAATTATTTTGTTTCGAGGGTCGGATACGTACGCACGTGCGTGTGTGTGTGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTCCCTACCCAAAGTTATATACTGTGAGTCGTTGTTGTTACTTCTTATATAACGTCTCTTTCGAAAATCTCTCTGTCCTCGTTTTCTAAAACCTTCTCTTAAATCGAGGCTAGAGGCTAGAACATACGTCGCTTGGCCGTAGGCGACGTAAGAACGAATTGGCTTAGCTCACTTGTCGTTGGAAAGTGAGTGCCACATAATCGCAAGTCTGCTGCCATCAAAAGTGCAATAGTGACAAGTGTATATATATATATATATCTTAGTTGATAAAGTTAGCGTGGTTTCTCTCTCTAACTAGTTTATTAGTTTCTCTTCGTCTCCGTGCATATGTTATATTTGTTGGACGAAAGTGTCCCGCATCGGTTAATTTAGGGAATGATCATGAGTTTATAATCAATTAATACTATCTTCATTGGTAGGAGGCATTTTTGGGAAGGTCGAAACAAAACTATAAGACTTTATGCTCAAAGTGGATAATATCATACTCATTGTGGATAATCGTGTTTGTCTAACAATATTAAGTTCGATTTTGTTTGGTTTTACTTTTTCTTTGTAAGGTCGTGTCTCGAAATAAATAAAAAAAAGGTATTTTTATTTTGTATTTAGGAAGAAAACATATTTAATGTGCATATAATTTAATTTTTTTTAGAAGATAAAATTTAATATATAATATTTTTATTTATGTTATAATATCTTAATTAATTGAGTATATATACACGCTATTGTGAAAATATATATATATATATATATTACTAATTTATTTTGGTAGGCTGGAAAGTTTGAACACTAATGACTGAGTGAATGAATTATATAAATATATTATTTAGATTTGAAAGTAGAGTTGGGAAGGGTAACAAGGTAATTTGGCTGAGTTGCAATATTGTTAGGAGGTGAGAAGCCAAGCAATGGCTAATGGTGGTGGTGAAGAGACAAAGTCGCAAGAAATTTGGGATTTTGCAAGGGCATTATGGACTTTTCTCAGGCCTCACACATTCTATGGAACTCTAGTGGCTTCATGGTAATTTTCATTTTTTTAATATTAATTCCAAAGTTTCGGTTTCTTAATTTCTTTTTCGTTCTCATTAATAATAAAGATAAATAAAACCATGTTTATTATTATTTATTAATATGTATATATATATATATATATATATATATATAAATGTAAAAGTTTATATGAAAATTAATTTTCAAAATTAAAAAATACAGTTTTTAATTTTAATTTTAACAAACTTATATAAATTAGGACGTGGAATAATAAATTATTAAATATTTTAAAAATTATAACAAAATTAAATAAGTATTATTATTAAAAATATGAATTGGTTAATAATGGACGCACAGTTCGTTGGCGGGCAGAGTGTGGATTGAAAATCCAAATCTAATGAAGTGGTCGATTCTAACAAGAGCACTTTGCGGCCTAGTAGAGCTGTTGTGTGGCAATAGCTATATTGTGGGTATCAATCAGATTTATGACGTCGAAATTGACAAGTATTTTCTTTCTCTATCTCTTATTATTTTCTTTCTTATAATTAACTTTATTTTGACTATGACTATTTATTTAATGCAGTTTATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATTATTTATTTGGAAAAATGAAGAGTTTATTTCTTTACCACTCACTTCAATTGACCTGTTTTGTAATTTTGTGTAATTTAAATACTATATTAATAGATTGATTTGAATTAATTGTTATTTTTAGTTTTAAAATAATTAAAACTTTAGTCCATCTATTTTTTGAAATCTTATAATTTTAAATTATCTTTTATGATTTTAATTCAATTATATTAGGATTTTTTTTTTTTTTTAATTTAGTCGGAGTGTATGAACTTTGAAAATTTTATTTATACGAGATTATTATTATTTTAAATTCAGTTATATGTAAGGTGAAAATTTTAATTTTTAATTTAAATACTATTTTTATCGGGTTAATTATTATCGCACATTATTTATAATTATTTTGTCGATTTTTTTTAATATCAAAGGATAATAACTAATAAACAATTCGAGCTATTTTATTTTATTTTATAATTTTTAAGAATACACAGTTTTTAATTTTTGTTATGATTTATTTTGCAGAGTAAATAAGCCATTTTTGCCCATTGCGGCAGGGAAGATCACGAGCAAACAAGCATGGGTTCTAACGACGTCGTTTTTGGCGATTGGGCTGTGTACGGCCACGTTTAATTCAGGCCCATTCCTTAGTTCTCTCTATTGTTTCGCTCTATTGCTTGGGACTCTCTACACCGTTCCTCCTTTTAGATTGAAGAGATTCCCCATTGCTGCTTTCCTCTGCATTGCTTTGGTACGTCTAACCTTCTCTTCTAAAACAACAAACCTCTTAGCTCGGGTTGGGTATATCGTGACGTTTGGAGGGTTGTGTCGGTGTAACAATTTAAACCCACCGCTAGTAAATATTGTCTGCTTTGACCCGTGACATATCACCGTCAATCTCACAATTTTAAAATACGTCTAGTTGACAATGATTCGTAACGGGCCAAAGTGGGATGTACCAACGAGAACGTTGGGCGCTCAAGGGATAGATTGTGAGATCCCACCGATTGGAGAGGGAAATGAAACATTTCTTATAGGTGTGTGGAAGCTTCTTACTAACAGATACATCGTAAAATCGTAAGGCTGACAACAATATGCAAAGGATCAAAACGAACAATTTTTGCTAGCGATAGGCTTGCACTGTTACAGTCGGGTTGGGGACAATGTGCTCTTAAGGTGGGTTGGGGTCGAGGTGGGGACCAGAGATGATATTTACATTCTTACCCCCATATCGAAAATTATTAAGAATAAATTTAAGATATTTCAAACTATTTTTAATTTCCTCTCTTAAATGTATTGAAAATTGTCAATTATGTCTTAAAAAAAACGTGGTAAGATTAATAATGTAAACTACGTTTTTACAGGTAAGAGGCTTTCTTGTGAATTTTGGTGTATATTATGCATCGAGATCGGTTCTTGGACTTCCATTCCAGTGGAGGTAATAATAAATAATAATAATTATTATTATTATAGTCTTTAATTATGAAAAATTTGATAATTTTTTTTACCAACAGCCCACCAGTGATCTTCATCACCACATTTGTTACCTTCTTTGGTTTGGTCATCGCTCTCACAAAAGATCTCTCCGATATAGAAGGCGATCGCAAGTAAGTTTTTTTACCGTCTCGTAAAAATTTATATTACTGAAATTACTATTCACAAAACTCGTGATTTTATTAAAAAAATTAATAAATTTATTAAACTACTCTAAAAAATTAACTGTCTGAGCACTCTAATTAAGTTAATTGGTAACATTTTTCTACCAGGAGTCATCTAAACTAGTTACTCTCAAACCATTCTCTAACAAATCTCGAGTTTTGTAGATAAAAACGTTTGATTTTCAGTTCTTGACTTGTCTCGTTGACTCGCTCGATTTGTTTGACTTTTTAGTTCTCGACTTGTCTTTCGTTGACTCGCTCGATTTGTTTTTTAATTAATTTTAATTTTTACAGATATAAGATCATAACATTTGCCACAAAGCTCGGAGTCAGAAGGTTGGCGTTTTTTGGTTCAGGGATTCTTCTTCTCAACTATGTTGCTGCCATTTTGGCTGCAATTTATACGCCTCAGGTTATTAAATATTTAAAAATTTTAAATATATTATTTTTTCCTATTTATATCGTTTATAATAATAATTTTAAATTTATCGTAGGCATTTCGGCGAACCGTATTGATACCGACACACACCATTATGGCAATATCTCTTATTTTTCAGGTTTTTTTAATTTGTTAATATTAAATAATAGCTTTATTATTTATATATATGTATCTCGATATCATATGTTTGCTCGTTAAATAAATTTTAATAATTTAAATAGTGGAAATGGTCGATTAAATAAATTAAAAAGAAATATGTCATTTTTAATAAATTTGGTGTAATTTTATTTTTCAGACAATAGCATTAGATCAAGGAAAATACACCAAGGTAATGTAATTTATGCATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATTTAATCCTTATTCTTATGATGTTTTTTGTGCACATTTTGTAGGAAGCAGCTTCAGGTTTCTACATGTTCTTGTGGAAGCTGTTCTATGCTGAATATTTAGTCTTCCCGTTCATATAAAAACGCTCTCGATTTAATCGAGAGCAATTTTGCTCTTTCCCGACTTGCTGATTAATAGTTCGTATAGTTTTTCGATGCACGTAATTAAAAGTACGGTGTGTTTTTTCTCGAATTTGCATCAATCAGTAGATATTTGTTAACTTAACAGTGACAATTCTACCGACAAGGTTTATATTCGTATACATTATATGACTCGAGCTAGTAGACTGAAGGTTCAAATCTTTATATCCAACGTAAGTCTTACATTTGGTACCTGACGTCTATCTGATTTAAAATTTTAAATTATTTAAAAATAATAATTTCTTTTATTAAATAATAATTATTGAAATTTAATTACGTAGGTTTAGTATGATTTCGGTTAGCCTAATAATAATAGCTAAAAGCTAAAATAACTACATTTGACGTGGATGTGCTCGAGAGTCGGGACAATTTTGTTTTATACGGATCTACTTATAAATAGTATGTATAAATTTCTGTA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ATTACATGTATCTTTCGCTGGAATTAATGCTTTAGTATATGCTGTTTCTTCATAGTTCCAATATTTTTCGTGTGTTTAGGATCTGAAGCTAATGCAAGATTATCTCTCGATGAAAGTATCGCTTGTAGTTGCTTATTAGTGATATTGGAACTATAAAGAAACGGCATGATAGTCTGTATAAATAGAATCACGATGTTAGTGTCTGCTTTTAGTTTTTTAAGCTTTAGTTACCGATGGCACTTACAAGGCACAAAAGTTTACGTAGATTTTTATATGTGACATTATATTCCTTGCAGCTCACCTGTGGCTTTTATTACCACATTTGTGACCCTGTTTGCTTTAGTGATTGCCATAACGAAAGATCTTCCAGATGTGGAGGGAGATCGCAAGTAAGATGCCCCAACTACTTCGATGGTGACAAATTTTTTAGTTGAATTGACGTTGTTCCCTCAACCCTTTTTTCCCAACAAACCTTACTTTTTTTTTTTCCTTCCTATTTCCTCTACTTATGCTTTGTGGGGATTCTTTTTCCAGAAGGCTTCAATTTTTTCCAACTCCAAAATTTGCATCTCAATTCTTTTAGAAGTGTATATTAGGAAATTATCATGTCGTCATCTGAATGAGAATTGTAATTAAGGTTTCAGATATCAACCTTAGCAACAACGCTTGGTGTTAGAAATATTTCATTTCTTGGTTCTGGACTTCTGCTGTTAAATTATGTTGCTGCTATAGCGGCTGCAATTTACATGCCTCAGGTCCGTATGACATTTTAACTATAAATACTTTTACGTATCTTTTTGAAGTAAAATTTCCATATTTCATCTTTACAGGCTTTTAACCGTAAAATAATGATCCCTGTTCATGCAATCTTGGCATCGTCCCTCATTTTCCAGGTTCATTTCTTGCACTAGTCTCCCAGAAACCACGAATGATGGTGCTATATTGTGTCTATAAATTTCTTCCTGCTATTATTTTCTTGATTAGTATGTATTAATACTAACCAAGGACTAAAGAAACCCTGTCCTCGAGAACAACTAATTTATATGTATTGACTCTAAACTTACAAAACCTTTGTTTCTTTTGAATCTCAGGCATGGTTGTTGGAGAGAGCAAATTATTCAAAGGTAAATTCCAGTTCTGGCTTTCATATCAGTAACTACAATGAGCGTTTTATCTTCCTTTATACGTTGTTTACTTCAAAGAGTGAGCGACTAAGGCAGCTTTGTTTCCAACCCATGAAATTCTGGAGCCTAATGATTAATTTTATTTGTTTTGCAGGAAGCAATCTCAACATTTTATCGGTTTATATGGAATCTCTTCTATGCTGAGTATATCATATTTCCTTTGATCTAG 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MAMASCLLRTVAAAAAAGGSQSFDPTSYRKRKIAVKTLKSFQTPLPYCSPSHLLNPPLPEVRSQAMANGGGEETKSQEIWDFARALWTFLRPHTFYGTLVASVNKPFLPIAAGKITSKQAWVLTTSFLAIGLCTATFNSGPFLSSLYCFALLLGTLYTVPPFRLKRFPIAAFLCIALVRGFLVNFGVYYASRSVLGLPFQWSPPVIFITTFVTFFGLVIALTKDLSDIEGDRKYKIITFATKLGVRRLAFFGSGILLLNYVAAILAAIYTPQTIALDQGKYTKEAASVFCGVSFCYDLTGNSSSLLPASVPIPVVLTMEYSVIQSVSLRTPAVNSSLKSSLPHRKLLVRHATALPKLLLPNFALQLQPRWMYCCRGNVSTRSWRRVSIQARTQVGAAGSDPLSNNISAFRDACWRFLRPHTIRGTALGSLSLVTRALIENSHLIKWSLLFKAFSGLFALICGNGYIVGINQIYDIGIDKVNKPYLPIAAGDLSVKSAWLLVIFFAVAGLLIVGLNFGPFITSLYSLGLFLGTIYSVPPFRMKRFPVAAFLIIATVRGFLLNFGVYYATRAALGLTFEWSSPVAFITTFVTLFALVIAITKDLPDVEGDRKFQISTLATTLGVRNISFLGSGLLLLNYVAAIAAAIYMPQAFNRKIMIPVHAILASSLIFQAWLLERANYSKEAISTFYRFIWNLFYAEYIIFPLI Homology
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1ACB3 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HST PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 3.4e-148 Identity = 267/332 (80.42%), Postives = 301/332 (90.66%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0D576 (Probable homogentisate phytyltransferase 2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT2 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 501.1 bits (1289), Expect = 2.0e-140 Identity = 255/322 (79.19%), Postives = 282/322 (87.58%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1JHN0 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic OS=Chlamydomonas reinhardtii OX=3055 GN=HST PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 358.6 bits (919), Expect = 1.6e-97 Identity = 185/306 (60.46%), Postives = 230/306 (75.16%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A0B5A051 (2-acylphloroglucinol 4-prenyltransferase OS=Humulus lupulus OX=3486 GN=PT1L PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 303.9 bits (777), Expect = 4.7e-81 Identity = 168/344 (48.84%), Postives = 223/344 (64.83%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E5RP65 (2-acylphloroglucinol 4-prenyltransferase, chloroplastic OS=Humulus lupulus OX=3486 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 8.9e-80 Identity = 162/322 (50.31%), Postives = 214/322 (66.46%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. NCBI nr
Match: KAG6596655.1 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1360 bits (3520), Expect = 0.0 Identity = 705/705 (100.00%), Postives = 705/705 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. NCBI nr
Match: KAG7028193.1 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1294 bits (3349), Expect = 0.0 Identity = 702/828 (84.78%), Postives = 702/828 (84.78%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. NCBI nr
Match: KAG7017533.1 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1019 bits (2635), Expect = 0.0 Identity = 578/822 (70.32%), Postives = 612/822 (74.45%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. NCBI nr
Match: KAG6580782.1 (Homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1004 bits (2596), Expect = 0.0 Identity = 565/817 (69.16%), Postives = 603/817 (73.81%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. NCBI nr
Match: XP_022945986.1 (homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 738 bits (1905), Expect = 1.03e-262 Identity = 384/388 (98.97%), Postives = 387/388 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G2E7 (homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450149 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 738 bits (1905), Expect = 4.98e-263 Identity = 384/388 (98.97%), Postives = 387/388 (99.74%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KU37 (homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498673 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 718 bits (1854), Expect = 2.79e-255 Identity = 373/388 (96.13%), Postives = 379/388 (97.68%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B713 (homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486727 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 670 bits (1728), Expect = 3.92e-236 Identity = 355/389 (91.26%), Postives = 364/389 (93.57%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LGW2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G791520 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 668 bits (1724), Expect = 1.59e-235 Identity = 353/389 (90.75%), Postives = 364/389 (93.57%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DCZ4 (homogentisate solanesyltransferase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019344 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 660 bits (1704), Expect = 1.79e-232 Identity = 348/390 (89.23%), Postives = 362/390 (92.82%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.1 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 2.4e-149 Identity = 267/332 (80.42%), Postives = 301/332 (90.66%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.2 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 1.2e-145 Identity = 261/313 (83.39%), Postives = 288/313 (92.01%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. TAIR 10
Match: AT2G18950.1 (homogentisate phytyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 159.5 bits (402), Expect = 1.0e-38 Identity = 113/328 (34.45%), Postives = 178/328 (54.27%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g207000 vs. TAIR 10
Match: AT3G51820.1 (UbiA prenyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 2.1e-04 Identity = 50/208 (24.04%), Postives = 86/208 (41.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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