Csor.00g189380 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g189380
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr16: 8904499 .. 8908530 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g189380
SyntenyCsor.00g189380
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSstart_codoninitialpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCCCGCAACCGACGATCTTTGGACCAATCTTCTTTGTGGAATCCCATCCGTCGTTGTAGAACTCCAAATGTTCGATCTATTCGTCACCATTTCTCCGTCGGCGTTGGCAATTACAATTTCGATATCGACCTTCAAGAATTTCCGAGTGCCCTCGCATTCGCAATTACATTACGATTTCCGAAGAAGAATCTTGATTCGGATTATATCTTGTGGTTTCTTGATTCAATTGTGCCAGGAAATTTATCTTGATTTTGAGTAAATTTTGAGAATCGAACAGGTCGGCGCCTCTCTGTATTTTAGGGCTTTTCGGTTTCAAGAACGCAATCGATTTCTTAATTCGAGTGATGCGAAGACGATTAATCGAACCAAAACGAATCTCAGATATGAACTGAATAAAATCAAAGCCGTAAACTAGCATTTCAACGAGATTCTCTAACCTTTTCGATCGAGATTGTTTTGCCTGATTCTAGCGGCTGTCGGCGCCGGCCTGATATTGCCGGAAGTGATCGTCGGTCGCCGGTAATTGCTGTTCCGCTGCCGCCAAGGTCTGAACAGTTTATCGTGGGATTGTTATACGCGAACGAACAATCCGCAATATTTAATAAATAAATAAATAACTTATTTCCTTTTTTTTTTAATACTTTTATCTATTTTAATTTTTAACCTAATAATTTTTTTATTCATCCAATACAAATTTGACACTTAAGCAAGTTTTAGTCTAATAGTGGATTTTCAAAATTAATATGTTCATCATTTGGTATTTGAGAGGTTAAAAAAAAATGGCATGTTTTGTACGGGAAGCTTTGAATTTGATCTCTAATTAGATTTTGAAATTTGAAATTTGTTTTTTTGGGTGACCCCGAGTAAAACAGTGGTATATGAATGAATTGGGACAGCAGATGTGTTAGGTTCCACATTGGTTGGGGAGGAAAACAAACCATCTTATAAGAGTGTGGAAACCTTCTCCTGGCAGACGCGTTTTAAAGCCTTGAGGAGAAGTCCGAGAGGGAAAGCTCAAATAGGACAATATCTGCTAGAGGTGGATCTGGGTCGTTACAAATTGTATCAAAGCCAGACATCGGACGATATGTTAGCCTTCTCGCTGTTTCTCGGAGGGTAGACACAAGGCGGTGTGCCAGTAAGGACGTTGGGCTCTAAAGGGGGTGGATTTGGGGGCGGTCCCACATTGATTGGAGGAAGGAAAAAGTGTCAGCGAGGACGCTGGGCCCGTAAGGAGGAGGGTGAATTGTGATGTCCCGTATTGGTTGGGGAGGAAAACAAATCACCATTTATGAGGGTGTGGAAACCTTCCCCTCGCCTTTTAAAGTCTCGAGGGAAAGCCCAAAGAGGACAATATCTACTCGTGGTGGATCTGGGTCGTTACAAAATGAGTGAAGACAAAACATCTAGGGTCTATGGAATAACATTCCCACTTAGAAACAAGGAGTAAATAACACCATTTTACAAAAATGCAGCAGAATGTCAAGTTCATCAAATGTCAAAATTGTAGTTTGAACCCTCGATATCGATCATAATTTACCTCCTGTCGGGTTAAAATAAAAAATTAATTTATATTTAAGATTAAACACGTCATATTAAAAAAATATTTTAAAAAATTAAATTCAAATTTCAATATTCAAAAAAGTGTTTCACCTTTTCTATTGCTTTTTCCACCTCCCAATTTCTTTCCTTCTCGTAATGTTGTCATTTTCATAATAATTCCCCCACTCACGTTTTTAATGATGAGCTGTCAAGCGTGTGAAGGTCGATTTCACTAAATAATTTATTTTTATTAAACATAATATTTAACCAACCTATTAATTTAAATTACAAAAATTAACTTTTTTTTAAGCTATATATTTAGGAAAATGATAATAATTCAATTAATTACTGATAAATATTCAAATGATTGTTGCATTGAAAAAACAAATATTTAATAAATAATTAAGAGTTATTTTGTTACATGATTATTGTTTAATTAGCTTCAAATTAATTTTAATTTTAAGTAACTAAAATTACAATTTATTAAAAGTAAATAAATTTAAATTAAAAAATACAAAACTAAATAAATTAGACTGAAAGTAATTACTTAAAAAAATAATTAAAAGAAAATGTTATTAAATTGAAGTCAAATGACATTAATGAATAAATGGTGCAAACTAAAATTATAGCGTCAAAGTTAACGATACCGTTACCGTCAAAATCGAGATGATTTCCCACGCTCTACGAAGCGCTTTCAAACAGCAATTCCATGGTACCAGATATCTTGGTCGTGTCCGCATTTAAGCCCACGCGCTTCATAGGCGCGTGGATTACTTCAACGAAACTGTCTGTTTAAAATTTGGGACCCACTCTGTCTTTATCCCCTCTCTCCCTAATCAATATCTCTCTTACTTACCCTCTAAATCGAGTAGTTTTATTAATATATAATTAATTAATTAATTAATATATTAGCTACTAAATTAGGTTTAAATTAACAATAAATTAAATTATACGCTAAATTTTAAAGTAAATTATATAATTATTATCAAATAGGTTGATTTGGAAGGTCCAAGATCTGGTTGAAAATCGAATACATTTCTTATAAAAATGTGAAAACGGCTCCCTCTGTGAGGATGACTGGGATGCATAATAGGCCAAAACAGACAATATCTGTTAGTAATGGGCTTGGACTGTTACAAATAGCATTAGAGCCAAACACCGGACGGTGTGTCAACAAGGACGTTAGTCCCCAAGAGAGGTGGATTGTGAAATCTCATATCGGTTGGAAAGGGGAACAAAATATTCGTTATAAGGGTGTGTAAGTATCTCCTTAAACGCGTTTTTAAACCATGAGACTGACAACAATACGTAACGGGCAAAAGCAGACAGACAATATCTGCTAGTAGTGGACTTGGGCTATTACCGTTATTGAAAAACAGCTACAACTAGTAATTAAAAAAATATAATTTTTTAAAAAAATTGAAAAATAACTACATAGGATAAGAATTAACGATATAATAGTTGTAGTGACGATGACGATTATTTTAATACTTTTTAATACAAATATTACGACCCGTAAAGAGTTGTAATACTGCTCTCAACTGGACTATAATTCAACTGGTAATTATATATTTAAAGTGAAATATATATTATAAATATAAAGTAAAATATTTAATTAAAATATTGAGATTTGGACATTAGTGCAAAGAGGTGGGTTAGACGTCTGTGAATTTGGCAATAGCCTTACACCCATTGCTCTCTCTCCGAACTCCGTACTGTATTTCATCTCTTTCTCTCTCTCTCTGGAAGGGGCTTCGTCTTTTGTTCTTGCGTTCATGGTGGTGGGTTTCGCAGAGGCTTTGCCTTTTGGGTTCCAAAACCCCCAATCAAACCTCAAAAAGCCATCTCTCTGGCTTCCTTCGCTTCGCAATCTCAACGATTCGCTTTCATTTTGTCACTTTCCTCGTCCATTTCCATTTTGACTCTCTCTAAAAGCGAAACTGTTTACTCTTCAAAAGGTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTTTTCCCCTTTTTTTTAATCTATTATCTTCTGGTAAAATAGTCTTCGCTTTGAATATTTGATTCTTGTGGATTTGTTGGGCGTGCTCTGCTGTTCTTTATCTTTTTGTTTGTTTATAATTTGTTTGACTCTGATTTTTTCAACTCTTGGATTGTAGAGGTGCGTTCGTCTGCTTTTTTCAAGGTTTTGAAAACTATTGTTTGATTTGCGTTTTGGATGTCCTGATTTTGACTGGAAACTTCGTGATCGAAAACCTTGATGAATGGAGCCTTCTGATTTTGAAGTTTTCTTAGCATTCTGTTCTTTCTCTTGAGATTTTGAGTTTGATTTCTGTCATTGATGTGATTTGGTTGAACTAGGAGCGATCAATCCAGGCTCTGATGAATGTTTTTGTTGGAGCCTTCTTCGTGTCAGGATTTGTGTTTATATCTCTTGCCATTGTCTCTGTTGATTGAGGAGATGATTAAGCTTTACTCGTGGATGCTGTTGTAGGGAACCATATATAA

mRNA sequence

ATGCCCCGCAACCGACGATCTTTGGACCAATCTTCTTTGTGGAATCCCATCCGTCGTTGTAGAACTCCAAATGTTCGATCTATTCGTCACCATTTCTCCGTCGGCGTTGGCAATTACAATTTCGATATCGACCTTCAAGAATTTCCGAGTGCCCTCGCATTCGCAATTACATTACGATTTCCGAAGAAGAATCTTGATTCGGATTATATCTTGTGCGGCTGTCGGCGCCGGCCTGATATTGCCGGAAGTGATCGTCGGTCGCCGGTAATTGCTGTTCCGCTGCCGCCAAGAGGCTTTGCCTTTTGGGTTCCAAAACCCCCAATCAAACCTCAAAAAGCCATCTCTCTGGCTTCCTTCGCTTCGCAATCTCAACGATTCGCTTTCATTTTGTCACTTTCCTCGTCCATTTCCATTTTGACTCTCTCTAAAAGCGAAACTGTTTACTCTTCAAAAGGGAACCATATATAA

Coding sequence (CDS)

ATGCCCCGCAACCGACGATCTTTGGACCAATCTTCTTTGTGGAATCCCATCCGTCGTTGTAGAACTCCAAATGTTCGATCTATTCGTCACCATTTCTCCGTCGGCGTTGGCAATTACAATTTCGATATCGACCTTCAAGAATTTCCGAGTGCCCTCGCATTCGCAATTACATTACGATTTCCGAAGAAGAATCTTGATTCGGATTATATCTTGTGCGGCTGTCGGCGCCGGCCTGATATTGCCGGAAGTGATCGTCGGTCGCCGGTAATTGCTGTTCCGCTGCCGCCAAGAGGCTTTGCCTTTTGGGTTCCAAAACCCCCAATCAAACCTCAAAAAGCCATCTCTCTGGCTTCCTTCGCTTCGCAATCTCAACGATTCGCTTTCATTTTGTCACTTTCCTCGTCCATTTCCATTTTGACTCTCTCTAAAAGCGAAACTGTTTACTCTTCAAAAGGGAACCATATATAA

Protein sequence

MPRNRRSLDQSSLWNPIRRCRTPNVRSIRHHFSVGVGNYNFDIDLQEFPSALAFAITLRFPKKNLDSDYILCGCRRRPDIAGSDRRSPVIAVPLPPRGFAFWVPKPPIKPQKAISLASFASQSQRFAFILSLSSSISILTLSKSETVYSSKGNHI
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g189380 vs. NCBI nr
Match: KAG6577737.1 (hypothetical protein SDJN03_25311, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 306 bits (784), Expect = 6.83e-105
Identity = 155/155 (100.00%), Postives = 155/155 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MPRNRRSLDQSSLWNPIRRCRTPNVRSIRHHFSVGVGNYNFDIDLQEFPSALAFAITLRF 60
           MPRNRRSLDQSSLWNPIRRCRTPNVRSIRHHFSVGVGNYNFDIDLQEFPSALAFAITLRF
Sbjct: 1   MPRNRRSLDQSSLWNPIRRCRTPNVRSIRHHFSVGVGNYNFDIDLQEFPSALAFAITLRF 60

Query: 61  PKKNLDSDYILCGCRRRPDIAGSDRRSPVIAVPLPPRGFAFWVPKPPIKPQKAISLASFA 120
           PKKNLDSDYILCGCRRRPDIAGSDRRSPVIAVPLPPRGFAFWVPKPPIKPQKAISLASFA
Sbjct: 61  PKKNLDSDYILCGCRRRPDIAGSDRRSPVIAVPLPPRGFAFWVPKPPIKPQKAISLASFA 120

Query: 121 SQSQRFAFILSLSSSISILTLSKSETVYSSKGNHI 155
           SQSQRFAFILSLSSSISILTLSKSETVYSSKGNHI
Sbjct: 121 SQSQRFAFILSLSSSISILTLSKSETVYSSKGNHI 155

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g189380 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g189380 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6577737.16.83e-105100.00hypothetical protein SDJN03_25311, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g189380 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g189380 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g189380.m01Csor.00g189380.m01mRNA