Csor.00g140690 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g140690
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr01: 13768412 .. 13771286 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g140690
SyntenyCsor.00g140690
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATGAAGATGAATGGGGACTCCGGTGGGATTTTATACCGGAGGGGATCCTATCCTTCGGTGGTTCACCGGCTTCTCAGCCGCCGCCGCCGGTCATTTTCCAAATACAGTCGACTCCCATTGAAGGGGTCGCGATTCTGTTGCAACAGACTACAGCGCACCATTGCTTGAAGCGCGGGACTCGGGAGAACGAGAGGGATCGCATTTCAGATAGGGCAATTCAAACTTCAAATAGTTTTGGGTTTGGGCCAGGCCCATTGCCTTTGCCGGCCCAGGTCCAACAACAAAATAACACTAAAATTATTCTCATTTTCGACCTTACAAATTTTTATTACATTTTGTAAATAATAATTGCTAACCACTAACATATACCGACAAACTTATGATAAAATTGTGTGCGTGATATCAGAACTACACACCGAGCGGTGTGCCCATGAAGATGCTAGCAACCCAAGGGAAGTGGATTGTGAAATCTCACATTGTTGTAAATGAGAACTAAGATGTTCCTAAAAAAAATGCGTTTTTAAACCTTGAGAGGAATTTTATCTCAAATAGTCCAATATTGGCTAATGATGGGGCTCTTACAATTGGTATAAGAGCCCGACAACAGAGCGGTGTGCTGGTGGGAACACTAAATCCCATATGGAGTAGATTGTGTGGTAATATTTGCTTGAATAAAAATATACACGAGCATAAAAAAAATGTTTTTTAAAACGAATTATATTATTATTATTTTAAAAAAATTGAAAGAAGCAATCCAAATAGAAAAAGACAAGGCAGACCATTATAAATTCACGGAGAATCGAACCCAGCACATATACACCCGACAACCTTATCATAATCAAGAATTGACATTTCTATAAATTATTCAAATTTAAACATTTTTATATAAATAAATATTATTTAAAAGAAATTCAACATTCATAATATTTTAAATAATACTCTAATTAACTATTAACTTATTTTACTCATTACCGTTTAGGTTAAGTTCTTAACCATTTAAAAATTTTTAATTTGGCCTCTAATTTTTAGGCATAATTTAAAATTTAAATAATTTTAAAATTAAATTGGTTTTATTACAAGTTGATAGGTTTGAATAAATTCATAATTTGACTTTATTTTCTTGTTAAGAATCATTGTCTGTTGAGTGTTGACCACTTTATAGAGAAGCTGACGTCATGGTGGGGACATGTAATGTGATGCCAATGGTATGCATGTGCATGCATGCATGGCGGTAGCATGCTTTTTTAAAGTACGTTTTGAAATAATTAATGAAGATTTGACTATGATTACCCAAATTATATTCCGTAATTATATTAAAGTTTTGGTCGGATTTAAGATAATTGTACTTTTCGGTATGTGATAATGACATCTCAATCACTATACTATTCCCTATCAAATATTATTATGTTTTATAAATAAAATAATAAGTGAAAATAGTATATATAAATTTGTTTAACAAAAACATGAACCTAAAAACTAAAAAAACTTAATTAGAGCCGAAAAAGTGTAGTTGGGTCATCACATTAGGCTTTCCGCATAGAACACGGTCCCTTTTAAATACTGAACCTGCTCATGCTTAGATAGCATTGTTACTAACGAGTAATCGACAATTTCCTCTAGTTTTCTAATGGAAATTAGTGGCATCGAAGACAAAACCCAAATTAACTCAAACCTGTAAACCGAAGAAAGATTGATAAAAAAAACTAATTCAATTAAAGGGTTGAAAAGAAAAAAAGACATAAATAAAGAAGGAGAATAGAGTGTTATGGAATGATTATTTTGTCGAGACTTTATATCGGTCAATAGAGCGAAAATGGTCGAAAAATGTTATAAATTAACTTGTTCTTTCATTAACTAGAAATTGAGTTACAATCATTTGGATGTTTGTTTCACTAGAATCATGGAGGTCTTAACAAGTACTCTACAATGAAGATCTTTCGTACTCGAACATTCTACTCTTTACGGTGTCAATGTCCAGAGACAGAGTAATTGGGATAGGGATTTGGACTTTGGATTCTTTCACCAAAATCGAAGAACAAAGAGAGAGAGGGGGAGGGAGAGAGATTTTGAATCCAAAACGAAATAAACAAAGAGAAAAGAGCAATTCGGCGGAGTGGAGGAGTGGACCATTGGGGGCAAGAGGGGTCGAGCTGGGATTTATTAATGGTGGAGGCGTAATAATGGTGGGAGATGTGAAAGAAACAGCCAACCAGCATTCAATGCAGACATGTTTGTATCGATTGCCATAGTAAATGTGGGAATTTATGGGGTTCTCAGAAACCCCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCACTCTCTCTGTTCTTGCTTACTGGAAGAGTGGTGGGGGAGCTGCCGATGTTGGTTGGAGGAGTTGTTGGATGCTGTTTTCTGCCCTTATTTTTCGTCCTTTCCCCTAATCCCAACAGTTTTCTTTTGGGTTTGGATTCCTTCTCTCCCATTATCTTTCTCGGCGGCTCCTCTGTTCATATTCTAGTGCTCTGTTTTTCACATTTTCGTTCCTGGTTCGATTAAAGCTCTGTTCTAATGGGTATATGCCATTTTCTGTAGAAAACTTTGGGATCTTCAGTTCAAAAAAGGCAAGTATTAAAGCTTGTGAATCTGGGGTTTACGGGTTTCTTGTTTTTTTTTTTGAATTTTTGAATGAGTTGCTGGTGATGGAGATGAATTTTTTGAAATGGAGCCATTTTCAGTGATGGGCCCTTGAAGAAAGTAAAGGGTTCTTCTCTGCTGATCGTATTAAAGGTAATGTCGCTTAGTCTGATGACCCTTTTGTTCTTTGATATCTTTTCCTTTATTTATACCTTCTCTTTAAGACCCACTGATATCGATCTCGCAAAAGTTAGCGATGTGGCTTAA

mRNA sequence

ATGGATGAAGATGAATGGGGACTCCGGTGGGATTTTATACCGGAGGGGATCCTATCCTTCGGTGGTTCACCGGCTTCTCAGCCGCCGCCGCCGGTCATTTTCCAAATACAGTCGACTCCCATTGAAGGGGTCGCGATTCTGTTGCAACAGACTACAGCGCACCATTGCTTGAAGCGCGGGACTCGGGAGAACGAGAGGGATCGCATTTCAGATAGGGCAATTCAAACTTCAAATAGTTTTGGGTTTGGGCCAGGCCCATTGCCTTTGCCGGCCCAGAAAACTTTGGGATCTTCAGTTCAAAAAAGTGATGGGCCCTTGAAGAAAGTAAAGGGTTCTTCTCTGCTGATCGTATTAAAGGTAATGTCGCTTAGTCTGATGACCCTTTTGTTCTTTGATATCTTTTCCTTTATTTATACCTTCTCTTTAAGACCCACTGATATCGATCTCGCAAAAGTTAGCGATGTGGCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATGAAGATGAATGGGGACTCCGGTGGGATTTTATACCGGAGGGGATCCTATCCTTCGGTGGTTCACCGGCTTCTCAGCCGCCGCCGCCGGTCATTTTCCAAATACAGTCGACTCCCATTGAAGGGGTCGCGATTCTGTTGCAACAGACTACAGCGCACCATTGCTTGAAGCGCGGGACTCGGGAGAACGAGAGGGATCGCATTTCAGATAGGGCAATTCAAACTTCAAATAGTTTTGGGTTTGGGCCAGGCCCATTGCCTTTGCCGGCCCAGAAAACTTTGGGATCTTCAGTTCAAAAAAGTGATGGGCCCTTGAAGAAAGTAAAGGGTTCTTCTCTGCTGATCGTATTAAAGGTAATGTCGCTTAGTCTGATGACCCTTTTGTTCTTTGATATCTTTTCCTTTATTTATACCTTCTCTTTAAGACCCACTGATATCGATCTCGCAAAAGTTAGCGATGTGGCTTAA

Protein sequence

MDEDEWGLRWDFIPEGILSFGGSPASQPPPPVIFQIQSTPIEGVAILLQQTTAHHCLKRGTRENERDRISDRAIQTSNSFGFGPGPLPLPAQKTLGSSVQKSDGPLKKVKGSSLLIVLKVMSLSLMTLLFFDIFSFIYTFSLRPTDIDLAKVSDVA
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g140690 vs. NCBI nr
Match: KAG6608506.1 (hypothetical protein SDJN03_01848, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 307 bits (787), Expect = 2.57e-105
Identity = 156/156 (100.00%), Postives = 156/156 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MDEDEWGLRWDFIPEGILSFGGSPASQPPPPVIFQIQSTPIEGVAILLQQTTAHHCLKRG 60
           MDEDEWGLRWDFIPEGILSFGGSPASQPPPPVIFQIQSTPIEGVAILLQQTTAHHCLKRG
Sbjct: 1   MDEDEWGLRWDFIPEGILSFGGSPASQPPPPVIFQIQSTPIEGVAILLQQTTAHHCLKRG 60

Query: 61  TRENERDRISDRAIQTSNSFGFGPGPLPLPAQKTLGSSVQKSDGPLKKVKGSSLLIVLKV 120
           TRENERDRISDRAIQTSNSFGFGPGPLPLPAQKTLGSSVQKSDGPLKKVKGSSLLIVLKV
Sbjct: 61  TRENERDRISDRAIQTSNSFGFGPGPLPLPAQKTLGSSVQKSDGPLKKVKGSSLLIVLKV 120

Query: 121 MSLSLMTLLFFDIFSFIYTFSLRPTDIDLAKVSDVA 156
           MSLSLMTLLFFDIFSFIYTFSLRPTDIDLAKVSDVA
Sbjct: 121 MSLSLMTLLFFDIFSFIYTFSLRPTDIDLAKVSDVA 156

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g140690 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g140690 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6608506.12.57e-105100.00hypothetical protein SDJN03_01848, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g140690 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g140690 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g140690.m01Csor.00g140690.m01mRNA