Csor.00g125920 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g125920
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr15: 3267529 .. 3273476 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g125920
SyntenyCsor.00g125920
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSstart_codoninitialpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATTGGCCCTCCTTGTGAAGCATATAAGCCTTCGGATTTCATCATGTTCACTATCTTGGTGGTGAAGTTTTGCATGTAAAACTATCATTGAAGGTGAAGGGTGACCGTGAAAACATAACTTTCACTTAGGTTATCATGATTCAAAAGCTAAAAGTTCATGAATTACTATAAATTTAATATCATCAATACTTTAACACACCTTGAATGGTTCATTATCAGATCGATAAACAATTCCAGGAACATCATGCAACCAAAACGGTAGACCACTGTATATTAAAAAGTTAAGACCATGACTGAGATATGGTTATTTATAAAGGAATAATGGTGAGAAAAAGTTTCATATGTTCTTACCCGTAATTCCATTCCGCCTCAATGAAGGGTCCGATCCTAAGGCAAGCATATAATCCTTGCGCTTGTATTTCCTTAACGAATTTTACTATGTCGCGTCTTCCACTAAATTCATACTGAAAAAACAAAATTTTTTACACGGTTCAAGTCATGTCTATCATCTTTTAGAGATATGCAGAGAGCAGAGAGATTGAGTTACCCTTCCTTGATGGGGTTCGTGCAGGTTCCAGAAGACATAGGTTTGTATAACGTCTATTCCACCTTCCTTTGCTTTGGCAATCAAAGAAGGCCACATCTGCATAACAAATTAACAAAAACCATCATCATAATTCAACTCTTTCCAACACTGAAGCACACGTAAAAAAATGTTGCGGGTTTACGGGTTGACCCGGGCCCAATTGAACTACAATGGGACCCAGCCTTTTTCTAGCCGATTCGTAATAGCCATCATGTTCACAGATGATTTGAATTTCATGTGGAGATTTTCCATTCGTCCATTGAACGGTGACCCGAATCACATGATTCTTGAATACTTTTTGTTGGGTTTTTCTATGGCGGGCCTGATTTCGTTCACTTTCAAACAATGTTTTAAAAAAATAAAAAATAAAAAGTATTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTGTAATTAAAATTTAACTTAAAACTTCAACTTTATTTATTTTTTTTTAAAATAATTTTATTAAACTAACCACTCTTTATTTAATTTTATGTTGAAATTTTTTAATTTTATATAACAATATAATACAAATTTTGTGTAATGTTGATTACAAAAAAAAAATAATAATAATAATTAACAGATAAATGTAACATAACAAATTATAATCTATTTTTATGCAATAATGATAAAAATATATATATATATATTTCGAATTACCGTAACTTAATGAGACGGTATTAAAAAATTAGAAACTAAATATATTTTTGTTTAAAAACTATTAATATAATCGTCAATCCCAACATCACTAAAAAAAATCGCTATATTTCATATTTAATAGTAATAATAATAGACCTTATTAAAAAACTGAACACAAATCACGTATCATGCTGTTCTAGAAACGCAACATTCATAATTAATCTCATAATTCTTTTAGTTCTGATTCTATCACTGAAACAAAATAGAAATTCCAAAATAATTTATTCCTTAATTAAGTAAAATTTAATCTAAGAAATTGAATAATACCGTAAACAGTAATTCACTTCATTTATTGGCGGGAAGTTTTATTAATCTAAACACCGTTTCTGAAAATGAGGGGGAAAAAGACACAGAAATTCCATTTTAGAAAAGTAGATTGAAAAGAATGAGCAAACATGAATGATGAACCACTATGGCTATGTACTTCGCCTAAACGCTAGACAACAAACCGCATTTTGTTTCTCTTTTTGAACTAACCTAAACACCTATTGCACAGCAATGCGAAATGGATGATCCATAGAAAAATCGTTTTCCCGCCAAAAAAATTGAAACAGTGAAAATTCGGCCGCCATGATTCTTAAACTCAAATTAGAAACAGAAATCATCGGAATTATCACAGAAGATCAGAGATGGAGGAAGAAAGTAAGAAATCGAACTTACATCCGGAGTGCTCCGTGGATAGTGAATAGAGCCAGAGAATAAAAGTTTGTGTTCGCCATTGACGATTAAGGATCTTCCATCGTAACTTACACCGTCGCTGCCGTCGCTGCCGTCGTTACCGCCGAGGACGCAGTGGAATAACGCCGCCGTGAATACCAAAGCAGAAACACAGAGTAATCGGACGGTGCCGCACTCCGATTTCGCCATTGATTCCCGAACCTTCCTCTCTTCCAAGGCTGTTCACTGCTGAATCAGAGAAATGCCGCTTCCTTCTATATCAACGCTAGAATTCCACTTCTCTCTCACTCCTCATTCTCTTCTCTCAATTGAAAGCAATATACAAATTCGTCTGGATCTGTCAGAGGCGAATTTCATATACCAATTTTCTGCGTAAAAAACGAGGCGTCTCTCTTGATTTTATACAGCGCCTTCATAACTGGCTGTCAATTAATTTAAAATAAATAAATAAATAAACAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTTGGCGGATTCGAGTCGAACTGGAATTTCCGGATTTCAATGGTACGTTGGGGAACTATTAAATAGTTTTGTCGGTACTTTAAGAGAATTATGGATAAATAACGGGGGGGAAATGAAAATAGAGTAAGTTTGTGGGTAAGCATGTAAATTAAGTATAAAATTAAAAAAATAAAAATAAAATAAAAAAACAGAGTGGACCCTGACCCGGACCCAATGGTAGCGGAAGCTCGTCAGTTGAGTCACGTGAGAGAGATAAAACAAAAATAAGCAACTTATTCAAACGTAGAAGCCACGCGCCACGCTTCCAAGCATTCACACGCTTGAGACTATTATAATAGAATTTTTTTATTTTTATTTTTTTATAATAAATTAGAAGTGAATCGAGTCAACGATGGAGATTATATTTTTAATTTTCATCCCTGATATGTAACAGCTCAAGCTTCGAAGGGGTGAATTGTACAATATCTGCTAGTAATGGGACTAAGTCGTTAAAATTATATCAGAGCCAGACACTAAGTTCTGTGCCAACAAAGATGTTGGTCCCAATGGAAGTGGATCGTGAGATCCCGCATTGATTTGAGAGGGAAACAAACCGTTCTTTGTAAGGTGCATGGAAACATTTTCGGTAGTAGACACGTTTTAAAATTTTGAAGAGAAACTCATAAAGAAAGTCTAGATGAGACAATATCTGCTAATGGTGGGCTTGAACAGTTTAGATAGATAGATATACATAAAATCTCTATAATAATCTTACCCTTGCCGCTACAAAAATAAATTGAGAATTTTGTAAGAATTGGAATGAAAGACAGGGACACAGAAATTGTTGTTCTTTAAGGATAGTTGACCGTATATTTTGAGACAAATATTTGACTTGTGCTTACCATATTTACCTTATATTCTGTTAAAAGTAAATATATTGTTTTCATTCATAATTTACCATATTTCTCTATTTAGTAAATTATTATAAAATTTATAAATGGTAAGAAAATTTAGCTAGAAAATATTTATTAAAAAAAACACTCATATTGACTAAACAGTATTATCTATTAAATTGAGTGTTTTTACAATATTATTACATCTAAATAAGTTTTAAACGCAGGTAAAATTTATAAATAAAATAATAATTGAAGGCAAATATTTAAGGTAAAAATAGGTGGAGAACGGTATTAAATTAAAGGTAAATTTGATAATTTAAAATTTTAATAATGGTTGTGAAATAAAATGAGGGAGTGAAATCGAAATTAAACAGAATCGCTAAAATTTCGGCTTGCATTTTGAAGCTGCAAAACGTGCAAGCAACAGAGCAAGGTTGTCTTGGCTGTTCCTCACATTAATTGCTTTCTAAAGCCGTTTATTAACGTTGCGTCTTTGGCTGGACTTGGAAAAATGAGCCTTTGACGTTACAAAAATACCCACAAAAAAGTTTATTGCATTTAATTTAAATAATTAATTAAAAATTTTATTTTATTATTATTATTTAATTGAATAAATTAGTAATTGATATTAAGTATATATCAAGTTATTATTAATTTTAAAATATACATTTTTATATATAATATAATTGTATTTACTTTTTAATAATTACAATTTCTTAACTAGTTTTAAAAATAAATTTTAACAATTTAAAAAGTTATTTTTTAAAGCATATCTTAATTAAATGTTTTAAAATAAATCAATAAATATTTTATCAACTAACATTATATTTTTATTAAAAAATAAAATTTAAATAAATGATTGAACATCTCGAACCAAAAGTAAAAAAAAAAAGTTATGGTTTGGTTTATCTGAGTAGAACAATTTTATAACTCAAATAATTCGATTGAGTCTAAAAAATGTCCGACGCTGACTAACCTAATTCACGAACCCCCAACAATAGAATAATTATTCGATTCATTTTAAATCAGTGTTATTGTGGAAAAAAAAAAGAGAATAAAACTCCAAATCATACCGAAAATCTATATATTTGAGAAAAATATTTTATATCATACCCTCTTCTATCATCACTTTATATATATTATAAATATTTTTATGTATATATTATAATTACTCACAAAAATAAGAAAAATTTTCAACAAGAAATTTTCGAAGAAATAAATGGAAATTTTTGCAAAAATGAAAATTAAAATAAGAGATAGAGATGAAGTTTGACATATCTGTATGTTCAAAAGATTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATATGAAATCCAAATAAGAATTTATTAAAATTTTAAAATTAATTTGGATCAAGAATCTAATAATAACTTATAATTCAAGCATAACAGTTGACTTGGACAAAATAATCTAAAAAAAAAAAAACATTAGCTAATTAATCAATGTCTGTCTTTGAATTAATTGTTTATTTATAAATTCATGTGGCATAATAAATGCTAAATACAGTTTCTTCTTAAAATATTAATTAAAATAAAAATATTATTTTGGTTCCTATTTATTTAAGTCTCTAATTTTGTATGAGAATGAGCTATATCGACTTTTAATTTTAAAATATGGAGTTTAAATTGCTTAAAAAAGTCACTCTAAAAATATAATAATAACTCATTTTTATTATTTTAATATTTGTGTAAAAATATTATTCATGTCATAATAAAATGATGGTATTGTCCCAATAAACTTGGTTTGAATAATAAAGAAAATTAATATTCAAATTAAAATATATAAAAAGTAAATAAATTGGGGGAAAAAAAAGCCTTAATTATAATAATTTATAAATTAAATTAAAATATAAATAGATGAAAATGTGAAAGATAAAATAAATTAATGAAAATTACTATTTTCCATTTGATTTTTAAATTTCTCTAATATATTTTAATGTTCGTATTTAATTAAGTCTTATAAATCTCTTTAATTATAAAATATGTTTAATATATAAATTATTCTAAAAAAGTACCATTGGGCCAACAATATTGGCCCAATTTATTTAGGCCCAAATAAAGCCCAAATCAGTTCGACGGTCCACTTTCACAAACCGAGACCACTGGTTCGGTTTATGGGTTTAGAAGAAAAAACCCGAAAAAAATCCGATAATTTTAATAATTAATTAGAAAATAAGAAAACAGGAAAGCTGGAGAAGCCAGAAGTTGGAGTGAAGCCCAAGCCATCAATAGCTATACTATAAACCAGTGCGTCCCTCGTTTCCCGCATTTCTTCTCTGCGATTCAACTCCCTCTTCTCTCAGGTTTGGATTTAATCTTTTCTTCAAAAGTTCAGTTCATTTTGTATCTGTGATTGTTTACGATTAGGGTTTTGGATTGGGATTGTGTTTATTTTAATTTTGATTTCGGTAAGAACATTTCCGATCGTCCTGGCTGACAATTCTTTTCCTTCCTTTTCTCATCTCACAAAGATTCTTATAATTTGATCGGCGAAAGCTTGAGTTTCGGACCTGATGTCGGTGCGTTTCTCTTCTTAACATTACCGCGTTTTTTTTTTTTTAATGGAAGTATTAGCTAGTGTTTAGTTCATGCATTTTAATGATGGAATATTATTGTAGATCTTTGA

mRNA sequence

ATGATTGGCCCTCCTTGTGAAGCATATAAGCCTTCGGATTTCATCATGTTCACTATCTTGGTGGTGAAGTTTTGCATGAAAGCTGGAGAAGCCAGAAGTTGGAGTGAAGCCCAAGCCATCAATAGCTATACTATAAACCAGTGCGTCCCTCGTTTCCCGCATTTCTTCTCTGCGATTCAACTCCCTCTTCTCTCAGATTCTTATAATTTGATCGGCGAAAGCTTGAGTTTCGGACCTGATGTCGATCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATTGGCCCTCCTTGTGAAGCATATAAGCCTTCGGATTTCATCATGTTCACTATCTTGGTGGTGAAGTTTTGCATGAAAGCTGGAGAAGCCAGAAGTTGGAGTGAAGCCCAAGCCATCAATAGCTATACTATAAACCAGTGCGTCCCTCGTTTCCCGCATTTCTTCTCTGCGATTCAACTCCCTCTTCTCTCAGATTCTTATAATTTGATCGGCGAAAGCTTGAGTTTCGGACCTGATGTCGATCTTTGA

Protein sequence

MIGPPCEAYKPSDFIMFTILVVKFCMKAGEARSWSEAQAINSYTINQCVPRFPHFFSAIQLPLLSDSYNLIGESLSFGPDVDL
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g125920 vs. NCBI nr
Match: KAG6578951.1 (hypothetical protein SDJN03_23399, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 177 bits (448), Expect = 5.99e-56
Identity = 83/83 (100.00%), Postives = 83/83 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MIGPPCEAYKPSDFIMFTILVVKFCMKAGEARSWSEAQAINSYTINQCVPRFPHFFSAIQ 60
          MIGPPCEAYKPSDFIMFTILVVKFCMKAGEARSWSEAQAINSYTINQCVPRFPHFFSAIQ
Sbjct: 1  MIGPPCEAYKPSDFIMFTILVVKFCMKAGEARSWSEAQAINSYTINQCVPRFPHFFSAIQ 60

Query: 61 LPLLSDSYNLIGESLSFGPDVDL 83
          LPLLSDSYNLIGESLSFGPDVDL
Sbjct: 61 LPLLSDSYNLIGESLSFGPDVDL 83

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g125920 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g125920 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6578951.15.99e-56100.00hypothetical protein SDJN03_23399, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g125920 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g125920 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g125920.m01Csor.00g125920.m01mRNA