Csor.00g076590 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g076590
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr01: 10991439 .. 10996628 (-)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g076590
SyntenyCsor.00g076590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGATTGCATGGATCTTGCTTCTTTTTCCGGATGTAGATTCTTCCAGGTTTGGATGGTTTCGTTCTTATAATTTACTATTTTAAGATCTGGAAGAATCGCTCATAGGAGCTAGTTCGTTATCGAAACTCGAAGGTTTGAATTCGCTTGAGCGGTCTGGATTTTATTGATCTTTGCGCGTGGTGTTGTTTGTGTTAATGCGTATTTAGAATAGTTAATTGATTTGTACGAGTATACTGGATTGCCTCGTTGAAGGTTTCTGTGTGTTTTTTACTGTTGATTTGGCGGAATCGGTTTTTGTTATAGCTTGATGATGTCTCTGTTCGGACTTCGGTGACGGTTTTTCTCGCCTGCTTTGATTTGAAAATTAAATGGTAATGGAAGGAACTAAAAGTGCTTTTTGTCAATGTGAACAAATCATGGTTTGTGCAGTGCGATTACTGTGGTCCTCGTTTGCGTCATTCACTTTCTTGATTCTCCTGTTATGCAATTGTTCTATGGATTCACAATGCGTTTCGAGTAAAATTCCATTAACAATGAATCACTTTGGTTATTTCTTGTTTTACTATATATATTTATATTTTTTTAATTTCTGTAATCCCTCCTGTTGCTTTTAGCATCTTCTTTATAGAAGTACTTCGCAGTCTGGCACCACACCGTCGTCGAATCTTTTAGTGCTCTTTTCCGACCGAGCTCAGAGGGTACTTTTTATTCTCTATATGTAGTAACTTTTTTTTTTTGGGCATCTTTCTCAAGATGCTTATCCACTATTATTCTAATTGCAAAGTTCGTAGTTACCTGTTACTCCCTGATGGCCATTTTAGTAAACCGTCGAGGCCATTTTCTTTTCAGAATGCTTTGACTTGGAATCTATCTGTTGATTGCACAGATTCCTAATTTCTGTTTACGCTTTTTATTCATCTTTTTCTTAGTCGTTGTTAACCTGTTTGCTCATCTTGGGAAGAGTAATTCATTATAACTCAGATTGTTATATGGAAAATATAAATTCTTTTTTTTTTCCTTTTTATCAATGAACTGGTTTGCTTGAATTTGTAGATTTTGTTTTTTCCGTCGGATTTTGTGCACAATCCTCCCCCTTGCATTTAGTATTGTAAGCTTTTCTAACAACCTTCTGAACTCGGCAATAAGAAATGGTGGAAACTGACCAAGGTAAATCAGCTTTTTTCCTCTGTTTACGGCATGTGAAGTTGTTATATTTGTTAACAAATTCTGTTCATTTCTTGGAAGGTTTTGGGTAATAATGGAACCAAATGGCTCTCTGTTGCAAAAGCTGTTATTTTGATTATGCTGTGGAATGCCACCCATGCCCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATTGTTATTACTTACACGCCTTTGGTCGGTCTTATTTCAGAAGTGAATATTAGAAAATAGCTGTAATGACATGTATAGATGAAAAGGAAATCTTATTAAAGTTTTGTTCTGTTTCCTCGAACCTATTAAAAGCTTAGTAAGAACTGAGCTGTTTGTTTTTCTTTACTTCATGTGAAAACAAACCTGAGTTGTTGAATTATTTTTTCGTATTTCTTCAAATTTGGCTACAAACCCTTTTCTGGAAGAAAACAAAAAGCGAAATAATTGGAGATATTCTCTTCTACAGTAGCCAACTATTGCACGAGCACACACGGTGTGGCTTGATCGAACACAGGACCATGGGTGTAGGCCTGGGCTTGGGCCCTTGGACGAGCTTTGTACAGATTGGAAGATGGGCCATGGCTCTTCGACGAGGTATGTACAGTTTGAATGCCACTGGTAAGGGATGTTTCGTTGGTTTAGTTTGGTTGCTTTTATTTTATTTTTATGAAATATTTGAAACCAATCCCTTAATATATTATGATTGAACTAAACGAGTTTGGTTCAACATTAGAAAGCCAAACAGAATCAAACCAGTGGCTAATTAAACCACTTTAATCGTATTCAATTCTTTTTTCTAACGACGTTAGCCTTGTTTGATTCCTTTTGGACATAAATTTAGTTTGGAGATCAATATCTTTGTTCATGTAGGCCCTCTTTTTTTCCCTACTCTTTCAGGGTCGATCAAATTTAAGATGAGTATTAATGCTTTTGTGTTTTGTTTGTATGGTTTAGGGACTAAAGTATTAGTATCTTACTTTAGTTGCACTCTTTTTTGTTTCATGCTTTGTGACCACACTTATTAAAAAAAGAAACTATATTTGGACCTAACTATTAGTAACTTGATTATTTTGAGATAGAAACAACGCTCGCATGGAGCTGCCATCCACACCATAATATATGAGGTTTTCTGGAAAAGCTTGCTAATGAAGGAAACCATCACTTTGACAAAACTTTGTATTGTTTTGTTAATTTATTGCTTGGTGGCAGAAGAAAATTGGCTTAATCAGAACCGATGTGTCGATTTAGAGATATTCATTTAACAAATCAGATCAAAGTCTCACTGAAGAAGGAGGTGAAGGTGAGAATTATGTTCTCTATCCCTATCTCGATCTCTCTATATATTCTCACTTCTCTATTGTTTTTTTTTTCCCTAAAAAAATATAGATAAATTATCGATAGATTTTATAAAAGCTCAACATTCACAGAAGGATATGGAAGGCATGTGGAGGAAAAAGTGGAAATGGGCAGCCCACTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTAGCATTAAAACAAATGGGTAATGAATGAATGAAAATGAAAAGCTTCTAAAAGCCAAGTCCTTTGATCATTCATCTTCACAATGCCATTGCCTTTTCTTCAATCATTTCTTTTTCTTTTATTCTTCATTGTGTTTGTTTTCTTTGGTTGAGAGGCCCTCAAACGGGATCGGACATATGTGAATCGCTATTAAAACGTTGACATTATCAAACTAGAATCAGTGGTGTTCATGGGTTCAATGTAAAATTTTAGTTAAATTAATAAAATTACTCATCTTGTATTTTGTTTCAAAAATGCACTTTTAAAAGTTTTAAATACTCTTACAAAAATGCACTTTTAAAAGTTTTCAGTACTCTTAAAACTTAAAAAACTTTAAATACTCTTACCATTAATTTTAGACGAAATTGTTAATATTTTGTTTAAAAAATATCTTAAAATTTAAAAACTTTAAATACTCTTACAATTAGCTTGAGACGAAACTTAGTAATATTTTGTTTAAAAAACATCTTAAAATTTAAAAACTTTCACTAATATCAAAATAATGTAAATGTTTAAATACATATTTTAAAGTATAAGCACCGGTGGAGTTAATCTAAAATTCAATGACCAATACAATAATTAAACTTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTATTTGTATATTTTTAGATGCATTATAAAAAAAAATTAAATAAATAAATTTGTGATTACATTATTAATTAAATCAATTAATAAATCAAACATTCCATCAATGGAAGGCAATAAATACATTACTTAATAAGCCTTGTTTAGACTTTTTATGATTGGTGATGGTCATTTTACCGTTCATTAATTTCATTCCAGTTTTTATTTTTAAAATTTAAATTTTTTTAAACTTTAATTTTCTTTATTCTTTCAATTCAGATTTCTAATAGGAATCAATGGCTTGTTTCGTAATTTCACAATCACATATCAAAAATAAATTTATTTCAGTTTGAACATCACATCTCCTTTAATTTGTATATCCCAAATTCATAATTAATTTGGAATTTCTTTTCCGTCCTTGTTTGATCTAATAATTAAATTATTAGTAAATTAGTTAATAAATTTTATTTAAGGATATTTTTTAAATTTAAAAAGTTTAAATAGTATTAATAAAAATTTTAAAAAATTAAGAGTGTTTTTGAAATTTTGAAATTTTAAGAATATTATTGAAAACTTTAAAATAATTTTATTTTTATAAAGTATTAATTTATAAATATTTAATTTTTTTTAAGAAATAAAAGGAATAAGAAACTGCCAAAAAAATTCCAATAAGCGGGCTCGGGGCGCGTAAATTATTTTTGCGGGCCCCACTTTAAATCCAACTAGACTTCCAAGTGCCACATACGAAGCGCGTGAATTACAAACGCGTAGCCCCACTTTGATTTGCCTCAATGGACGGCCAAGATGCAGTTTTGGCGCGTGACCTCACGTGCCTAAAACCGTACGTAACGTTCACGTCCATTCCACGCACTTCCTTTCTCTCTCTAAATAGTCACTCTTCTTCATCCTCTCCTTCTTAACCCTCTCTGTCTAAAACTCATCCGCCATTTTCACTGTTCCGAAGCTCTGTAATGGCAGTGCATTTCTTCGCTCAGGGCTCCGAGGAGCTTCTGGTGTCGTGGCTTTTGAGGTTGAGTTTGTAGTGATGCTCTGCTTCAGCTCCGCCGTGAAACGCCGCTGTGAAATCGGCCTTTCGGATTCAGGTTGCTTGGTTTCACTTTTGCATTTTATTTAAATTGCGCTAGATCCTAGAGCTGGTTGATTCGAGGATTTTTATCTCTGGTTTATCGCTTCTGTTTTCTGTAAGACTTCACGATTCACTAGGATTGTTTTGTTTTTTGTTTTCTACACTGCCTTGTTTGCGTGTCGCATTGTTCATGAATAGTTTGTCTTCAGCTATAGAAATCGGAGAGATATTGGTGAGGAAATGATGTTTGTGGTTTGTTTGAAGTTCTACGGTACTGTGAGTATATTGAAGTTCGTGATCTTTCTCGGCGCCCAAGCTTTGTGTGCGTGCCTTTTCCGGTTTAGCTCCTTAAGTTTCCTAAATGCAACTTTCGAGAACTGGTTTTTCAATTGTTTTTCTTTGAATCATGATGTTAAAGTCCATTTTCTACCAGTTTCTCTGGACCCAAAAGATTCATATAATCCTTTCCCCCCTTTTCCCTTTATCTTTCTTTTACTTTTTGATTCTATTGACTTTTTCGTTTCCCTGTTCTTATTATTTTAAAAGCAAACCAAATGCTAATCATGCTTATATAGCTGAAACACCAACGGAAGTTTAATGCAGGTTTGATTGAATTAAAACTTCTACGCTATTCTTCGTATATACATTTTTTCTTCAAAACGGTCATCTCGTTTCATGATTTCATCAAATTACTCTATCTGAAAGGACTAATTCTTGATGAATAATCATGTAGTGGGCGCGTGTTCGTCGATCTGTTTGTTACATTGTTTGCTGCAAGCCTCAAGTGATACTGATAGATTGTAA

mRNA sequence

ATGAAGATTGCATGGATCTTGCTTCTTTTTCCGGATGTAGATTCTTCCAGTAGCCAACTATTGCACGAGCACACACGGTGTGGCTTGATCGAACACAGGACCATGGGTGTAGGCCTGGGCTTGGGCCCTTGGACGAGCTTTGTACAGATTGGAAGATGGGCCATGGCTCTTCGACGAGGTATGTACAGTTTGAATGCCACTGGGCTCCGAGGAGCTTCTGGTGTCGTGGCTTTTGAGGTTGAGTTTGTAGTGATGCTCTGCTTCAGCTCCGCCGTGAAACGCCGCTGTGAAATCGGCCTTTCGGATTCAGTGGGCGCGTGTTCGTCGATCTGTTTGTTACATTGTTTGCTGCAAGCCTCAAGTGATACTGATAGATTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGATTGCATGGATCTTGCTTCTTTTTCCGGATGTAGATTCTTCCAGTAGCCAACTATTGCACGAGCACACACGGTGTGGCTTGATCGAACACAGGACCATGGGTGTAGGCCTGGGCTTGGGCCCTTGGACGAGCTTTGTACAGATTGGAAGATGGGCCATGGCTCTTCGACGAGGTATGTACAGTTTGAATGCCACTGGGCTCCGAGGAGCTTCTGGTGTCGTGGCTTTTGAGGTTGAGTTTGTAGTGATGCTCTGCTTCAGCTCCGCCGTGAAACGCCGCTGTGAAATCGGCCTTTCGGATTCAGTGGGCGCGTGTTCGTCGATCTGTTTGTTACATTGTTTGCTGCAAGCCTCAAGTGATACTGATAGATTGTAA

Protein sequence

MKIAWILLLFPDVDSSSSQLLHEHTRCGLIEHRTMGVGLGLGPWTSFVQIGRWAMALRRGMYSLNATGLRGASGVVAFEVEFVVMLCFSSAVKRRCEIGLSDSVGACSSICLLHCLLQASSDTDRL
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g076590 vs. NCBI nr
Match: KAG6608014.1 (hypothetical protein SDJN03_01356, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 258 bits (659), Expect = 9.01e-87
Identity = 126/126 (100.00%), Postives = 126/126 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKIAWILLLFPDVDSSSSQLLHEHTRCGLIEHRTMGVGLGLGPWTSFVQIGRWAMALRRG 60
           MKIAWILLLFPDVDSSSSQLLHEHTRCGLIEHRTMGVGLGLGPWTSFVQIGRWAMALRRG
Sbjct: 1   MKIAWILLLFPDVDSSSSQLLHEHTRCGLIEHRTMGVGLGLGPWTSFVQIGRWAMALRRG 60

Query: 61  MYSLNATGLRGASGVVAFEVEFVVMLCFSSAVKRRCEIGLSDSVGACSSICLLHCLLQAS 120
           MYSLNATGLRGASGVVAFEVEFVVMLCFSSAVKRRCEIGLSDSVGACSSICLLHCLLQAS
Sbjct: 61  MYSLNATGLRGASGVVAFEVEFVVMLCFSSAVKRRCEIGLSDSVGACSSICLLHCLLQAS 120

Query: 121 SDTDRL 126
           SDTDRL
Sbjct: 121 SDTDRL 126

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g076590 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6608014.19.01e-87100.00hypothetical protein SDJN03_01356, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g076590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g076590.m01Csor.00g076590.m01mRNA