Csor.00g071910 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGTGAAAGTGAACGGGCCTGGAAATGGCGATTGTTCGAGTCGGCTTGTGGATGGACCTACCAACCCCATGGTTACTCCTTTGCTAACCGATCTTTATCAGTTCACTATGGCTTATGCTTATTGGAAAGCCGGCAAGCAGAACGAGCGAGCTGTGTAAGTTCTTTCTTCTATGTTTACGCAATGCGTTTCTGCTGCTGAGAATTCGGAATTTATGCGAAAATGAAAATAGGTGGTTATGAAACCTTGTTTTGAATTGAAATTGTGTGTCTCTTTAACTTTTTTCCCAACTCTGATCCTTTTGGGTGATCAATCTTAGCAGTGAGTGCACGAAATTGATCTTTAACATTTCCCCCCCTATTTCGTTTGTTCACTAGTTCAGCTGTCGCTTTCGGTTTTCAAATTGCATGCAAGCTGCAACAGAGTTGGGGACTTGTAAAATTGAATTGAGGGATAACGCTTTTACTGTTTGAATTTTTCTTTATTTTCTGTATTAAGAACATTAGCAGTTCGATGGGAATTGTGAGGAGTGTTAGATTCTGACTTTTCATGTTTCCCTCTCAGTTTTGGTGCATGAGGACTTCTATTTTATTCTTTAGGTCTCATTTTGTTAGATTAGAGCTCCATTTGTTTTAGTTTGCCTCTTTTTGCTAGGCTTTCCTTTTGTATTCCCTTTGTATTGTTTCTTTCCTTTGCCTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGTCATACGGCGGTGAATTCGTATCCGGGCCTTGTACACACTGCCCGTCACACTATGAGAGCTGGCCATGCCCGAAGTCGTTACCTTAATCGCAAGGAGGGGATGCTTGATGAAAATATGGTTTCCAATTTAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGCGCGGTAATCAAATGATTCATTGAATCACTCATCCGCCAAGTTCATATGACCTTGAACGTTTGGCCTTGATTTTTTCTCCACTCTGTTGGTTTTGAGCTCTGTATTTATTTCCCATTTCTTGAAAACAAATGGTTATTCATATTCTCATATAAATTATTTATTAGCTCTCTTGGTGTCATGTCTTTGTGAAGAAACACCTCATTGCTTGTAGGTAATAGATTAGTCTGGGTTGGAAATTGTTGTTTCAAACTTCTGAAGTGGAACTATCTGTGTCAACTACTATGGTTAATCATCACTTCGAAATCATTTTTCTTAGTGAACAGAATGCTTTGCTTTGAATGGCCAACCTCAATCTTCTTGTGCTGCGAGGTTAAACAATTTTGATGGAAATTGTTATGACTTAGATGCTCTAGGTGATACACTAGTCTTGTTTGGAGGTTGTTATTCCTGACTTCTGAAGTGTCTTAGTTACGTTAATCTTGAAAAGCATGGTAAGCTTCAAAAACTATTCACAAAGCCCAACCTTCACTGGGATTTAAAATTAATATTGGCATTTAATTATTTGTTTGGACATGGGCTGCTTCTTACATTCTTTTCTAATAAACAGAACTAATTTCAGCTTTACTGGGATTATACATTTATTGCAATATCTAGAAGTTGGAAGTCTGCCTTTTCCAACCCGGTTGATTTTCCTGAGTAAACCAGAATTTTTCATTCTCATCAAAAGCTATATGGTCCCTTCAGCGCCTTATTAGTCATGTTTGGAAGTGTCTTTGAGGGAGAAAATATGCTTATTTTATTAGAATGTTTTTTTTTTTGTTGTTAAATTTTTGTGGTTCAGGTTTGATTTATATTTTCGGAAGAGTCCTTTTGGTGGTGAATATACAGTTTTTGCTGGTTTAGAAGAATGCATAAGACTTATAGCTAATTTCAAATTCACAGAGGAAGAAATATCTTTTATCAAGAAGTCTTTACCTTCATCGTGTGAGGTAACCCAATTTATTGATTTGTTTGGTTGGTGGACTTCGACTTGTACTTTATTTTACGTGGTAGACCACTTCATGTTTAAATTAATCAGATATTGCATTCTATAAGTATAGCTGCTTAAATAAATTAAAATGTAATTAAGATTGGCCACCTTTGTTCGACACAACATAGAAAGAAATGCACCATTACCTCTTAAGTCTTAATGATTATAAAGATAAGACATGCTAGATTTCATTTTTTAATCCCCAGAAATAGAAATACTAATTAAAAATTGGATGTACCTAAGAGGCTTAGGATTCAACATACATAATAAAGAATTCCAAAATTTAACTCTTTGGGTGAGTATAAAATGTAGAATCTTTGTAACAATAACATATTGTCTCTCTACTTTGCTAATCAGTTGGAATTCTATCTCGTGATCCACCTTTGGTCGGGTTTTCATTTCATTTATCAACGAAATCTCTGTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAAGAAAAAAATTAAAGAAAACTAAAAGTTAATTAGTTTGGATTATCTTCCTTCTATTATATAAAGCACACACTATAGTTACACTAACATATCAACCGCATTAGTTATATTTAGCATGCAATTATGATAATTTGGTGATGCTCAATAAGACTTCTTGCTTGTTGAATTAACTCTTATTGGTTATAAATATAATGCACTGATTATCTTAGAGGAGCTGATTGTTCTGATGCTGAAGAATTTTTATTGATCAAATCTAGGATGCATTCTACAAGTACCTTAGAGAAATCGACTGTTCTGATGTCGAAGTCTATGCTATTTCAGAGGGATCAGTTGTTTTCCCAAAGGTGCCCCTAGTAAGGGTCGAAGGGCCAGTTGCTGTAAGTATCAAATTTTGTTCTCTGATGAAATCGTTAACATTGGATTCGGAAACCTATTTTATTTCTTTGTATTCATCCAAAAATATCTTTATAACTGCATAAACAGGATATTCTTCATAAATTTATACTTGTACTTATTTTTATTTCAGGTGGTACAGTTACTAGAAACTCCATTTGTAAATCTTATCAATTATGCATCTTTAGTTGCTACAAATGCTGCTAGACATCGATTTGTTGCTGGAAAATCTAAACTTCTTCTCGAGTTTGGACTTCGGAGAGCTCAGGTTTCAATTTCTTTCATTCTTCCTTTCTTTTAAGTTTTGCATTTAGCTTATCCTCATCTAGAAGAAATCTTTACTTGGTTCTAGGGTCCTGATGGTGGAATTAGCGCCTCAAAGTATTGCTATCTTGGAGGGTTTGATGCAACAAGGTAACTTTTCATTTCTTCCTATATTCTTGCATTTGATATTTTTTCATATATTTTTCTTCCAGAGTACTAGTGAAGGAATGACCTTAATTTATGTCATTTCTAGCCTTAATGTAAGTAATATTTGTGTAATCTCATTACATAGGGGAATTAGTTAACCTCCCTATTTTCAATTAAGAATATAGAACAAGATAGTTTATACTTTTGGTATCAGAGCCTCTCTAGTCTTAGTCTAGAAACTCTGACAAAACCAAATCCTCATTCAACCGGTGAAGCCTTCATAGCTGTCGATCATCCACCGTGACCAAGTTTCATTCGGAGCCTTCATAGGCATCGATCATCCATTGTAACCAAATTTCATTTAGATTGTGAATATTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGCCAATTTCATTAGAAAAGTACATCCAGGATTTTGTTCAACAGGAAGTTTCAATCAGGATTTTGTTCATCCAGAAGATTTGACAGAGCCATAACCATGCCGATTTCACGATTTTCCGTAGCCGATTTGTAGAAGATTTCTTGGATTTTCTGTAGCCTTAATTTGGGATAAAGCTTCAGGATTTCAGGATTCGCAAGGTTCTCAGATCTTGCCCACGGACAGCAGCCCTCAGCCCACTTGCTTCTAAACAATTTCCCATTTGGCCGACTGGCCCATTTCAATCACGTGCTTGAATCCCACTTGGACAAAAGCTTCAATTATAGGAGAAACGATCTAGCTTTAATCATATTCACATACTAAGACCACTTGGTCCACTTGGACAACAACTTTCTTTGCTTTGCTTTGCTCCTTAAGAGATTCCAGACTAAGACCCATCGGTTTCATCTTTTTGCTTAAACCCTCATCATGTTAGAAGAATCAATTTTTCCATCACTAGTAGAGGAAGTTTTTATAGGCCAAAAGAAAGGTGATCTGGAACCCATTCAATTATCATATCGACTCAATGGAAAAAACTTTCCTTAAGGACTAGAGGGCAAGAATTTTTTGGGTTTTTAGGTGGGTCAGGATAGGGAGCTATGGTCTCATTTGCAACTCATAGATGTTACTATTTCCTCCCTTGAAACCATGTTAGGTCTCAATATTAACCAGGAAAATAAATTGTGATCTTGGCCAGGTGGGAAGGTGGGTTGTGAAACAGGCTTTTTCCTTCCATCCATCTCCTTTTGAAGACCCTTTGTGTAAACTTTCATTTGTTCACTGTTGAGTGGTATTCCTATCTATTTTTTCCTCTTTAGGGATTTTTGTTCTACTTTTAAATCCTTATAAAAGCTTATGAGAGATTTTTTGTGGGAAGGGATCGATGAAGGGAGGCATGCACATTTGGTGATTTGGGATATTATGGAGAAGTCGGTGAATCTTGGGGGTGCTAGAGTTAGAAAATTTAAGGACCCTTAATAAAGCCCCATAGGCTAAATGGCTTTGGTGGTTCTTTGTTGATTCTAATGCCTTTACCATTAGATTATTGAGTAAATATGGTCTCCATCATGTTTTCCTCTTAGACATAATATAAAAGCCATCTCCTTTTGAGACTCTGTTGTGTGGTGACATTCATTCGTTTAGTGGTGAGTATTCCTATCTATTTCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTTGAGGGCTTTTTGTTCTACTTTTAAGTCATTAGAGAAGCATATGAGAGGTTTTATGTGTGAAGGGGTCGACGAGGGGAGGAGTGCGCATTTGGTGATTTGGGATTTTATGGAGAAGTCAGTGAATCTTGGGGTGCCAGAGTTAGAGAATTTA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ATGGAGGTGAAAGTGAACGGGCCTGGAAATGGCGATTGTTCGAGTCGGCTTGTGGATGGACCTACCAACCCCATGGTTACTCCTTTGCTAACCGATCTTTATCAGTTCACTATGGCTTATGCTTATTGGAAAGCCGGCAAGCAGAACGAGCGAGCTGTGTTTGATTTATATTTTCGGAAGAGTCCTTTTGGTGGTGAATATACAGTTTTTGCTGGTTTAGAAGAATGCATAAGACTTATAGCTAATTTCAAATTCACAGAGGAAGAAATATCTTTTATCAAGAAGTCTTTACCTTCATCGTGTGAGGATGCATTCTACAAGTACCTTAGAGAAATCGACTGTTCTGATGTCGAAGTCTATGCTATTTCAGAGGGATCAGTTGTTTTCCCAAAGGTGCCCCTAGTAAGGGTCGAAGGGCCAGTTGCTGTGGTACAGTTACTAGAAACTCCATTTGTAAATCTTATCAATTATGCATCTTTAGTTGCTACAAATGCTGCTAGACATCGATTTGTTGCTGGAAAATCTAAACTTCTTCTCGAGTTTGGACTTCGGAGAGCTCAGGGTCCTGATGGTGGAATTAGCGCCTCAAAGTATTGCTATCTTGGAGGGTTTGATGCAACAAGCAACGTTGCAGCTGGGAGGTTATTTGGGATACCACTTCGTGGGACACATTCCCATGCATTTGTTAGCTCATATATGAGCCCAGATGAGATCAAAGATAAGTCACTTCGTAGCAGTGATGGCTCACGCACCTGTGAAGATTTTCTTAGTGCAGCTCAAATGTGGTTAAACAAGATTCAGTGGTTGCCTTCCTTACATGGCATTTTTGGTGAGACCAACCAAAGTGAGCTGGCTGCGTTCACGTCTTATGCTTTGGCATTTCCATCCGACTTCCTTGCTCTTGTGGATACATATGATGTTATACGGAGTGGAATCCCTAATTTCTGTGCAGTTGCTATGGCACTCCATGATTTGGGGTACCAAGCTAAAGGGATTAGGTTGGACTCTGGTGATTTAGCATATTTGTCACGTGAGGCACGAAAATTTTTCATGACTATTGAAAAGGAGTTTGGGGTGCCTGGATTTCAAAATATAAATATTACTGCCAGTAATGACCTCAATGAGGAAACTTTAGATGCTTTAAACAAGCAGGGTCATGAGGTTGATGCATTTGGAATTGGAACCTATCTGGTTACATGTTTTACTCAGGCTGCTTTAGGATGTGTCTTCAAGCTAGTTGAAATAAATAATCAGCCCCGCATTAAACTTTCTGAAGACGTTTCAAAGGTCTCAATCCCATGCAAAAAGCGTACTTTTAGATTATATGGGAAAGAAGGCTATCCTCTGGTAGACATAATGACAGGCGAGAATGAACCGCCTCCTCAGGTGGGCGAAAGAATTCTCTGCCGTCACCCATTTAATGAATCGAAAAGAGCATATGTGGTGCCACAGCAAGTAGAGGAGCTTCTCAAGTGCTACTGGAGTGGAAAATCAGGTAAAACAGCAGAATGTTTACCAGCTCTGAAGGACATACGGAGTCGTTGCATTAAACAACTCGAGAACATGCGTCGTGATCACATGAGAAAACTTAATCCAACTCCATACAAAGTTAGCGTGAGTGCGAAACTGTACGACTTCATTCATTTCTTGTGGCTAAATGAGGCGCCTGTTGGGGAGTTGCAATAA MEVKVNGPGNGDCSSRLVDGPTNPMVTPLLTDLYQFTMAYAYWKAGKQNERAVFDLYFRKSPFGGEYTVFAGLEECIRLIANFKFTEEEISFIKKSLPSSCEDAFYKYLREIDCSDVEVYAISEGSVVFPKVPLVRVEGPVAVVQLLETPFVNLINYASLVATNAARHRFVAGKSKLLLEFGLRRAQGPDGGISASKYCYLGGFDATSNVAAGRLFGIPLRGTHSHAFVSSYMSPDEIKDKSLRSSDGSRTCEDFLSAAQMWLNKIQWLPSLHGIFGETNQSELAAFTSYALAFPSDFLALVDTYDVIRSGIPNFCAVAMALHDLGYQAKGIRLDSGDLAYLSREARKFFMTIEKEFGVPGFQNINITASNDLNEETLDALNKQGHEVDAFGIGTYLVTCFTQAALGCVFKLVEINNQPRIKLSEDVSKVSIPCKKRTFRLYGKEGYPLVDIMTGENEPPPQVGERILCRHPFNESKRAYVVPQQVEELLKCYWSGKSGKTAECLPALKDIRSRCIKQLENMRRDHMRKLNPTPYKVSVSAKLYDFIHFLWLNEAPVGELQ Homology
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84WV8 (Nicotinate phosphoribosyltransferase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAPRT2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 948.7 bits (2451), Expect = 2.9e-275 Identity = 457/561 (81.46%), Postives = 504/561 (89.84%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWM2 (Nicotinate phosphoribosyltransferase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAPRT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 926.4 bits (2393), Expect = 1.5e-268 Identity = 452/560 (80.71%), Postives = 500/560 (89.29%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VQX4 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Naprt PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 634.4 bits (1635), Expect = 1.2e-180 Identity = 305/538 (56.69%), Postives = 401/538 (74.54%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55G10 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=naprt PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 612.5 bits (1578), Expect = 4.9e-174 Identity = 297/548 (54.20%), Postives = 395/548 (72.08%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q95XX1 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=nprt-1 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 607.8 bits (1566), Expect = 1.2e-172 Identity = 296/558 (53.05%), Postives = 406/558 (72.76%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. NCBI nr
Match: KAG6605206.1 (Nicotinate phosphoribosyltransferase 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7035184.1 Nicotinate phosphoribosyltransferase 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1137 bits (2940), Expect = 0.0 Identity = 561/561 (100.00%), Postives = 561/561 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. NCBI nr
Match: XP_022947790.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1134 bits (2933), Expect = 0.0 Identity = 560/561 (99.82%), Postives = 560/561 (99.82%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. NCBI nr
Match: XP_023007036.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Cucurbita maxima] >XP_023007038.1 nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1132 bits (2928), Expect = 0.0 Identity = 558/561 (99.47%), Postives = 559/561 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. NCBI nr
Match: XP_023533693.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023533694.1 nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1131 bits (2925), Expect = 0.0 Identity = 557/561 (99.29%), Postives = 559/561 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. NCBI nr
Match: XP_038901526.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1062 bits (2746), Expect = 0.0 Identity = 519/558 (93.01%), Postives = 537/558 (96.24%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G7W1 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451548 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1134 bits (2933), Expect = 0.0 Identity = 560/561 (99.82%), Postives = 560/561 (99.82%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZF2 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499647 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132 bits (2928), Expect = 0.0 Identity = 558/561 (99.47%), Postives = 559/561 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TUG1 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold243G002970 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1056 bits (2732), Expect = 0.0 Identity = 519/561 (92.51%), Postives = 536/561 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5U4 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497376 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1056 bits (2732), Expect = 0.0 Identity = 519/561 (92.51%), Postives = 536/561 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LJM4 (Nicotinate phosphoribosyltransferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G279170 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1052 bits (2721), Expect = 0.0 Identity = 516/561 (91.98%), Postives = 535/561 (95.37%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. TAIR 10
Match: AT2G23420.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 948.7 bits (2451), Expect = 2.1e-276 Identity = 457/561 (81.46%), Postives = 504/561 (89.84%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g071910 vs. TAIR 10
Match: AT4G36940.1 (nicotinate phosphoribosyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 926.4 bits (2393), Expect = 1.1e-269 Identity = 452/560 (80.71%), Postives = 500/560 (89.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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