Csor.00g050960 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g050960
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr12: 3578382 .. 3581765 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g050960
SyntenyCsor.00g050960
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACCAGATTTCGGAAAGCCATGGCCGTGTGGGTTACGATCATACCCCAAATTTTGTTGGCGACAGGACCGCCTGCGGTGTGGATTCAGGATTTTATCACAAATTTTCCCTCTTCTCTCTTCTGGCCTTCAAAATATTTCTCATCAATCCTTATAATAAGGTTTGAAATGGTTTAAATATATAGTTTTCGTTGTGTACCATTTCAACCAAGTTCCTAATTTTATTTTTCTTATCCAGATTTTTACAAGAAAATAATTGTGAGTGCTCAAATTCAAATGAGATTTGTGATGTGTTGCTACAAAATTCAAATATTTGTATCGGTTTTATCATGCGTCATAGAAAGGATTGAGTTTCCTCTTGAACTCATAAAAAGAGCGATATAGCGGTTGAGCTCTGATCCGTGGAGAGAGTCAAGAAAGTTCTTTATTCAAATTTACAAGAGGCATATGTGAGTGGAGTAACATAACCACGGTGTCATATTTCCTAATTCTTCTTATTTAATTTCAAAATTATTACAGTGATTTAGTGCATATTTATTGTTTTCACTTGATCTAATTTGGTTGTATTAATTATTATTAGTATCATAATTAGAAAAATTAAGCACGTTTAAATACTTTTATTGTTAAAACCCTATTCACCCCTGACATACCGATCCAACAATATTAACGTCACAAGTGTCGAGGAGTCATACAATGAAATTGTGAGATAAAGAATAATCTTGTAAGAAGGAAGGGAAGACAATGGAATTGTGAACCAAGATTACGAGGCAAACGAGAGAAGTAAAACCAAGAGGGAAAGGAACGAATAAAGTAGTGAGATAAATCATATTCTCGTTACAAAACTTGTGTCACGCTATATCGCTTAACCGAACAAGATATTCCTTTAAAACCTAAACTTTTGACCAAGTCACATCATAGTCCCATTGTGATATCTGACCGTCCGTCCCATCTAAAGATCTAAGCGAGTCTTGCCCATTTAAGGAATATGGTTGGTCTCGAATACTAGCGATCGACAATCTTTTCTTTCCTCTCTCTTATAACCTCGGTAAGCTGCTTATCTTATTAGGTGTAAAGTAAAACTTATATGAAGGGATTTGTTACCTAGGGTAAAATTAAATTAAAAACACAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAATTTTTACTTTTTCAAAATTTATATTCAATTTTCTCATTAAAAAAAATTATTAAGAAGACTTTCATTTTCTAATCATTATATTTATGTCACATCACATGAAATAATATATAGTTTATTATTAAATTAATTGATTGAGTTGACTAATGAACAAATCATTATCTTTTGTAAAAGCAAACAAGATTACCCATTTCTAATTTTATATTTAATGGATATTTATTTTATTTATTGTGATCTTATCTTTAATTTTTTTATTATTATAAAAATACATAAATGTGACGGAAGCTAACAAATAAAATAAGGTTTTACGTTTATATTAAAATAAAAAATTTACATATATAACTCCGAACACTCGTATTTACCAGAAATTTTTAAATTAAAAATTTAAATTCGGTTGACTATAAAAATAGAGTTCGAAAATTATTTTAAATCTAGTTATTTATTTTTAAAAATAAAAAATATATATTTTTCAGGATCAATTTAAATATCAAACTTTTATCAGCCACAAGTCATCATTAATATCGGTTACAAATGTTAAATATTCTTGAATTTTGTAACCTTATTTTCAAGTCAACCACGAACTCTATTTACTTTTGGTTTCCTCAAAATATCTCGTAATAATCGAGATATTATTTATTCCTTACTAAACTCATGATTTTTCTATTAATTAATTAATTACTGTTTTGATTTATATAATTATTAATTTTAATATTTACGAGTATAAATTGATTTTACTCTTTGAAAAATTAGAAAAACAAAAAATAGACCGTTTTTGTAATTTTGAAAATATTTATTAAAAGGTGAGGAGTGAGACAAGTAATATACATGTCGAGTTTAATGTCTTTTTTATATGGAAGACAAGTAATCTCTCAAGATTTTCACATGACTCGATAGCCCAAACTATTCAACCAAACCAAGGTCGGATTGGGTTAGTTTTTTTTCTTCTTTTAAGTCGAGATTAGGTTTGTTGGATTATGAAAGTCCCATGTCGCTAATTGGAATGATCATGCATTTATAATGAAAGAATACTCTCTTCATTGATACGAGACATTTTGGGAAGCCCAAAACAAAGCCACGACAGCTTATGCTCAAAGTGGACCATATCATACCACGGACATTTCTATTTGTCTAACATGGTTGAATTTGTTGGAAAAAAAAAAAAAAAATCAGATCAATTTGCGAGCTGATATTTTTTTTTTGGTCAGGTCAACCCAACAATACTAAAATCTAACCCAACCTTATCCTACTTTCAAATTATTATGTAAATTAAGAATTTTTCAAAGTTTGTAATTGATGCTAGCCATCCAAAAAGGATTAGGTTGAGAACTCTCAGCTTATGGGTCACCGATATAACCAATTGAAGCCTCGGATTAATCTAAAAGATTTTTTCAATCGAGATCGTGTGTACCCTCGTAACATATATATATATATATATATATCTATATTTATGATTTGTTTATGGGCGGGAATAAATTTTGAGCAATAAATATAGGTAGACTTGTTCATCCATTGGTAGCCAGTGATTGGAAGAGGAACAGCATTGTAATTAACAAAAGAGCCTTTTTGATTTGATTGGAGCGTTAGAACAGAAGGATTTGAGAACAACATCATCATCATTATCATGGATTGGTAGGTTTTCATCCACTCGACACGTGTTCTATTCGTTCATCTTGAAAAAAGTTAGTATTTCTTACAATTTTTTTCAATTTTTTTTCATCGTATTTGTGTACTTCTCTGCAGCCTTTCCAATTTTTTTTTTAATCTTTTTCTTTTCTGGGTCTTCTAATTTCCTCTTTGTTTAAGTGGTAAGCAACCCTTCATTTCTCGTTTCTTCATTTTGATTCCCTTCTTCTCTCTCTACTCTCTCTCTACCCCCCTTTTTAATCTCTCTGGATTTGCGATGTTGAAGAGGAGAAAAAGAAGGCATTAGCCGGATTGAAGTAGCGAGACAGCGACAGGTTAGATAATGAACTCTTTCTTCAACCTTGTTCTTCGTTTAATCTTTTTTGTTTGAATTTCATACTAGAGGTCACGATGGATTGCCTCTGATTTGGGGAAACTCTGCCAATTTTGTTAAAAGGGTTTCTATCTTTTCTAGGGTTTTCCTCTGATTCTTGAGATTTCGTCTTTCTGGGCTGTTTCTCGTGATTTTTTTTACCCTTTTTCTATGTCTTTCTTGTGCTTACAGATAAAGTTTTTTCTGATTGATACCTGTTTGGGGTTGAACGGATAG

mRNA sequence

ATGACCAGATTTCGGAAAGCCATGGCCGTGTGGGTTACGATCATACCCCAAATTTTGTTGGCGACAGGACCGCCTGCGGTGTGGATTCAGGATTTTATCACAAATTTTCCCTCTTCTCTCTTCTGGCCTTCAAAATATTTCTCATCAATCCTTATAATAAGAGGAGAAAAAGAAGGCATTAGCCGGATTGAAGTAGCGAGACAGCGACAGATAAAGTTTTTTCTGATTGATACCTGTTTGGGGTTGAACGGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGACCAGATTTCGGAAAGCCATGGCCGTGTGGGTTACGATCATACCCCAAATTTTGTTGGCGACAGGACCGCCTGCGGTGTGGATTCAGGATTTTATCACAAATTTTCCCTCTTCTCTCTTCTGGCCTTCAAAATATTTCTCATCAATCCTTATAATAAGAGGAGAAAAAGAAGGCATTAGCCGGATTGAAGTAGCGAGACAGCGACAGATAAAGTTTTTTCTGATTGATACCTGTTTGGGGTTGAACGGATAG

Protein sequence

MTRFRKAMAVWVTIIPQILLATGPPAVWIQDFITNFPSSLFWPSKYFSSILIIRGEKEGISRIEVARQRQIKFFLIDTCLGLNG
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g050960 vs. NCBI nr
Match: KAG6585756.1 (hypothetical protein SDJN03_18489, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 174 bits (440), Expect = 1.07e-54
Identity = 84/84 (100.00%), Postives = 84/84 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTRFRKAMAVWVTIIPQILLATGPPAVWIQDFITNFPSSLFWPSKYFSSILIIRGEKEGI 60
          MTRFRKAMAVWVTIIPQILLATGPPAVWIQDFITNFPSSLFWPSKYFSSILIIRGEKEGI
Sbjct: 1  MTRFRKAMAVWVTIIPQILLATGPPAVWIQDFITNFPSSLFWPSKYFSSILIIRGEKEGI 60

Query: 61 SRIEVARQRQIKFFLIDTCLGLNG 84
          SRIEVARQRQIKFFLIDTCLGLNG
Sbjct: 61 SRIEVARQRQIKFFLIDTCLGLNG 84

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g050960 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g050960 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6585756.11.07e-54100.00hypothetical protein SDJN03_18489, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g050960 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g050960 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g050960.m01Csor.00g050960.m01mRNA