Csor.00g035830 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview


Name	Csor.00g035830
Type	gene
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
Description	Extensin
Location	Csor_Chr09: 6247413 .. 6248414 (+)
RNA-Seq Expression	Csor.00g035830
Synteny	Csor.00g035830

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSsinglestart_codonpolypeptidestop_codon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCGTCTTCAATGGCATCCTTAGTTATTGCTATCTTAGTTGTTGCTCTAAGCGTGCCATCGTCAATTGCTAGAGGGTATCGTTACGATCCTTGGCTACCACCTCCGACATATAAGTGGCGGCCAATTTATCGCTCTCCTCCATCACCTGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCGGTGTATCATTCTCCTCCGCCACCTGTGTATTATTCTCCTCCACCTCCTGTCTACAAATCTCCTCCACCACCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACTGGTGTACCATTCTCCTCCACCTCCCATCTACAAATCTCCTCCTCCACCTGTCTACCCCTCTCCACCACCACCGGTCTACAAATCTCCTCCACCGCCAGTTTACCCCTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTATTATTCTCCTCCACCACCCGTCTATTCCTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAATCTCCTCCGCCACCGGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCCCCGCCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCAGTCTACTATTCTCCTCCACCACCAATCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCTCCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTATATCATTCTCCTCCGCCACCAGTCTATCATTCTCCTCCTCCACCAGTCTATTCGTCTCCTCCACCTCCGGTCTACAAATCTCCTCCACCACCTACATACTATTAG

mRNA sequence

ATGGCGTCTTCAATGGCATCCTTAGTTATTGCTATCTTAGTTGTTGCTCTAAGCGTGCCATCGTCAATTGCTAGAGGGTATCGTTACGATCCTTGGCTACCACCTCCGACATATAAGTGGCGGCCAATTTATCGCTCTCCTCCATCACCTGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCGGTGTATCATTCTCCTCCGCCACCTGTGTATTATTCTCCTCCACCTCCTGTCTACAAATCTCCTCCACCACCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACTGGTGTACCATTCTCCTCCACCTCCCATCTACAAATCTCCTCCTCCACCTGTCTACCCCTCTCCACCACCACCGGTCTACAAATCTCCTCCACCGCCAGTTTACCCCTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTATTATTCTCCTCCACCACCCGTCTATTCCTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAATCTCCTCCGCCACCGGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCCCCGCCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCAGTCTACTATTCTCCTCCACCACCAATCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCTCCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTATATCATTCTCCTCCGCCACCAGTCTATCATTCTCCTCCTCCACCAGTCTATTCGTCTCCTCCACCTCCGGTCTACAAATCTCCTCCACCACCTACATACTATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTCTTCAATGGCATCCTTAGTTATTGCTATCTTAGTTGTTGCTCTAAGCGTGCCATCGTCAATTGCTAGAGGGTATCGTTACGATCCTTGGCTACCACCTCCGACATATAAGTGGCGGCCAATTTATCGCTCTCCTCCATCACCTGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCGGTGTATCATTCTCCTCCGCCACCTGTGTATTATTCTCCTCCACCTCCTGTCTACAAATCTCCTCCACCACCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACTGGTGTACCATTCTCCTCCACCTCCCATCTACAAATCTCCTCCTCCACCTGTCTACCCCTCTCCACCACCACCGGTCTACAAATCTCCTCCACCGCCAGTTTACCCCTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTATTATTCTCCTCCACCACCCGTCTATTCCTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAATCTCCTCCGCCACCGGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCCCCGCCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTACCATTCTCCTCCACCACCAGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTGTACAAGTCTCCTCCGCCACCAGTCTACTATTCTCCTCCACCACCAATCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTGTACAAGTCTCCCCCACCACCAGTCTACTATTCTCCTCCGCCTCCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCTGTTTACAAGTCTCCTCCGCCACCGGTCTATCACTCTCCTCCACCTCCCGTATATCATTCTCCTCCGCCACCAGTCTATCATTCTCCTCCTCCACCAGTCTATTCGTCTCCTCCACCTCCGGTCTACAAATCTCCTCCACCACCTACATACTATTAG

Protein sequence

MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY

Homology

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 300.1 bits (767), Expect = 3.2e-80
Identity = 234/344 (68.02%), Postives = 256/344 (74.42%), Query Frame = 0


Query: 5   MASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPT--YKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVYHS 64
           MAS +  +L  +L+  S     Y Y    PPP   Y   P+Y+SPP PV +  PPPVY S
Sbjct: 1   MASFL--VLAFSLAFVSQTTANYFYSS-PPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKS 60

Query: 65  PPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPP 124
           PPPPV +  PPPVYKSPPPPV YYSPPP VY SPPPP+YKSPPPPV    PPPVYKSPPP
Sbjct: 61  PPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPP-VYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPP 120

Query: 125 PVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYY 184
           PV    PPPVYKSPPPPV +  PPPVY SPPPPV    PPPVY SPPPPV    PPPVY 
Sbjct: 121 PVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYK 180

Query: 185 SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSP--------PP 244
           SPPPPV H  PPPVYKSPPPPV +  PPPVYKSPPPPV H  PPPVY SP        PP
Sbjct: 181 SPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPP 240

Query: 245 PVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYH 304
           PVYKSPPPPV+YSPPP +YHSPPPPV+ SPPP VY+SPPPPV++SPPP VY SPPPPV++
Sbjct: 241 PVYKSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPVHY 300

Query: 305 SPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPP----VYKSPPPPTYY 334
           SPPP VYHSPPPPV++SPPP VY SPPPP     YKSPPPP +Y
Sbjct: 301 SPPPVVYHSPPPPVHYSPPPVVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHY 340

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 1.5e-74
Identity = 254/399 (63.66%), Postives = 267/399 (66.92%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALS---VPSSIARGYRYDPWLPPPT---------YKWRPIYRSPP 60
           M S MASLV  +LV+ +S   V  S A  +   P  PPP          Y   P+Y SPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSP--PPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPP 60

Query: 61  SP----VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP----VYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP- 120
            P     Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPP    VYKSPPPPV +YSPPP VYHSPPPP 
Sbjct: 61  PPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPP-VYHSPPPPK 120

Query: 121 ---IYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPP----VYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP----V 180
              +YKSPPPPV    PPPVY SPPPP    VY SPPPPV    PPPVY+SPPPP    V
Sbjct: 121 KHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 180

Query: 181 YSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYKSP 240
           Y SPPPPV    PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSP
Sbjct: 181 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 240

Query: 241 --------PPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPV 300
                   PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV
Sbjct: 241 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 300

Query: 301 YYSPPPPIYHSPPPP----VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYHSP 331
            +  PPP+YHSPPPP    VYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H  
Sbjct: 301 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 8.5e-49
Identity = 214/340 (62.94%), Postives = 225/340 (66.18%), Query Frame = 0


Query: 34  PPPTYKWRP--IYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YYSPPPP-VYKSPPPPVYYSPPP 93
           PPP Y   P   Y+SPP P  YS PPP Y+SP P V Y SPPPP VY SPPPP YYSP P
Sbjct: 281 PPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPP-YYSPSP 340

Query: 94  LV-YHSPPPP-IYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPP-VYPSPPPPV--------YKSPPPP 153
            V Y SPPPP +Y SPPPP Y   P   YKSPPPP VY SPPPP         YKSPPPP
Sbjct: 341 KVDYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPP 400

Query: 154 -VYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPP--------VYKSPPPPVYYSPPPPVY 213
            VY SPPPP YS  P   YKSPPPP VY SPPPP         YKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 401 YVYSSPPPPTYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPY 460

Query: 214 HSPPPPV-YKSPPPP-VYHSPPPP--------VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YK 273
           +SP P V YKSPPPP VY SPPPP         YKSPPPP  +S PPP Y+SP P V YK
Sbjct: 461 YSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYK 520

Query: 274 SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPV-YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YKSPPPP-VYHS 333
           SPPPP  YS PPP Y+SP P V YKSPPPP  YS PPP Y+SP P V YKSPPPP VY+S
Sbjct: 521 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYNS 580

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 1.9e-40
Identity = 195/338 (57.69%), Postives = 212/338 (62.72%), Query Frame = 0


Query: 34  PPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVYH----SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPP 93
           P P +   P   SPP P   SPPPPVY      PPPP  YSPPPP    PPPPVY  PPP
Sbjct: 413 PAPIFSTPPTLTSPPPP---SPPPPVYSPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYSPPPP 472

Query: 94  LVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYS 153
                PPPP+Y SPPPP  P PPPPVY SPPPP  P PPPPVY  PPPPVY SPPPP   
Sbjct: 473 PPPPPPPPPVY-SPPPPSPPPPPPPVY-SPPPPPPPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSP 532

Query: 154 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP-PVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP 213
           +P P     PPPP  HSPPPP +  PPP P YYS PPP + SPPP    SPPPP  HSPP
Sbjct: 533 APTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYSSPPPPHSSPPP---HSPPPP--HSPP 592

Query: 214 PPVYK--SPPP---PVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP---VYYSPPPP---IYHS--P 273
           PP+Y   SPPP   PV   PP PVY  PPPP    PPPP   + YSPPPP   +++S  P
Sbjct: 593 PPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTPVYSPPPPPPCIEPPPPPPCIEYSPPPPPPVVHYSSPP 652

Query: 274 PPPVYKS--PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPV--YHSPPP-PVYHSPPPP---- 332
           PPPVY S  PPPPVYYS PPP    PPP  Y SPPPP   YHSPPP PV++S PPP    
Sbjct: 653 PPPVYYSSPPPPPVYYSSPPP----PPPVHYSSPPPPEVHYHSPPPSPVHYSSPPPPPSA 712

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P13983 (Extensin OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=HRGPNT3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 149.8 bits (377), Expect = 5.4e-35
Identity = 178/320 (55.62%), Postives = 187/320 (58.44%), Query Frame = 0


Query: 35  PPTYKWRPIYRSPPS------PVYYSPPPPVY-HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSP 94
           PPT++  P+   PPS      P  YSPPPP Y  SP P   YSPPPP Y  PPP   YSP
Sbjct: 241 PPTHQPSPLRHLPPSPRRQPQPPTYSPPPPAYAQSPQPSPTYSPPPPTYSPPPPSPIYSP 300

Query: 95  PPLVYHSPPPPIYK---SPPPPVYPSPPPPVYKSPPP--------PVYPSPPPPVYKSPP 154
           PP  Y   PPP      SPPPP Y   PPP Y  PPP        P+Y SPPPPVY SPP
Sbjct: 301 PPPAYSPSPPPTPTPTFSPPPPAY--SPPPTYSPPPPTYLPLPSSPIY-SPPPPVY-SPP 360

Query: 155 PPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPP---PPVYHSPPP 214
           PP  YSPPPP Y  PPPP   SPPPP +  PPP   +SPPPP  YSPP   PP Y SPPP
Sbjct: 361 PPPSYSPPPPTYLPPPPP--SSPPPPSFSPPPPTYEQSPPPPPAYSPPLPAPPTY-SPPP 420

Query: 215 PVYKSPPPPVYHSPPP-PVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIY 274
           P Y SPPPP Y  PPP P   SPPPP Y  PPPP Y SPPPP Y  PPP     PPPP  
Sbjct: 421 PTY-SPPPPTYAQPPPLPPTYSPPPPAYSPPPPPTY-SPPPPTYSPPPPAYAQPPPPPPT 480

Query: 275 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH-SPPPPVYHSP 331
           +SPPPP Y  PPP   YSPPPP    P PP +  PPP   H PPPP     PP P Y  P
Sbjct: 481 YSPPPPAYSPPPPSPIYSPPPPQV-QPLPPTFSPPPPRRIHLPPPPHRQPRPPTPTYGQP 540

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr
Match: KAG6592189.1 (hypothetical protein SDJN03_14535, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 563 bits (1450), Expect = 1.68e-200
Identity = 333/333 (100.00%), Postives = 333/333 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60
           MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY
Sbjct: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPP 120
           HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPP
Sbjct: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPP 120

Query: 121 PPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 180
           PPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY
Sbjct: 121 PPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 180

Query: 181 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 240
           YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP
Sbjct: 181 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 240

Query: 241 PPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 300
           PPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
Sbjct: 241 PPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY 333
           HSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY
Sbjct: 301 HSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY 333

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr
Match: XP_022936376.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 478 bits (1230), Expect = 8.76e-162
Identity = 308/357 (86.27%), Postives = 317/357 (88.80%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60
           MASS+ASLVIAILVVALSVPSSIAR YRY PWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY
Sbjct: 1   MASSVASLVIAILVVALSVPSSIAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVY--------PSPP 120
           HSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPP VY+SPPPPIYKSPPPPVY         SPP
Sbjct: 61  HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYNSPPPPIYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPP 120

Query: 121 PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY-------- 180
           PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY        
Sbjct: 121 PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVY 180

Query: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP 240
           HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP+YKSPPPPVY+SPP
Sbjct: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPMYKSPPPPVYYSPP 240

Query: 241 PPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP--------VYKSPPPPVYYSPPPPVY 300
           PPVYHSPPPPVY SPPPPVY+SPPPP+Y SPPPP        VYKSPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 241 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPYYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY 333
           +SPPP VY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY SPPPP YY
Sbjct: 301 YSPPPVVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYY 357

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr
Match: XP_022976649.1 (extensin-3-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 473 bits (1217), Expect = 2.38e-159
Identity = 299/332 (90.06%), Postives = 306/332 (92.17%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60
           MASSMASLVIA+LVVALSV  S+AR YRY PWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY
Sbjct: 1   MASSMASLVIAVLVVALSVSPSMAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPP 120
           HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPP VYHSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPP
Sbjct: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPP 120

Query: 121 PPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 180
           PPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVY
Sbjct: 121 PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY 180

Query: 181 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 240
            SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPP
Sbjct: 181 LSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPP 240

Query: 241 PPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 300
           PPVYY PPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPP VY
Sbjct: 241 PPVYYFPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPP-VY 300

Query: 301 HSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTY 332
           +SPPPPVY SPPPPVYSSPPPPVYKSPPPP Y
Sbjct: 301 YSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY 331

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr
Match: KAG6592187.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 422 bits (1085), Expect = 1.23e-144
Identity = 279/332 (84.04%), Postives = 287/332 (86.45%), Query Frame = 0


Query: 4   SMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPV--YH 63
           SMA LV  +LV  LS  S IA  Y Y    PPP Y    +Y+SPP PVYYSPPPP   Y 
Sbjct: 7   SMAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSS--PPPPYY---VYKSPPPPVYYSPPPPKKEYK 66

Query: 64  SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPP 123
           SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPP VYHSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPPP
Sbjct: 67  SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP 126

Query: 124 PVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYY 183
           PVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYY
Sbjct: 127 PVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYY 186

Query: 184 SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP 243
           SPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVY SPPP
Sbjct: 187 SPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPP 246

Query: 244 PVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH 303
           PVYYSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH
Sbjct: 247 PVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYH 306

Query: 304 SPPPPVYHSPPPPV-YSSPPPPVYKSPPPPTY 332
           SPPPPVY+SPPPP  Y SPPPPVY SPPPP Y
Sbjct: 307 SPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 333

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr
Match: XP_022936196.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 417 bits (1071), Expect = 2.96e-142
Identity = 279/350 (79.71%), Postives = 288/350 (82.29%), Query Frame = 0


Query: 5   MASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYD----PWL-----PPPTYKWRPI------------ 64
           MA LV  +LV  LS  S IA  Y Y     P+      PPP Y   P             
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 65  YRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSP 124
           Y+SPP PVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPP VYHSPPPP+Y SP
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 120

Query: 125 PPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPV 184
           PPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPV
Sbjct: 121 PPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 180

Query: 185 YHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSP 244
           YHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY SP
Sbjct: 181 YHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSP 240

Query: 245 PPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 304
           PPPVYHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 300

Query: 305 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YSSPPPPVYKSPPPPTY 332
           YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  Y SPPPPVY SPPPP Y
Sbjct: 301 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 350

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7A8 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 478 bits (1230), Expect = 4.24e-162
Identity = 308/357 (86.27%), Postives = 317/357 (88.80%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60
           MASS+ASLVIAILVVALSVPSSIAR YRY PWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY
Sbjct: 1   MASSVASLVIAILVVALSVPSSIAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVY--------PSPP 120
           HSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPP VY+SPPPPIYKSPPPPVY         SPP
Sbjct: 61  HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYNSPPPPIYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPP 120

Query: 121 PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY-------- 180
           PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY        
Sbjct: 121 PPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVY 180

Query: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPP 240
           HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP+YKSPPPPVY+SPP
Sbjct: 181 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPMYKSPPPPVYYSPP 240

Query: 241 PPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP--------VYKSPPPPVYYSPPPPVY 300
           PPVYHSPPPPVY SPPPPVY+SPPPP+Y SPPPP        VYKSPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 241 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPYYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVY 300

Query: 301 HSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTYY 333
           +SPPP VY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY SPPPP YY
Sbjct: 301 YSPPPVVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYY 357

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IP49 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476988 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 473 bits (1217), Expect = 1.15e-159
Identity = 299/332 (90.06%), Postives = 306/332 (92.17%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60
           MASSMASLVIA+LVVALSV  S+AR YRY PWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY
Sbjct: 1   MASSMASLVIAVLVVALSVSPSMAREYRYAPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVY 60

Query: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPP 120
           HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPP VYHSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPP
Sbjct: 61  HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPP 120

Query: 121 PPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 180
           PPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVY
Sbjct: 121 PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY 180

Query: 181 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPP 240
            SPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPP
Sbjct: 181 LSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPP 240

Query: 241 PPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 300
           PPVYY PPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY SPPP VY
Sbjct: 241 PPVYYFPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYSSPPP-VY 300

Query: 301 HSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPTY 332
           +SPPPPVY SPPPPVYSSPPPPVYKSPPPP Y
Sbjct: 301 YSPPPPVYKSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVY 331

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6U4 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 417 bits (1071), Expect = 1.43e-142
Identity = 279/350 (79.71%), Postives = 288/350 (82.29%), Query Frame = 0


Query: 5   MASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYD----PWL-----PPPTYKWRPI------------ 64
           MA LV  +LV  LS  S IA  Y Y     P+      PPP Y   P             
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 65  YRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSP 124
           Y+SPP PVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVY+SPPP VYHSPPPP+Y SP
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSP 120

Query: 125 PPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPV 184
           PPP+Y SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVYKSPPPPV
Sbjct: 121 PPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPV 180

Query: 185 YHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSP 244
           YHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY SP
Sbjct: 181 YHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSP 240

Query: 245 PPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 304
           PPPVYHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV
Sbjct: 241 PPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV 300

Query: 305 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YSSPPPPVYKSPPPPTY 332
           YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  Y SPPPPVY SPPPP Y
Sbjct: 301 YKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSPPPPVY 350

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6D2HCM3 (Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MERR_LOCUS720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 395 bits (1016), Expect = 5.12e-133
Identity = 284/366 (77.60%), Postives = 289/366 (78.96%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALS---VPSSIARGYRYDPWLP-----PPTYKWRP---------- 60
           M S MASL   +LV+A S   V  + A  Y   P  P     PP YK  P          
Sbjct: 1   MGSPMASLAATLLVLAFSLCFVSETTANYYYSSPPPPIKHYSPPVYKSPPPPVKHYSPPP 60

Query: 61  IYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKS 120
           IY SPP PVY SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPP VYHSPPPP YKS
Sbjct: 61  IYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPYYKS 120

Query: 121 PPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVY--PSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPP 180
           PPPPVY SPPPPVYKSPPPPVY   SPPPPVY SPPPPVY SPPP VY SPPPPVYKSPP
Sbjct: 121 PPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPRVYHSPPPPVYKSPP 180

Query: 181 PPVYHSPPPPVYKSPPPPVYY----------SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP 240
           PPVYHSPPPPVYKSPPPPVY           SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP
Sbjct: 181 PPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP 240

Query: 241 VYKSPPPPVY--HSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVY 300
           VYKSPPPPVY   SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY+SPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVY
Sbjct: 241 VYKSPPPPVYLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY 300

Query: 301 YSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY--HSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPVYKS 332
            SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY   SPPPPVY SPPPPVYHSPPPPVY SPPPPVY S
Sbjct: 301 KSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS 360

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IER1 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 371 bits (953), Expect = 3.17e-125
Identity = 260/339 (76.70%), Postives = 277/339 (81.71%), Query Frame = 0


Query: 4   SMASLVIAILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRPIYRSPPSPVYYSPPPPV---- 63
           SMA LV  +LV  LS  S IA  Y Y    PPP Y    +Y+SPP PVY+SPPPP     
Sbjct: 7   SMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSS--PPPPYY---VYKSPPPPVYHSPPPPKVKYE 66

Query: 64  YHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPLVYHSPPPPIYKSPPPPV-YPSPPPPVYKS 123
           Y SPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPP VYHS PPP+Y SPPP   Y SPPPPVY S
Sbjct: 67  YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYYS 126

Query: 124 PPPPVYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP 183
           PPPPVY SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP+YKSPPP VYHSPPPPVY SPPPP
Sbjct: 127 PPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPPP 186

Query: 184 VYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKS 243
           +Y SPPPPVYHSPPP VYKSPPPPVY+SPPPPVYKSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY S
Sbjct: 187 IYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHS 246

Query: 244 PPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP 303
           PPPPVY+SPPPP+Y+SPPPPVYKSPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP        
Sbjct: 247 PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK------- 306

Query: 304 VYHSPPPPVYHSPPPPVYSSPPPPV----YKSPPPPTYY 333
           VY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP     YKSPPPP YY
Sbjct: 307 VYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY 333

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 1.1e-75
Identity = 254/399 (63.66%), Postives = 267/399 (66.92%), Query Frame = 0


Query: 1   MASSMASLVIAILVVALS---VPSSIARGYRYDPWLPPPT---------YKWRPIYRSPP 60
           M S MASLV  +LV+ +S   V  S A  +   P  PPP          Y   P+Y SPP
Sbjct: 1   MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSP--PPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPP 60

Query: 61  SP----VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP----VYKSPPPPV-YYSPPPLVYHSPPPP- 120
            P     Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPP    VYKSPPPPV +YSPPP VYHSPPPP 
Sbjct: 61  PPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPP-VYHSPPPPK 120

Query: 121 ---IYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPP----VYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP----V 180
              +YKSPPPPV    PPPVY SPPPP    VY SPPPPV    PPPVY+SPPPP    V
Sbjct: 121 KHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 180

Query: 181 YSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYKSP 240
           Y SPPPPV    PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSP
Sbjct: 181 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 240

Query: 241 --------PPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPV 300
                   PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV
Sbjct: 241 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 300

Query: 301 YYSPPPPIYHSPPPP----VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYKSPPPPVYHSP 331
            +  PPP+YHSPPPP    VYKSPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VYKSPPPPV H  
Sbjct: 301 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 360

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 236.5 bits (602), Expect = 3.1e-62
Identity = 267/407 (65.60%), Postives = 281/407 (69.04%), Query Frame = 0


Query: 10  IAILVVAL-SVPSSIARGYRYDPWLPPPTYKWRP---IYRSPPSP--VYYSPPPP--VYH 69
           + +LV+AL SV +  +  Y Y P   PP+Y ++P   IY SPP P  VY SPPPP  +Y 
Sbjct: 10  LLMLVIALYSVSAHTSAQYTYSP-PSPPSYVYKPPTHIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYIYK 69

Query: 70  SPPPP--VYYSPPPP--VYKSPPPPVY-YS---PPPLVYHSPPPP--IYKSPPPP--VYP 129
           SPPPP  VY SPPPP  +YKSPPPP Y YS   PPP +Y SPPPP  +Y SPPPP  VY 
Sbjct: 70  SPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 129

Query: 130 SPPPP--VYKSPPPP--VYPSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYSSPPPP--VYK 189
           SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYSSPPPP  VYK
Sbjct: 130 SPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 189

Query: 190 SPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYH 249
           SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY 
Sbjct: 190 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 249

Query: 250 SPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--IYH 309
           SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPPP  +Y 
Sbjct: 250 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYK 309

Query: 310 SPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP------------VYH 333
           SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY+SPPPP  VYKSPPPP            VY 
Sbjct: 310 SPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPSPYVYK 369

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10
Match: AT1G23720.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 220.7 bits (561), Expect = 1.8e-57
Identity = 209/323 (64.71%), Postives = 219/323 (67.80%), Query Frame = 0


Query: 34  PPPTY--KWRPIYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YYSPPPP-VYKSPPPPVYYSPPP 93
           PPP Y    +P Y+SPP P  Y+ PPP Y+SP P V Y SPPPP VY SPPPP YYSP P
Sbjct: 117 PPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPP-YYSPSP 176

Query: 94  LV-YHSPPPP-IYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPP-VYPSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPP 153
            V Y SPPPP +Y SPPPP Y   P P YKSPPPP +Y SPPPP Y   P PVY SPPPP
Sbjct: 177 KVDYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYIYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPP 236

Query: 154 -VYSSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP-VYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP-VYKSPPPPV 213
            VYSSPPPP Y   P P Y SPPPP VY SPPPP Y   P P+Y SPPPP VY SPPPP 
Sbjct: 237 YVYSSPPPPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPIYKSPPPPYVYNSPPPPY 296

Query: 214 YHSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP-VYYSPPPPIYHSPPPPVYK 273
           Y   P P YKSPPPP VY  PPPP Y   P PVYKSPPPP VY SPPPP Y   P P YK
Sbjct: 297 YSPSPKPAYKSPPPPYVYSFPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKPAYK 356

Query: 274 SPPPPVYYSPPPPVYHSP-PPPVYKSPPPP-VYHSPPP--------PVYHSPPPP-VYHS 333
           SPPPP  YS PPP Y+SP P P YKSPPPP VY SPPP        PVY SPPPP +Y+S
Sbjct: 357 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYIYNS 416

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10
Match: AT3G28550.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 3.7e-55
Identity = 222/347 (63.98%), Postives = 233/347 (67.15%), Query Frame = 0


Query: 34  PPPTYKWRP--IYRSPPSPVYYSPPPPVYHSPPPPVYY-SPPPP-VYKSPPPPVYYSPPP 93
           PPP Y   P  +Y+S P P  YS PPP YHSP P V+Y SPPPP VY SPPPP YYSP P
Sbjct: 640 PPPCYSPSPKVVYKSSPPPYVYSSPPPPYHSPSPKVHYKSPPPPYVYSSPPPP-YYSPSP 699

Query: 94  LV-YHSPPPP-IYKSPPPPVYPSPPPPVYKSPPPP-VYPSPPPP--------VYKSPPPP 153
            V Y SPPPP +Y SPPPP Y   P  VYKSPPPP VY SPPPP        VYKSPPPP
Sbjct: 700 KVHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP 759

Query: 154 -VYYSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPP-VYHSPPPP--------VYKSPPPPVYYSPPPPVY 213
            VY SPPPP YS  P  VYKSPPPP VY SPPPP        VYKSPPPP  YS PPP Y
Sbjct: 760 YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPY 819

Query: 214 HSPPPP-VYKSPPPP-VYHSPPPP--------VYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPV-YK 273
           +SP P  VYKSPPPP VY SPPPP        VYKSPPPP  +S PPP Y+SP P V YK
Sbjct: 820 YSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK 879

Query: 274 SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPV-YKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YKSPPPPVYHSP 333
           SPPPP  YS PPP Y+SP P V YKSPPPP  YS PPP Y+SP P V YKSPPPP  +S 
Sbjct: 880 SPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSS 939

[Close]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 204.5 bits (519), Expect = 1.3e-52
Identity = 243/385 (63.12%), Postives = 259/385 (67.27%), Query Frame = 0


Query: 11  AILVVALSVPSSIARGYRYDPWLPPPT-YKWRP--IYRSPPSPVYYSP-PPPVYHSPPPP 70
           ++L+V L++ S +A  Y    + P PT Y   P  +Y SPP  VY SP PPP  + PPP 
Sbjct: 8   SLLMVVLALYSMVA--YTSAQYSPTPTPYSPLPPYVYNSPPPYVYNSPSPPPYVYKPPPY 67

Query: 71  VYYSPPPP--VYKSPPPPVYY----SPPPLVYHSPPPP--IYKSPPPP--VYPSPPPP-- 130
           +Y SPPPP  VY SPPPP Y      PPP VY SPPPP  +YKSPPPP  VY SPPPP  
Sbjct: 68  IYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPY 127

Query: 131 VYKSPPPP--VYPSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYSSPPPP--VYKSPPPP-- 190
           VYKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYS PPPP  VY+SPPPP  
Sbjct: 128 VYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPY 187

Query: 191 VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYHSPPPP-- 250
           VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  
Sbjct: 188 VYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPY 247

Query: 251 VYKSPPPP--VYHSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPP-- 310
           VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  
Sbjct: 248 VYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPY 307

Query: 311 VYKSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYKSPPPPVY---HSPPPPVYHSPPPPVYH 334
           VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VYKSPPPP Y   +SPPP  Y   PPP  +
Sbjct: 308 VYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAPYVYKPPPYVY 367

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q38913	3.2e-80	68.02	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9FS16	1.5e-74	63.66	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q9M1G9	8.5e-49	62.94	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
Q9T0K5	1.9e-40	57.69	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
P13983	5.4e-35	55.63	Extensin OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=HRGPNT3 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Csor.00g035830 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAG6592189.1	1.68e-200	100.00	hypothetical protein SDJN03_14535, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
XP_022936376.1	8.76e-162	86.27	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]
XP_022976649.1	2.38e-159	90.06	extensin-3-like [Cucurbita maxima]	[more]
KAG6592187.1	1.23e-144	84.04	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_022936196.1	2.96e-142	79.71	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]

BLAST of Csor.00g035830 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1F7A8	4.24e-162	86.27	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443012 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1IP49	1.15e-159	90.06	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476988 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F6U4	1.43e-142	79.71	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1	[more]
A0A6D2HCM3	5.12e-133	77.60	Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MER...	[more]
A0A6J1IER1	3.17e-125	76.70	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Csor.00g035830 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	1.1e-75	63.66	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	3.1e-62	65.60	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G23720.1	1.8e-57	64.71	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	3.7e-55	63.98	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	1.3e-52	63.12	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01217	PRICHEXTENSN	coord: 42..58 score: 35.29 coord: 98..114 score: 51.76 coord: 77..98 score: 39.09 coord: 63..75 score: 44.62
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF22	EXTENSIN-3-LIKE	coord: 95..289 coord: 155..329
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 95..289 coord: 155..329

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Csor.00g035830.m01	Csor.00g035830.m01	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall