Csor.00g008010 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g008010
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr08: 1185974 .. 1189878 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g008010
SyntenyCsor.00g008010
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTTTTTGTAATGCAGTCGTCCAGATACTCATGGGAAGGTTTGTCCATTTCTATAGTGATGCATTTCTGGTATCTCTCCTTGCTTTTGTACAATACTTTCTAAACTGGAAATCATCATTCAGAGGAAATTATGTTCTTGAGATTTATTTGCATGTTTCTTTGTTCTTAGGGATCTATTTTTCGTGTTTTATTCTTCAAATACTTGTGATTCAGAGTTTCTTTGCTGTCCGTTCGGGTTAACCGCTAAAGGACAATAGACAATTTTCGTGGGTTCAAAGGATTGATCGACGTTTGAAGAACGCTTGTGACTGGAGGCTGACAAAATCAAAGATCTACATGACCAAATTTTCCAGTGGTGCTCGGCCGATTAGGCAAATGCGAGTGAGGGATAAGCTTCTCAAGCTGAAGAAACTTATTCGAAACTTATTCGATGATAACTTTTGTTAGTGATTTAATTTTTGCGATGAAATGAATGGTAACAGGAAATTTAATATTATATACGGATGTGAATAAAATCATGTATCCTCATCAACCATGGCACCAATTTCTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAACATTAATTTCTGTATTTGTCTAAAAATTTAGTTAATAAATTTCAGTATGTAATAATTTAATTTCAAATAATAAAATTTAAAAATATCCTATCCATAAATTTGAGTATGTAATAATTAAATCTCAAATATTAAAATTTCCTTAAAATCAACAATCAATATTTATTATGGAATAATTTATCCTTATTATCCGACGGAATAATGAAAATTTTAAAACTATAAGCTATTTTTTAAAATTAGCTATCTGTTAAATGATTAAAAAATTATTTAAAAAAGTAAAATTGAATATTTAAAAATGAAATAAAAATATTTTGGGTTTTATAGAGAAACTTCCCTTTTTCAACCAGTTTCCATAAAAAAACCCGTTCGGTTTCAAGAGAAGAGACACAGAAGGAAAGCGGATCTCGATCAAATTCCGCTTCCCTGAAATTCAGCCAAATCTTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTTCATATTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCGCTGTTCTCTCTCCGCAGAATGTAACCTTTTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCACTGTTCGCTCTCCGCAGAAAGTAACCTTTTCTTCAGCCCTCATCTCACACCAACTGATCGCGAATCCGCAGACGAACCGGTGAAATCCACGCCGCTGGCTCCAACCGCCGCCGGAGACTCGTCTCCGGAGAATCATCGCTGGGTGATGTGAGTGTTTATTTATTTATGAACAAATCTATTTATTTAAATTTATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTGATTGTTTGTTTGTAATTATTATTGTTGTTTTTGTGCACGGTAATTTAGAAAATGTTCATGAATTTATAATATTTATAATAAGAAATACTATCTCTATTGAAATGAGGTCTGTTAATAAGTACAAAACAATACATGAATTTATAGTATTTATAATAAGAAATACTATCTCTATTGAAATGAAGTCTCTTGAGAAGTATAAAATAATACAGCAGAGTTTATAGTATTTATAGTAAGGAATACATGGAACGAGGCCTCTTGAGAACTACAAATTAAAGCCACGAGAGTTTATGCCCACAATATCATACAATGTTGTTAAGGTGTTATGGAACTAGTTAGGTTAATGGGATACGTTTTTTAGCTCGGCCACAATGAAGAGAGATTTAGCGGTCTAGACTTCTAAAATTTCTTTAGTCGGAAAAGTTTAGATTTGGATCCGACTCTTACAAATTAGCAATATTAGAAAATTAGTGGATTATATTATTTTTTTTAATTAATTTTATGAATTGATGTTAAACAAAATTGTAATTTAATTATATATTTTTTATTTAATAACTATTTTTATGAATAAGTTAATTTGTATTTTTTTTTTGTTTTTATAATCTTTTATTAAAATTTTTAACAATAATAATTATTTATTAAAAAAAAAATAAGGTAAGTTTTTTTGATAGTATTTTTATTTTTTTACTTAAAAATATAATATTATTAAAAAAAAAAACTATTTTTACCTTTTTTCCTATTACCCTAAACTTATTGGTTAAATTTCAATAAATAAATAAAGCTAAAAATAATAATTTTTTATTATTATTGCTAAATTAATAAAAATAATATTCAACTTACTGTTGAATTTTAAAAATTTTCAATAATCCCAACTTTCCAAAAACTCAAGAAAAAAAAAATTAAAAAATACTTATATGAAAATGGTTAATATTTTATTTAAAAAATACAATTTTTAAAAAAATATGCTTGAGTTTTTAAAATTTAATACCGTGTTTCAAAAATGCAAATGAACATTTAAAAGTAACATTATTAAAGAGGGAGATAATCTATAAGTCATCGATAAATTGTTTTTATCCATATATTGACGGTAATGTTTTTAATTTTTTTTATAAAGTTAATGTTACCTTTAAAATATTAATGGTATTTTTTAAATATAGTATTACGGATAAGAGTAAAATTTTAAAAGTAGAGATATTTTTTTTTAATAAAAAAAGCTTTTGAGATTATTTTAAAATTTAAGAGTATTATTTAAAATTTTAAAAGTTTGGATATATTTTTACAAAAGCGAAAGACATATTACACAACATCATATTACTTTCCAAAACGGGATCGTTTTGAGCCGGGTCGGGTCGGGTCAAGTTAGGATCCGGGCGACCATTCATCGACGGCCCAACAAGGGCCCTACAAATCGACGGCCCACGAAAGCCCTAGCTGTGGCCATGCACTCTCTTCCGTCTTCCCCGTAGCAATTGTTTTTTTTGGTTATTCTCCCCAACGCCAGCAGGTTCGATCTTCTTCCCCAGTCTTCGTCGTCTTTCTCCTCACTCAAATGCAATTTCCACCAATTGAATCACTCACCAAAACCCACCATCGGTACTTTCTTCACTTTCCCCCTTTCTCCCCTTGTTTCAATTTCTCGTTTTTTCAGCTCTGAGAATGCTTCCTGTTTTTGGTGAAATTTTTGATCAGACTGCCTTGATTGTTGTGAAGCCTGCGATATCTTTCGTTTTGGGCCAACACCAGGCAAGAGCGAGGCGAAACGAGCTGAGGTTTGTTTTAATAACATGCAATGCAATTACTTAATGTTTGCACTATGTTTTTGCTTTTATGTCGGGCATAAATCATGGTCAATACTTGGTTTCTATGTTTTTCACTCAGAATTAGACTATTCTTTCTGGAATCTATGTTTTTAATAGCCATAGAGTGATAGGGCATATGCCATTAAGGTGGATGATCACACAACGCCATGAGAATTAATAAGCAAGTAATTTCAAGGAAGTCATGTAATTTTGGGCATATGTATTTGTGCAGTCCGGGTATATTTCGTTTTTAGAGGGGATATATTAAGTCTGCAACATTTTCTCTTATAACCTTTATCGTTAAGATAAGATTGACCAAACCATGGTTAGGAATGTGCGTCTTGTTAAATGATTTGTTCCCTCTACTCTTGGACTGTTTTCCATCATTCGTGATCAAGCTTTTGTCACTTTCTAGCATTGTTAATGTCATGGTAAACTGTAAAGTGTATTAGGAACATCTTGATCTTATTTTTAATTTTTTGTAGTGGTTTTTTTTACCATGATGTTGGTTGGATATATTAAAAGCTCATTGTTATGACAATGAAGGGGATGAATGACAATTTCATTATTAGGAACATCATAACGGTCCTCCCAATTTCATTGGTTGGATATTTGAAAATGCATGTTGGCTAGAGTGTTTTTTTATATTTTTATTGCTGAGTCATTTGCTGAAAATTGACGAGGTTAATTGCTTGTCAGATGCTGTCTTCAGAAGCATTCACCGGAAATTTGATCAATCCCATCTAG

mRNA sequence

ATGGTTTTTGTAATGCAGTCGTCCAGATACTCATGGGAAGAGTTTCTTTGCTGTCCGTTCGGCCAAATCTTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTTCATATTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCGCTGTTCTCTCTCCGCAGAATGTAACCTTTTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCACTGTTCGCTCTCCGCAGAAAGTAACCTTTTCTTCAGCCCTCATCTCACACCAACTGATCGCGAATCCGCAGACGAACCGGTGAAATCCACGCCGCTGGCTCCAACCGCCGCCGGAGACTCGTCTCCGGAGAATCATCGCTGGGTGATGTTCGATCTTCTTCCCCAGTCTTCGTCGTCTTTCTCCTCACTCAAATGCAATTTCCACCAATTGAATCACTCACCAAAACCCACCATCGACTGCCTTGATTGTTGTGAAGCCTGCGATATCTTTCGTTTTGGGCCAACACCAGGCAAGAGCGAGGCGAAACGAGCTGAGATGCTGTCTTCAGAAGCATTCACCGGAAATTTGATCAATCCCATCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTTTTTGTAATGCAGTCGTCCAGATACTCATGGGAAGAGTTTCTTTGCTGTCCGTTCGGCCAAATCTTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTTCATATTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCGCTGTTCTCTCTCCGCAGAATGTAACCTTTTGAATTTCATAGCCGTCGATTTCCTTCACTGTTCGCTCTCCGCAGAAAGTAACCTTTTCTTCAGCCCTCATCTCACACCAACTGATCGCGAATCCGCAGACGAACCGGTGAAATCCACGCCGCTGGCTCCAACCGCCGCCGGAGACTCGTCTCCGGAGAATCATCGCTGGGTGATGTTCGATCTTCTTCCCCAGTCTTCGTCGTCTTTCTCCTCACTCAAATGCAATTTCCACCAATTGAATCACTCACCAAAACCCACCATCGACTGCCTTGATTGTTGTGAAGCCTGCGATATCTTTCGTTTTGGGCCAACACCAGGCAAGAGCGAGGCGAAACGAGCTGAGATGCTGTCTTCAGAAGCATTCACCGGAAATTTGATCAATCCCATCTAG

Protein sequence

MVFVMQSSRYSWEEFLCCPFGQIFSSSSSSSSSFILNFIAVDFLRCSLSAECNLLNFIAVDFLHCSLSAESNLFFSPHLTPTDRESADEPVKSTPLAPTAAGDSSPENHRWVMFDLLPQSSSSFSSLKCNFHQLNHSPKPTIDCLDCCEACDIFRFGPTPGKSEAKRAEMLSSEAFTGNLINPI
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g008010 vs. NCBI nr
Match: KAG6592991.1 (hypothetical protein SDJN03_12467, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 372 bits (954), Expect = 7.32e-130
Identity = 184/184 (100.00%), Postives = 184/184 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MVFVMQSSRYSWEEFLCCPFGQIFSSSSSSSSSFILNFIAVDFLRCSLSAECNLLNFIAV 60
           MVFVMQSSRYSWEEFLCCPFGQIFSSSSSSSSSFILNFIAVDFLRCSLSAECNLLNFIAV
Sbjct: 1   MVFVMQSSRYSWEEFLCCPFGQIFSSSSSSSSSFILNFIAVDFLRCSLSAECNLLNFIAV 60

Query: 61  DFLHCSLSAESNLFFSPHLTPTDRESADEPVKSTPLAPTAAGDSSPENHRWVMFDLLPQS 120
           DFLHCSLSAESNLFFSPHLTPTDRESADEPVKSTPLAPTAAGDSSPENHRWVMFDLLPQS
Sbjct: 61  DFLHCSLSAESNLFFSPHLTPTDRESADEPVKSTPLAPTAAGDSSPENHRWVMFDLLPQS 120

Query: 121 SSSFSSLKCNFHQLNHSPKPTIDCLDCCEACDIFRFGPTPGKSEAKRAEMLSSEAFTGNL 180
           SSSFSSLKCNFHQLNHSPKPTIDCLDCCEACDIFRFGPTPGKSEAKRAEMLSSEAFTGNL
Sbjct: 121 SSSFSSLKCNFHQLNHSPKPTIDCLDCCEACDIFRFGPTPGKSEAKRAEMLSSEAFTGNL 180

Query: 181 INPI 184
           INPI
Sbjct: 181 INPI 184

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g008010 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g008010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6592991.17.32e-130100.00hypothetical protein SDJN03_12467, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g008010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g008010 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 84..105

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g008010.m01Csor.00g008010.m01mRNA