CsaV3_7G023250 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGAATACAACATAAGAGACAAATGGCTTGTCCCTTTGTGTCAACAAACACATTTTTTTTCTTTCTTTTTCTTCATTATAAACATTACTACATACTCATGCATTAGTATTCATACACCAAATACCATTTTAGACTTCCCCTATGGTTAGTGTTCAAATGTGTCACCTCCTACATACCAAAATTCCTATAAATAAGTGGTCATTTGTGGATTGTGTACACACACATGCATTTCCATAAATATTTGATTTCCTATATTTTTGTTATTTTTATTATTTTATTTTATTTATAAATTATGCTTGATTTATTTCAATATTATATTTTTTCAATATTCGTGTTTTCATTGTATCGCGATTTTGCGTTACCAGCACAATCCCTAGTTATTTTGTCCATAAAAGTTGGTCCTAAAGGCATGCCATTTGTTTTCCTCTTTGTCATAATTAATAGATTAAATGTTGATTTTGAATGTTGAGTACATAGTAGATTTGTAATGTATATACAAATGTTTAATAATAGTGTTAGCACCTTACGAAATTACATTTGATATTAATGGTAATAATTATTTGTCATAAGTGTTTGATGTCGAAATACATCTAGATGCCACAAAGATATAATGATTGGAGAACAATTATTCTTTCTAAAGTTTGTTATGAATAGATGCACTCGTGTTTTTAAGATTTCAAACCATTAAGTGGTTATAACTTCACATTATTTAAAATTAGTTCAAAATTGTAATTACGCGGAGAGAGTTATTGATGCAAAAATTGTTAGAGAAGATGTTTTCTAAAATTCACGTCCTAAATATGCTTCTAGAGGAGCAATATCAAGAGAAATGTCTTATAAGTGTTATGAACTCATTTTATGTCTTTTTTTAGGCTGATTGAAATAACAAGTTATTCATTAAAAAAATTACGAACAACTAAAGCAACAACATTCCCTTAATTGTGAATATTGATCAACTAAAAATGGATTTAATTGTGTAAATTAAATCAATTTGTTAAAAATTTTAAATTGAATTGAAAACCATCAAATTAAGATGATGTTTCATGAATAAATTTAACATTTATGAAAGTTAAACGTGTAGTTTCTTCGATTTGGGTGAGTTATGTTTGTGCTAACAAAATTGAGTTAAAATTTGACATATGTTTCAATATTTATATTTATTTAAATTTTTTTGTGTATTTTGGAGAGTTACTAAGTTGTTAGCTTATAAATAGCCACTTGGTTCTTCATTTGTTGTATCTCATTCCAAAATTGAAAAGTTCAAACTCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCCTTTGTTATTGAGTTGAATTGAGAGCAAGTATCCAAGACTTCTGCTAGATCTGAGTAGTTTGAGGCTGCAGTTCTATCGATGTTAGTTGTTATATCCTGTTGAGACGATCGTTGGTTGTAGTTTGCTTGCAAACCTGTGCAAAGCGAATAATTATCTTCAAGTGAATGTTGTGAGTTCTATTTTATTTTTCTTTTCTAATTGAGATGTTAATCAGTTTACTAGTGTCTTGAGTTTATGTTATATTCAAAGTTTCCTCCAACATCATTCCCTGAAGTGAATATAGTAAATTTTGACAATTGTGATCGAGATTGTGTGTCACACCCCCTCCTAAAGCCCCCTCTTTAGCCTCGAAAGAGGGTGCGCGGGATAGCAAGTGTTACCATACTTTGACAACACTTACCAACCAACTAAACTAACTAACTTAGCTACCTTCCAGCTATTAATGCATACTAGTTAAATAAAATAAACAACAAGTTAAATGCTTATCAAGTTACACAAACTTCTCATTTAACTAATACATACACTTAGCCAAAATTTGAACTTACTAAACAACCTTACTATCTAGGCCTATAATTTCAAACTCATGCAAAATGCATATACATGTCAACACTATAAGAATAATAACCTCGTAATACTAATAGCAAGTAAGCAGTTGTAAGACAAGCTCGGGCATGACAATCTCTACCTGGAAAGTGACAAAACAGTTTGAAAGGATGAATGGAAAAACTCAGTGAAAGATTATTTCATAAACATACTTTTGATAAATAGTTATGCTCAATGCTTAGCTTGAAATATGCAAATAAGAAACATTTCATAAGTTTAACTATGTATTACTCTATAACTTGTCTATGACTGAAATCGGGTGATAACACACATCACTGAAGGAATAAAAGCCTTTTGCAACAGGAACAATTAACAAAACATTTTTCTCAATTTAATTGAAAATTAGGAAATACCAGTACATTGGCTAAAAATACATAAAATTATTGTAAATTAATTAATGGTTAAGCATGCATTTACAATAATATATAAAATAATAGGGAAAAAGAACTTACTCTCGTTGTAGTCTTAAAATTCTACAAACTACAATATTGGGGTCATCACCACTAAGAAAACCTTTATATTATCTGAGTGAATGAGATTGATGGTTTATAAGAACCAACTATTGGAATGAGAATTTTTACAAAGAGTTTTTTTTCGTTAGAGAATAAGTAAGGAATAAAAAATTTTCAAAAAAAAGAGTCTACGATACCTGCTTCCCCTTTCTTCACGAAGAAGAAGAAGTTAGATAGACAAATTGGGATATGTAGGAAAGCTGCCCACATTCCGTGAATAATTCTCACGTAACTCGTAAAGGAGCTATTCCTTTTAATTAAATTAAATCATATTTAGTTACTATTCTATTTAAATCATATTTAAATGAATATCTCACATAATTTATAATTTTAATTTCATTAATTTAATTTAATAGAATTAAACTAAACTATTCATAAATTCTTCAACTAATTAATTGCTAAATTAAATATATTGTATTTAGTTTAATTCAAATATGAGTCTTACTCATATATAAATTGTGTTGATGTATATGATATATGAATTAAATTTTAAACTATAGTTTTAATATGAATTTAATTAATATTTGAACTCATTTAGATATTTTATTCTCTCGTAAATTATTTTTGAATCATATTCAAAATTAAATTTAGGTTAATTTTAAAAAATATAACAAATATGCAAAATATTTACATCTGCGGTAAAAAATGAAAAAGTCTATTAATTTGGCCATTTTTAAAAAATATTATAGGTTTGTCATTCCTTGTCATCGTCTTTCTTCTCTTTCTGGTTTTTGTTTTCTTTCCATCGTCTTTTTTTTATTCTTATGTAGTTTTTCTTTTATTTTTTCATTTAAACTATTATTTGGTTCAACATCATGTACCAAATACAAAAGATCTGTTTTTTTTATAAAAAAATCTTTTCAAACGGCTATTTGGTTGTTGCAAATATAAAAGATTGTGAAAAAAAAAAATCATTGGATATTGGATAGCCAAATCTAAACGAAATGTACCAAAAATTGTTAAATCTAGACGATCGTGTGCAAATTTTTTTAATAAATTGTTTAAATTTGGTTAGCCAATTTTAATGATCAAATCTAAATGATCATATTCCAAATGTTTCAAATATTCCAAATATAAATGATCGGATTCCAAATCTAAATTATCTTTTTCTAAATTTAAACTATAGTTTTCCAAATATAAACAAGTACAAAAAAATCTTGAAAAAAAATGGTTGAGATTTGAGAACCAAATTTAAACAATCAATTTAAACGATCCTGTACCATAAAATTATGAAAAAATTGTTTAGATTTGACTACCCAAATATAAACGATCAAATCTCACTACAAGAAATGTAGGGTCCAGTGACAAAGTTTTAGTGACGCAAATAATTTTTGTCTCTAAAGGATCATTTTTAGCTACACAAAAAAAATTTGTCACAAAACATTATTATTAGAAATATATTTTTAATCAAGGACGGATTTAAGAAGGGACCGGGGGCAACCCCCTCACATTCTCGATTTTTATATTTTATTATTAATTTTGAAGTTTAAAAATACAATGTATATTAAATAACGCTCTTTTAAAGGTAAAATTGGTTTTCAATGAAGTGGTTGTGTCCCCTTTGGAACTCTCACATCTTGTGTTCAAATCTTAATAATTTTTTAAAAGAGGAAAAAAAACCTATATAAGATAAAACTCCAACTTATTTCCTAGAAGAGTCACTTGTTATCTAACAAACTTTTACTCTACCAACAATATTTTAGAAGAATGTATTATTTTTTATGCAATTTTTAAATTCACATATTTACCTTACTTATGTATATATTTATTTTATTTTATTTTATAATTAAACGATACAAGATAATTTTTTTATGTTGATCGTTAGAATATAAATATCGTATCAATTCACTAGTAAGTTCAAATTCTTCTTAATATTTTTAGTTTTTGATTCTGAATTCCCTAATTTCACTACAGATGCACGGAACATTCGTTTGGGGTTAGCTTCAAATGATTTTAATTCGTTCGGTCATATGAGTACCTTGTACAGTATGTGGATTGTGGTGTTAATTCCTTACAATTTGCCACCCTAGAAATGCATGAAAGACTTAACTTTTTTCATGACATTGCTCATTCTCTCGGTCTAAAATCTCCGGATATTAGCATTCTCAAATGAAGATACCAAATTTATATACATGTAGATTTAATTTAGCTTCTAAAAGATATTAAAATAAAATCATTATGAGAGATGAATTCATATGGAAAAGTTGCAAACAAAATCATAGTTGGATTGATTCTCTTTTCTTCTGATATCTTTGTTTCCATCACAACATCAGTAGCAATTTGATATACATTTTCCTAACTTTGGCCCATACAAATTTAGTTAATGTGAGGAGATGATAATATACTTAAGAATATGTTCATTTCATACATTACTTTGTATTATTCAATAGATATTTATTCTCGATATTAAATTTTGTACGTATTATAAGACATTTTCATTTCCATGAATTTGATATTAGCACGAAGAAGTAAATCAATATTTTGATGAAACATAAATTGTGTTAACAAAGTTGTCCAAGCAAGTCAAAACCCAAGCCCAAGCCTAAGCCCAAGAAGACCCAAAGGTGTTGTAAGGGATCTTGCATA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ATGGGCAAAATCAACAACATGAAGGACAACGGTGTTGAGTATCTTAGCAACAAGAAGCACAAAATCGTGTTCGTTATGGGCTCTACAGCTACCGGAAAATCAAAACTCTCCGTCGACTTAGCCACTTTCTTCCCATCCGAGATCATCAATTCCGACAAGATTCAGTTCTATAAAGGCCTCGACATAATCACCAACAAGATCAACCAATCCGATCGTCGCGGCGTTCCTCACCATCTCCTCGGCGTAATCCACGATCCAGACGCTGATTTAACTGCCGGAGAGTTCTGCAGTCTCGTCGAAGACGCAATCGCCGACGTTATCAGTCGCGGATGTCTTCCAATCGTCGTCGGAGGATCAAACAACTACATCGAGGCACTAGTTGAGAATCCGATTACTGATTTTCGGTCGCGGTTCGATTGTTGTTTCCTGTGGACCGATGTTGCTCTGCCTGTTCTGTACAAGTACATCGCGAAACGAGTGGATCAAATGGTGGAGTTAGGGTTAGTGGAAGAAGTTCGTGAGATGTTCGTTCCTGGTGCTGACTACAGCCGCGGAATCCGCCGCGCAATCGGCGCTCCAGAGCTAGATAGTTACTTCAAAGCAGAGAAGAACAACGAAGAAGAAACTTACAAGAATGATCTACTGAAATCGGGGATTCATGAAATTAAGGAAAACACCTGTAGACTGGCGCTCCGTCAATTCGGAAAGATCCACCGGCTGAGAGATGAGATCGGTTGGGGACTCCACAGGATCGACGCAACGGCGGTGTTTGAAAAGAGCGGAGAAGAGGCGGCGGATGAGTGGATGAATGGGGTTCTGAAACCGAGTTTGGGGATCGTTGGAGAATTCTTGAACGAAAAACAGAAAATAAATCAGATGGAAACGATGACGAAGAACCGATCAATGGGGAGTCAGAAACCCCACCAGGCGTTGTTGTCGTTGCTGAATCGATCGGCAGAATCTGAGGATTGA MGKINNMKDNGVEYLSNKKHKIVFVMGSTATGKSKLSVDLATFFPSEIINSDKIQFYKGLDIITNKINQSDRRGVPHHLLGVIHDPDADLTAGEFCSLVEDAIADVISRGCLPIVVGGSNNYIEALVENPITDFRSRFDCCFLWTDVALPVLYKYIAKRVDQMVELGLVEEVREMFVPGADYSRGIRRAIGAPELDSYFKAEKNNEEETYKNDLLKSGIHEIKENTCRLALRQFGKIHRLRDEIGWGLHRIDATAVFEKSGEEAADEWMNGVLKPSLGIVGEFLNEKQKINQMETMTKNRSMGSQKPHQALLSLLNRSAESED* Homology
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. NCBI nr
Match: KAE8646129.1 (hypothetical protein Csa_016307 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 649.8 bits (1675), Expect = 1.2e-182 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_004148309.1 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 2.9e-168 Identity = 299/310 (96.45%), Postives = 302/310 (97.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. NCBI nr
Match: KAA0036515.1 (adenylate isopentenyltransferase 5 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13465.1 adenylate isopentenyltransferase 5 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 2.0e-156 Identity = 275/294 (93.54%), Postives = 285/294 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_008447303.1 (PREDICTED: adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 1.3e-155 Identity = 274/294 (93.20%), Postives = 284/294 (96.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. NCBI nr
Match: XP_038888774.1 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 543.9 bits (1400), Expect = 9.5e-151 Identity = 268/294 (91.16%), Postives = 281/294 (95.58%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID2 (Adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 5.9e-79 Identity = 145/269 (53.90%), Postives = 191/269 (71.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93WC9 (Adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 2.8e-73 Identity = 146/269 (54.28%), Postives = 188/269 (69.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID1 (Adenylate isopentenyltransferase 7, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 1.0e-70 Identity = 141/287 (49.13%), Postives = 187/287 (65.16%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5GHF7 (Adenylate isopentenyltransferase OS=Humulus lupulus OX=3486 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 241.5 bits (615), Expect = 1.3e-62 Identity = 132/304 (43.42%), Postives = 183/304 (60.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID3 (Adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 2.5e-61 Identity = 135/295 (45.76%), Postives = 184/295 (62.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K7L1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G253720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 1.4e-168 Identity = 299/310 (96.45%), Postives = 302/310 (97.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CPK4 (Adenylate isopentenyltransferase 5 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold179G00270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 9.5e-157 Identity = 275/294 (93.54%), Postives = 285/294 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BH37 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489774 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 560.1 bits (1442), Expect = 6.2e-156 Identity = 274/294 (93.20%), Postives = 284/294 (96.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4L3 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470933 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 3.4e-130 Identity = 232/291 (79.73%), Postives = 259/291 (89.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLR3 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455496 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 473.8 bits (1218), Expect = 5.8e-130 Identity = 232/294 (78.91%), Postives = 260/294 (88.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. TAIR 10
Match: AT5G19040.1 (isopentenyltransferase 5 ) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 4.2e-80 Identity = 145/269 (53.90%), Postives = 191/269 (71.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. TAIR 10
Match: AT3G63110.1 (isopentenyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 2.0e-74 Identity = 146/269 (54.28%), Postives = 188/269 (69.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. TAIR 10
Match: AT3G23630.1 (isopentenyltransferase 7 ) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 7.1e-72 Identity = 141/287 (49.13%), Postives = 187/287 (65.16%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. TAIR 10
Match: AT1G68460.1 (isopentenyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 1.8e-62 Identity = 135/295 (45.76%), Postives = 184/295 (62.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G023250 vs. TAIR 10
Match: AT3G19160.1 (ATP/ADP isopentenyltransferases ) HSP 1 Score: 225.7 bits (574), Expect = 5.3e-59 Identity = 124/288 (43.06%), Postives = 178/288 (61.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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