CsaV3_7G019900 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_7G019900
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionProtein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like
Locationchr7: 9139399 .. 9149132 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_7G019900
SyntenyCsaV3_7G019900
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGTGCACGTGAGGTTGCGTTGGATGAGATTAGAGGTTCTCCAGAGGATTCCTACAAGATGATCGCCAAATTTGCATACATGTTGAATCTTAAGAATCCAAGTATATTAATAATATACCTAACGACCTATGTAATATATTTGTCATTAACAAATTGTTGTTCTTTAATGTCAATATTTGTTATGTTCATAGGCTCTATTGTTGAATACCGAGTCGATGCGGATGGTAGATTTCTATATTTCTTCATGGCATTATATGCTTCTATTGTTGCTTGGCAACATTGTCGTCTAGTCATATCTATTGATGGAACAAGCATGAAGAATAAGTATGAGGTACTCTTTTAACTGCTTCAATTCCTGATGCCAACGATCAAATTTTACCACTAGCATTTTGTGTTGTCGATTCTGAAAATGATACCTCTTGGACGTGGTTTTGCAATCAACTAAAGTGAATCATTGGTTGTAGGAATGACATTGTGATAGTATCTGACCGACATAAAAGTATATGTAAAGCGATAGAGGTAGTATTTCCCAATGTTCTACATTGCATGTGTATGGTTCATTTACTTAGGAACTTGAAGTTGAACTATAGATCAATAGTTGATATCGTGTTCCATGCATGTGGCAAGACTTACAATGTTGTTGATCTTGAACAACAAATGCGTTTGTTGGAATCTAATGCACTTGGTATACGTGAGGAGTTACAATCGATTGGATTTTCAAGGTGGTCTCGTGCCTACTCACCCCTTAGTAGATATAATGTCATGACTACCAACATATCTGAGAATCTAAATAATGCAATTATCAAGGCTAGGGAGTTGTCAATATGTTCAATGTTTGAGGTATTGAGAATGATGCTGCATATGTGATTTTTTTATCGTAGAAATGAAGCAGCCTATCAAGTTATAGATTTTACAAAAATTGTTGAAGGTATTATAAGGAAACAAATTGAAAATAGTCGATCTATGGAGGTATATTTAACTTATAATCTAAATATATATTAATATATACATCTTATTATCTAATATATACCTAATTATCTTCTACATGTAATTATCTATGTAGGTCAATCCAGTCAACAATATGAAATACTAGGTCATCCATGACACATCTCAATATGTTGTGTACTTGCCTTCGAAGATTTGTACTTGTAGGATGTGAGATATATTGCAAATACCTTGTGCGCATGCATGCACTGTTCTTACCGTAAAATATTTGTCAATAAAACCGTTTGTTTCACATTATTATTTGAACAACACACTAAGTTCAATCTATAAAGAATTAATAAACCCGTTAGGTGATCATCGACAATGACAAGTACCTGATGATGTTTTATCCATTGACATCCTGTCACCTAATGTAAAACGTCCATTAGACCCAAGAAGATTAGAATCCCTTCTAAATTGGAGTTCAAGAGACTGATAAAATGTGGCCGTTGTGGGCGCTATGGGCATAACAGAAAGCGATGCAAGTTTTTCTTATCTAGCTAGTTTTTCATTGTATTTTATATTATTGTTTAAAAAAAATTACGTTTATTATTCAATTTGTTTTAACTTTACGTTTATTTAAGATTTTAATTTAATTATTTCTATTTTTTATTATTGTATTTTATATTATAATTTTTTATTATTTCCATATGCACTACCACTACCATTGTTATAACATTTAAATAAATATAAATTGCATACTATCACATATAAGAATTACAACTTGTTTCAAATATACTTATAAGATTTATATTGAACATTTTATTTTAATTCAAACAATAATTCCATGAACAATGAACACCATGTAACAACATACTACATCATATAAATAATAATGACTTTTACGTCTTTGTGATTGCAGTGCACCAATTAATCAGAACGAAAAGTACATGTAAATGATTACAGAAATTGATTTTTTTCTTTATTACATAACCTTCAACATTAACTATATCATATTCAAGTGAAAATTACTAAATTCTTTGTGATAATAAAAAACAAATTATTATGTTCTCTCTAATCATACACCTTCCCATACAAATAAAATTTATATAACTTCATCAAATTGCTATAACATTGGATTGAATATAAAAAACATACCATCACTTATAAGAATCACAACTTGTTCCAAATATACTTTTAAGATTCATATTGAGCGAAAATTACAACAATTAATCTTTACGAAAATTACAAGTAAATGAATTCAGAAATTAAAGTTTCTCTTCATCACATAACCTTGAACATTAACTCTATCCTATTCAACTTAAAATTACTAAAGTCATTGGGATAATAATTTGAAACTTGGACCTTCAAACCCTTGATTGGTGATCTCTAACTTTTCCTTCTTTGGCTTGGCTGATCCAAATTTGGTTGTGAACGATGACCTAAATATTTTTTATGGATGATTTCCTTTCCTTAGGCTCCTCCTCACTGATTGTTTGGAAGCAAAAATCTCTCTTTCTCTTTCCTAATTAATCATCTAAAAAATATCATGGTATATAGATAATAGATGTCATATATTTCGAACATTTTTCTTATACATCTTTAGTTTTCACAGCTCCTCTTTGATTAATATGTTTTTCCCCAATTTCTTGGTTTGCAATAAACATTATAAACTTCATTTTCAGTTTATCATTTAATTCATAAAATCACTAATACATAAATGATTTAAGAAATGTAATAACCTTGCTTCTTTTTCTATTTGTTCTACTTCCTTTAGTAGAGTTATGTTGTATATCATGTCATTTACGCTCTCGTTCTGTCCATCCTGTCAATCAAGAATACATACACAATACTAAATATATAATTTACATACGTGTTTAAAAAAAATAACTATACATATACTAGTCATAACATCATACCCTTCCAGCTTCATTTTCACTATTTACTATTGTAGTTATGTCATCTTCTTCATCCATATTTATATTTTATGTATTACCATCTTCTCCATCGTCCACCAATCTGTCATCTCTTTCACCGTTTCCTCCATCATGATCCTCATCCCTATCTTCCCAAGTTTCTTCTTCAGTCATTGAACTACTTCTATTAGTCAATTTATTTTTTATCTCTTCAACCTCTCTAATGAGTTTGTCCAGCTTCTTATTTAATTTTCATTGTTTGCCAACATAATTTCCTGGAATGTTAGGAAATACTCAGGAATCTGAGTGTTAATACCCTTATATTCTTTAGAGCATTCTCATTTTTCAAAATTTCTGGTTTCAGTACCATGGAACATACTTCCTTCCACGACATCTTCATCAGAAAACAACTCCTTAAACACAAACTAAAATTTCAAAAGTAGTGTACATAAGTATATTTGCGTACATAGTATATATACATATTGAATTTGAATATATTTCAATTTAGTTAACTTCGTTCATTACCCGATTAGTGTCAAAGACCCTTTCAGCCAATTCCTTTCATTTTGGATGTGTGTCAACAACCCAGTTTATCATGCATAAATTGCTATCACCAACTCTTTTAGCACAGAACATGGACGGTCCACTCAATAGTGGTATACATTCATATGCCCATACTAAAATTGCATAAGCAAATCTAGAAATACTTACTGCTAGAGCTGAAGGGTTTTTCATAGACTTCTTTATTGAATCTATCTCAACATCTACCCCTGTTGTTAATTGTTTTCTATGAAATAAATTTTTGTCAACTTCACTCTATCTTCATCTTTTACTTTCTTAGAGTCGTTGAAGATATATGTCGTCAACCTTGACCTCGATATAATATCCTCATTTTTGAAATACTTTCCTAAAAATCAACCTTCAGTTTCTCCATGTTCAATTGTGGTAAAGGACCACAATTCAAACCAGTTGTGGCTTCATATTCCCTAATTCTAAACTTAGCTATATTACCTTCAAAGTTGAACCAAAGTTCGTCGTCCTTGGTCAAGGCACATTGTCGTCTTATGATATGAAATAGCAATTGACTTTGAAATTTAGTTATTTTTAGATCAAGGAAATTACTAAACAGAGAACTCCTAAACATCTCTATTTGCTCCCTATTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTTTGTAATAACATCTAGACGTGCATATATACTAAGTTTCTATGATCTAGACCATTTATTCCTTTTCAGGATTAGTGGTCCAACCTGCAAACATTAATATTAAGACAAGTTAATATTTCTGCCTTATTATATCTATTTGACAACATATATGATATATGACAAAGAACCACATTCAAATCATTATTTGCATCCCTCTTTTATGCATTCCTATTTTTTATTTTTGCTTTCTGTTCACAATATAAATATTCATTACAATATAATTAATCATAATTATAATTTAGATGATGGACAAAATTATATATATGAGTATATCACAATATACTCCACCATATAAAGAATATATTATATCTATTTGACAACATATATGATATATGAGAAAAAATACATCCTTCAAATCGTGATTTGCATCTCTCTTTTCTGCAGTCCTATTTTTTATATTTGTTTTCTGTTAACATTATAAATATTTATTACAATATAATAAATCCCAGTTATAATTCATTGTATGCATCAAATGATATATATGAGTACATAAAAAAAATACCTTTTTTGATTCTACACTTTTTTTTAGTCTTTTTGCACTTTTGATTTCTTTGTTGTATTTGATTTCTCTACACTTCTTTTCAAAACTTCTTGTACTTTTGTTTTCTTTTCAGTATGTCCTTGTTTCGCTTTGTCTGCATCTGACAACTTTCTCTTATTTTTATGAGATTCCTGAGATTTTCTTTTTGACTTTTTCATTTATGTATATTAACTTTCTTTTAACTATCAATACATTATTTTGTCAAATATACATCATATATGTCAAATATACCTATAAGTAGTTAACAATAATAACAAAAGTGATATTGCTTCCATTTAAATATATCTCATCAGATTCATCACTTTCTTCGACGGGTAATTCAGTGTTCTTTGATCCTTCTGATTTCTAATAGAACATCATATACCAGTACATTACTAAGTATACCTCTTGTCACAGCCTATTAAGTATACATCTTTTTTATAAAATATATACAACAATGTTTATATACATACATATTAACTAAACTCTCTTAACATTAGGTTTACAAAATATATACAACAATTAACTAACCTCTGTTTCTTGTGCATCCAATTTCTGAACTGGCATTTCTACCTTTATTTTTCTTTTACTTGCTAAGTTTTCATCGTACAGAACAATTTGAGTGTCATTTGGTCCTGTTATATCATATTCATCCTCACCTGGGTACACTGTTTGTATATGTTTGTAATCCATTTGATTTTCTTCATAAATCTCTTGAGAACTTGATATCTTTTCATCCTATGATATAGATGAATACAATATAATTAAAATATATTTGCATATCAAACATCAACAAAGTAACAAATTATAACAATTAATCTTAAATATACCTCATAATCATCGAGAAGGATTGAATTATCTTCGTTTGTTCTTGATTTTTTCATCCTAGACCCAAGACATCTTTCACTTCGTCTTACCATTTTTTACACTGCCAGCATTTAACATATGTAAAGCACGTTGCATTGTCAAATAAGTTAAAGAAACTTAGAGTACCAAATGAACTCAAACTACATTTCAGTTGAGCCCCAAAACTCATAATCTCAATAAACACAAGAGTATGTCACAATAAAAATTACATTTTTGCATTTGCTCAACAATTAGAACATTCAACATATACTAAATGAACATTTAAGATATACCCAATATCTATAGGAAAACCCTCATGCGACGATCCTCTTCACTTCGAAACCTCAATAAAACCTAGGATATAACAAATGCAAAATTTCATTTTTTTTCGTTGCCTTATCAGACTAATATCTTTAATCTATGTAATATACAAAATGTATACTGTTTATTGAATATATACAATCTAACCTCGTATTTTTCGTCCGTCGGTAAATAGAGAACTGGTCGCCGAAAACGGATCCCACTTCATTGTCGAAATCGATGAAACCCTTATTCTTTGAGTCGAAAACAGAATCATCGAATAATTTCTTCACTGTCGAAATTGAATTGATTTTTTTGAATATGGAAAGTGGTGAGAAAGTGAGAAACCTTTCCACCACTTTTCTATTTTAATGACCCACGATCTTCTCCGATTTTCTATTTTAAAATAATTCTGTATATTGTGTGAAAAAACTATCATATGAGTATATTTGTAATTTGGGCCTATTTTATGTAATATTGTGGCCCATTTGATACATTTGTGTAAAGTATTAGCAATTTGTGTTTTTTAATATCCTCGGGTAAATTAGACTATATGAGTTAAAAACCCTATTTTTAATTATTATCATTATTATTATTTTATTATAATTATAATTATTTTATTTTTAGTATTAATAATAATATTATTATATTTATTATTTTATTATTTTTATTTTTATTGCTCTATCTATGTATCTATTTACCTCTCTCTCTATATATATATGCTTTTAAATTCCCTTTTGTATATATTTTAAGCAAAATTTTGAACTTGTAAAAGGGTACAATGTTACAATATTAAATGTTTAAAATAACAAAATCCACAAAAAAAATAATTTTTTTTGTAAAATTATTTTTATAAAATTAAAAAAAATGATTTACATTTATTTTTCAATCACACACATGTACACACAATCGGTTTATTATTGATTTATACCATATCCTTAAATTTGTCCTTTCATCTCTTATTACCTTTATTTTTAATAACAAATCATTTCTAATTTTCATGAATTTGAAATTACTAAATATTTTCTTTTGTAACAAAATAAAACATTTGAAAATTGAATCTATACAATATCAAAATTTATAAAGTTAAAAGAAAAAACCATTAAAATATCAAAAGATAATTAATTTTATTAAAAACGAAATAAATTAAACAATAAAATTACGATTTAAGAGATAACACTGTTTTTTTATAAATTAAATAATTAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAAAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAATAATAATAATAATAATAATAACAACAATAATAATATAACAACAATAATATTTAAAAAAGAATAATAATTTATAAAAATAGGACCCACCACACAAAATGACAAAAAAATCCACCTCTCACCCAAATAGTTTTGAAAACATCCATTTTCCAATTTTTTTTTTCAAAACATCCATTTTTTTTCAAATAACATCATATAAAATGTCAGTCATTTGAAGCGTTTAAAAAATATCATTAAATTTAGAAAAATTAAAAAATACCCTTACCTCAATAAAGTTAAAAAAGTTGGTATTTGAAAAAAAAAATCATTAATTTCTCAGGACAAAAATCAATTTTAAAAGTTTTTAAAAGTTAAAAAATGCCCGTAAAGGTTAATATGGGACCGATTTAAATTGAATAAAGTTTACTGATTTTGATTTGAAATTAATCAAAACACTATTTTTTAACTCAATTTAAAAGTAAAGGATATTTTTATACTTTTGAAACTTGAGAAACATTTTTTTTACACAACTAGTAATGTACAATTTTTATAATTTAGTCATTTTCTTTAATACCTTCGTAGTTGCAAGGTGTCATCCATCTATTGATCATATATATTCCAATTACAAATTCGAAGGGCATCGTGCTTTTTTTAAAAAAAGAATGGCCATTGTTAAGATATACCATTAAGGTTCTCTTTCTCATTCTTCATTTTTTCTCATTGTATCAATGACCCATTATACACAAAGCCTCATCTTCCAAAATTTGTCTTTACCTTGTATTAATTAGTCTACTGTGGGTGTGTTCATTGTAAGAAGTCTTCATCCCTGCTTTTCTAATTATATGATGATTGTTACCAATATCAAATAATAAGAAGGAAAACCAAAGTTTTCTCTTTACAATTTTAACATGTGATCAGAGAAATGATGTCTAGTCTCATGACTTTATTCCTTTTTTTTTTTCCAGCTTTGGCCGCTCCATAGCTATGTTTTTCAAATGAGTTCTTTTATTCACTCAAGGATGAACACCTCTTCATCTCTTCTCAGTGCCGACTCAACTAGTGGATCATCATCCATCTCATAG

mRNA sequence

ATGGCGTGCACGAACTTGAAGTTGAACTATAGATCAATAGTTGATATCGTGTTCCATGCATGTGGCAAGACTTACAATGTTGTTGATCTTGAACAACAAATGCGTTTGTTGGAATCTAATGCACTTGGTATACGTGAGGAGTTACAATCGATTGGATTTTCAAGGTGGTCTCGTGCCTACTCACCCCTTAGTAGATATAATGTCATGACTACCAACATATCTGAGAATCTAAATAATGCAATTATCAAGGCTAGGGAGTTGTCAATATGTTCAATGTTTGAGCTTTGGCCGCTCCATAGCTATGTTTTTCAAATGAGTTCTTTTATTCACTCAAGGATGAACACCTCTTCATCTCTTCTCAGTGCCGACTCAACTAGTGGATCATCATCCATCTCATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTGCACGAACTTGAAGTTGAACTATAGATCAATAGTTGATATCGTGTTCCATGCATGTGGCAAGACTTACAATGTTGTTGATCTTGAACAACAAATGCGTTTGTTGGAATCTAATGCACTTGGTATACGTGAGGAGTTACAATCGATTGGATTTTCAAGGTGGTCTCGTGCCTACTCACCCCTTAGTAGATATAATGTCATGACTACCAACATATCTGAGAATCTAAATAATGCAATTATCAAGGCTAGGGAGTTGTCAATATGTTCAATGTTTGAGCTTTGGCCGCTCCATAGCTATGTTTTTCAAATGAGTTCTTTTATTCACTCAAGGATGAACACCTCTTCATCTCTTCTCAGTGCCGACTCAACTAGTGGATCATCATCCATCTCATAG

Protein sequence

MACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFELWPLHSYVFQMSSFIHSRMNTSSSLLSADSTSGSSSIS*
Homology
BLAST of CsaV3_7G019900 vs. NCBI nr
Match: KAE8646011.1 (hypothetical protein Csa_015433 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 255.4 bits (651), Expect = 2.8e-64
Identity = 132/132 (100.00%), Postives = 132/132 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 1   MACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAY 60
           MACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAY
Sbjct: 1   MACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAY 60

Query: 61  SPLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFELWPLHSYVFQMSSFIHSRMNTSSSLL 120
           SPLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFELWPLHSYVFQMSSFIHSRMNTSSSLL
Sbjct: 61  SPLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFELWPLHSYVFQMSSFIHSRMNTSSSLL 120

Query: 121 SADSTSGSSSIS 133
           SADSTSGSSSIS
Sbjct: 121 SADSTSGSSSIS 132

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. NCBI nr
Match: KAE8646163.1 (hypothetical protein Csa_015903 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 3.0e-34
Identity = 77/91 (84.62%), Postives = 83/91 (91.21%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+SIV+ VFHACGKTYNVVD EQ+MRLL+SNA GIREELQSIGF RWSRAY PLS
Sbjct: 64  NLKLKYKSIVNTVFHACGKTYNVVDFEQEMRLLKSNAPGIREELQSIGFLRWSRAYLPLS 123

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           RYNVMTTNISE+LNNAIIKAREL ICSM E+
Sbjct: 124 RYNVMTTNISESLNNAIIKARELPICSMLEV 154

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. NCBI nr
Match: XP_008450197.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491857 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 142.1 bits (357), Expect = 3.4e-30
Identity = 66/91 (72.53%), Postives = 82/91 (90.11%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+ I+DIVFH+CGK +N+VD + +MRLLES+A GIREEL+SIGF++WSRAYSP  
Sbjct: 211 NLKLKYKRIMDIVFHSCGKAFNIVDFKHKMRLLESSAPGIREELESIGFAKWSRAYSPRR 270

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           RYNVMTTNISE+LN+A++KARELSICSM E+
Sbjct: 271 RYNVMTTNISESLNSAMLKARELSICSMLEV 301

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. NCBI nr
Match: KAE8648359.1 (hypothetical protein Csa_023101 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 1.3e-29
Identity = 71/90 (78.89%), Postives = 76/90 (84.44%), Query Frame = 0

Query: 5  NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
          NL L YRSIVDI+FHAC K YNVVD + QM LLESNA  I EELQSIGFS+WSRAYSPLS
Sbjct: 9  NLTLKYRSIVDILFHACDKAYNVVDFQHQMHLLESNAPSICEELQSIGFSKWSRAYSPLS 68

Query: 65 RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFE 95
          RYNVM TNI  +LN+AIIKARELSICSM E
Sbjct: 69 RYNVMGTNIFGSLNHAIIKARELSICSMIE 98

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. NCBI nr
Match: XP_008452162.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493267 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 6.4e-29
Identity = 65/94 (69.15%), Postives = 81/94 (86.17%), Query Frame = 0

Query: 2   ACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYS 61
           A  NLKL Y+ IVD VFH+CGKT+N+VD E +MRLLES+A GIRE+L+SI F++WSRAYS
Sbjct: 327 AIKNLKLKYKRIVDTVFHSCGKTFNIVDFEHKMRLLESSAPGIREKLESIDFAKWSRAYS 386

Query: 62  PLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           P  RYNVMTTNISE+LN+A++KAREL ICSM ++
Sbjct: 387 PRMRYNVMTTNISESLNSAMLKARELPICSMLKV 420

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN44 (uncharacterized protein LOC103491857 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491857 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 142.1 bits (357), Expect = 1.6e-30
Identity = 66/91 (72.53%), Postives = 82/91 (90.11%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+ I+DIVFH+CGK +N+VD + +MRLLES+A GIREEL+SIGF++WSRAYSP  
Sbjct: 211 NLKLKYKRIMDIVFHSCGKAFNIVDFKHKMRLLESSAPGIREELESIGFAKWSRAYSPRR 270

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           RYNVMTTNISE+LN+A++KARELSICSM E+
Sbjct: 271 RYNVMTTNISESLNSAMLKARELSICSMLEV 301

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BT85 (uncharacterized protein LOC103493267 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493267 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 3.1e-29
Identity = 65/94 (69.15%), Postives = 81/94 (86.17%), Query Frame = 0

Query: 2   ACTNLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYS 61
           A  NLKL Y+ IVD VFH+CGKT+N+VD E +MRLLES+A GIRE+L+SI F++WSRAYS
Sbjct: 327 AIKNLKLKYKRIVDTVFHSCGKTFNIVDFEHKMRLLESSAPGIREKLESIDFAKWSRAYS 386

Query: 62  PLSRYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           P  RYNVMTTNISE+LN+A++KAREL ICSM ++
Sbjct: 387 PRMRYNVMTTNISESLNSAMLKARELPICSMLKV 420

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPY6 (uncharacterized protein LOC103502914 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502914 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 7.7e-28
Identity = 63/91 (69.23%), Postives = 79/91 (86.81%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+ IVD + +ACGKT+N+VD+E +MRLLES+  GIREEL+SIGF+ WSR+YSP S
Sbjct: 162 NLKLKYKRIVDTISYACGKTFNIVDIEHEMRLLESSVPGIREELESIGFANWSRSYSPHS 221

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFEL 96
           RYNVMTTNISE+LN+A++KAREL I SM E+
Sbjct: 222 RYNVMTTNISESLNSAMLKARELPIYSMLEV 252

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VBR6 (Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold90G00840 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 1.0e-27
Identity = 63/90 (70.00%), Postives = 76/90 (84.44%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+ IVDIVFH+CGK +N+V+ E +M LLES+A GIREEL+SIGF++WSRAYSP  
Sbjct: 73  NLKLKYKRIVDIVFHSCGKAFNIVNFEHEMHLLESSAPGIREELKSIGFAKWSRAYSPRR 132

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFE 95
           RYNVMTTNISE+LN+ + KA EL ICSM E
Sbjct: 133 RYNVMTTNISESLNSVMPKAMELPICSMLE 162

BLAST of CsaV3_7G019900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C7C0 (Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold606G00880 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 132.9 bits (333), Expect = 1.0e-27
Identity = 63/90 (70.00%), Postives = 76/90 (84.44%), Query Frame = 0

Query: 5   NLKLNYRSIVDIVFHACGKTYNVVDLEQQMRLLESNALGIREELQSIGFSRWSRAYSPLS 64
           NLKL Y+ IVDIVFH+CGK +N+V+ E +M LLES+A GIREEL+SIGF++WSRAYSP  
Sbjct: 43  NLKLKYKRIVDIVFHSCGKAFNIVNFEHEMHLLESSAPGIREELKSIGFAKWSRAYSPRR 102

Query: 65  RYNVMTTNISENLNNAIIKARELSICSMFE 95
           RYNVMTTNISE+LN+ + KA EL ICSM E
Sbjct: 103 RYNVMTTNISESLNSVMPKAMELPICSMLE 132

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8646011.12.8e-64100.00hypothetical protein Csa_015433 [Cucumis sativus][more]
KAE8646163.13.0e-3484.62hypothetical protein Csa_015903 [Cucumis sativus][more]
XP_008450197.13.4e-3072.53PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491857 [Cucumis melo][more]
KAE8648359.11.3e-2978.89hypothetical protein Csa_023101 [Cucumis sativus][more]
XP_008452162.16.4e-2969.15PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493267 [Cucumis melo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3BN441.6e-3072.53uncharacterized protein LOC103491857 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491857 PE=... [more]
A0A1S3BT853.1e-2969.15uncharacterized protein LOC103493267 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493267 PE=... [more]
A0A1S3CPY67.7e-2869.23uncharacterized protein LOC103502914 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502914 PE=... [more]
A0A5A7VBR61.0e-2770.00Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E... [more]
A0A5D3C7C01.0e-2770.00Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 27..47

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_7G019900.1CsaV3_7G019900.1mRNA