CsaV3_7G018470 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTCTCGATGCATTTTCAAGTTGTTACTCATATGCTAACAAGGTCATACAACTATCTTTTTTCAACACTAATTCTCAAGTAAGTCCAAACCTTTCATTTTTGTTTGTTATGTTTGGATCAAGTGGAACATAAATGATAGTAGGTTTATGACTTGTTGGGTGATCCACTCTTATTGTTTATTATGGGAAATCGAAATCCACCTTTTTGTTTCTAATTGTAACTAATCTACTTTGGTCTCTTGACCAAAAAGAAAACACAATCTATTATTCAATAGAAAATAACTCAACAAAGGCTGGCTGTGAGGTATTTTGACTTGAAGAGGCAAGATGAAGCCTCAAATGGTGAATTAAAAACATTTTAAAATTCTAAATTGGTACGATAAAGTACAATTAAACATGAGAACACACAAAAGCGGAAAGAAACCTCATAATTTTCACTTAACAAAAAATTTTAAAGGATATGTAATTTCGTCATTACTAATTCTATTATTATCATTAATAAGTTTGATTTATTCTATAAATTGTCTTCAATATCTTTAGAGCACAATTGTAAAGGAGATCCTAGTTCATATTGCCACAACTCAAAACTTAATGTTTTTTTTGAAGAATTAGGCTAATCACTATTTGTTCCGTTTTACTATCCTCTTTAAACACCATTACATCATTCTTCTTCCTTTTTACTATCCTTCTTAAACATTGTTGGATGGTATTGTTTGATGAGGAAACTTTTAGAGATTTTTCAATTCATTTCTTTGAGAAGGATGTAGATTAAGAAAGCACATCAGGATGTTTCTTTGAGAAGGATGTAGATTGAAAAAGCACATCAGGATGTTGGGTTTAGAGGTTTATGGGTTTAGGGGTTTAGGATGTAGATTGAGAAAGCACATCCTAACACATTCTTTAGTATTTTAATTTTATTGCAGTACATTATATTTAATCTTCATTTTTCTTGGCTCTGCTGTAAATGGTGTTTCTTCTATTGTAGATTTGCATTATACAACACTGCCATATTATGTCATAAAGTTAGGAAAATTAGAAACATACCCTTTGTAGGAGAGAACTTGATCCTTCCTTTGAAGAAAATTGAGAGAATTTCCTGTGAAGAACAAGGATGAATAATCAACAAAAACGGAACGAAGAGGTTTCTCGTTTAGGGAAAATAGTGATTTCTCGTTTTTCATACTTCCAAAAAGACACAAGTATGAACTTATTGTTAGATAAATTGATCGAGAGGCCTTCCAATTGTTTGTTAATCTATAGTTTCTGTCTCTATTTTAATTAACTGCTACAGGGAGAAGCTTAACTACATGGTTAGAGTTATATCAAAAAAGGAAAGAAAAAAAAGAAGAAGAAAGAACATGTGATAAATTTATAGAAATGCCATGGAATAATGTTCTAATGTTTAATTTCTGTTTCTGTGTTAAATTACTGCTACTAGAAATCTAATTGTGTTTAGTTAGTTAGACTTTATGGGTTTGAATTTTTAATATCCGACTCTGCAGGCTGTGATGCTGCTATTCATGTGATTGTAAAAATAGAAAGTGTATACTCCATACCAAATTTGCATTCAATTATTACAGCTTCTGATGGGGTGATTGTTTGAATTTTTTCACAGCTTCGTTAATGTTGAATTTCATTAAAAGGTTTTCAATTTTGTTGATAGTCTGGGGCTTGGTTGCTAATTGAAGAACATTATTTCTTTTCATTTTAGGCAATGGTTGCCAGAGGTGATCTTGGTGCAGAACTTCCTATTGAAGAGGTTCCTCTTGCAGGTAGTTAAGTTTTCCAATAATAATAATATTAAAAAAACCAGCGATCTTTTGGGTACCCTAGATAACTTTTCTAATTATCTTAAATTCATGTCTTTTTTAGGCCTATGCAAAATTGGGAAGTTTTGGTTTCATGTTTAGATATATATACATGTTGGGAGGAATCAATATGAAATTCAGCATTTGGGTTGTTTGCTTTTGACTAGATCGGGATTGAATGGTGTGGTTCAGCTTGTTTGGCTCAATTAAAAGATTATTAAGCACTTGTTTAATCAAGCTGATTTTCTGTTGTTGCTGTTTCCAATTAATTTAATAGCATGAAGCTTTCTCTTACTTTTTAGCTACTTTATGCATAAAGCTAATTAAAGTATTCTTTGGGTATGCTTCATGTTTTGTTGACTATGTTGAAAAGCTACCAATTTAAAGCTTCTAAAAACTATCTATCTTGAGTTTAGACTTGTTTCATCTTTATTCATATTGATGAATATTCTAACATTCAGGCTTTGTCTGATATTAATAATTCAGACTTGTTCCAATTTCTTGTTCTATGTTTATTAGTGGTTGGTTGAATTAAAGTATAGTATTGAAGTCTTAGGGTGGTATTCAAGAGTTATGATTTAAATTAAAATTCCACTTTAGACTATATACTTCTCAGGAGATATAGTTCTTATCAATGTTTTTATCAAATCCCACTGTGGCTGCTTGTGATGCTGGTCTTCCGGTCACAGGAGATAAAGTTGGAATGGGGCAAGGGCTTAGCTAAAAACCGAAAAGCAGAAGTTGAACTTATGGAGTTAGAACTCGAGAAAGATAGACCATTTGCACGGTCAAGGTAAAACTGAGCATTCTTAGTTTTCAATTTTATTTATACTTCTAGAATATCAAATAAATTAATTGGAAGGATACAAAGATTATTTCTCTTACCGGTGTGCCACTCTATTAGCTACATGTTGAATGGTTTAGGAAATGATACTCTCCAGTTTTATGTTTATTATCTTCTTTATCCTCTTTTAGTTAATTGCTAAATTTGCAACTATCCCGTTTAGTTAAAATCACAGTCGGTCCCTCCATAAAAATGAAAATTCCTAAAATACCTCTTTCCCCAAAATAAATTGGTTCCTCTTGTCGTTGTTCTCTTTCTGTTCTCCTCTTTTCCTTATCCCCTTTCCTTTCTCCCGTCGCCTTCGTTCTCTTCTTACTCGGTGTATAGTGAATGCAATAAGTTATTTTCAAACCTCTAAGTATTTTACGTATGTAAATCATAGCCCCCCTCCCTAGATTTTTGTGTAATTTGTGTTAAATATTGAGGACCCAGTTCAGTTTATTAGACAAGCTTGATGCTTCATTTATTTCCTGGATTGATGGCTAATGAAAAACTTCTGGTACACTTCTTCAACCCTCTTTAAGTTGTTTCAGAGACCTTAGCTTCACACAATTTGTACATTGAGATAATGGTCTATTAATTTGTGAATTATATACATAGAATAACAAATATTATTTCTTTCAGCAGTGGGATAATTGTTATGCTTTATAGATATATATATATTTTTGAAGTTCATTGTATTTTCTTCTTCCAACTACAAGTTGACATGATTGTCTTGACAGATGGAAGTCGTATTCTTGGCCTCCGTGACCTTGGAGTTTAGGGAATAGGAATACCTACAGGAAAGCTGGATATGTATGTTGCTGCTGCTGCCATAAACCCTCAAAGAGTATGTTTTTCTTAGACAAGCTCAACGCCCTCCCTTCATCAAATGGTTGTTTATCCAACTTGATTTTCATCGGTTGTGGCTATTGTTTTAATAGTTTATAGGATCGCCTGCATTCAGATTGTTTTATCTTCTCATGTTGGGCTACTACCAAGCAATGTTTTAAGCGAAGGGTGGATAATAGCTCACTTGTTTGGTCTAAACTTGGGGGATTTCAAATTTTGTCCAAATTTCAAAATTTTTCAAAAGTTTTTCATTACAATAATGAGCATCATAGCTTCTTAGATCTTGCATAAAAGGCATGACTGTCACACCCTTGAGCACTAAGCTCGGGTTTGTGACGTGAGATTCTGAATTTTGATGAGTATATGTACTGAAATTTGAGAATAAGCTTATGTCCTTTTTGTGTTTGCTAAGTTTCAACTAATACTCTCAGTATTTATCTTTGTGCTTATGTGATAGATTTGTTATGCACTGTAGTGATGTGGGGTGTTACCTTATTTTCTGCATCTTAACTACCTTATTTTCTGCATCTTAAATACCTTATTTTCTGCATCTTAATTGGTACTGAAATTTGGTTTGTTTCAGTGAAAGAGGCACTATCAGCATTGACATGTACATGTGATTTTAAGCAAGAACCAGGAGAGTGAGAGTTTTAGTGTGCCGTATTTAGAATTTGTCGATATCTTTTTCCCGTTCCAACAAGTATTCCTGATAGTGGGGGTAACTCTCAAGTCTGCAGTCTTTTCTTCATGAAATTTGTAGATTATCTAAGAATACTAATATCATTTAATGGTGACATTTTTTAGCAACTTTTCTTAACCACACTTTTCATTAAGTTTGCTCTTGTTTAATTGACAGATTCTTCCAGTAATGCTAGATATTGGTTCTAACAACAAGAAGTTACTTAATGATCCTCTTTGTAAGTGAAAGGTAAACCTTCATGTCTTTTATCTCCATATTTTCCTTGTAATGTATTGTGCTTATATTGCTCTGTTTCTGTTGTCAATGACGATATATCTGGGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGTGGTGGTGGTGAAATATTTTATTTAAGCCTCTAGTTAATATTTATGCTTACTTAACAGAAAGTTTGTTGCTTGACTTGCTTCATTTCGTCCTTTTACTTGTTTAAGTCCTCCAAAAAGTATTCATTACTTTAATAAATTCCCTCACCAGCATCATCACCTCTTAGTCAACAAACTGTTTTTTCCCAAATGCAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAAGATAAAGACAATCAAGAACAACCATCAACAACATGAATAAAAAAAAGAAGAAAAAGATAGCTACTGAAAAACGTTACTACCCATTTTCATTATCATAATCCTCTACTATGCTTTTCCACCTTCTAACCCATTTTTCCATTGCAGGATTTATTGGAGTTGAGGAGTCCCACAATCTTTATGTTCTGTTTGTTTCTCCATCACTTGTTCAAGGCTGTTCAATTGGAGTTCCATCTTCAGGTAATATTAATGTGT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BLAST of CsaV3_7G018470 vs. NCBI nr
Match: KAE8645975.1 (hypothetical protein Csa_023811, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 2.2e-35 Identity = 81/81 (100.00%), Postives = 81/81 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. NCBI nr
Match: XP_031745848.1 (NAD-dependent malic enzyme 62 kDa isoform, mitochondrial-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 3.6e-14 Identity = 45/46 (97.83%), Postives = 45/46 (97.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. NCBI nr
Match: KAE8652983.1 (hypothetical protein Csa_023955, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 1.4e-13 Identity = 47/54 (87.04%), Postives = 48/54 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. NCBI nr
Match: KAE8650964.1 (hypothetical protein Csa_001464, partial [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.8e-09 Identity = 33/35 (94.29%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. NCBI nr
Match: KAE8652990.1 (hypothetical protein Csa_023490 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 1.0e-08 Identity = 33/35 (94.29%), Postives = 35/35 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHR8 (BUD13 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.5e-07 Identity = 30/36 (83.33%), Postives = 33/36 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VKV1 (BUD13-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold602G00590 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.5e-07 Identity = 30/36 (83.33%), Postives = 33/36 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTH5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G428990 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.5e-07 Identity = 30/36 (83.33%), Postives = 33/36 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPM1 (BUD13 homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022658 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 3.5e-07 Identity = 30/36 (83.33%), Postives = 33/36 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6D2ID10 (Uncharacterized protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MERR_LOCUS13889 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.3e-06 Identity = 29/36 (80.56%), Postives = 32/36 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. TAIR 10
Match: AT1G31870.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cytosol, nucleus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF2050, pre-mRNA-splicing factor (InterPro:IPR018609); Has 13303 Blast hits to 9618 proteins in 489 species: Archae - 8; Bacteria - 444; Metazoa - 7153; Fungi - 2294; Plants - 942; Viruses - 128; Other Eukaryotes - 2334 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 9.8e-10 Identity = 27/36 (75.00%), Postives = 32/36 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_7G018470 vs. TAIR 10
Match: AT1G31870.2 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cytosol, nucleus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF2050, pre-mRNA-splicing factor (InterPro:IPR018609); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 9.8e-10 Identity = 27/36 (75.00%), Postives = 32/36 (88.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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