CsaV3_7G008080 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_7G008080
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr7: 5054574 .. 5058095 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_7G008080
SyntenyCsaV3_7G008080
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAGCAGAAGCAGAAGCAGATACCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGCTTCGGAAATGCGAGTGCCTCCTCCTTACTTCACTTTATTATTATCCAAAACCATACCTTCTCTTTTTATATATCTTTTAAGAAAGTGAAAGATGTGAGCATTCAAAGATGCAAAGAAAATAACACAGTAAACCATAATAAAAAATAGAGTTTGGTTGAAAACTTTTAGAACTACATCAGTTTTGTATTATAAATTGGGTCAAAAAATGTAATCTAAATATAGTTTTAGATTATGTTACATTACATAACACCCCCTAACCATTTGTTAATGTTGTGACGTTTAACTTGATGTTATTATAACTTTACTCTCTAGATTTGTAAGGTTCATTTTAACATCTTACAATTGTTGTGCTAAAAAAACATTTAATTTGTACGGTCACAAAGGAGCCTATATCCAAACCTAAGAGTGCTCAATTCGATTCACTATTGTTTTGTTATGATTACAATTGAAAAACTACACTTTTGACATCTTCGTTTTTGTTACTATTACCGTTATTGCTTCATCCTATAAGGTAGGGGTAACGATAATAAAAATAATCGATAAATTCATAGGATTTGGTGGAGTAATATAAGCATTTGGTGGTTTAAATTCATAGGATGCCGTATTTCCCAACACCTCGATGGTGAAATACTCTTTTATTAACGCCCTCCCATGTCTCGGCCACTGCCACTGCCACCACCACCCCCTTCTATTTTCTTTTTTCAATGCAACAAGATTTATGTTCTAATAGGGGACATATTACATCTTTAAATTTATATTTGTTACATCTACTTTTCTCATTCTTTTAAGTTATTTCTAGTATTAAAAAATTATTTTTATATTATCCACCTCCATGTAATTATTAAAAATGATAAGAATCAAGATAACGTCGGAGATTTGTTTCTCTATTCTGTACTCAAAAATAGTAAATATTATAAAATGTTTACAACGTGATAGTTAGGAGCATGTAGCTATGAAGTCTATAAAGAATTGTAAACTCCTGAGACTCACATTATAAGGAGTTGGTAAGATATAAAATCGATGTCTTTAGTGTGATACCCACAAACTCCTTAGTCTAAACTAGGAGTACTTCTCTACTCCTACTTACAAATTTCTTGGACCAAACTTATCTTTACAGATTAATATTTCAAAACAAATACAATCACTTTCGATGAAGGATATCTATGTTTCCAAAATGAAACCTATTTTTCATCCTCGAGATTTAAAAAAAATGATAATTGTAATTATACCTTAGGTTTTGGAAATGTTAAAATTTGATCGTCAAACTCAGTCTAATACTAGAAATTGAAGCGTAACTCGAAACTTGGTTGGTGTTTGGAAATTTGACAAGTGATTGTGAATTAGTATTGAATAACTTGAGGGATAAGGTTAGTGTCAATGTCAAAAAGAAAAGCAAAAAAGCAAAAAACGCTATAAAACAAAGAAGATTTCGATCATCTTAGGAATTGCTTTTGTAGTTTGCTCTTCACTCGATAACCTTCAAACTCCTAAACACTCACTCTTCGTTGTATCAATGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCGATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGTTTTCCACTCTGTTCCCTTTTCCTATTCGATTTCGAGAATTGATCAGAATTTGTTCATAATTTCTTTTCAATCCACTCCAGAACTATCTATGCTTTTACGCTGCTTTGAATTTTATCGTTCGATGTGATCCATGCGTTCTTCGTTGAATTGAATGAGATGGGGCTAGAACTTTTGCATTGGTGGGTTGGGAAATTAGTGCCAACAAGTAAAGAATGCAATGCTCCTTTTTATATGGATTTGTGTTTCTAGGTTTTCTCTTTTGTTATTTTTGATTTAAGCTTCTAACATTTTCGGATCATTGGTATATCATTGAGAAGTTTCGATTTCTTTGAAAGATTTATTAATGCGCAATAATTTGGTGCATGCTACGATGAACCGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTAGTAATTGCTTTCTTTATTTATTTTTGGTAGTTAAAAAAGGTGTCGTTGTAATGTCCATGAGTTTGTTTAATTTAATGTATTCTTACTTTCTTGTGCTTTGGGAATCTTTTTATCAATTCGATAATTGTTTTGGGTTTTTTTATAATTAATTTATTGGGGTTGCTATCATGAAGAAAATGGGTTTTGAAAGTTCACTTGTTCCGTTTTATGTTTAGCCAATTGAGTGAAAAAAGGAATAAGGAGATTTTCAGTGTAGTGTTGGGGTTTTGAAAATGTTTTGGATTGAATTTCATTCTTTGCTTACTGCTGGTAGAAAATGAAAAACCCTTTTCCTTTGAGATTTTAGTTTTATCCCATGATATCGATTGCTTTTTATTATTGTACACGGATTTTGTTAATGTAATGTTGAATCCGCGTTGTATAAATGTTGAATTCTTAATGTGTCCAATTGTTTGATTCTTTATGATTAATGCCGTGAATAAGTTATTGTTGGCATTCTTCTTGGAGTATTACCCAGAAGACAGCTTCAAACTTGAAGACTCTTAATTCTGTTGTAGCAAAAATTGTAAAAAGTCTTGGTCTTAGTTCACACCATCCCTGGATTAGGATTCTTCTGTTTTTTCGCCCCAAACTCATTGCATTTACACTTTTTCAAGCATCATTTTCATCCTATATCTTTCGCTATAATGATTGGTGATGCTTCTAATATGTCGTATCGGACGGTGTGAGAGGAGGGGAAATGAACGATAATCCAATGAAATTCTCAGAAATCGGTTATTCATGTAGTTGCTTGTGTTAGCATCTTGGTGGCAAGGGCTACTTTCTACCAGGGTCCTATTTTAAAGATCCTAAGGTTAAATAATTCTATAATTTTAAACTCTTGTTGTCTTTTAGAATTGGTCTTGCGGTAGGCAAAGCCTTGCTCGGGATTAGCAAAATATCAGTTTTGAGGAAGATAAGAAAAGGCAAAAGTTTGTAGTTTTTTGTTGGTGTAACAGTAATGATTATTTCAGGTTTAGCTTAACTTAGCATTTCATGTCCTTGTATGGTTTTATAGCTTAACTATCTTTTTCTTTGTAATTGTCTCTCATTTATTTTAAACTTTGACAATATTTCAAGGTCAAGTTATCTATCTTTCTTGACCTCCTGATTCTGGTTAGGAATTAGGATAGTGTTTGAAAATTGACTGATACCGTGTAGTGCAACTTTGTTGAATAGCCGAGATTGTCGACGTTATCAAAAGAGTGCAATCAAGCTCTAAGTGGTGACTCCTTGATTGATGTCTAACACTAGACAATACTAGTAGCTGGAAAATACATCGGTTTTGGAGAATTGTCTGTTATCACTGTCAACCATTTCATTACTTGTATGATACAGGGCTGTAGAAATTCTTATAGGAACTTTTAACCTTCTTCTCGTTCGTATGGTTTGATTGGTTGATTGATTTCAGGATCCATAGTTAA

mRNA sequence

GCAGAAGCAGAAGCAGATACCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGCTTCGGAAATGCGATTTGCTCTTCACTCGATAACCTTCAAACTCCTAAACACTCACTCTTCGTTGTATCAATGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCGATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGATCCATAGTTA

Coding sequence (CDS)

GCAGAAGCAGAAGCAGATACCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGCTTCGGAAATGCGATTTGCTCTTCACTCGATAACCTTCAAACTCCTAAACACTCACTCTTCGTTGTATCAATGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCGATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGATCCATAGTTA

Protein sequence

AEAEADTIAIAIAIAIAPLSPYSASEMRFALHSITFKLLNTHSSLYQCNEDLPWLLRSIPPFYQPRSFRIHSX
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_7G008080 vs. NCBI nr
Match: KAE8645849.1 (hypothetical protein Csa_023854, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 143.7 bits (361), Expect = 6.4e-31
Identity = 72/72 (100.00%), Postives = 72/72 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  AEAEADTIAIAIAIAIAPLSPYSASEMRFALHSITFKLLNTHSSLYQCNEDLPWLLRSIP 60
          AEAEADTIAIAIAIAIAPLSPYSASEMRFALHSITFKLLNTHSSLYQCNEDLPWLLRSIP
Sbjct: 1  AEAEADTIAIAIAIAIAPLSPYSASEMRFALHSITFKLLNTHSSLYQCNEDLPWLLRSIP 60

Query: 61 PFYQPRSFRIHS 73
          PFYQPRSFRIHS
Sbjct: 61 PFYQPRSFRIHS 72

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_7G008080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8645849.16.4e-31100.00hypothetical protein Csa_023854, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_7G008080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_7G008080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_7G008080 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_7G008080.1CsaV3_7G008080.1mRNA