CsaV3_6G033590 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_6G033590
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 18533524 .. 18535518 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_6G033590
SyntenyCsaV3_6G033590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCGGTATATATTTATTTCATTTAGAGGTTTCTATTTCATACACAACCGCCGACTTCAACATGTATATATGTCTATGCTATTTATGTTTAAATCATGTAATATTGATAATTTTTTTAATGTAAACACAAAAATCTTACCTATATTTTTCTCTCTCTCCTCTTTAATTTTTCTACTAAAATTATTTTATTAATAAAATGATTGAATGACTTGTACTTTAGTTATGTTAAAACAATGTAAATATTATTAAAATTTATTAAATATACATAAAAGGTAATAAAATGAAGCAAGAAATATTAAAGTCCTTCGTTTAATTCTTTATTTACAAAATCATTAAATGAAATTATGAATTCATGTTTATAATTTCATATTTTCAAAAGAAGTATGATTTGGGTGAATATTTTATCCTTTCATTGTAATTTTTTTAGTCTTACTTTAGCCACAATTTTGTCATTCACATAGATTGAATGTGTGTGGTCATTTTCACATTAAACAAAATAAAAATTACATTTCGTTAATTAATTTTTCATTTCCTCGTTAAAAGAAAAATGTTTTGATTCCATAACGGATATTAGTTAATGCTCTATGTTATTAGGGGCTTAGGGCTACAATGTAACTTTTCTATATGTTATTTACACAACTAAATTTTTTTTTATCATACTTTATTCAGATATATATAGATTAGATGGTTAAGTTTGGATAGTATAAGCTTAAAATATTAAGAAATAGAATTTAAATGGTGAAAAATGATACATTGGAAGGATGTAAATATAAAAAAGATATAAATATGTAAATGTTGAAATGATTGTTGTTAAATTAAAAATTTTATTGTTTATTGCTATAACTAAATGGCTCATTTTCGTAGCTTTCAAGTCTCACGTGCTCCACCCTCTCCTATTTCTTTCCGTTTAGCATCTCAGTTCCGCCGCTGCCGTTCTTCGGTTCGTGCTCGTACAGCATCCTATCTAACGGCTCTGCACTGATTGGTATTCTCCCAATCTCCATCTATCTCTGTCTCCTCACTCGAATAACGAAAGAATGGAAGATTTGTATGTATTATCATGAATTTTCCAGCATCTCCCTTCTCAGTCGAAGTAATTCAATTATCTTTTAATCACAAGCACGTCCGGCGGCTATCTTTTAATTGACCGAACAACCTCAACAATATTTCTATTTTGTATATTTGTTTAACCAATGATGGTCTGAATTTACTGAATATAAAAGCCTTCCTAGTTCCTTATGCTTCATACTTGATACTCCACCCTCCATTTATTCTTCTTCTATTGCTATTATTATATTTCTATAGTTGATTGTGTCAAATTAGAGTCTGTGACTGTTTTGAATGATAGCTGGACGTGTTTCGATTGATTTTTTGTATTGAAAATGTTTATGTTTTGGTTTTGTTACTTCTGACTAATTGGAGAAGTTTTATAGCTCCATTGGTTTGGGCATGCTGTCTTTTTTCGTGTGTGTGTGTGTAAATTTCATACATCAATGAAATTTGTTTCTTATAAAAAAGATGAAAGGTTTGGATGATTTGATTTGATGATTTCTTCTGCTGAGATTGCAATTTGAAACTGTGTGTTTTGTTTGAAATGTTTATGAATGATTCGGATGCCAAATCGATGGTGTAGTTGTCTTTCCGCTTGCTAATTAAAACAAAGTAATAAAGTGTAAGTGAACTTTCTTTTGGGCCTGAATATCGAACTCGATTGGGAAAACACCAGGACGGGCCAAAGAAACAGTTGGTTGGGATGAAATGTTAATTACTAATTCTGAGGAAGTTAATGAGGTTGGACCTTAATTATTGAAAGCCAAGGATTTTTTTTATTAAATACAACTTGCTTTTCATTTTATGGATGGAGTTCAACTCTTTGTTTTTGGTGCTGTTTTTAGGTCAGTTTTTGTTTAATCTCCCAGAAATTTTTTATGAGTGAGTGTCTAGATAGCTTATGCCTACCTTGATTAATTTCAGTCAGAAAGCAGATGTATTGA

mRNA sequence

ATGCCGCTTTCAAGTCTCACGTGCTCCACCCTCTCCTATTTCTTTCCGTTTAGCATCTCAGTTCCGCCGCTGCCGTTCTTCGGTTCGTGCTCGTACAGCATCCTATCTAACGGCTCTGCACTGATTGGTATTCTCCCAATCTCCATCTATCTCTGTCTCCTCACTCGAATAACGAAAGAATGGAAGATTTGTATGTATTATCATGAATTTTCCAGCATCTCCCTTCTCAGTCGAATCAGAAAGCAGATGTATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCTTTCAAGTCTCACGTGCTCCACCCTCTCCTATTTCTTTCCGTTTAGCATCTCAGTTCCGCCGCTGCCGTTCTTCGGTTCGTGCTCGTACAGCATCCTATCTAACGGCTCTGCACTGATTGGTATTCTCCCAATCTCCATCTATCTCTGTCTCCTCACTCGAATAACGAAAGAATGGAAGATTTGTATGTATTATCATGAATTTTCCAGCATCTCCCTTCTCAGTCGAATCAGAAAGCAGATGTATTGA

Protein sequence

MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKEWKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. NCBI nr
Match: KGN47643.1 (hypothetical protein Csa_018274 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 1.7e-38
Identity = 84/84 (100.00%), Postives = 84/84 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE 60
          MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE
Sbjct: 1  MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE 60

Query: 61 WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY 85
          WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY
Sbjct: 61 WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY 84

[Close]
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KDN4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G366410 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 8.0e-39
Identity = 84/84 (100.00%), Postives = 84/84 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE 60
          MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE
Sbjct: 1  MPLSSLTCSTLSYFFPFSISVPPLPFFGSCSYSILSNGSALIGILPISIYLCLLTRITKE 60

Query: 61 WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY 85
          WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY
Sbjct: 61 WKICMYYHEFSSISLLSRIRKQMY 84

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN47643.11.7e-38100.00hypothetical protein Csa_018274 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KDN48.0e-39100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G366410 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CsaV3_6G033590 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_6G033590.1CsaV3_6G033590.1mRNA