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CsaV3_5G026060 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACCATTGCAGAAAGTGAAGAGGTGCTTAATATTCTTCTTTGATGTTCTCTGGATATTGAAGATCTTGCAACTTTCTTCTTAATGGTTATAATTAGTCAGTAAATGTTTTATTGGCACTATGCAGGTTGGTTTTAAGCGCATTGGGCTGTCAGCTAGTGATTATGAGGCAAATATTCCTATCAAGAAAAGGAGATTTCCGGGAGTGCAATTAACTCCATCACCATCTAAAGATATATCTTCATTCCATTCAGATGGAAATTTATTGAAGGTGGAGCAGCCATCTCCACCTAAAGATGTATCTTCCTTTAATCACAATGAAAATTTAATAAAGAGTGAGGAGCCGATTCTATCTGTGACAACAGTTTCAAGTTCTAGTGTGGTTACAAGTTGTGCATTGTCGAACAATAACCAGGACAGTGTTTCTGAAGAGAAGAAAGGAAAATCTGATACGGATTCATGCTGCGTGGATATAGTCCAAAGCAATATTGGAGCAGCAGGAGTCAAGTTTCAAGAACCCAGTTTGGGAAGACATGCTTGTACTGATGGTTTTGTTGAATGTGAAGGTAAGTCATTGGTAACTGTAGAACATACCGATCATGCATCACCAGTGATCTGTGCGGGGTTGAAGTTGTTGTCAACTAGCCTTGACTCTGATCATTTTGCTGGTAACAAAGAGGAAGAAATTGATGTAAAAATGCCTGAAGAAAATTGCAGCCCTCCAATTTGTCAACTTGGAGGAGCTGGAGTATTGGTAGGTTTGAAGGGACATATGGATCTGAAACTAGTTTCTGAAAAGAGTGATTTGAATTTCCTGAAGCAGAATTCTATGGAACCTGTGTTACTAAACTTCGCTTTAAACAAGCAGGGAAGTAGCACCCAATGTGTCAAAGGTAACGTAGGGTTTGATTGTGATGGTTCTTTTTTGCAGTCGAACAGGGAAAAATGGGATCTAAATACTTCAATGGAATCATGGGAGGGTTGTACTAGTGGTGATGCTCCTGTAGTGCAGATATCGGCCACTCGGACAAATACAACTATTGAAACTTATTCTTGCTCATCTGAAATGGTTGAAAGTGACAGTCCATGTGGAAAACAAACCCTTTTAGATAATGAAGATAAAGGTGACTCTACAAAAGAGCATCTTCATTTAAGTCTTGATTCATCTTATCTGAAGTCTGTGCTTGATGAAGACCCTTACATTTCTGAATATGAATCAGATGGCAACTGGGATATAGCTGAGACTGTTGATGATAATGATGATAATGATGATAATGATAATGATGATAATGATAATAATGTAGAAGAAGACTATGAAGATGGGGAGGTCCGGGAAACAATGCAGGAAACTGAAGTAGAGGTCCATGTATATGAGAAAAGAGAAATTGAGCCTTTGGATCATGCTGGTTGTAACGACAAAAAGATCAATTCTGTTGGATTGCTGGATCATGAATTTTTTACTTTAGGCCCTAAGAAACAGGAAACAAAATTAGAAAATCTGGATTATAGAAGTGAAGATGAAGATGAAGTTCAGACCACAACTAAAAGTAATTCTTATGAGCAAGAAAATGAAGATCTTTGTGTGAAAGAATTGCATGCTGTAGAGAATGCTATTGGTGAGGATGTAAACATATCTGCGAAGGCCACAGAAAGAAGCCAATTATCTCAATATGATAAAAAGGGCAACTTTGAGGGACAGGGCACTGCTGACAAAATCCTAAATGAGGAACCGGTTCCTACATTTTCTCAGAATGAGGTGGAGAATGCTGTAGCAGTAGATGTAGTGCAGAATAGGGATCTAACTTTGCCTACTGTAAAGGAATCTGTAAACGAAGATAATGCAAAGGATATCAATGGAGGCACTAGAAATAGTCGGATAATTAATTTTAATCGAACATCTACTGATTCAACTCCTTGTAAGGCAAAATCTAATTTTGCTAAGCCGGTTTTATCACATAAGGATAGAGAGTTTGTACCCAACATGGTAGTTGAACGAGCAAATATGAAACCTCAAGAAAGGTGATTATCAGTTACTTGATTTCTTCTATTCATTTTTCTTTCTAAACTTGTTTTAACTGCTCTTATGTCTATGTTTATCTTGTCTTTTTCTCTTTTTGCTAGAGATGACGTGTACAGTAATATTTCCAAGAAAATTTCTATAGACAAACGCCAGGGTCCACCACCGTTGATGGGTTTTAGTCATAGACGAGGGAGAAATACTAATAGGTTGGACAACCGATCCGAGGAATGGGATTTTGGTCCCAACTTTTCTCCTGAAACATACAGTGAACAACAGATAGATTACCATGTTACTGGTCTTGATCAAAACCGATATAAGATTATACCTGATGGTCCATTTGGTGGCGCTAACCGTCGTGGTCGAGAATTGGTAGAGGATGAGGAACCTTTTTTTTTCCATGGGCCCTCAAGGAGGAAGTCACCTGGAAGAAGACATGGGCACAGTGTACGAGGTGGAAAAATGGTAAACAGAATGCCTAGAGATTTTAGTCCAGGTAGATGCATGGATGAAGGTGGCTCTTTTGATAGACAACATGGTGAAAAGTTCACTAGGAATTTTGCTGATGACACAGTGGATGAGATGTATCCACGACCTCAACCTCCATATGATGTAGACAGACCTTTTTTTCGAGAAAGAAGGAACTTCTCATTCCAAAGAAAAACTTTTCCCAAAATTGATTCTAAATCTCCAGTAAGATCCCGAGCTCGTTCTCCCAGCCAATGGTTCTCTTCAAAAAGATCTGATAGGTTTTGTGAACGTCCCAACATGACACATCGAAGATCTCCAAATTATATGACAGACAGGATGAGATCTCCTGATCAGCGTTCTATACGTGGATATATGCCAGGCCAAAGACAAGGATTCCGTTACCTTTCACCACCTGATGAATTGAGAGATGTGGGTCCTGCACCTGACCATGGCCATATGAGGCCTTTTATCCCTAACAGGAATCAAACTAAAAGATTACCACTTAGAAACAGAAGCTACGATGCTATAGATCCTCGAGGAAGGATCGAGAATGATGGACTTTTTTATGGTCCTGTACGTTTGGGTCAATTGACTGGGTACAATGGTGGCGAACCAGATGACGATGAAAGAAGATTTAATGAGAGACATGAACCTCTTCATTCTTTTAAGCATGGATTTCGTGATTCTGATGGTGAGAGATACCGAAACAAGGGGGAGGATTGTTCTAGGCCATTTAGGTTTTGTGCAGAGGATGACCCAAGAATTTCATGGAAGAGAAGGTAGTCAGGGAGAAAGACTGAGTTAAGGATCTCTACCAAGGGAGTGGAGAATGCTTTAGACTAGGCCATTCTGTTAGTTTAATTTTGAGGTTTTGTAGGTGATATTTTATGGTGCAAAGGGGGCCACTTTTTGTTCTCCTTTGTTTTATTTCATAATTGCAACTGTAAAAAAATTCCATTTCTATGCAGAAAGTATACCTCTCAAGTGCTATTGTGACTTCAAACTGACTAAACCACTATGGAAATTTTGTTCTCTAAAACGTTAGAATCTTACTTATTATTCTGATAGAGAAATTCAGTTGAGAAGGGAAGTAGATCAAGTGGGGTTGTTTCCCTTTCTAATCTCCACAAATGGTTTGCAATTCTTTTAACAAGTGTTATTAATTTGTTCTTTTAATACCAATGTATTCACTGATTTACTATTGAATTTGATAGCCATTTCTAGATCGTTGAAGCGCAAGGGGAGGATATCTCTAAGGTATTCTTTTCTTGGACCAAGTTACATTCTACTCTTCTATGCCTTCTGTTACTGTTCTACTTCAGTACTGAAGTTGGACCTTGGTCAGTTGGTCCTCGAAATCGTTGCCCGCTAACCCAGTTCTGAATCGGCAGTAGGAGATTTTGGATCTGCTCTTGTCACGAAGGTTAGAGGCTTTGGCTTCTGAGGCTTTGAATTGGAAGGAAATGTGAGAGAGTTGGGGAATTGCAGTGAGGAGATGGAATGGCCCCCATGGAAGGTGACACATGAGCTTGAGGATAAACTCACCCCTCTGTGCTTGCTATCACCGTTTGGACCTTATATTGCTGCTTTTTCTTTTTGTATTTTTTTTACATTCTTTAAGTTAATGGGTTTCTTTCTTTCTCTTTTTTTTATTTGAATAAAATAAATTAATGATTTCTATTTGTTTTGTTATATTTTTGTATATATATGTGCGTATATTACATAGGTCCTTATAATTTTGAAAATTGATTGTTTTTGTTTAACCTTTTTTAATCTCATTTTTTAATACCATTGCAGGCCATGTTTACCAATCCATAATGGATGTATATATATCGATAAAATCAACAACTTTCACTGGGAAAAAAATGAAAGAATACAGGGTATACGAAAACACAAGCCCACCCAAGCGACCTCCTAAAGAAAGGGTTCCATCTAAGCAAAATATTATCTAGTGAGTAGTTATACAAAGGTTTTGAGTTCAAGCCCAAAGTGAAACCCGAAGCCTCACTAATAACCAAACCTACTAGGGTGGTTATCCAAACCTCTAAAAATCCTATTGCTTCTCTCCCCCCAAATGTCCCACAACACAGCACATCTCGGAAAACACAACAAACAGCCTCTCTCTGGAAAGCAAATGGAGGACGAACTCCCTGATCATTGCCCGAATACCCCTCTGGTGATAATTAGAACGCCAAACTTTTGCATGAAACAAATCCACACAGACATTGCACATTGACATCCCCAAAGAAGGTGATCTAGGTTTTCCTCTACCTCCTGACAGAGAATACAACAGAAAGGACCTATTAATGGGGCCATTTTCCAGTAAGCCTATCAAAAATGTTCATATGACCAAGTAGAACCAGCCAGGTGATGAACCCAACTTTCTTTGGGTATCTTAATCCTCCTGACTGCATCAAAGACTGAGTCACAAACAGGAAAGGGAACCAACAGCAACATAAAGAAAGAATATTAGTGTCATCGGTAATTGGAGTTCATTGATAGATCA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ATGACCATTGCAGAAAGTGAAGAGGTTGGTTTTAAGCGCATTGGGCTGTCAGCTAGTGATTATGAGGCAAATATTCCTATCAAGAAAAGGAGATTTCCGGGAGTGCAATTAACTCCATCACCATCTAAAGATATATCTTCATTCCATTCAGATGGAAATTTATTGAAGGTGGAGCAGCCATCTCCACCTAAAGATGTATCTTCCTTTAATCACAATGAAAATTTAATAAAGAGTGAGGAGCCGATTCTATCTGTGACAACAGTTTCAAGTTCTAGTGTGGTTACAAGTTGTGCATTGTCGAACAATAACCAGGACAGTGTTTCTGAAGAGAAGAAAGGAAAATCTGATACGGATTCATGCTGCGTGGATATAGTCCAAAGCAATATTGGAGCAGCAGGAGTCAAGTTTCAAGAACCCAGTTTGGGAAGACATGCTTGTACTGATGGTTTTGTTGAATGTGAAGGTAAGTCATTGGTAACTGTAGAACATACCGATCATGCATCACCAGTGATCTGTGCGGGGTTGAAGTTGTTGTCAACTAGCCTTGACTCTGATCATTTTGCTGGTAACAAAGAGGAAGAAATTGATGTAAAAATGCCTGAAGAAAATTGCAGCCCTCCAATTTGTCAACTTGGAGGAGCTGGAGTATTGGTAGGTTTGAAGGGACATATGGATCTGAAACTAGTTTCTGAAAAGAGTGATTTGAATTTCCTGAAGCAGAATTCTATGGAACCTGTGTTACTAAACTTCGCTTTAAACAAGCAGGGAAGTAGCACCCAATGTGTCAAAGGTAACGTAGGGTTTGATTGTGATGGTTCTTTTTTGCAGTCGAACAGGGAAAAATGGGATCTAAATACTTCAATGGAATCATGGGAGGGTTGTACTAGTGGTGATGCTCCTGTAGTGCAGATATCGGCCACTCGGACAAATACAACTATTGAAACTTATTCTTGCTCATCTGAAATGGTTGAAAGTGACAGTCCATGTGGAAAACAAACCCTTTTAGATAATGAAGATAAAGGTGACTCTACAAAAGAGCATCTTCATTTAAGTCTTGATTCATCTTATCTGAAGTCTGTGCTTGATGAAGACCCTTACATTTCTGAATATGAATCAGATGGCAACTGGGATATAGCTGAGACTGTTGATGATAATGATGATAATGATGATAATGATAATGATGATAATGATAATAATGTAGAAGAAGACTATGAAGATGGGGAGGTCCGGGAAACAATGCAGGAAACTGAAGTAGAGGTCCATGTATATGAGAAAAGAGAAATTGAGCCTTTGGATCATGCTGGTTGTAACGACAAAAAGATCAATTCTGTTGGATTGCTGGATCATGAATTTTTTACTTTAGGCCCTAAGAAACAGGAAACAAAATTAGAAAATCTGGATTATAGAAGTGAAGATGAAGATGAAGTTCAGACCACAACTAAAAGTAATTCTTATGAGCAAGAAAATGAAGATCTTTGTGTGAAAGAATTGCATGCTGTAGAGAATGCTATTGGTGAGGATGTAAACATATCTGCGAAGGCCACAGAAAGAAGCCAATTATCTCAATATGATAAAAAGGGCAACTTTGAGGGACAGGGCACTGCTGACAAAATCCTAAATGAGGAACCGGTTCCTACATTTTCTCAGAATGAGGTGGAGAATGCTGTAGCAGTAGATGTAGTGCAGAATAGGGATCTAACTTTGCCTACTGTAAAGGAATCTGTAAACGAAGATAATGCAAAGGATATCAATGGAGGCACTAGAAATAGTCGGATAATTAATTTTAATCGAACATCTACTGATTCAACTCCTTGTAAGGCAAAATCTAATTTTGCTAAGCCGGTTTTATCACATAAGGATAGAGAGTTTGTACCCAACATGGTAGTTGAACGAGCAAATATGAAACCTCAAGAAAGAGATGACGCTTACAGTAATATTACCAAGAAAATTTCTATAGACAAACGCGAGGGTCAGCCACCGTTGATGGGTTTTAGTCATAGAAGAGGGAGAAGTAGCAATAGGCTGGACCACCGATCCGAGGAATGGGATTTTGGTCCTAACTTTTCTCCCGAAACATACAGTGAACAACAGATAGATTACCATGTTCCTGGTCTTGATCAAAATCGATATAAGATTACACCAGACGGTCCATTTGGTGGTGCTAACCGACGTGGTAGAGAATTGCTAGAGGACGAGGAACCTTTTTTTTTTCATGGGCCGTCAAGGAGGAAGTCACTTGGAAGAAGACATGGTCCGAATGTAGGTGGTGGAAAAATGGTTTACAAAATACCTAGAGATTTTAGTCCAGGTAGATGCATGGATGAAGGTGGCTCTTTTGATCGACAACATGGTGAAAAGTTCTCTAGGAATTTTGCCGATGACACAGTGGATCTGATGTATCCACGACCTCAACCTCCATACGACATAGACAAACCTTTCTTCCGGGAAAGAAGGAACTTCTCATTCCAAAGAAAATCATTTCCAAGAATTGATTCTAAATCTCCAGTAAGATCCCGGGCTCGCTCCCCAGGCCAATGGTTCTCTTCAAAAAGATCTGATAGATTTTGTGAACGTTCTGACATGACACATCGAAGGTCTCCAAATTATAGGTCGGAAAGGATGAGATCTCCTGATCAACGTCCTATACGTGGGCATATGCCACCAGGCAGAAGACAAGGATTCCATTTCCTTTCAGCATCTGATGAAATGAGGGATGTGGGTCCTGCACCTGACCATGGCCATATGAGGTCTATTATCCCTGATAGGAATCAGACTGAAAGATTACCACTTAGAAATAGAAGCTATGATGCTATAGATCCTCAAGGAAGGATTGAAAACGATGATTTTTTTTATGGTCCTCCTGTACGCTTGGGTCAATTGACTGGGTACAATGATGGCGTACCAGATGACGACGAAAGAAGATTCAATGAGAGACATGAACCGCTTTATTCTTTTAAGCATCCATTTGGTGATTCTGATGGTGAGAGATTCCGAAACAATAGGGAGGATTGTTCTAGGCCTTTTAGATTTTGTCCAGGGAATGACCCAAGAATTTCATGGAAGAGAAGGTAG MTIAESEEVGFKRIGLSASDYEANIPIKKRRFPGVQLTPSPSKDISSFHSDGNLLKVEQPSPPKDVSSFNHNENLIKSEEPILSVTTVSSSSVVTSCALSNNNQDSVSEEKKGKSDTDSCCVDIVQSNIGAAGVKFQEPSLGRHACTDGFVECEGKSLVTVEHTDHASPVICAGLKLLSTSLDSDHFAGNKEEEIDVKMPEENCSPPICQLGGAGVLVGLKGHMDLKLVSEKSDLNFLKQNSMEPVLLNFALNKQGSSTQCVKGNVGFDCDGSFLQSNREKWDLNTSMESWEGCTSGDAPVVQISATRTNTTIETYSCSSEMVESDSPCGKQTLLDNEDKGDSTKEHLHLSLDSSYLKSVLDEDPYISEYESDGNWDIAETVDDNDDNDDNDNDDNDNNVEEDYEDGEVRETMQETEVEVHVYEKREIEPLDHAGCNDKKINSVGLLDHEFFTLGPKKQETKLENLDYRSEDEDEVQTTTKSNSYEQENEDLCVKELHAVENAIGEDVNISAKATERSQLSQYDKKGNFEGQGTADKILNEEPVPTFSQNEVENAVAVDVVQNRDLTLPTVKESVNEDNAKDINGGTRNSRIINFNRTSTDSTPCKAKSNFAKPVLSHKDREFVPNMVVERANMKPQERDDAYSNITKKISIDKREGQPPLMGFSHRRGRSSNRLDHRSEEWDFGPNFSPETYSEQQIDYHVPGLDQNRYKITPDGPFGGANRRGRELLEDEEPFFFHGPSRRKSLGRRHGPNVGGGKMVYKIPRDFSPGRCMDEGGSFDRQHGEKFSRNFADDTVDLMYPRPQPPYDIDKPFFRERRNFSFQRKSFPRIDSKSPVRSRARSPGQWFSSKRSDRFCERSDMTHRRSPNYRSERMRSPDQRPIRGHMPPGRRQGFHFLSASDEMRDVGPAPDHGHMRSIIPDRNQTERLPLRNRSYDAIDPQGRIENDDFFYGPPVRLGQLTGYNDGVPDDDERRFNERHEPLYSFKHPFGDSDGERFRNNREDCSRPFRFCPGNDPRISWKRR* Homology
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: KAE8648526.1 (hypothetical protein Csa_009072 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2058.9 bits (5333), Expect = 0.0e+00 Identity = 1023/1023 (100.00%), Postives = 1023/1023 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_031742263.1 (uncharacterized protein LOC101204083 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1933.3 bits (5007), Expect = 0.0e+00 Identity = 966/1023 (94.43%), Postives = 993/1023 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: TYK05750.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold98G002390 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1758.0 bits (4552), Expect = 0.0e+00 Identity = 886/1024 (86.52%), Postives = 937/1024 (91.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_008463540.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008463541.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008463542.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1756.5 bits (4548), Expect = 0.0e+00 Identity = 886/1024 (86.52%), Postives = 936/1024 (91.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. NCBI nr
Match: XP_008463536.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008463537.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008463538.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1744.9 bits (4518), Expect = 0.0e+00 Identity = 880/1017 (86.53%), Postives = 930/1017 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KU39 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G504130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1931.4 bits (5002), Expect = 0.0e+00 Identity = 965/1023 (94.33%), Postives = 993/1023 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C339 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G002390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1758.0 bits (4552), Expect = 0.0e+00 Identity = 886/1024 (86.52%), Postives = 937/1024 (91.50%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJI4 (uncharacterized protein LOC103501669 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501669 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1756.5 bits (4548), Expect = 0.0e+00 Identity = 886/1024 (86.52%), Postives = 936/1024 (91.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJG6 (uncharacterized protein LOC103501669 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501669 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1744.9 bits (4518), Expect = 0.0e+00 Identity = 880/1017 (86.53%), Postives = 930/1017 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KNM2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G503580 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1708.0 bits (4422), Expect = 0.0e+00 Identity = 875/1074 (81.47%), Postives = 927/1074 (86.31%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G026060 vs. TAIR 10
Match: AT5G13590.1 (unknown protein; Has 150 Blast hits to 121 proteins in 42 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 80; Fungi - 5; Plants - 17; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 40 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.4e-12 Identity = 115/466 (24.68%), Postives = 185/466 (39.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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