CsaV3_5G014200 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGGACTCCCTTAATTTTCTCTACTACTACCACACAGGTTCCATTTTCTTTCTTTCTTCTTTAAATTTCTTAACATGGTCGATCTTATAAATTGATGATGCTGTTTCTGCTAGTTTATAGGAATTAATTAAATGGAGAAGAAGGGTAAATCCAAATATGAAGAGAGAAGTATTGAGGTGTTTCTGAAAAACTACAAGGTCGGGAAAATTCTTGGAGTTGGTTCAACAGCAAAAGTTAAAGCTGCAATACATAAATTAACTGGACATCAAGTTGCCATCAAGATTCTCAATCATCACAAAATTGCTAAAATGGGTCTTGAACATAAAGGTCCATTTTCTTTTCTTCTCATCTTTTTCCTATTTTCATTTATCCCATACATCCTATATATTCCATAACTTTTTTTCGTAATATTAGTTCATCCATATTTGTCTACTCTGGGTTTCATCAATTTCAAAGAAACATTTGTCAATTTCTAACAAAAACACAAGTTTTTAAAAACCTTTTACTCTTTTTGTTTTTTGTTTTTGAAAACTGAATAGAAAGTCTATAAGAAAAGGTATAGAAAAAGTTGTGCGTGAAGTAGTGTGTGTTGTAGAGAAGGATTTTGTGGCTGAATAGCTTAAAATCGAAGCTACACTTGGATTGAAAAGAAGAATAATAGTTATGAACAACAAGAAGAGAGAGAGTAATACCGATAAACAAAATTAGGGTTTAATTTATTGCTAATTAGTATTTTTATACTATTTTCCCTTCTAAACTTATTTAATATTTTTTTTGTTTCTTTTCAAAAATAAAAATAAACTACTGAAAGATAAAATATAAAATTGAGGTATGGAGATTTGAACTACCTATTGTTTTTGTTGGTGTAGTATACGCACATACTAATTAATTATTATTTATCAACTAGAGCAGAAAAAATGCAAAAAGAAGAGAACACACCACAAGGTTATATAGAATGTATGAAGTAAATGGTTTTTTCTCTTAATCTAAAGATATGATCTTGGGGCTAGAATTAGACTATGAATTCTAAAAGGATCAGTACTGAAAACCTGAATTGAATATTGGAGCATGTTCATATTTTAAAATATAATAAAATTTTAAATTTTAAATAAACTTTTATTAGTATTTAAAAATGGTATGCAAATAGAAAAAGTATAGCAACTTTTTATAATTAATAAAATATAAAATTTTATTATATTTTGTAAATATTTTTAGCAATTATATCTTTTAATCGTAATTTTTGTTGAATTAAGTATGGTCTAAATTGGCAAGTTTCATTTAAAATGTCTTAACTTAACTTATCCCACAACGTCAATAAAAGCATATAACTAAGAAGATTCTGAAAATTTATTGGAAAGTCAAATCACCATTAAAAACTATATCTCATCACAAATATTAATTTATTAATTTTAATTTTATATATTTTAAAAAAAATTGACAAAAATTTTATGGATCCTAGTGAATTTTATCTTTTAGTTTTATTAAATATTTTGTTTTTATTTTTGGAAAATCTCTTATAATTTTTTTTTTTTTTTGAAATAATATATTTGTAGACGGTTCAGACCTTTAATTCTTTTCGCGTTTTAAAATTTAACCACACACTCTCATTTCCAATTTTGTATAAAAGTATATAGTTAATCATTACACACAGTAAGTGAGAGTCAAAGCTCCCATTTGAAGATAAATAAATAATTTCTGTAATGTTTGCCGAGGTAGAAGAATTTTCAGATTGAAGTGTGGGGCAAATTAAGTACAAAACCAAAAAAAATTTGATGACCAAAACTATAATCTACACTCATTTCTTTTCATGAATGAGTGGTGATTACTTTTTAAAGAAATTGAAGGCTGATTCCTCACCACAGTTTGAAGTAAAAAAAAAACATATAGAATAATAATGTGTTAATTTGAAAAAGTATTTTCTTTTTCATTCATGAAATTACATGTATTCTGAAACTGAAAGTATATGTATTTATATTTACGTTAATGTTAATAAAATTGATGCATGCATGCAGTTAGAAGAGAAATAAAAATAATGAAGTTGTTAAAGCATCCACACATAGTACAACTATATGAGGTTATCGAGACACCAACTGATACATATGTAGTGATGGAATATGTGAAATGTGGAGAACTGTTTGATTATATTGTGGAGAAGGGTAGGCTAAAAGAAGATGAAGCTCGCAGAATTTTTCAACAGATAATAAGTGGAGTGGAGCACTGCCATAGAAATATGATCGTTCACAGAGATCTAAAGCCTGAGAATGTGCTTTTGGACTCAAATTTCAATGTCAAGATTGCTGATTTTGGTTTTAGCAGTGTCATGTATGATGGCCATTTCTTCAAAACTAGTTGTGGGAGTCCTAACTATGCTGCACCAGAGGTAACCATATTTCTTCACCATTTCATCGTAATTGGCATCAAACTGGCTTTATTCTTTCATTCTAACTTTTTATTAATTCTTGGTACGTACAAGTGTCTGTGACTCTTTCTTTCTGTATAATAATTATAGTGGGGATTGAAACCCTTCATCTCTAGGGAGGAAGGTCTCGTGAATACCAATTAATATATAATATCAAATTGTTTTAAAGAAAAATGGATGGGGTAGGTTTTTTTTCCTTAATGCATGAATTTTGACGAGAATGTATTTAATGGTTAACCTTATTTTATTGAAAATTATTGAGTTTATGAACATTTTGACGTTGAAAACTAAAGTCGTTGATCCAATTCCAAAAGTTTAGAGTCAAAGATTTTTTTTTTTCCTTTTAATGTTGCTTTCAAATTTCTTTAATTTTAATTTTAATTTTTAGAAAAAACACGGTTCTACTCCATGTAAAATTCAAACAGTAGGATTTTATTATACATCAAATTAAATTTTATATATTAATTCATTTTAATAGTTTTGAACACATCATCCTAGTATCGAAAATTGAAAATTGAAAAGCCTACTATTATGTAGTTAAATTTGATGAACTAAACAAATATATACTTCCAAGTCTAAGAAACTAAGAGCTTGTTTGATAACGTTCATGTTTCCTGTTTTTGTTTTTTACTTTTTAAGACACAAGCGTGTTTGATAACAATTTTTGTTTCTCGTTTTCAAAATTTAAGAAACATTTCTAAAAATTGGGTAACAATAAGAAACTATGAAAGATAGTTTCTGTCACACTCTCTTCCAGAACACCTCCTTTTGATTCGAGAGATGGCGTGATGTAACCGATATCGTGCTCCTCTCAACGATACTTGTTGACCCTAATCTCACTTAAAATTCATGCGAAAGCAAATAACACAACTCTAGGAAAAGATGTAGCATAGGAACTCAAGTGCAACATATTTTCAAGATAAGTTTTATATAGACTATTAATACAAACCATAAATTTCATAGTTAGTACAAGAACAAACCCTCCCTTCCCACAACATAATACTCACCATAACTTAGACATGTTTACATGACTGTATGTACATAAAAGTACATATGACCTAAACAACATACTGAAGAAAAGACGGGATCCACTAGCAGAATTGACGACATTGTTTCAAGCCTTGTGAACATAAGTTCTACCAAGAAAGTGGTAAACAATTTTGAAATGGTGAGCTAAAAAACCAGCTAGTGAGTGACTAGGTTTTAGAAACCAATGTAGAACTATAAAATGTTTCAAGAAAATAAACTTAGTAAAGCATTTATACAAATAATTTTTAAATCTTAGGCTTTTTCTCATCTGTACTAGATATCAAATCCTTAGTAGATGGTAGAGTTAATAAATACCAAATCCAACATAATCCTTTGCCTTAGATAGCAGAGTAAGATTGATACTATCGATCCCTCAAAGATAGACATCCCCAACTCCACCTTAGAGATAGACGTCCCTACCTCAAATCCTTAAAGATAGATGTTTCTATCTCAAAATTTCTTGGTGCCTAATATCCTATCTCATAAAATTGTAGTAGTAACAAGATAACTTGATATAGACTAAAACATGTTTAAAATAATAGGCTTTGAAAACAATATCTAAAACCATAAACCAAGCCTTGTTACAACCTTTATAAACTCATTTCCTCTTGCTAACCAAAGTACACTTGAACAATTCAAGCTTGATAATGCTTTATTTAAATGACAGGCTTTAGAAATAGCTTGTAGATCATATTAAATTCAAGCATGTTAAAACATTTGGCTAATAAATTCACATAGAAAACCTTATTTGAAATACATTTTGTCATTCACAAATAAGAGCTAGATTCTTGGCCTATAAAATTATTCAATCTTCTCTTAACTTGAAATAATTATATTTAAATCCAAATCAATCCCTTAGGTCCAGAGAATATCCAAACTTTGCTTTAAATTTCAAAAAATATTAAAAAAGGCAAAAAATTTAGCTTTTTGGCACTACTGGTGTACATGGCATGGAGGCAGGCTGCACACGAACGTGCAGGCTCAGGGGCCTGACCGCTTGCTAACCTCGAAAGTGTTGGAATGCCTCGCCGTGCTCAAGCCATGTGTTTCATGTGACGTCCTTTGTTTGCATGCACATGGCACCCTGTATGGCCTAGGCGCACTCCTCATATCACTTGGTTGTCTTGTGGACATGCTTCTTGCATGCTCTGAAACTTAAATAACCTCTCTTGCCCAGTTTCCATGCCCATCTCACACTGTCATCTTGGCACTCAACCCACCCTTGGCCTTGCCTAGATACTTGATTTTCGACTAGAAAATTTATTCGCCTTTGGAGCTTAATAACTTAAAATCTAGAACTGAAATAAAGAAACTTTCTTCTACAAACGTGTTTAGAAACTTTCGAAGTAGCTTACCTCAAAATTTCAGCCAAACACTCCAAGTATTGAGTTATGTAGCTTAAATATAATCAACACTACTCAGTTTTCCTTCTAAATTGACCTTTGTGGTTTTCTTCAGTTCAATGCCTTCCTTCTTGACGTCTTCCCTTCTTGGCGTCTTCCCTTCTTGGCAGTCATTTCCTAGATACTATACTTAATTTATGAGA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ATGGAGAAGAAGGGTAAATCCAAATATGAAGAGAGAAGTATTGAGGTGTTTCTGAAAAACTACAAGGTCGGGAAAATTCTTGGAGTTGGTTCAACAGCAAAAGTTAAAGCTGCAATACATAAATTAACTGGACATCAAGTTGCCATCAAGATTCTCAATCATCACAAAATTGCTAAAATGGGTCTTGAACATAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAATAATGAAGTTGTTAAAGCATCCACACATAGTACAACTATATGAGGTTATCGAGACACCAACTGATACATATGTAGTGATGGAATATGTGAAATGTGGAGAACTGTTTGATTATATTGTGGAGAAGGGTAGGCTAAAAGAAGATGAAGCTCGCAGAATTTTTCAACAGATAATAAGTGGAGTGGAGCACTGCCATAGAAATATGATCGTTCACAGAGATCTAAAGCCTGAGAATGTGCTTTTGGACTCAAATTTCAATGTCAAGATTGCTGATTTTGGTTTTAGCAGTGTCATGTATGATGGCCATTTCTTCAAAACTAGTTGTGGGAGTCCTAACTATGCTGCACCAGAGGTTATTTCTGGAAAATTATACGCAGGGCCTGAAGTAGACGTATGGAGCTGTGGGGTTATATTGTACGCTATTTTATGTGGTTCTCTTCCTTTCGATAATGAAAACATTCATATTCTTGTTCAGAAAATAAAGAATGGAGTGTATAAGCTTCCAAGTTATTTATCAGCTGAGGCAAGTAACTTGATCTCAAGTATGCTTGTAGTTGATCCACTTAGAAGAATAAGCATAACACAAATTCGCCAACATCCATGGTTTCAATCTCATCTTCCTCGATATTTAGCTGTCAAACCACTTTCTACTATACGTCAACTTGAACAGATCGATGAGGATGTTCTTCAAAAAGTAGTTATGATGGGATTTAGCAAGAATAAGTTGATTGAATCTCTTCATAGCAAAAGCCAAAATGAGGGAACTGTGACGTATTATTTGCTATTGGGCAATCAATTCCCTATTTCCAATGGCTATCTTGGTGCTGAGATTCAGGAATCAACTGAACCTAAGCATATGAAGAATCCAATTGTTGGCCCCAAAATTCCTATAATGCATAATCAAGCTGTTGCTGTTACACCTCAAATTCCTAATAATGGAAAATGGGCTCTTGGATTACAGGCTAAAGCCCATCCACGTGATATAATGATGAAAGTGCTTAAAGTGTTGCAAGAATTGAATGTGTGTTGGAAGAAGATTGGAGATTACAATATGAAATGTAAGCTAACATCTGATACTTCAACACATCACCAACACATGCCTAATCATTCAATCATGTTGGAGGTTAATCATCTCAGTATATTGCAAAATGTGGTCAAATTTGAAGTTCAGCTATATAAAGTACAAGAAGAAAGGTATCTACTTGATCTGCAAAGGATTCAAGGCCCTCAGTTTTTGTTCTTGAACCTTTGTGCCACCTTCATTTCCCAACTTCGAGTGGTTTAA MEKKGKSKYEERSIEVFLKNYKVGKILGVGSTAKVKAAIHKLTGHQVAIKILNHHKIAKMGLEHKVRREIKIMKLLKHPHIVQLYEVIETPTDTYVVMEYVKCGELFDYIVEKGRLKEDEARRIFQQIISGVEHCHRNMIVHRDLKPENVLLDSNFNVKIADFGFSSVMYDGHFFKTSCGSPNYAAPEVISGKLYAGPEVDVWSCGVILYAILCGSLPFDNENIHILVQKIKNGVYKLPSYLSAEASNLISSMLVVDPLRRISITQIRQHPWFQSHLPRYLAVKPLSTIRQLEQIDEDVLQKVVMMGFSKNKLIESLHSKSQNEGTVTYYLLLGNQFPISNGYLGAEIQESTEPKHMKNPIVGPKIPIMHNQAVAVTPQIPNNGKWALGLQAKAHPRDIMMKVLKVLQELNVCWKKIGDYNMKCKLTSDTSTHHQHMPNHSIMLEVNHLSILQNVVKFEVQLYKVQEERYLLDLQRIQGPQFLFLNLCATFISQLRVV* Homology
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. NCBI nr
Match: XP_031741194.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN50804.2 hypothetical protein Csa_018532 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 996.5 bits (2575), Expect = 8.2e-287 Identity = 498/498 (100.00%), Postives = 498/498 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. NCBI nr
Match: XP_004149632.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031741193.1 SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 991.5 bits (2562), Expect = 2.6e-285 Identity = 498/500 (99.60%), Postives = 498/500 (99.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. NCBI nr
Match: XP_008452375.1 (PREDICTED: SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 909.4 bits (2349), Expect = 1.3e-260 Identity = 466/505 (92.28%), Postives = 478/505 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. NCBI nr
Match: XP_038892877.1 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 890.2 bits (2299), Expect = 8.3e-255 Identity = 448/500 (89.60%), Postives = 471/500 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. NCBI nr
Match: XP_008452372.1 (PREDICTED: SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008452373.1 PREDICTED: SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 862.4 bits (2227), Expect = 1.8e-246 Identity = 466/616 (75.65%), Postives = 478/616 (77.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38997 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KIN10 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 1.1e-182 Identity = 317/510 (62.16%), Postives = 392/510 (76.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P92958 (SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=KIN11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 623.6 bits (1607), Expect = 1.9e-177 Identity = 310/508 (61.02%), Postives = 394/508 (77.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q852Q2 (Serine/threonine protein kinase OSK1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=OSK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 5.9e-171 Identity = 304/495 (61.41%), Postives = 372/495 (75.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8BBT7 (Serine/threonine protein kinase OSK4 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=OSK4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 596.7 bits (1537), Expect = 2.5e-169 Identity = 304/507 (59.96%), Postives = 377/507 (74.36%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q852Q1 (Serine/threonine protein kinase OSK4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=OSK4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 596.7 bits (1537), Expect = 2.5e-169 Identity = 304/507 (59.96%), Postives = 377/507 (74.36%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BUG9 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493434 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 909.4 bits (2349), Expect = 6.4e-261 Identity = 466/505 (92.28%), Postives = 478/505 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BTQ3 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493434 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 862.4 bits (2227), Expect = 9.0e-247 Identity = 466/616 (75.65%), Postives = 478/616 (77.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BTM5 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493434 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 797.3 bits (2058), Expect = 3.5e-227 Identity = 439/614 (71.50%), Postives = 450/614 (73.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CT90 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014121 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 755.0 bits (1948), Expect = 2.0e-214 Identity = 375/499 (75.15%), Postives = 430/499 (86.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L5M8 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500223 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 743.0 bits (1917), Expect = 7.9e-211 Identity = 364/496 (73.39%), Postives = 431/496 (86.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.1 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 8.2e-184 Identity = 317/510 (62.16%), Postives = 392/510 (76.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.2 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 8.2e-184 Identity = 317/510 (62.16%), Postives = 392/510 (76.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. TAIR 10
Match: AT3G01090.3 (SNF1 kinase homolog 10 ) HSP 1 Score: 641.0 bits (1652), Expect = 8.2e-184 Identity = 317/510 (62.16%), Postives = 392/510 (76.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. TAIR 10
Match: AT3G29160.1 (SNF1 kinase homolog 11 ) HSP 1 Score: 623.6 bits (1607), Expect = 1.3e-178 Identity = 310/508 (61.02%), Postives = 394/508 (77.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014200 vs. TAIR 10
Match: AT3G29160.2 (SNF1 kinase homolog 11 ) HSP 1 Score: 623.6 bits (1607), Expect = 1.3e-178 Identity = 310/508 (61.02%), Postives = 394/508 (77.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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