CsaV3_5G014010 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCTCGATCAAGTTCAAGAACATAGTAGTTTCTCGATCGAGTTCAAGAACATAGTAGTGTTTGAGATGGAACTCAAGTCAGAAGAGAAGAATCTCGGCCCAAATAGGCCCCGGGATTGCCTGAGATCCCGCCATACTTCTTTTTTTTTTTCTTTTAAAAGTTTGTTGAACCGGTTTAGTCTATCACTTTAAATAACTGCTGAACCAACGGTTCGCGAATTTTTTTTTCCCTTCATCGTATTGGTGCGCTAATCAAACCCACTAAACGGAGGTGCCGCTGAGCTTGAAGTTGACGTTAGACGCACCACCCGGGCTTCAGATACGGAGGTGGACGGTAGAGGCTCCAACTCCCACAAACCGACCACCACCTCCAAAAGAGACCACTGGCGGTATCGTCAGAGACAGCAGCGGCTCTGGTATGTAGAGGCGGCGGTGAATGGTAAAAGTGACGTAACAAATTATTTTTCTTAAGCTTCTGATACCATGTCTAGTTCTGTATATTATTGAAGATAATTGTCTATTCACAATGGGAATTACAAAAGTGTATTGTATACATAAAGGAGATTACAAGAAAGAAAATATAAATTAGCCTAAAAGGAAGAGTAAACTGGCTGTTTAATAGCACAACATTCTGGCAATAGATTTGATAAGAGCATGCCTATGAGCCTATTCTTTTTTAGGATTATGGAATGGCTGGTAATGGATTGGTTAAACATCTCAAGGGTGACCTTTTATTCCTTGATTCATCGCCTTTTTCCAAGCTCTTGAACCAGTGTGCTCGCTCGAGGTCAGCTCGAGACACCAGTCGTGTACATGCTTGTATAATTAAATCACCTTTTGCGTCCGAAACTTTTATCCAAAATAGGCTCATTGATGTATATGGGAAATGTGGATGTGTGGATGTTGCTCGCAAGTTGTTTGATAGAATGCTTGAGAGAAATATTTTCTCTTGGAACTCTATCATTTGTGCATTCACTAAGTCCGGATTTCTTGATGATGCTGTCCACATCTTTGAGAAGATGCCTCAAGTTGACCAATGCTCGTGGAACTCTATGATTTCAGGTTTTGAACAACATGGTCGCTTCGATGAAGCTTTAGTTTATTTTGCTCAAATGCATGGCCATGGTTTTCTTGTGAATGAATATTCATTCGGTAGTGCTCTCAGTGCTTGTGCAGGTTTACAAGATTTGAAATTAGGTTCCCAAATCCACAGTTTAGTATATAGGTCAAACTATTTATCAGATGTGTATATGGGCTCTGCGCTAGTAGATATGTACTCTAAATGTGGAAGAGTTGAATATGCTCAAAGTGTTTTTGATGAAATGACTGTGAGAAGTAGAGTTTCTTGGAATAGCTTGATTACCTGTTATGAACAGAATGGTCCAGTTGATGAGGCTCTTAAGATTTTTGTTGAGATGATCAAATGTGGGGTTGAACCTGACGAGGTAACACTTGCAAGTGTTGTTAGTGCATGTGCAACTATCTCGGCAATCAAAGAAGGTCAGCAGATTCATGCTCGAGTTGTAAAGTGTGATGAATTTAGAAATGATCTTATTTTAGGAAATGCGTTGCTTGATATGTATGCTAAATGTAATAGGATTAACGAGGCTAGAATAATTTTTGATATGATGCCAATTAGGAGTGTGGTGTCTGAGACCTCAATGGTAAGTGGGTATGCAAAGGCATCCAAAGTTAAAGTTGCAAGATATATGTTCTCAAATATGATGGTGAAAGATGTAATTACTTGGAATGCGCTTATTGCAGGGTGTACTCAGAATGGAGAGAATGAAGAGGCACTTATACTCTTTCGTTTGTTGAAAAGAGAGTCTGTTTGGCCTACACACTACACATTTGGCAATCTCCTCAATGCTTGTGCAAACCTTGCTGATTTGCAGCTTGGCCGACAGGCTCACTCTCATGTTTTAAAGCATGGATTTCGATTCCAATATGGAGAAGATTCAGATGTTTTTGTTGGCAATTCTCTAATAGATATGTATATGAAATGTGGATCAGTTGAGAATGGTTGTAGGGTGTTTCAACATATGTTGGAAAAGGATTGTGTGTCATGGAATGCTATGATAGTTGGATATGCACAAAATGGTTTTGGCAATAAGGCTCTTGAAGTTTTCTGTAAAATGTTAGAATCAGGAGAGGCACCAGATCATGTAACAATGATTGGTGTTCTTTGCGCTTGTAGTCATGCCGGACTACTTGACGAAGGTCGCTATTACTTTCGGTCAATGACTGCACAACATGGTTTGATGCCATTAAAAGACCATTATACATGTATGGTTGATTTACTGGGCCGAGCTGGGTACCTTGAAGAAGCAAAAATCTAATAGAGGAAATGTCAATGCAGCCTGATGCTATCGTCTGGGGATCATTGCTTGCTGCTTGTAAAGTTCATCGGAACATCCAATTGGGGGAATATGTAGTGAAGAAGCTTTTAGAGGTAGATCCTGAGAACTCTGGGCCATATGTTCTTCTTTCGAATATGTATGCTGAAAATAGAGATTGGAAGAATGTTGTGAGGGTAAGAAAGCTGATGAGACAGAGAGGAGTGGTTAAACAACCAGGTTGCAGTTGGATTGAAATTCAAGGTGAGTTGAATGTTTTTATGGTTAAAGATAAAAGGCATGCGAGGAAGAAAGAAATCTACATGGTTTTGAGAACAATTCTACAACAAATGAAACAAGCAGGATATGTCCCATATGTTGGCAGTAATGAGTTTGATGAAGATGAAGAACAATAGAAAGAAGACGACATACTTCCATCGTACCAAATTGAAATGCTAGATGCAGGTGGCGACTAGGTTGTTCTAACTAATTTAAATATGGATAGTCTTGTGCAAATGGAACCAAAGAAGTGGTTGGAAATGGCTTGGCAAAAAAGAAGCTGGAGAAGGTGGATTCTTAAATGGTTTGTTAAATGGCCAAAAGTTGTTAAAATTCAGAGGAAGAAGGGGATTCTTAAACAGTAGTTGAAGATTCCACCATCTTTGAATCAGTTCACTAAGACCTTCGACAAAAATCTTGTGACTAACCTGTTCAAGATGCTTTTGAAATATAGGGCGGAGGACAAATCACAGAAAAGGTAGAAGTGGAGTTCAGCAGGAATCTGGAAGTCATTTAAGGCCAATTTCAACAAGTACGATGAGAACAAGAAGAAGTGGGGAATTGGAAATCATGGGCTCGAAGTCTTAGGCTAAAAAACGCAAAGGAGAAGCTGCTGAAAGATTGTGTTAGGGATCATTTAGTGAACTAATCTAAATAATCAGTTTGAGGATTTTTCTTTTTTTGACCTATCTAAGTAAGAATAAATTTTAAGGATATTGAGGGAAGTAGGGAAAAGTTCAGTCAATGAGTTTTATTCTTCTTTGAAATTGATCCAATGCTAAAGGCAAACCATGTTCATGATCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAACATTCAATGTAAGAAGACATGGATTCCTCTAACTCTGATCAATATAGTGTTAGTCTAGATTGTTAAATTCTGTATTGTGTTCAATAACGTGAAAAATATTTCTGTGACCGCCTATTTGGATGCCACATCTTTTTTTTTCATTTTAGGATAGGATACTAATGTTTTTTTTTAAAAAAATAATAATAAAAAAAAACTGCATAATCTCAGTTTTCCTCGATTTTAAAAGGAAAAATGCAATTATAGAACTACATGCAATTTGCCTGTGTTTTTGTGTGATTTAAGAAGAAACTATTGAAATATCTTTAAATATATAGACAATAGTTCTGAATGTTGATTGTGTGGATGATTTGTGGTGGAAGAACCATCTTGTAGCTTCATTATGACTTCCATTTTGAAGAAGGTTGTAATATGCCATGATGGCCCCTTTCTTATTTTGTAAAATTGCATTCTTCTCATTGTTTATTACCATAATATGTTCCTTCTTATTTTGCCATTTTGTATTTTTCTTAAAACATGTTGCTACTAGTTTCTGTTCTATATTAGAAGAAAATATATTTTCTCTTATAATATAATAAAACAGGTGATAGTCTATTCGATTTGATCTATTTTGGGACTAACTAAGAACCAAACCAAATCAATCAGTTTTACACGTAAGGGATCTAAACTAATGTTCAATAAAGAAACAAAACCAATGGATTGGTTTTATTTGGATCGGTTTATTATTGGTTTGGTTTTTGGATAGCAGTCAACTTCTCCTTAAGCACTAGAAAGGACCTAACCTCTCTAACAAATTAGGGTATGGCAAGTTATAGATCACATCTACCTTAGCTTTATCAACCTTAATACCATTTGAAGAATCTAAATGTTCTGACACAATGTCATGGCTAGCCATAAAGTGACATTTTTCATAGTTTAAAATTAGATTAGTTTCTATGCATCTTTTCATGATTAAGAAATTATGCAAGCATTCATCAAATGAGCTATCATATACAGTGAACTGTCTATGAAAACCCCAATACAATCTTCAATAAAATCTAAAAACATACTCACCATTTATCTTTCGAGCATACTCGGGACATTGCACAAACCAAATGACATTCTCCTAAAAGCATATGTACCGTAGGTGCATGGGAAGGTAGTTTTTTTTTTGTCCTCTTGAGCGATTGGTATTTGATAGAAACCCGAAAAGCCATAAAAAAAATAAAATAAAAAATAAAGGCTTCCCCGCTAAACATTCTACCATTTGATTTGAGAAAAAAAAAAGGATGTGATCTTTCTATTGTTAACTCAATGAGCTTGCAGTAGTCAATGCACCTACACCACCCATTTGAACTCGAGTTTGCACCATCTTTCCTTTCTTGTTCTTAACTACCGTCATTCCAGTCTTTTTAGACACGACATGGATAGGACTTACCCATGTGCTATCAGAAACAAGGGTAGATAATGGCAGCTTCATTGAGCTTTAGAATTTCCTTAAGAACAACATCCTTCATCGTTGGATTCAATCTTCGTTTGGGTTGGGCAACAACTTTTGCTCCTTCGTCAAGAGAGATG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ATGGGAGAGAGGAAGGTGCTTAACAAATACTACCCACCGGATTTTGATCCGTCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGACCCAAAAACCAGCAAATGAAGGTTCGTATGATGCTTCCTATGAGCATCCGGTGCAATACTTGTGGTAATTACATATACAAGGGCACAAAGTTTAATTCTCGCAAGGAGGACGTCATTGGTGAGACATATTTGGGAATTCAAATTTTTAGGTTCTACTTCAAGTGTACCAGATGTTCTGCTGAGCTTACCATTAAAACAGACCCCCAAAACTCAGACTATGTTGTAGAATCAGGAGCCACACGTAATTTTGAACCATGGCGTGAGGAGGATGAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACACAAAAGGAATGCGGAAGAGATGGGGGACGCAATGAAATCCTTGGAGAATAGAACCTTGGATTCGAAACGAGAGATGGACATTCTTGCTGCTTTGGATGAGATGAAGTCTATGAAGTCGAGACACGCAACTGTGAGTATTGATTCAATGCTTGTAGCTTTGCAACGAACTGCCGCTGAAAAGGAAAAGAAGTTAGAAGAAGAAGATGAAGCACTGATAAAATCAATAGTCTTCAATAACTCAAACAGTTATGTTAGAAGAATTTCAGATGATGAATTTGATGATGGTAGTATTGTTCAACATTTGACCAACAATGATATAGCATCGGACTTTAAAGCTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGAAGGATCTCCTCATGATCCTACAAGTACTTCATCAAAAGCTGGTTTTCTCCATAGCCGCATGGGTGAAGGTGAAGATGGCAACATTGGGACGTCTACTGATACTAAATTTGTTTCGAAATCCTTTCCGGTCATAGTTTCTATTAAAAAGAAACCAGAAGTGACTGCTCGGGTGGAGAATAAACAGAGCTTGCAACTTCAAAGCAATGGTACCAAAACTGGACTCGAGTCATTGTGCCAATACGACAGTGACGAGGATTAA ATGGGAGAGAGGAAGGTGCTTAACAAATACTACCCACCGGATTTTGATCCGTCAAAGCTACCAAGGGTTCGTAGACCCAAAAACCAGCAAATGAAGGTTCGTATGATGCTTCCTATGAGCATCCGGTGCAATACTTGTGGTAATTACATATACAAGGGCACAAAGTTTAATTCTCGCAAGGAGGACGTCATTGGTGAGACATATTTGGGAATTCAAATTTTTAGGTTCTACTTCAAGTGTACCAGATGTTCTGCTGAGCTTACCATTAAAACAGACCCCCAAAACTCAGACTATGTTGTAGAATCAGGAGCCACACGTAATTTTGAACCATGGCGTGAGGAGGATGAAGCTTCTGAGAAGGAGAAACACAAAAGGAATGCGGAAGAGATGGGGGACGCAATGAAATCCTTGGAGAATAGAACCTTGGATTCGAAACGAGAGATGGACATTCTTGCTGCTTTGGATGAGATGAAGTCTATGAAGTCGAGACACGCAACTGTGAGTATTGATTCAATGCTTGTAGCTTTGCAACGAACTGCCGCTGAAAAGGAAAAGAAGTTAGAAGAAGAAGATGAAGCACTGATAAAATCAATAGTCTTCAATAACTCAAACAGTTATGTTAGAAGAATTTCAGATGATGAATTTGATGATGGTAGTATTGTTCAACATTTGACCAACAATGATATAGCATCGGACTTTAAAGCTAAGAAGCAGAGGGTTTCTGAAGGATCTCCTCATGATCCTACAAGTACTTCATCAAAAGCTGGTTTTCTCCATAGCCGCATGGGTGAAGGTGAAGATGGCAACATTGGGACGTCTACTGATACTAAATTTGTTTCGAAATCCTTTCCGGTCATAGTTTCTATTAAAAAGAAACCAGAAGTGACTGCTCGGGTGGAGAATAAACAGAGCTTGCAACTTCAAAGCAATGGTACCAAAACTGGACTCGAGTCATTGTGCCAATACGACAGTGACGAGGATTAA MGERKVLNKYYPPDFDPSKLPRVRRPKNQQMKVRMMLPMSIRCNTCGNYIYKGTKFNSRKEDVIGETYLGIQIFRFYFKCTRCSAELTIKTDPQNSDYVVESGATRNFEPWREEDEASEKEKHKRNAEEMGDAMKSLENRTLDSKREMDILAALDEMKSMKSRHATVSIDSMLVALQRTAAEKEKKLEEEDEALIKSIVFNNSNSYVRRISDDEFDDGSIVQHLTNNDIASDFKAKKQRVSEGSPHDPTSTSSKAGFLHSRMGEGEDGNIGTSTDTKFVSKSFPVIVSIKKKPEVTARVENKQSLQLQSNGTKTGLESLCQYDSDED* Homology
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_004149128.1 (splicing factor YJU2 [Cucumis sativus] >KGN50783.2 hypothetical protein Csa_018408 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 637.5 bits (1643), Expect = 6.4e-179 Identity = 327/327 (100.00%), Postives = 327/327 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_031745804.1 (LOW QUALITY PROTEIN: splicing factor YJU2-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 635.2 bits (1637), Expect = 3.2e-178 Identity = 326/327 (99.69%), Postives = 326/327 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_038895471.1 (splicing factor YJU2 [Benincasa hispida] >XP_038895472.1 splicing factor YJU2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 572.4 bits (1474), Expect = 2.5e-159 Identity = 296/328 (90.24%), Postives = 307/328 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: XP_022965295.1 (coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima] >XP_022965296.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 1.1e-151 Identity = 283/329 (86.02%), Postives = 303/329 (92.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. NCBI nr
Match: KAG6577830.1 (Splicing factor YJU2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 546.6 bits (1407), Expect = 1.5e-151 Identity = 282/329 (85.71%), Postives = 303/329 (92.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54WR5 (Splicing factor YJU2 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=yju2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 4.4e-58 Identity = 119/236 (50.42%), Postives = 167/236 (70.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8WHR3 (Splicing factor YJU2 OS=Danio rerio OX=7955 GN=yju2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 214.9 bits (546), Expect = 1.3e-54 Identity = 108/217 (49.77%), Postives = 150/217 (69.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9BW85 (Splicing factor YJU2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=YJU2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 6.6e-54 Identity = 104/192 (54.17%), Postives = 140/192 (72.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D6J3 (Splicing factor YJU2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Yju2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 211.8 bits (538), Expect = 1.1e-53 Identity = 108/217 (49.77%), Postives = 150/217 (69.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9P7C5 (Splicing factor YJU2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=cwf16 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 185.7 bits (470), Expect = 8.7e-46 Identity = 104/226 (46.02%), Postives = 142/226 (62.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HNB0 (Splicing factor YJU2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465203 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 5.5e-152 Identity = 283/329 (86.02%), Postives = 303/329 (92.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E6Q8 (Splicing factor YJU2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431206 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 543.5 bits (1399), Expect = 6.1e-151 Identity = 281/329 (85.41%), Postives = 302/329 (91.79%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KL62 (Splicing factor YJU2 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G003615 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 517.3 bits (1331), Expect = 4.6e-143 Identity = 264/264 (100.00%), Postives = 264/264 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HYT1 (Splicing factor YJU2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469322 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 516.2 bits (1328), Expect = 1.0e-142 Identity = 270/329 (82.07%), Postives = 290/329 (88.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EW00 (Splicing factor YJU2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438528 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 515.8 bits (1327), Expect = 1.4e-142 Identity = 269/329 (81.76%), Postives = 290/329 (88.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR 10
Match: AT1G17130.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 2.5e-101 Identity = 211/342 (61.70%), Postives = 253/342 (73.98%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR 10
Match: AT1G17130.2 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 359.4 bits (921), Expect = 3.1e-99 Identity = 211/349 (60.46%), Postives = 253/349 (72.49%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR 10
Match: AT2G32050.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 245.7 bits (626), Expect = 5.0e-65 Identity = 128/217 (58.99%), Postives = 161/217 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR 10
Match: AT3G43250.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 1.1e-59 Identity = 122/214 (57.01%), Postives = 160/214 (74.77%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_5G014010 vs. TAIR 10
Match: AT2G29430.1 (Family of unknown function (DUF572) ) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 6.9e-22 Identity = 45/76 (59.21%), Postives = 58/76 (76.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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