CsaV3_4G011980 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_4G011980
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 9268767 .. 9274768 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_4G011980
SyntenyCsaV3_4G011980
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTACTCATTTCTCCATTTCCACAAAATCCAAAACCAAAAGAAATCCTTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCATTCTACCATTTCCATTTTCTTCGTAAAATCTCCAACAAAATCTTGACAAACTCCATATCCCTTTTCATCTTCCTCTTCTCGACCTAGGGTTTCACTTCCACGTTCAACCCCATGAACATCTCATTTCCTCATCCATAACACAAGATGTACTCACCCAATAAAAGCCCCTTAGCTTCTCCGACCAGCTCCCGTTCTGTTACAGAGACTATTAATGGCTCCCATAACTTCGTGATCAAGGGTTATTCCCTCGCGAAGGGGATCGGTGTGGGAAAGCATATTGCCAGCGAGAATTTCTCCGTCGGAGGTTATCAGTGGGCTATATACTTTTATCCTGATGGTAAGAATCCTGAGGATAATTCGGCTTATGTGTCAGTGTTTATTGCCTTGGCTAGCGATGGCACTGATGTTCGTGCCTTGTTTGAGCTCACTTTGGTGGACCAGAGTGGTGATGGAAAACACAAGGTGCATAGTCATTTTGATCGCTCGCTTGAGAGTGGACCTTACACGCTTAAGTACAGAGGTAGCATGTGGTAAGAATTCTCTTTGCCTTTTTGTTGCCTGTGAACGTATTTAGAATCATGGGTATTGGTTAATTGCAGGGTGTTTGTTCAATTTTCATTTATTTTGATGTGTTTAGAGAACGATTAACTATTATGTAAAGGATGTTTTAGATTTTCAGATCGGGAATTTATGCCTTGGGATCTTTTTACTTTTTATATTGGTGTTGATTGCTAAATGAAGCGAGGTGGGTCTTTCAACAACTATTATTGTTTTGACCCATACTGAAGCTGTTGAATCCACAATGACTAACTTGTGGTATAATTGACGAGGAACCATGTGATGTGCGCATACCAGTTTGTGTGCTAATTTACCTATCAATTTACCGAAGCACAACTACTTTTTTTGCCCCCTCCTATTAACAAATGAAAATTTTCATTGAATTAATGGAAAAGAATCAATGCTTAAAGATACAAAAAAAACCTCGCAATTTATAAGTACATTTTGCAAAGAAAATTTTGAGAATGGTTTAGAAAGAAACACAATTGTGATGACAAACCATTGATTTTGTTTGTTCTAGAAAACTCTTTGATTGCCTTCTATCCAAATTTTAGAATTTATAGCTTTACTTGCATAATGCGGTCTCAGAGGTAAGGAAGACCCAAGAGAAAAGATAAAGGATATAGCTCTGACAGCTATTCCGCTATTTGAAACTATGAGTTATGCATTGCAAATTGAAAGTTCTTAGCAATTGACTCCAACAAGCCTTAGAAAAGAATTAATCAGTCTCACTTCCTTGGATCCACAAAACATTATGAAGACATAAGGGATTAAGGGCCATATTTCTTTATTTGAGTCCAACTTCTACTACTCCATCCGTTTGAGATTTAGAAGTTAAATTCCATCTTACAAGATCGGCTAGCTTGCTACCCTCGTCGCTTTCCCAAAAGAAATCACATTTTCCCCTCAATATTGAGATGAAAGGAAGAAATCCTTATCTATACTTACCATATTTATGGCTAATAGCGTCCCATTCGACACCAAAATGTTTTTTGAATGGCCTCCCAACACACATTTTTTAGCCACATATATGAACTCAACTATCCACAAGGCATTTCATTATTCTTTTAGAAATATCATGGCGAATATTGTCTCTTTCAACCAGAAATCTTCTAGGCGCTTAGTGAGTAAAGCTGAATTATTCTTCATTCAGTTGCTAACTTGAGGCCTCCACAAACTTTTGGCGAACACTGGGTGTTCCAATGAGTAAGGTGGCTCCCTTTGACTGTACTCAACTCTCATTGTTTGTCCAATTCAAAAGATCTTCTTCAGGCATCTTAAAGAGGGAGTATGTATAGTGTATGGAGACATACTAGATAAGGTAGCTTCAAGAGGAGAAAGACTCCCTCATTTAGACAAGTAGGAATTCCATCTTCCTTGTACTTTATTTTCCTTTTAGTGTCTGAACCTTGCCCGAAATACTCAAGAGGCCACACGTCAACAACGCAACCCCAATCCAAGGAGATTCTGGTAACTTCATTCCCTTCAATATTAAGAACAACCAAGAGAGGTTTAAAGATATTTCTTTCCTGACATCATTTATTTAGCATAATGTAGTTGTGGGCTGAAGAAAGTAAAGCATCGTCATCAAACTTCAAGTGAGAAATGTGAGCCTTTCTATTGCCTTGCTTTAACCCTAGTAGTATGGATCTAATCCCTTGGTCTATCGTTAATCAAGGTGGAGAAAGAAGTGATGGTAATGCATGTTTTGATCCAATCAAGCTCACAAGTTCGAAAAACTTTTTGCTCTTCCCAATCAACCATTTCGTAAGCTTTTTAAAAATTAATCTTGAAGAGCTAACCTTCCTTTTAGTAACTAAGTGATCAAGTAACTCACTGGCAATTAGAAATGGGTCAAGAATTACCTTTCCCTAATGAAGGCTGATTGGCTGCTACTAATAGTTTGATGAAGGATCTTTTTCAATCTCTTAGCTAAAACTTTTGTATTAAGCTTATACAAAACAGTGATCAAACTTATTGGTCCGAAATCAACAACTTTGGTAGCACTCTCTTAGGGACAAGAAAAATGTACTTGTACATACAACAGTTGAAAATGTCATATTAAAAAAGGTACCTCATTTGTAAGCACCTAACCCATATGGACCTGGAGATATGTTTAAACCCAAATCATAGCTTCCTTGGCTTTAGTTTTAGAAAAAATATCTTCTAACAAGGAACTACTATGGGCATCAACGGGGTTTGTATCAATGTTGGATGGAATATAATGGATGCCACTGTTTCTATTAAGCTTCTCAAAGAAGGAAACCAGTTCACTCACAATCAAGTCTACTTTGAGCATCAATAATAGGCTGCTAGTTGAAGATTCACCTTCCCGATAATTTATTTTTATTTCACTGTAGGATTGGTGGCCGCTAAAACTATCAACTTACCTCTAAGTCATCATCTTCTAATTTAACTATATATAATTATAATTCTTTTGGCCTTTCAAACTCATCTTCTCTAGCAACTGGAGAGCTTTGATAATAAAAGAATCATTCACGACCTGAAAAAGAGACGTTTTCCCTTCCATTGTAGAAGCTACGTGCCCTTTACTTCTTTTTATGCCTTTGTTCCTCTTCTTTCTCAAGGCTTTTATTTTTTAAAAGGTCCTTTTTAAGTACAACTTGGGAGTAGGGAGATTTGAACCTGAGACCTCTTGTCGGGAACATATAGATACCATTTAAGCTAAGTTTATGTTGGCGGATTTTTGTTTTTTATTAAAAGGTTGGTAACCATTTCTCCCTTTAGATGGATAAGTCATTTCAAAGTTTGTTTGTTAAGGTACAACCAATTGATCCGTAAGGTCACTAGTACAATCTCTTTGTCAAGCGATTAGCGTTTCTTTTCCCAACCTTTCATCCATAATGTGACTTCTTTTGCTTTCATTCACTAGCATTCAGTCTTCGAGGAATGTCCAATGAATTTTTGTTGTCACCATGGAAATTCATTGCTACTCGAGGGGAGAAACAACCATAGATTTCAACTATCCGACCAAAAAGGTGGGAGATGTCTTTTCACATGGTGATTTGTGGCATCACCTTATCACCTGGTCTCATTAACACAACCTTAGCTGGGAAGGATGAACCCACATTAATTTCTTGCCTCCTCCAAACATTTAGAGAAAGTAATCGTTTTAGTAGCACTTTGTTAGGAACCAAGGTAATATGGATGCCTTTGTTCCACATTGGTTAGAATGGGATGACCAATGTAGTACTTAATGACTCGGCTCTCCTACCCTAATAAGCTGGTTTTTGGGATGTGATTCTCCAAGGTGCTTTAATACCTAACAATGGTATCAGGGTCGGTTGTTGATGTTCTAGAGTGGAACTGGCAGAGCGTTCTGGTCTGGTGTGGCCAAGTGAAGTACCGCTAGAGTAGCCGCTAGTACGTCTGCTATTCGAGGATGGAGTATTGTTAGAAACCAAGGTAGTATGAAGTGCCTTTGTCCCCCATTGGTTAGAATGGAATGGCCTTAAATGACTTGGCTCTTCCACCCCAATATCCGACTTTTGAGGTGTTAGCTACTTAAGCACATTGGAAAACCACACCTCATTTTCCTTTGGTCTCATAACCAGTATGGTACTTAAGTGACTTGGCTCTTCCACCCTATTTTCCTTACTAGATATATCTTAGGAGGCTTTTACTGCCAACAATGAAAAACTTCTGAGCTGGGTAGTTCTATCTTTTCCTTTGGCTGTATCATGTGGCTTGAAATTTAAGCATATTTTTGAAGTAAATCTTGACTGAAGAGTGGTGCTACTATACCAGCTCTAATGCACCAAACTCCACCAATCTGTGCAGTTAAGCATGGCTGGGTGAGAATATTGCTAGGTTGGTGACTGCATAGGCCTGATAAGCCCGACTGTTGCGCCTCTTTAAAGAGAATAAACTGCTCAGGAAGTTGTATTGCTTCTTGAAGAGATTTGTTGAAGTTTGATGATTGGAATGTGAACACTGTGAAAATATGTAGAAAGCTATGGAAATGGAAACATGCTCATTTTCATCTTTTCAAAGGAGGCCCCTTACTTTTGCTCATGGGTTCTTTCTAGCGTGATCAATTTCCTATGCTTTTTTGCTAAAGGTCCTAGAAAAGTGGTGAAGGAGATTGTAAAGCTCATGTAATTTAATTTGGGAAGGCAGAGGAAGATGTATCCGATCTTGTTGAGTGGAGCTTGATCTCTCCATATTAGTACATGTACATGGGTGCTTGAGTTTGGAGAAATCTTCAAGTCATGAAATATTTCCTTGGTCTCTAACTAAGTTTGGCGTGAAATGAAGACTGCACATGGTTTGTGACCATTGTTAGCATTTAGATTGAACCTCGAGGATGAGAGCTGATTATGAAGAAGGAGAATTCCAATTGGAAGGTGCCTCTGGAATTTCTTCTCTAGGTGCAAGTTCTTGATGGAATTTTTTTTTTTGGGTAAAAGAAAATCTTTATTTTTGGGTTGTGGTTGTTGTACTGGCAATGTAATTTTTCTTTTTCCTTTTAGAAAGTGCCCCTGGAATCTAAATATGTTTCCCTTGGTCTCTCTATGTTGTAATAGAGTCCAATAAATGGAGTGTGAAGAAATCTCTCTCAAGTTGCTGGATTATTATTCTAATATAGGAATAACTTCCTAGACGGTGAGGTGGTTGACTGTATTCTACTATGTATAACATGTATTTGACATTTGTTGAAACACATATCCAGTTTGGTCAAGAAACTATCTGTTCACATTAGTGTGGACACATACACATTGGGATAGATAGTTGATGCTTCATAATCATCTTCTCGCTATTGAATATATGAAAAAAAAAAACAATCTTTTTAGTTTGAAATCCATTATCAAAGTTCTCAATAAAACATTAAAAAATTTGCAACTGTGAAAAGGTTTTCCTTTCACCAAATGGAATTGTATGCAAGCTTGTTTTATGGTTTATGCATTTATTATTATTAATTATTGTATTATTTCCTTCCCTACTAGGGGCTACAAGCGCTTCTTCCGAAGGACTTCACTTGAAACCTCAGTTTTCCTCAAGGATGATTGCTTGAAAATAAATTGCACTGTTGGTGTTGTTGTGTCCGGAATAGACAGTTCAAGACTACATTCCATCCATGTCCCTGAATCAGATATTGGAGCTCATTTTGGTACATTGCTGGAAAATGAGGAGGGTTCAGATATCACTTTCAATGTGTCTGGGGAAAAGTTACGTGCTCACAAGTTAGTACTGGCTGCTCGCTCTCCTGTTTTTGAGAATGATTTTGTGAACATGATGGAAGAGGATAATGATGAAATTCTTATAACAGAAATGGAACCTCGGGTTTTCAAGGTGAATTTTCTTGGGAACTGTTACTTTCGTCACTTCTAATATTTAAGCC

mRNA sequence

TTACTCATTTCTCCATTTCCACAAAATCCAAAACCAAAAGAAATCCTTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCATTCTACCATTTCCATTTTCTTCCTCCCGTTCTCC

Coding sequence (CDS)

TTACTCATTTCTCCATTTCCACAAAATCCAAAACCAAAAGAAATCCTTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTCTTCATTCTACCATTTCCATTTTCTTCCTCCCGTTCTCC

Protein sequence

LLISPFPQNPKPKEILSSFFVLRSSFFILPFPFSSSRSX
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_4G011980 vs. NCBI nr
Match: KAE8649365.1 (hypothetical protein Csa_019150, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 5.1e-11
Identity = 38/38 (100.00%), Postives = 38/38 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  LLISPFPQNPKPKEILSSFFVLRSSFFILPFPFSSSRS 39
          LLISPFPQNPKPKEILSSFFVLRSSFFILPFPFSSSRS
Sbjct: 1  LLISPFPQNPKPKEILSSFFVLRSSFFILPFPFSSSRS 38

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_4G011980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8649365.15.1e-11100.00hypothetical protein Csa_019150, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_4G011980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_4G011980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_4G011980 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_4G011980.1CsaV3_4G011980.1mRNA