CsaV3_3G028120 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G028120
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 24554403 .. 24568631 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_3G028120
SyntenyCsaV3_3G028120
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTATTATTAAATATAAAAAAAAGGAAAAGAAAATTAAAATTCTCTCTCTCGGGCCGCACGTCGCACGCACCCCCCCCTCCGTTTTTCCTTCTCCCTTCAGCCAGCAACCGCTGGTCACCCCTCTCCCTATCTTCTTCTCTGTTCACCCTAGCAGTCGGTCTTTTGTGAAGCAGTGGGCTGCGAAATCGTGGGTCACGCGACTCTTCGTTTCCCCAGCCGAGCCGCAAACCATCTATACGCAGTCTCTCCATCGCACGTCGTCTCTACGTCGTATCTCGTTGCTCTGCCGCACGTTGTCTATTCACAAAGCTGCTGCCCAATTTCTTCTGCGAGTAACACCTTTGACGTTCGCGCCGCCAGGTTTTCATCCGCTACCGTGAAGCTGTCGTGAACCGAACTAAAGACCCCAGATCCAACTTTCTGCGCGTCGAGTTCCTTCTTCGTCCTGCCGCAGGTAGCAAACCCACGCCATTCGATTGGGTTGTTCGCTATCATTTCTGCCTTGCCACGAGTCATCAAATTTTGGTTGGTAAGATTGAAGTTATGAAATTTGTAGTTGTTTCCAAAATAAACTCAAGTAATATTACTGAAATAATTGGTTGGATAAATTGTTTAATGTTCGATCATAGGTTGAAGGTAATGCTCGAATTCCTTGGGTTCGCAGCAAACATTTGATTTTAGTTGGAACTCGTTTCGTGAAGATTTGGGTAAGTTGTAAAAAAAAAACACATTGGGTTGAATTTAAATGATTGATGTGTTGGGGAGATTTATTGAGAAATTGTCTTAATGTTTAGGTTCGTTCTTCGTAGACCTCAACGTGGTCAAGGAGCTTAACTAACTTCAAGGTAAGGGACTTTCTACTGGACTCACCTAAAGTTTTGAGTTGTGTTGGACTGTATGGTTATATCGGAACTTAGTAGGAATGATGGTTATGATATACACATTTGGTTCCAGACTTAATGTTTAGTGTATATTGTATTTAAATGGAAATATATATATATATATATATATATATATGATTATGTACGGATTGATGTGGATTGTTGAATGTATACTCTGAATGACTGGAATTATGCATATACATAAATTGACGTAGATTTGATGTTGAATATATATGGAGATTGTCTGGGATAAAACATGCAGGTGTGGATGTAGACATGATGATATTAGTAGACTGGTGTTGTATAAAATTTTGCATGTGAACGGGTGAATTTGTTTCGGTTGGGTGTGGGTTATACTAAACTGTGGCTTGTACTGGTAAACTGAGGAGTGTTATGACTTTATAGTTTGTTCGACTGATATATTAAAATGTTACCAACGGTCTTTGGACTAAAGTGGGATAGGTTGATTGTTAGAATGTTAAGTGAAAGAACTTTATATTTTGAAGTAATGGAAAGATGTTATAAATGACTGTTAAAATGTTTAGAATTGACTGAGGGGAAAATTGTTAGCTTTTATTGGGATGTGTGCCTTGTAGGTGTCACACGAGATCACCAATCATTATGAATCCTTCGGGAGCATTAGACTGATATATGTTTCTACAGAACACTAGACTGAAATGTATATCCCTCGGGGCGTTAGATTGATACGTGTATCCTACGGGATCACAAGACTGTGACTGTGCAGGGTTTTCTAATAGGACGTTAACAATTTATTTTCCCCTGACGGGACTAGTAGTGGGTCTCTTACTGAGTATTTTTTATGTTTAATTTTTCAGGCAAAAGTAACAAAGGCGGCAAACCGGCGAGGGGAAGGAAGGAAACGTGATTGCCATAGGAAATGTGTTATTTTGCTTCCGCTTATTGTTTTTTTGAGGTTTAAGACGTCGTATTGAAACTTAGCTTACAAACTTTTATTTGTAAGTAGTACTTTTTAAGTTTTTGAATATTTGAAATCAGGTCAAACTTAAAGTTGTTTTTCCTCGATTGTGTGTTTTTCAATTGGCTTACATTTCATTTTGTATCAACCAAGGTCTTTTGTCAAAAATTAATGACCTCGACTTAGGTAGAAAAGTTGGATCGTTACAGTTGGTATAAGAGCCTAAGTTTTAGGTTCTGTAGACTGACTTACGATGTAAGTCTGTGTTTTGTGTCCCTATGGCTAACGCGACCCTTCGTCTCTCGTCAGGTATGTTTTATGCTTATATGTATGGTTTATTTGCATGACTTTTGCCTAAGTTAAACTGGACGGTATGAAGTACTCTTTTGTTTAGATTTTTAAAAGATAGTTATTGGTGGATAATAGGAATTATGCCGCCAAAGAGAGGTGTTCAATATCGCAGACTTGAAGCCCTATCATGCCCCAGACGACTTCCAGCTTGCTGACTAATGTACTCGTGGTCGAGTACAATCTCGGGAGGATGGAATGATGCAATTATAAACAGTGCAATCATACAGTCATTAACTATCTTACTATTGGTTGTTATTTCTGTTTTAACCATTCTTTGTTAGTAGTTGTTTTATCTGTTAGTAGCTGTTATTCCCGTTTTCAACTGTTGTTGTTAGTAGCTGTTTCTTCTGTTAATAGTTGTTGGTAGCTGTTATTTCCAAACTAATCAGTTACAACAACTGATTAGTTACACTCAACCAACACTCACAGCTATAAATAATCATTCTCCTATAGAGAATGATAGAATAGAATTATTGAATAAAAGAGAGAAATTAATCCCAGCTTTGAATTACATCAAAGATGATGCAATTATAAACAGTGCAATCATACAGTCATTAACTATCTTACTATTGGCTGTTATTTTTGTTTTAGCCATTCTTTGTTAGTAGCTGTTTTATCTGTTAGTAGCTGTTATTCCCGTTTTCAACTGTTGTTGTTAGTAGCTGTTTCTTCTGTTAATAGCTGTTGGTAGCTGTTATTTCCAAACTAATCAGTTACAACAAATGATTAGTTACACTCAACCAACACTCACAGCTATAAATAATCATTCTCCAGGAGAATGATAGGATAGAATTCTTGAATAAAAGAGAGAAATTAATCCCAGCTTTGAATAACATCAAAGTGGTATCAGAGCAGCCCCGATTCTTGGACGGATGGCTGGCCGAAGAGGAAACAACCCAGCCACGGGGGACGACCGTGCGCAAGAAGAGGCAAAAGACACTGCCGCTCTCTCACCAAGGACATCAACGGTTCGCTTGCTGGCCGTCGAGGACTCCTTGGGAGATTTACACCGGAAGATAGATAGAGTCATGGACAACTTTGAACTTTTGGCAAGAAGGATGGACGAATTACGGGCACCACCGCAGCTCGAAGCAGAAATGGCAGACGATGGGGAGATCAACAACAGGCGAAGGCAACGTGGACGGGGAAATTTCAGAAATCTCCACAATCCACGATACGCTAACCGAGGAAGGGCTGATCTCAACCCACCACCACAATTCTACGCCGACATCCATAATGAGCAAGAAGACGAATCGTCGAGCAGTGAAGACCAGAACAACCCCTGGGACGCCTTAGACGAAACACAGAGAGGACAACACGGCAGGAGGTTCGGCACGCGGGCAGAGACTCATCATGACTTCAAGATGAAGGTTGACTTACCTTCATATAGTGGCAAGAGAGATATCGAATCCTTTTTGGATTGGCTAAAAAGTACTGAGAACTTTTTCAGTTACATGGACACCCCTAAACAGAAAAAGGTACGTCTCGTGGCCTTGAAACTCAAAGGGGGCGCATCAGCATGGTGGGAGCAACTGGAAGCCAACAGGCAAAGATACAACAAACGACCCGTACGCTCTTGGGAAAAAATGAAGAAGCTATTAAAAGAACGATTCCTGCCTCCGAATTATGAGCAGACTTTATACAACCAATATCAAAATTGTCGTCAAGGTACCAGGACAGTCACCGAATACATAGAAGAGTTCCACCGATTAAGTGCCAGGACAAATCTAAGTGAGAACGAGCAGCATCAAATAGCCAGATTTGTGGGGGGTTTGCGTTTTGATATTAAAGAAAAAGTAAGATTACAGCCTCTCCGTTTCCTATCTGAAGCAATTTCATTGGCCGAAACAGTAGAAGAGATGATAGCTCTAAAGACCAACACCATGAATCGAAGAACATGGGAACCAACATCAAACAAGAAGACAAACTATGCGAACAAGTCAAATGATCAGCCGATGGCACCAACTTATGGAAAAGGAAAAGAAGCCGACTCTCAGACTGCAACATATGAAAAGTAGGCAGAGATGATCAACAGAAGCAAGAACCAAAATAATTACACTCGCCCATCATTGGGCAAGTGCTTCAGATGCGGACAACCAGGTCACCTATCAAATTCTTGCCCTCAAAGAAAAACAATTGCCTTAGCTGATGAAGAAGACAACTTACCTGGAGAGGTGAGTCAGAACCAGAAGAGGAAACAGAAGAAATTGAAGCCGATGAAGGAGATAGGATCTCTTGTGTTATCCATAGAGTACTCATTGCTCCCAAGGAAGAAAAGAGCCCACAACGCCACAGTCTTTTCAAGACAAGGTGCACCATTAATGGGAAGGTATGCGATGTTATTATCGATGGAGGTAGCAGTGAAAACTTTATAACCAAGAAGATAGTCTCCAACCTGAACTTGAAGGTTCAGCCACATCCAAACCCCTACAAGATAGGATGGGTAAAGAAAGGGAATGAGTCCACAGTTAACGAGGTATGTACGGTCCCCCTTTCTATCGGCAGCAGCTACAAGGATCAGATCGTATGCGATGTAATCGACATGGATGTATGCCATGTCCTCCTAGGCAGACCGTGGCAACACGACACTCAAACCTTGCATAAGGGGAGAGAAAACACATACGAATTCCACTGGATGGGTAAACGGATAACTCTACTGCCCTTGACCAAAAAGAACGAGGAGAACAGTAAGACAAGGGGCCAGCTATTCACAACGTGCAGTGGCAAAACTCTTTTAAAAGAAAGAAAGCAAGATATTTTAGCCCTTGTGATGACAGGCAGCTCTAATGAAGAACAGGCTGGAGAGTTGGAACCACAATTACAACAACTTT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ATCAGTTACAAGGAGCCACAGTGTTCTCTAAGATTGACTTACGCTCAGGTTATCATTAGTTGAGGATTATAAACATTGACATTTCTAAGACTGCTTTTCGTTTGAGGTATGGACATTATGAATTTATAGTAATGTCTTTTGGTTTGACTAATGCACCTGCAGTATTTATGGATTTGATGAACAGGGTGTTTAAGGATTTCTTAGGCACTTTTGTGATAGCCTTCATTGATGATATTTTGGTTTATTCCAAGACCGAGGCCGAACATGAGGAACATTTGCATAAAGTATTAGAGACTCTTCGAGTCAATAAACTTTATGATAAATTCTCTAAGTGCGAATTTTGGTTGAAGGTGGCTTTTCTTGGTCATGTGGTTTCTAGTGAGGGAGTTTTTGTGGACTCTGCAAAGATTGAAGTGGTTACCAGTTGGTCTCGACCCTCTACGGTCAGTGAGGTTCATAGTTTTCTGGGTTTAGCAGGGTATTACCAGAGGTTTGTGGAGGATTTTTCTCATTTGGCTACTCCCTTGACTCAGTTGACCAGGAAGGGAACTCCTTTTTGTTTGGAGCCCAGCTTGTGAGGATAGTTTTCAGAACCTTAAGCAAAGGTTAGTTACTGCACCGGTTCTTACAGTACCAGATGGAACTGGAAGTTTTGTGATTTACCGTGATGCTTCTAAGAAAGGACTGGGATGTGTTTTGATGCAGCAGGGTAAGGTGGTTGTTTACGCCTCTCGCCAGTTGAAGAGTCATGAGCAGAACTACCCAACGCATGATTTGGAGTTGGCAACAGTGTTTTTTGCACTAAAGATGCGGAAACATTACTTGTATGGTGAAAATATACAAATCTTTACTGACCATAAGAGCCTGAAGTACTTCTTTACCCAGAAGGAGTTAATAAATATGAGACAGCGAAGGTGGCTCGAGTTGGTAAAAGATTATGACTGCGAGATATTGTACCATCCTGGTAAGGCGAATGTGGTAGCTGATGCTCTTAGTAGAAAAGTATCACATTCGGCAGCACTTATTACTAGACAGACACCGTTACATCGAGACATTGAGAGGGCTGAGATTGCAGTATCTGTGGGGACGGTCACCTCACAATTAGCTCAGTTAACGGTGCAACCAACTCTAAGGCAAAAGATTATTGATGCTCAGAGTAGTGATCCTTATTTGGTGGAGAGACGTCGCCTCGTTGGAACAGGGCAGATTGATGAGTTCTCCATATCCTCTGATGGTGGACTGATGTTTGAGAGACGTTTGTGTGTGCTAGCAAACAATGCAGTTAAGATTGACTTACTAGATGAAGCCCCTAATTCCCCATTTTCCATGCAACCTGGTAGTATGAAAATGTATCAGGATCTAAAACGATTTTATTGGTGGCGGAATATGAAGAGGGAAGTGACAGAGTTTGTTAATAAGTGCCTAGTGTGTCAGCAGGTTAAGGCACCTAGACAGAAACCGGCAGGTTTTGTTACAACCTTTAAGTGTGCCATAGTGGAAGTGGGAGAATGTGTCGATGGATTTTATTACAGGGCCGCCTAGAACCCTGAAGGGTTACACAGTGATTTGGGTTGTCGTAGACAGGCTTACGAAATCGGCACATTTCGTTCTAGAGAAATCCACTTATACTGCTAGTAAGTGGGCACAGTTATATTTAACTGAGATTGTGAAACTGCATGGAGTGCCTGTATCGATTGTTTTTGACAGGGATGCACGTTTTACTTTCAAGTTTTGAAAGGGACTTCAGACTGCCATGGGTACGAGGTTAGATTTCAGTACAGCCTTCCATCCACAGACTGATGGTCAAACTGAACGTTTGAACTAAGTTTTAGAGGATATGCTACGAGCTTGTGTTCTAGAGTTCCCAGGTAGTTGGGACTCTCACTTACATTTGATGGAGTTTGCTTATAACAACAGTTTCCAAGCTACCATTGGCATGGCACCATTTGAGTCTATTATCGTTAATGAGTGGACTAGAGTTCGTATAGGTATGACTCTTTCTCTCTATCTTCCTCACTTTTTCTTTATGGATGTGAATTGATCTTTCTTCTTATGAGCTTCGCGGAGTGCAAAGAAAGAGCTCATTCTCAGTCTTAACCTAAAAAATATAGCTTAAAGGAAGACATAGGTAGAAGGTTTAGTGGTTTTCTATTATCGGAAGACGAAAGCAGGTTCCATAAGACAGGGATATTGTGCTCATTTGTATGGTAAATGTTGTAGAACCCCTGTTTGTTGGAGTGAAGTTGGTGAACAGAGGTTGATGGGTCATGAGTTGGTTTAGTCCACAAATGAGGCTATTCAGAAGATTAGAACACGTATGCAGACAGCGCAGAGTAGACAGAAGAGTTATGCGAATGTGAGACGGAAAGACCTTGAGTTTGTTGTGGGAGATAAGGTGTTCTTAAAGGTAGTACCTATGAAGGGTGTTATGCGTTTTGAGAAGAAAGGGAAGTTGAGTCCTCATTTCGTTGGACCGTTTGAGATTTTAGAGAGAATTGGTGTTGTGGCGTATTGTTTGGCATTACCACCGTCTCTCTCCGCACTTCATAATGTTTTCCATGTTTCGATGTTGAGGAGGTATGTGGCAGATACATCTCATGTAGTGGATTATGAACCACTAGAGATTGATGAAAATTTGAGCTATGTAGAACAACCAGTTGAGATTCTTGCTAGAGAGGTGAAGATACTTCGTAATAGGGGGATTGTATTAGTGAAAGTATTGTGGCATAATCACCGAGTTGAAGAGGCAACATGGGAGCGAGAAGATGATATGAGAGCTCGTTACCCAGAGTTATTCCAGGATTAGAACTTTCGAGGACGAAAGTTTCTAAAGGAGGGAAGAGTGTAACACCTATGATCCTAAGGTACTCTATTTTAATTAAGTTGCCCTATTTATGTAGAGTTTTTTATTTTTTGGGTTGGGTGTTGTTATATGATAGGATTGAAGGAAAAGAGAAATTGGGTATTGTTAATTAGGATTGATGTGGATTGTTGAATGTATATTGTGAATGACTGGAATTATGCATATACATAAATTGACGTAGAATTGATGTTGAATATATATGGAGATTGTTTGGGATAAAACATGCAGGTGTGGATGTAGATAGGATGATATTAGTAGACTGTGCTGTATAAAATTTTGGATGTGAACTGGTGAATTTGTTTCGGTTGGGTGTGGGTTATACTAAATTGTGGCTTGTACTGGTAAACTGAGGAGTGTTATGACTTTGTAGTTTGTTCGACTGTTATATTAAAATGTTATCAACGGTCTTTGGACTAAAGTGGGATATGTTGATTGTTAGAATGTTAAGTGAAAGAACTTTATATTTTGAAGTAACGGAAAGATGTTATAAATGACTGTTAAAATGTTTAGAATGTACTGAGGGGAAAATTGTTAGCTTTTATTGGGATGTGTGCCTTGTAGGTGTCCCACGGGATCATCAATCGTTATGCATCCTTCGGGAGCATTAGACTGATATATGTTTCTACAGAACACTAGACTGAAATGTATGTCCCTCGGGGTGTTAGACTGATACGTGTATCCTACGGGATCACAAGACTGGGATTGTGCAGGGTTTCCCAATAGGACGTTAATAATTTATTTTTCCTTCACGGGACCAATAGTGGGTCTCTTACTGAGTATTTTCATACTCACCCCTTTATGTTTAATTTTTCAGGCAAAAGTAACAAAGGCGGCAAACCGGCGAGGGGAAGGAAAGAAACGTGAGTACCATAGGAAATGTGTTATTTTGCTTCCGCTTATTGTTTTTTTTTAGGTTTAAAACGCTGTATTGAAACTTAGCTTACAAACTTTTATTTGTAAATAGTACTTTTTAAGTTTTTGAATATTTGAAATCAGGCCTGACTTAAAGTTGTTTTTCCTCGATTGTGTGTTTTTCAATTGGCTTACATTTCATTTTGTATCAACCAAGGTCTTTTGTCAAAAGTTAATGACCTCGACTTAGGTAGAAAAGTTGGGTCGTTACACTGAAATCCCAGGTTAATATGAATTGTCCTTCGAACTTGGGAAATCAATATATAAAGAAAAAGAATGGACTTCTTTTTCTCACAATATCCCTGATCATACTGATCGACATTCTGTTCTTTGCAAACGCGTGGGAATCTAAATTAAGGCCTAAGACGATGGTCACATATTAAGTTGCTCCTAACTTTAGGGTAGAGCCAGCTTGTCCGAAGGACTCATCGTAGAGATCTAGGAGTATTCACAT

mRNA sequence

ATTATTAAATATAAAAAAAAGGAAAAGAAAATTAAAATTCTCTCTCTCGGGCCGCACGTCGCACGCACCCCCCCCTCCGTTTTTCCTTCTCCCTTCAGCCAGCAACCGCTGGTCACCCCTCTCCCTATCTTCTTCTCTGTTCACCCTAGCAGTCGGTCTTTTGTGAAGCAGTGGGCTGCGAAATCGTGGGTCACGCGACTCTTCGTTTCCCCAGCCGAGCCGCAAACCATCTATACGCAGTCTCTCCATCGCACGTCGTCTCTACGTCGTATCTCGTTGCTCTGCCGCACGTTGTCTATTCACAAAGCTGCTGCCCAATTTCTTCTGCGAGTAACACCTTTGACGTTCGCGCCGCCAGGTTTTCATCCGCTACCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATTATTAAATATAAAAAAAAGGAAAAGAAAATTAAAATTCTCTCTCTCGGGCCGCACGTCGCACGCACCCCCCCCTCCGTTTTTCCTTCTCCCTTCAGCCAGCAACCGCTGGTCACCCCTCTCCCTATCTTCTTCTCTGTTCACCCTAGCAGTCGGTCTTTTGTGAAGCAGTGGGCTGCGAAATCGTGGGTCACGCGACTCTTCGTTTCCCCAGCCGAGCCGCAAACCATCTATACGCAGTCTCTCCATCGCACGTCGTCTCTACGTCGTATCTCGTTGCTCTGCCGCACGTTGTCTATTCACAAAGCTGCTGCCCAATTTCTTCTGCGAGTAACACCTTTGACGTTCGCGCCGCCAGGTTTTCATCCGCTACCGTGA

Protein sequence

IIKYKKKEKKIKILSLGPHVARTPPSVFPSPFSQQPLVTPLPIFFSVHPSSRSFVKQWAAKSWVTRLFVSPAEPQTIYTQSLHRTSSLRRISLLCRTLSIHKAAAQFLLRVTPLTFAPPGFHPLP*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G028120 vs. NCBI nr
Match: KAE8650820.1 (hypothetical protein Csa_017501, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 249.2 bits (635), Expect = 1.9e-62
Identity = 125/125 (100.00%), Postives = 125/125 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   IIKYKKKEKKIKILSLGPHVARTPPSVFPSPFSQQPLVTPLPIFFSVHPSSRSFVKQWAA 60
           IIKYKKKEKKIKILSLGPHVARTPPSVFPSPFSQQPLVTPLPIFFSVHPSSRSFVKQWAA
Sbjct: 1   IIKYKKKEKKIKILSLGPHVARTPPSVFPSPFSQQPLVTPLPIFFSVHPSSRSFVKQWAA 60

Query: 61  KSWVTRLFVSPAEPQTIYTQSLHRTSSLRRISLLCRTLSIHKAAAQFLLRVTPLTFAPPG 120
           KSWVTRLFVSPAEPQTIYTQSLHRTSSLRRISLLCRTLSIHKAAAQFLLRVTPLTFAPPG
Sbjct: 61  KSWVTRLFVSPAEPQTIYTQSLHRTSSLRRISLLCRTLSIHKAAAQFLLRVTPLTFAPPG 120

Query: 121 FHPLP 126
           FHPLP
Sbjct: 121 FHPLP 125

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G028120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8650820.11.9e-62100.00hypothetical protein Csa_017501, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_3G028120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G028120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G028120 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G028120.1CsaV3_3G028120.1mRNA