CsaV3_3G026330 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGAAAATTTTAAATATTATTTACTATATATTTAGAGGTGATTAGGAATGGTCGCAACTCAGCCTTTTTAGTTTTTTTACCACTTAACTACCGGCGACGATAATACCATCCACGAACGCTTCAGCTCCAGCGAGACCCACGAATCTCCAACTCTGAATACCACGAACGGTATTGTTCCTCTCCGGTGAACAGTGTCGGTGCGATACCCACGAGTTGCAGCAGTCACCCATTCGAAATCGGATCTGATTCTGGAACTGGCGCAATTTCGGCTCTCTCAGTGGTGTTCAACGGGGGTTTCATCTCTTTTGACTAGGTTCCACACTGACCTACTTTTATTTAGCGTTATATCTAAGTCACGCACTTCTTAACAGCTCTAAATACGTAGGATTAAGCATATATGGACACGTTCTAGCAAGAATCCAAGTCTATTTAGACAGTGGTTCTGAACATTCTAAGTTGTCGTTTGGACTAGTAAGTTCGGCCACTCAAGTTTAAGATTCTTTAAATTTGTCTCCAGCGCTGGTAAACTCTTATACGTCGACTCAAAGTAGTTTCTGAACTATTTGAACACTTTTCAGTGAGGAACCAGGTCCATATGGTTTAGGCATTAGAACTCCATTTACAACTTTTTGATTTTAACTAAGGTGCTGTTTTTTAGTTTTTGGCCCTTGAATACTCTCTGGTTTGAATTTTGATCATAAACACATTTCGTTAACACACTGAACCATATCATAGAAGAGTAGAGAAAAAAACATAAATATTTATAGTGGTTGTGTATATATTATGCAAGATAAACAATTTTCTATTACCTTTGAACTTCACGAACAAAATACAACAAAAAAAAAAGGGAGAAGAAGAGAAAGACTTTAATTCTCAAGCAATCTGACACAAAACCCAGAATTTTACCCTCTGAGCGGAAGCTAAAAACGAGCCTATAAAACCCAGAAAAACCAGTCTGCATGCAGTACCCTTCAATGATCGTCCAAGTTCATTTCCCACAAACTGATGTATTGGAGGCGGGAGAAAGGTTAAAACCTAATACACAAGTTCCAATGTTTGGGCTACAATCTAGAGATATTAAGGTTGCACAAGATTTTTGGCTTTCATAAATCATAAGCCCAACCACATAAATGCTTAAACAAATGAGAAGCCCAATCCACAACTTCAAAATAAAATATGAGAGAAAATGCTGGAGTCAAAACCACGAAGCAACAGTTGTGTTTCTACGTGTTCAGATTAAGGTTTAAGGTTCCTTTGAGTAAAATTGCTCATTATAAACTCTTTTTGAGACTCTGAATAACATTTCAAACCAGGTTTTAACGTTGGAACCTTGTTTTTATTATTTCAAGAGTTTGTCTTAGTTAAGTGGAGTTCTGCCTGTTGATTTTGTTTGTTGTATGATGGTATGTTAGACGTTACATATTTTATTTATGTTATGTGTATATACGACTTGTATGATCTATTTATGAATTTATTATATGTTATTGAAAAGAAGAAGACAAACACAAGATATATGTGGAAAACCTAGTGCAGGGAGAAAAAACCATAATACAAGTTGCTCTTATTATTTTCTAATAATCCAAAAAATACAAAGGGGAAGAATATATACAGGCTTCAACAAGCCTTAACAAATAAGGAAATAGAACTAGGGTATAATAAATTACAAAAATATCCTTGAGACTAAACAATCAACTAGTCCCTTGTTTCCAACATATTCCAACGCTACTCCTCAAGTTGGAGTGTAGATGTCAATTAAACCTAACTTGCTAAAACAAAAGTCAAAGTTCTGCTTGAGTAATTCTGTAGTGAGAACATCAGCAATTTGTTGACTAAATGGAATGTACGGAATAGATACTGTCATTATCAAGTTTCTGTAAAGATACTACAGATGTATCTTTATGTATATTGAATTTCCTCAGGAAGTTACAATATAAAGTTCTTCAACAAACACAATATAAGACTCAGAACACTATTAAAATCCCAGATCACAGCAGATCATCAACTTACGTAAAAAAGAACTACCAACAAACAATAAAGACTCCATGATATCATAAACCAAAACAAGATCGAACAATAAAACCTGGACCCTTCTGCTTTCTTTCCTTGCAAGGATAAGCAACCTCCTCCTTCCAGAAATTATCTTCGATGCCTTTCTCTCTCCTTCTTCTATTTATCCTAACCAACTAGTGGGACGCACTGAGGGATGATCCTGCCCTTTTTCCTCTCCCAATGCTTCACGTGTAATTCTGTTTTTCTCTTTATTCTTTCTACTATAAGTAATAAGTATAGGAGGTCTAGCAGTTTCTCCTTTGTAAAATATGTTGTCAGTCTCCACATGTTTTGTTCTGTCAAGGGTCATTGTCGGTAGGACTTCTTCTTCGTCCAAAGTAGGTAAATCGGTTGCTTCCTGTTTTTTCTTGTCAACGATTTTCACTTCAACGCTTAGCATTTTGCTCTTTCGTGTTTGAAATTTTGGGTGTGTTATTCCCTGATTTTTTCTCAATTGTTGACGTGATTTTCTCTTTCAAATTAGGTTGCACAATCTCTAAATTGAAAATGTTTTCGTCGTTGTTATCCCCACAAGCAATTTCTTGTTCTTTGCGATTTATACTGTAATATTCCTGCTTCTTTGAGTTTATTTCTTCCTCATCTTCTTTACTCAGCTCATTTTTTTCAAATGTTGGCATGCTATTTTCATAGTATCTTCTTTGGTAAACTTGCATTCTTGGTTGTTCTTGAATAATCAGTGGCAAATTTTGGACATGTTTTGGAGGAATTTGTTGTACATTCAAATTTTGTCTTTGTTGGGGGTAGTTTGTGATTCTTGGTCATGGTAAACCCATATTGTTCTCTATTTCATCAAGTGCCAAGGACATGCGTTCAAGTGAACAAAAGATACCATCGATTGTGCTTTCAATTACGCAAGTGTCGGATCGATGCCTTCGATGTTAGGATGGTTGTTTGCTCCACCTCTTTGAAGGTTGTCATGGGGTCATTGTCGGTAGGCCCTCTTCCCTCCATTAAATCCAAGTTTCTTGATGCTCTGATACCAATTCGATGTAACTCAAATGAGAGAATTTTATTAATGTTTTGAAGTTGTGAATACAAGAAGAGAACTACTCTATTTATAGCAAAAGTAAACTAATCCTAATCCTAATCCTAATTAATAAGACAAACTTAACAAAAGTAAACTAATCCTAATTGTATGACCCGTACCTAATTTAGGAAGGCTAAAATTTGACCAAGTGTTGAAGGCGTTTTGAAAGAAAAGTTGTGATAGGATTTTAGGTGTTTAAGTATTGTTAGGCATTTGAAGTTCTTTGCAAGATGGAGTTAGGCGAGGAATATATCTAATCTTGATTTGACAAGGGTTTACGTGTAGGATTAAGAGCTAAGCATGTCTAAGATGCACATGAAGTTTACACGTGTATCACTAAGAGTAGGAGCTGGTGAATTATTAAGAGTTTAAGGATGACTAATCCATTTAAGGACTAGTATAAATAGAGGAAGATAGTAGAATGTTAAGAAGTTTATTTGTGAAGTGAAGTGTTACTTTGCTGAGTTGCTCCTAGGCAAGAAGAAGAAGAAGAAAGGAAGCTAGGTGTTTAGCAAGGAAGTTCTCAGTGAGTGATTTTCTTCTTAAAGAATTTGTTTATGTTAAAAATTTTCCTTAAAGTTCTTATTGATTTGAAATGATATTTAATATATGAATGTTTTAAAGAGATTTTGAAAGAAAGTTTATACTATGTTTTATATGAATGTAAAATGAAATTATGTTCAAACCATTAGTCTTCTTCCTGTCATTAAGCTAACTGTTATGTGCACATAAGGGATAAGACAACCATGTAGAAAAGGACTGCATGGTGGAATGAAGCTGGCCAATGCATAGAAGGTGTGTATTGTGTTAGGTGGCCTGTGCAACAAGGAGTGAATTAGGATATTTCCGGATACTGTTGATGAAAAGGACATCACAGTAGTCTAAACGCGAAGATGATGAGTCTTGGCATAGGGAATTTCATGTACTTGGTGAAAGGATTGTTTGAGACTAATGTGTGTTTATGTGATAAGATGTATTTATGCTATTTGATATGAAATGATGATATTTATTAGTGTTTTCCAAAAGGGTTTTACTTAAAACCTCACTAGGTCTTTTGACTTACGTTTTAAGACTTCACTTCCCAGGCAATAAGGCCAAAGTAAGGAAGGGTTAAGGAGCTGCTAGGTGAAGAGAAGCCACTTGGCGTTTTGTAAGTTTTTAATGTTATTATTGTATCTTGTAAAATGTTGTAAAATGCTGGTTTAAGGTTAATAAAGGAACAATTTATATTATTCTGTTGTGTTAAAGTGTTTTACTGCCTAAAGTATGAATTCAAGTTAAGTATAACGTCATCAAGCGTTTTAAGGCAAAATTTGAGGACTTAAGCTGAGCTTTTTGGCGTTTAACGCGTTAGAAATGCTCAAGTCATACTATGTAACACGATGCATTGAGGTGCTTGCGGGACAGAGTGTGACACTAACCCTAATCCTAATTAATAAAAGAAACTTAATCCTAATCCTAAATAATAAAAGAAACTAATTCTAATCCTAATAAACCAAAAAAACTAATTCTAATCTTAAGGATTTGGCCATAATATCCTATTCCTACTACATCAGGGAGTGTTGATTATTTTCTTTTTGTATTACATTTTATTGTATTGGTTGTATTATATTTGCCAGATTAATTTTTTCCTTCTTTATAATAGGTTCTTCTATTTAAGAAAATCCTTCTTTCTCTTTGAAAAATAAAAGAAATATATTATTTTGGCAGTTACTATGGTTGAGTACACCGTAAATGCTTGTGTTTATTCACTTTAGTTTTGAGTTGGTTGGTTTTGTTTCACATGATAACTTAAGAATGTTCTGTTGAGTCTAGTTAGAAAGTTTTTGTTTATTTAGTTATCATGACTGATGTGAGAGTTTATGGTCTCAGCTTTTGTGCGCTGTACAGTATGGGAT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MAMEGVASIALLPCGSVSGHFIQLPHSICYGLHGTELECERECSRGEDYRLIKLTITNYNNKQERTVVVECRGHDAARFHSIVHAHGWEEDVVSMVEKKHGKNEIMVSFECQMLKSEKAAEDHIRQFMPKLVGQDAVVNVGPMSIGGLDFEAEEQPGE* Homology
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. NCBI nr
Match: XP_004149842.1 (uncharacterized protein LOC101206322 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011651516.1 uncharacterized protein LOC101206322 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031738372.1 uncharacterized protein LOC101206322 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN58109.1 hypothetical protein Csa_017450 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 3.1e-86 Identity = 158/158 (100.00%), Postives = 158/158 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. NCBI nr
Match: KAA0060329.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold22G001140 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK22078.1 uncharacterized protein E5676_scaffold318G00630 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 1.3e-84 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. NCBI nr
Match: XP_008450156.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491830 [Cucumis melo] >XP_016900818.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491830 [Cucumis melo] >XP_016900819.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491830 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 4.9e-84 Identity = 155/158 (98.10%), Postives = 155/158 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. NCBI nr
Match: XP_038877383.1 (uncharacterized protein LOC120069678 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 7.8e-82 Identity = 152/159 (95.60%), Postives = 156/159 (98.11%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. NCBI nr
Match: XP_022980736.1 (uncharacterized protein LOC111480016 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 308.9 bits (790), Expect = 2.5e-80 Identity = 148/158 (93.67%), Postives = 152/158 (96.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAZ2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G516480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 1.5e-86 Identity = 158/158 (100.00%), Postives = 158/158 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DF47 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold318G00630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 6.2e-85 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN08 (uncharacterized protein LOC103491830 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 2.4e-84 Identity = 155/158 (98.10%), Postives = 155/158 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IS39 (uncharacterized protein LOC111480016 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 308.9 bits (790), Expect = 1.2e-80 Identity = 148/158 (93.67%), Postives = 152/158 (96.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J065 (uncharacterized protein LOC111480016 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 308.9 bits (790), Expect = 1.2e-80 Identity = 148/158 (93.67%), Postives = 152/158 (96.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G026330 vs. TAIR 10
Match: AT3G29280.1 (unknown protein; Has 24 Blast hits to 24 proteins in 9 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 24; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 2.0e-67 Identity = 113/152 (74.34%), Postives = 134/152 (88.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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