CsaV3_3G023450 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G023450
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 21154258 .. 21161870 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_3G023450
SyntenyCsaV3_3G023450
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAAACGATGAGAAGGATGGATATTCCATGGTCAGGTTTCTTTAGTCTGCAACAGATCAAAGTTGAAGAGAAGAGGTTGTGTGATTTTGGCGCCAACCTAACCGTAAAACTCCCAGACGAAGGCGATGACTATTTATCAGGATGTGAAGAAGATTTGGAATTCCAAAATCAGTTAGGATTTTCAAATAATGCCTTTTTAATTTCCCGCCATTTATTTTATATTTTTCCTTTCTCAAATCCAACAATAATTCATTAAGAATTAGTCTAAATTATTACAAAAAAATGCCCCTAACTTTATGGATTGGGTAAAATATATCCATCATCCTTCAATAGTTTCAAAAATGATTTCAAAATATTCTTGGGATGAAAATCCTTAAATTTTTATTTTAAAAATATCCCTAAACAATTGAAAGGTTTCAATAGATATCTTAAACTTAAAAACATTAGAAAGAAAAAGAAAACTTTCATCAATCCAATGTTTATATCAAATTTCTTAGCAACCAAAACTTTGATTGATATATATGTGGATATTTTTATCATATTTTGAATATCGATAGAAAAGTGAATCTAATATTTCCGGGCGATTAATTTTGATCCCACGTTTCAAAAGATATATTCTTTAACGGGCGATTAATTTTCTATTTTTCTAAAAGAGAAGAAGAAAAAAAGCTATTAATTACGAAATCGTGATATTGTCACAGCTCCTCTCCTGCACTTCTCTTTCAAATCCCAATTCTTCCCTCTTCCACAACGCCACTCCTTCCAACTTCCCTTCAATTATCCATTATTTCCCTCCATTCTCCGAACCTCTCTGGATCTTACTGATCTCCAAGCTTCTCTTGTCTTTCATTACTTGTTCGCTGCTGATCCTGGTATTGTGTAAGACTACATTTTTGTTTCACTTCAACATGCTTATCTCTAGGTTAGCCTTATCCTAACACTTCAAGATTATCAATCTCCATGGTTTTCTTCTAAATTTCACTTGAAGAATGATATATTTTCCTGCTTTCCCCTCTCCCCACCACTTGCTATAGACTTTAATTTTTTTTAAAATATGATATGGTAATTTGTGTCCATTGTTCATATTGTACTTGCATTGATTCTACCGTCATTCTTCATATTTTTGGGTTTTAAATCATACTATTATTACTCTCTGCGTCTCCTTAGAAAACAAACCAATAAACAAACATGAACCAGGACTCTGAAATGGCAAATCTTCTACTTAAGATTGCACCAGTTTTTCCACGAAATCCCAGTTTTTCTTCTTGTATATATTTTGTTTATAGAAATTAACAATAACTAAAACAAAGTCATAAATTAATGGTACATCGAGTCAATTAATAATAATCGACGATGGTAGAACTTCAGTAAAACCCTAGATTAAAAGTTTGTTTAAAAATGAATCTTATAGAATTGGTTCTGATGAGCTTTGAAATCTCCTTGCCAGTGTCTTTTTACAGAAAAAAAAAAAGAAGGAAAATCCTTATCAGAGCAAATTAGTTTGTGTTTACTAATGAAAGTAATGATTGTGATGTGATAACTGTTCGTTGGACTAATTTATATGTTTACACTGTTTCTTTTCATTTACAATAATTTTAATACACTTCAATATCATCTGTAATAGTGCTCTCGAAATTTGAAACGATTATAGTTTACATAATGGTATGATTGACCTTTGAGCTTGGTTTATGAAACTCTCAAGGTTTGTGTGGCTGAATGTTAATTTTGAGTTTAGTGAGCTTGCCGTCCATCTATAATATCGTTAGTGGTAGTGTTAGTGTATATTTTAATTGCCTTGATATAATTTCTAACCTCTGAAGTAGAAAGAAGAGATACACAAAGTAGTTCATAAAAGGTCGTCATCACAATTAAATGATTGCATTTGTGGTGATTACACTCAAGTATTTTACTCAATGGAAATTGTTTTATTTTTATTCTTGTCTTGAGTTTAAGACTTCCAGCCAACCTATTGGCTGTGAACTTGGAGGATAGAAGGAGATCCTCTATGGTGTATTTGATCAACTCTCGTTGTTTCTTTTCTTGACAGCATGACAAGCATAGACCACTTTATTACAAAATATGAAATATGGAACAATCCGAATTTCAAAAGGGTAAAAGATACATATGACTTTATTTTCCATCTCAGCGTCCCAAAAAAACCTGGCTGATGGATGGTTATTCATCTCTTTGGACATACGTACTAACGATCCCCAGATACTTATTTAGCAGCTTCAGCTAACCTGTGTGAGGTAACGCGTTCCTTCACTTGACTATTTTAACTTCTCTACATTGTTCTCTTCTACATGATTCTCTTTTCTAAAACTGCTTACTAGTTGGACCGATAGATTTTTGTTGTTCTGCTCATCACTGACATGTTTAGGGTGCAAGAAACTCGGTTGGTTGGTGGAAGACAATAGCCTTGCCCACATCCTGTCAGTAATCACTACTTTGTTTTGTCTCTCAGTTATCCGCTGCAAATGTAGGAGCAACATAAGATTGGTCTATTTTCAGGTACTAGACCTCTTTTCATACCAATATACGAACAATTAACTTTAAGCAACATGGGAAAGTAAAGGTTTATGATATTGAGCTTACCTGAAATGGTATGTAAGCATGCCTTCCATTTACTGGGCCTACTGTAAATCCAGTATATCCTGCCATTGCGCCATGAATGGCACTTTGAGCAAGAAGGGTGCAAAAGATGTTATCTGATGCAATGCTAGGAACTGCTCGAATCATGTAGGTTGGATCTACAAAAGTAAAAAAAAATTTTAAAAAATCACAATAAGTAATGTTTGTGTGTTTGTGTTTGAAGAAAAATAAAAATTGCATGACAGAGAAGGATAACCCAGGCTACCTATATATTTGAGATTTATTACCATCTTCCTCTTTTCTTTGAAGTAGTCCTAGATTAACCAAAACTCATAGTTAATCTCCATAATTAGTATATGCAAGATATATGTATGTATGTATATATGTATGTATGTGTATATATATCTATTCTTTTAGTATTTAATATAAAGGTAGGACGAACTTTGATTTGTTGGGATATCCATAAACCAACGTCTTGGTGTAGCTTATTTCCTGAAGCATCTTGTTGATCTAGTTTATGTATGCTTTCAGACATGAGTTCTTGTCCAGCTCCTTCAGCTATCACTATAACCATGTGCCCATGTTCTTTTATGCAATGCTCAATATACTCGAATAGACCTCCCTCTCCTTCAAGATAAAAGGGTGACTCTGGTATCAAGCAACAATCAACATCTCTACTTGCGAGAGTTGCATACATTGCAATAAACCCTATATGATTCCAGATCAAATAAGATTGGTTAAGGAAAAAGATTTTTTTGTCACAAATTCAAACTCCAACTAGCGATCAAGTGGCAAAATCTTACCACTATTGCGACCCATCAATTTGACCAACCCTATACCATTCTCATTACTTTCCGATTCAACATGGGCGGCACTAATGGCACGCTGAGCTTCTTCCACGGCAGTGTCAAAACCAAATGACTTGTCAATGACCTAAAAGAAGAGGAATGGTGGAAAGATTTAAATATGGACTTGATGGTTCATGCTGCTACGTTAATCAACAAGTTCACTAATATTTACAGGAATGTCATTATCAATAGTCTTCGGAATTCCAGCTACGGCAACTTTGAGCCCACGCCTTCTGATTTCCTGTATAAATAAGAACCATAATTTATATGAGATCAAAGCTCTTCAATCTTTAGATATCCTACCCATTTGCAAATAACCAAACCAATGTGCATTACTTCAAAAATGGCAGCAGCTCCTTTCTGAGTTCCATCCCCTCCAAGTATGTACACCTGATTGATGCCCCTGTGTTGAATGCTGTCAACAATCTTGGTGGTATTGTGACCACCTCTTGACGTTCCAAGGATGGTGCCTCCACGTTTATGGATGTTGTTCACCGACTTGGGTGTTAACGGAATTGTATTCCTTGCATAGAAACCTTTGTACCCTCCCTATAGGTGAAGTAATTGCCCTTATTAGTGATAATTTTAATGGTGATGAAGGATAGTGAAAAGGGAATATAATCACCTCAATTCCAACGACTCTGTGGACGCCATACATACGGTACAATCCACATACTATTTCTCTAATCACTGTATTAAGACCAGGACACAAACCACCACAAGTTACAATACATGCATGAACTTCATCGGATTCAAATAACACCTGAAAAGTTTTGGACTTGGATTAAAATCCAAAGAAACTAAAGCAATGATGGCAAAACACTTGTAGGTAAAAAAAACATCTAGCAACCTTCTGACGAGGTCCAGCTCGTCGAAAATGTGTCCCTCTCGGACTGTTATTATGAACAACGACCTGTTTCCAACAAAACCATAGGAAAATCAGAATAATTGAATCCCAACTTCATGAGGAAGTAGAACTTGATCACTTACGTTTTGAGCAACAGCATCATCCACGTTAACAAAATATTGCCTGAAGAAAATTCAACTCTCATTAATATTTTAATTGGTGTCATTCCCAAACAAAAGAAATTGTGCATCAACCAAACACCGAAGGGACATACTTAGCCGCAGAATAGGCAGGATTGTCTTGTAGAGGATTTAGATTTGCCTGTAAAAAAAGAACAGACAAATTTTCATTCTTCATTCGTCCATAAAAGTAGGTAATTTTAAAATTACGGAGGGGAAAGGAAAACAACAAAAACATAAAACGTATACACTCACAATCAAAGCAGAGTAGATACTAAAGTGAAATTTAACTTTTTAACCATGATCTTGTGGATTACTAACTATTTTAATTACTTTAATCATTGAAGATAAATTCCATAAATAGTAAGGTTTAAAAAATCAGAATCAAACATAACAAAATAAGTAAAAGAAAATTTTCTAAACATAACTCAATTGGTTATGACATGATTGAGGCATTATAACAAATTTTTGCAACTACCGGAAGGTCAGGGAGATAATCAGTCAAATGAGGGACATCTTCAAGAACATAATGAAAGTCACCACCAGTCAAGGAATCTCCGGGAGCACCTCTACTATTCCCACCATTATGGTCCATCGGAGATGATCCGCGGTTCCAAAAGGGGAGGTGATCGGAGGCAGGTGCCGAGAAGTGGATGGAAGTGGAAGAAGAAGAGAAGCTAGAAAAGGAAGAATCCATGGGAATTGAAGAAGGTCAAAGAAGAAGGAAGAAGAGAAGGCATATTTGTAGACTGATCGACAGGAACGTCAGATGGTGGTGACTTTTATGAAGAAGAACGTCATGGTGGTGACTTGTTGAAATGAAAAATAGTTAGAAAAGGCAGAGTAGTGGTGGCTTCTAGAGGATTGGTGAGGAAGCCATGAAAAAAAAGTAGAAAAGTCCGAAAGAAAGAAAAGGAATATTCTTGAATCTCCCATGGTTCTCATATTCGTGCAGCTTGTGATTTTGCTACCTAGACCTACAGTTTCACGGATTATGGGGGAACCTCTATGGGCTAATTTGTCAAATATTTTAGAAGGAAACTTCAATTCAAACTTGAATTAAGCACAAGGAGAAAGAGAAAGAAGGGTTGACTTTACAACCGATTTGACAAATTGATATATAGGTAGCTATTTTGGGTATGAATTTTCTTACTATAGAGTTGAGCTACAAGAACATCCTCCAATAAACCATCATGAGTTTCAAATGGTAAAAAAAGAGAAATGATGATATTTAATTAAGAGCTCATAAATTTAATTCACGGTGGCCATCTATGTAGAAATTAATTTTTTATAAAATTTTTTGATACCCAAATGTTATAGAATTAAGCAGGTTGTCTTGTGAAATTAGTGAAGGTGCATGTAAACTGACTTGAACACTCACGAATAAAAAAATAAATAAACATAATCTAGTAAAAAATACTAATAAGCCTTTAAAAACCTATATAATTTTTTATTTGTGTGAGTGAATATGACAATTATCATAAATTAATCCGTGGTTAAACTCAATCAAAATAAGTTTAGCTATATGTAAAAAGCTTTAATTTCCTACCGCCACTTAACTTGATAAAGTTGGAGCTGAGATCAAAAGTTAGAACTCTCCTTTAAAGAAATGGTTAGATTCAATGTATAACATTTATTATATATAAGATTTTTCTTGTTCAACATAGCTGGAGCTGGAGTGTATAGTTAGATTCTATTGGCTACATTTATTGCTAGATCAATATATATTTAACTTTGAAAAATAACATTAGTTTTTTGTTGGAGACTAATGTTTGAGAAGATTCTTGATGCCTTCCAACCATACATTACATCAAGTTGACATTGATAATCTTTTCTGTAAAAGAGCTTAGTTTTATTAATATTTTAGAAATCAGGGTTCGAAGTTTTTTTTTTTTCTGGGGTGGGGGAGGAGGAGAATTTTTGAAAAATAGTAAAAAAAAAAACACTACAGGATCCACTACAATCAAGAAGTGTATATATTTAACTCATTGTCATTTTTGAAGATTGTCTCTCTTATATATATACAGAGAAAAAGACCGAAAGCCAAATTATATATTTTTATTTGGGTCTTAGATGTTAAGAAAAGTATATTTAAGGGAGTGACACCAATGGGCATGCTTGTCTATATATTGATCATTTTTCATGTTTGTTGAAGGAATTATATTTAAATATATATATATTTTATCCTTTTTCAACAGGGAATGACGAAATTGGGTTTGAGTTCCATTGTCATATATAGATGATATATTATATAGTATGATACAAACAACTTCTCCCCCTATTGTACTTTATTGTAAAATAAACGTCTAATTAGGTTCTTCAAAATATTAATATATTATATATGAATATTTTAAGTATGTGACAAATGGGTGTCAATAATTTGGTTGCTTACCTGGAGAGAGAGAGAATTGAAAATAACGGTAAATAATACATAAAAATAGGGCAGTGTTTGGAATGGACGGAGAATTATGAGAAATCAACATTCATTCTCAATTCTTTTAAACAATTAATTATGAGAAAATGAACATTCATTTATCATATACATTATTGGGAAATTATTTTAAATAATCAAACCTTATATATTTATAAATATAACGTCAAGATAGACTATTATTTAGGTATATCCCTGATATTTTATAAATATTTGCTATATTTGAAATAGTCGAGGAACATAGTTTACTAAAATCTTGATTAAAAGTCAAAACCCTTACTAAATGAACAAGTTCTTTTTTTTGCAGGTTAGAACAAAAGTGATCACGTAATTTTGAGTGTTAGTGATCAGTTTGTCATTTGAGTTTCTCTATATGAGTTTCTATGTGTGAGTATAATGGCAATGGAGAAAGTTCTTAATAAAGTCTTATTTTAGTTGTATGGTTAATGTTCTTTAAAATAAGATTGATTTGGTACAATAATAACTTCTTGTTTTGGTTGTAGGGTGAAAAAGGATAGGAAGACTCTAATACTCCCATTTAGGAAACTATAACAACCTTTGTCAATTTCATTTCAAAGGTCATGCTAAAGAATTATTGAGTGATCTTTGTGTACCGATTGATTTGATTTAAGAATCTACTAAGAAAATGATGGTTAAGTGCGAGTGTACATTGTCAACACAATAGATATGGAAAGTATTTGAAATATTGTATTC

mRNA sequence

ATGAAAACGATGAGAAGGATGGATATTCCATGGTCAGGTTTCTTTAGTCTGCAACAGATCAAAGTTGAAGAGAAGAGGTTGTGTGATTTTGGCGCCAACCTAACCGTAAAACTCCCAGACGAAGGCGATGACTATTTATCAGGATGTGAAGAAGATTTGGAATTCCAAAATCAAAGAAAAAAAGCTATTAATTACGAAATCGTGATATTGTCACAGCTCCTCTCCTGCACTTCTCTTTCAAATCCCAATTCTTCCCTCTTCCACAACGCCACTCCTTCCAACTTCCCTTCAATTATCCATTATTTCCCTCCATTCTCCGAACCTCTCTGGATCTTACTGATCTCCAAGCTTCTCTTGTCTTTCATTACTTGTTCGCTGCTGATCCTGGTATTGTGTAAGACTACATTTTTGTTTCACTTCAACATGCTTATCTCTAGCGTCCCAAAAAAACCTGGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAAAACGATGAGAAGGATGGATATTCCATGGTCAGGTTTCTTTAGTCTGCAACAGATCAAAGTTGAAGAGAAGAGGTTGTGTGATTTTGGCGCCAACCTAACCGTAAAACTCCCAGACGAAGGCGATGACTATTTATCAGGATGTGAAGAAGATTTGGAATTCCAAAATCAAAGAAAAAAAGCTATTAATTACGAAATCGTGATATTGTCACAGCTCCTCTCCTGCACTTCTCTTTCAAATCCCAATTCTTCCCTCTTCCACAACGCCACTCCTTCCAACTTCCCTTCAATTATCCATTATTTCCCTCCATTCTCCGAACCTCTCTGGATCTTACTGATCTCCAAGCTTCTCTTGTCTTTCATTACTTGTTCGCTGCTGATCCTGGTATTGTGTAAGACTACATTTTTGTTTCACTTCAACATGCTTATCTCTAGCGTCCCAAAAAAACCTGGCTGA

Protein sequence

MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRKKAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLSFITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. NCBI nr
Match: KGN58019.1 (hypothetical protein Csa_010667 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 304.7 bits (779), Expect = 4.6e-79
Identity = 152/152 (100.00%), Postives = 152/152 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK 60
           MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK
Sbjct: 1   MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK 60

Query: 61  KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS 120
           KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS
Sbjct: 61  KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS 120

Query: 121 FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG 153
           FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG
Sbjct: 121 FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG 152

[Close]
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAS4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G435000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 304.7 bits (779), Expect = 2.2e-79
Identity = 152/152 (100.00%), Postives = 152/152 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK 60
           MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK
Sbjct: 1   MKTMRRMDIPWSGFFSLQQIKVEEKRLCDFGANLTVKLPDEGDDYLSGCEEDLEFQNQRK 60

Query: 61  KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS 120
           KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS
Sbjct: 61  KAINYEIVILSQLLSCTSLSNPNSSLFHNATPSNFPSIIHYFPPFSEPLWILLISKLLLS 120

Query: 121 FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG 153
           FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG
Sbjct: 121 FITCSLLILVLCKTTFLFHFNMLISSVPKKPG 152

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN58019.14.6e-79100.00hypothetical protein Csa_010667 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LAS42.2e-79100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G435000 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CsaV3_3G023450 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G023450.1CsaV3_3G023450.1mRNA