CsaV3_3G020160 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATGGGGTACTGCCGTTCTCTTATCAGGCGCCGCCGCCGGAGCCGATTCCATTTCGGCCAGTCTATGTCGATGTCTTAAACTACGTACCAGTCCGCCGTTTTCACCATTGCTTGGATTCTTCTATGCGAAGGTCATGTACAGCACTAAGACCTTCTCTTAGCGTATTTCCTCACTTTCTTAAACCCACAAAACTCTTTCAAGGTTATTCCTCTCCTTGTAATGGAACTAGAATCAAACCTGCTCTCGTTCATTCTCCTTTGCTGGCTGGTGACGGCCATGGGTGTGATGGAAATAACAATGGTGGCTGGAATAATTCGAATCCTTTTGGGGGTTTTGGATGGTGGCAGTATGACGGTGATTCTCCCCCATGGTCGGACAATGCCTTCCTTGCTTTCTTTTTTTCCTCTGTTCTGGGTTGTTTCTGCCTCTTTCAATTGGCAGTAGCGCTAGCACGTAACAATATGAACACCGAGTCTATTTGGGAAGTAAAAGGAGGTAAGCGAATCCGCCTCATTCTCGATACGTATAGAGATGAGTTCCATGTTGCAACTGGCATGCCGTCGTCTTCGTTATCCTTTTCCTTTGTCAACGTTTGGCTTCGTTGCAGCGATATATTCACGCGTTTGATGCTTCCGGAGGGTTTTCCAGACAGTGTCACCAGCGACTATCTGGAATATTCCCTTTGGCGAGGAGTCCAGGGGATTGCCAGCCAAGTTAGTGGGGTGCTTGCAACTCAGGTGCCCATTTAAGTTCATCTGTGGTTCCTCTTTCCTATTTCTCATCCAACAAAAAAGTAATTTACTGAATTTTGCTTGAACCCTCGCTGGGAACCAGGCACTGCTTTATGCTGTTGGATTGGGGAAAGGAGCTATTCCGACTGCTGCTGCAGTGAATTGGGTACTGAAAGATGGATTTGGATATCTAAGTAAAATTTTTCTCTCAAAATATGGACGGCACTTTGATGTTCATCCGAAGGGGTGGAGGTTGTTCGCTGATCTTCTGGAAAACGCTGCCTATGGGATGGAAATGTTAACTCCCGCATTTCCCCTCCATTTTGTCGTGATCGGTGCTGCTGCTGGGGCCGGACGATCTGCAGCTGCCTTGATTCAGGTTATTGGAAGTTGATACGTAATTTAATTTACACAGATATGCCCCATTCCTCATGTTTGCTGCCTTATGTTTATATATTTAATCTGCTGGTAAGTTTCTTCGAATGCATAGCTTAATTTGATTTAGATAGTGAAATGCAGAAGTATTAAATGAAACCAATGGATGGGCAAATGTCTAAGCTTTTGATAGGTCGTGGAGGATCTTGGTTCATGGAATGAGTAGAAGATCATGATCACAAATGTATTAGATCGCCTTCTCTTTAACAATTGAAGTGGAGGTGGGTAGTGGAGAAGAAGTTTCGGTTTTAAATGTTTATGTTCCTTCAAATTATAGATCAAGAAAAGTGTTTTGGGGAGAACTATAGGGCGTGTCTTTAAAGATATTGTGAGTGACAATTGTAGAGAGTCCCCAAAAAACCAAGCCGAAAATGGGTTTTGCCCCATCTTTTGAACCTTAAGAATTTTGCCACTTTGCTTATGCCATCATTAGCTAAAAATACCAAATTATCCTTAATTTGTTATGCCTTCTTTCTCTTCTTGATTTTCTCTTTCTCCACTCTTTCCCTCCTCTTCAGTTGCAAGGGTCATCGAATGTGGATTTTCACCAGAGAGAGGGTCGTCGTAAAGTGGGTTTTCAGCCCTGAGTGTTCTCCTCTCGCCACTCGACATGGGCCACTTGACATGTCATGAGTTGCGAGACTTTGGGATTTGACACTTGCTGACGATAATCCTTTACTAAAGAGAAGAGGACTTGGGGAAATGCTATAACTATTTTGCAAATAAGCTTTGTTTCAAGGCCTTTAATTTCCTAACTCCAACCCTCCCAAATATACGGGCATCCTGCCGAAATTTCCAATTAATCACCGACACTCCTTTACCTCCTCCACACCTTCCCATAGGAATCCTTCATGAGTTTGTTCAAGCCTTTACACACTGATCCTTGAGGCTCTAGAAAGGGAGAAAAATAAATCAGAATACTTCTCAACACCAATCAAGTTAAAGTCAGCCCACCTCCCTTTGAGGAAAAAAAAAAAACATTTCTCCCAAGAGGCCAATTTGTTTATCACCTTATCCTCAACAAAACTCCAAAAGGAATTCTAAAGCGTGTTATTCTCGACCACATTTTCATTGCCAACGAAGTGGTGAAAGACTTAGCTAAGTGGTCTAAAATCACCAAAAGCCAAAGAGATGGGGCCTCGGCCTAAATGATTTGAGATTAAGAAATATGACTCTTTTATCAAATGGGGATGGAGATTCATGTCAGAATAGAAGGCCTTGTGGTTCAAAGTAGTTAAAAGTATTCATAGTATCCACCCCTTCCTTTGGCACACTAGCAGGAAGGAGAATTTGAGTTTGAGAAGCTTGTGGGTTAGCATTTCAAGAGAATGATGCAAGATTGAAGCACTAGCCACTTTCAGAATTGGTAATGGCAGCATAATGTATTTTTAGATTGATCCATGGTTGGATAATATTCCCCTGAACAAGTTCCCTGGATTATCTCGTATTACCCTCTTGCCTAAACAGTCAATTTTTGAGCACTGGGATAGCCGAACTAGTTCCTGGGCGGTTTACTTTAGAAGATTAATGAAAGAGGAGGAGGTTGGTGATTGAGGGAAAATGGTAAACTCTATCGTAGATAAGAAAGTTTGGTCCCTAGAACCAAGTGGGTTCTTAATCCTTGGTTACTCATCTATCACTTGCTTCTCCCATTGATGTTTCTTTATATAGGGTGCTTTGGAAAACTAAGAGTCCTAAAAGAGTCAACATATCCATGTGGATTATGCTTCAAGGGAATTTAAATTGTGCCTCTTTTCTGCAAAAAATCTTTCCTCTCATTGCCTATCTCCTTATATGTGCCATTTATATTGTATGAATCAAGAAAACCTTCAAAACCTTTTTTTTTTAGTGTCCTATGCAGTGAATTGTTGGTGTAGGCTGCTGCAAATTTTTAATTTCAGATGGGTTTTTTATGGCAGTTTTAGTGGTAATGTGCTGCAAATTCTCCCTGGACCAGATTAAAGAAAACCTCATCAGTTTTATGGTGCAATGCAGCCAAGGCTTTATTAGTAGAAATATGGTTTGAAGGAAATCAATGAGTTTTCCACAATACGGCTTAGTACGGTTTGGTCGATTTGAGTATGCTCGTTTAAACACTTCATCATGGTGCTCCATGGTCACATGATTTCAAGATTACTTTACAGGACATTCACCCAACTAGCAAGCTTTTATTGTTTATTCATTTTGAGTTCAGCTAAGGAGATTTAAGCAAGGGCCTTGTTTTTGCCTGGTTTAGAGTTGTCTTTTAGTCTTTTGTTAATGATAGGCCGTTGATGTAAAGGTCTTATGTTTTGGACCATTTTTACTTTCTCAATGTCATTTCATTTCTCTATTTTTTGGATATGATGAAGACGCTAAGGGAATATTAACCTAATTGAGATATTCGGATGCGTCTACTGATCCCTAGTTCTTTAATTGCTCATTGTATAACCCTCTTGTACTTTGAGCTCTGCCTCATTTATTTTTTATAATAAATGAGATTCCTTTCCTTTTAGAAAAAAAGAAGATTCAATGTTTCAACAACAATAGATTCGATCTCATTAAGCTATCAGGAGATGAAGAGTTAACATCAATTCCTTTGAATCCTGAGATTGAAGAATTGATTGGCAGACTCTAAACATATCAGGAAACCGTCTTAGAAGCCCATGGATCAGTATCTCTAGAGAATAGGAAAAGGTGGTTGAGTTGGCAACTTTCAAAACAGGGAACGGAAGGAGAGTAGCTTTCAGGACAGATTTGTGGATAGGTGATCTACCTTTTAAATCTCAGTTTCCACATCTTTTCAGATTAGCTCAGCAGCCAAATGATTCAGTTGCTGCCCACCGGGATTTTGTCACTAAATCTTGGTCTTTAGTATTTCGAAGATTGCTTAAAGATGAAGAAATTCAAGATTTCCAATGTCTTTTAACACTCATATCTCATAAAGGTCTAACGGACTTGGATGACAGGAGAGTTTGGTCATTAGAATCCTCAGACCATTTTTCAGTTAAGTCTCTTTCAAAGCACCTTTCTCCCTCTTCACTTTTGGAAAAAGTTTACTTTAAAGCACTTTGGAAAACCAGCAGTCCAAGGAGAATAAATGTCCTGGTTTGGATTATGGCAGTGGGTTCTTTAAACTGTTTCGAGACTATGCAAAGGAAGCTTCCCAATACGTGTTTGCTGCCTTCAGTGTGCCCCCTTTGCTTGGAAAACAGTGAGCTATTAATTCACCTATTCATTTTCTGTCCCTTCTCATCAAATTGTTGGTTTAGCATATATGCTCAAATCAGTTTGGGTCTTTGATGGTTCGTTTAGCGCCAATGTGTGCCAATTAATGTGGGGGCCTTATTTATCAAAAAAACCTTTTCTAATTTGATGATTGGAAGGACATTAAGTTATACCTAGAGGATCTCTTTCAAGTCAAAATCAATATTAACCCTTTATTTGCAGACAAAGCCATCATGAAAGTTACTCAAGGAAAGTTCGAAGATTTAATTTTTGCTCAGGTCAAATGGTTCAATTATGGAAAAAATTTCATTTGTTATTCGAAAAATGGAATGAAGCCAAACACAGCAGACCAACTCTTATTGAAGGTTTCGGAGGATGGTTGTCAATAAAAAATCTTCCTCTCAACTTATGGCGAAGAATTATCTTTGAAGCAATTGGAGCATACTTTGGTGGACTGGAAAGTATAGCCTTAGAAACACTCAATCTGATCAAATGCTCTGAAGCAAGAATTAAAGTTTGGAAAAATCTTTGCAGATTCTTACCAGCAACTATAGAATTAAAGAGTGAGAACCGATGAAATTTTTTCCTTAATTTTGGGGATTTTGAACCCTTAGAAG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ATGTATGGGGTACTGCCGTTCTCTTATCAGGCGCCGCCGCCGGAGCCGATTCCATTTCGGCCAGTCTATGTCGATGTCTTAAACTACGTACCAGTCCGCCGTTTTCACCATTGCTTGGATTCTTCTATGCGAAGGTCATGTACAGCACTAAGACCTTCTCTTAGCGTATTTCCTCACTTTCTTAAACCCACAAAACTCTTTCAAGGTTATTCCTCTCCTTGTAATGGAACTAGAATCAAACCTGCTCTCGTTCATTCTCCTTTGCTGGCTGGTGACGGCCATGGGTGTGATGGAAATAACAATGGTGGCTGGAATAATTCGAATCCTTTTGGGGGTTTTGGATGGTGGCAGTATGACGGTGATTCTCCCCCATGGTCGGACAATGCCTTCCTTGCTTTCTTTTTTTCCTCTGTTCTGGGTTGTTTCTGCCTCTTTCAATTGGCAGTAGCGCTAGCACGTAACAATATGAACACCGAGTCTATTTGGGAAGTAAAAGGAGGTAAGCGAATCCGCCTCATTCTCGATACGTATAGAGATGAGTTCCATGTTGCAACTGGCATGCCGTCGTCTTCGTTATCCTTTTCCTTTGTCAACGTTTGGCTTCGTTGCAGCGATATATTCACGCGTTTGATGCTTCCGGAGGGTTTTCCAGACAGTGTCACCAGCGACTATCTGGAATATTCCCTTTGGCGAGGAGTCCAGGGGATTGCCAGCCAAGTTAGTGGGGTGCTTGCAACTCAGGCACTGCTTTATGCTGTTGGATTGGGGAAAGGAGCTATTCCGACTGCTGCTGCAGTGAATTGGGTACTGAAAGATGGATTTGGATATCTAAGTAAAATTTTTCTCTCAAAATATGGACGGCACTTTGATGTTCATCCGAAGGGGTGGAGGTTGTTCGCTGATCTTCTGGAAAACGCTGCCTATGGGATGGAAATGTTAACTCCCGCATTTCCCCTCCATTTTGTCGTGATCGGTGCTGCTGCTGGGGCCGGACGATCTGCAGCTGCCTTGATTCAGGCTGCTACTAGGAGTTGTTTTTATGCTGGCTTTGCTGCTCAAAGGAATTTTGCCGAGGTGATTGCTAAAGGTGAAGCACAAGGAATGGTGAGCAAGTCTATCGGTATGATGCTTGGCATTACATTGGCCAATCGTATAAGGTCCTCAACATCACTTGCTCTTGGGTGCTTTAGCATAGTGACCTTAATCCACATGTTCTGCAATCTAAAATCATACAAATCCATTCAACTAAGGACATTAAATCCTTATCGTGCAAGTTTGGTCTTCAGTGAATATCTGTTGAGTGGTGAGGTGCCTTCGATTAAGGATGTGAACAATGAAGAACCTCTTTTTCCGGCTGTACCACTTCTTAATAGAAAGCTTGCATGTGATGAGCCAAAGTTGAGCTTACTATCTGCCGAAGCGAAGGAATCAGCAGCAAATATTGAAAAGCGACTGCAATTGGGTTCAAAGCTCAGTGATGTGGCCACTTGTGAGGAGGATGTTCTTGAACTCTTAAGTCTGTTCAATAAAGAAAATTATATTCTATCAGAGCACAGGGGAAAATATTGTGTAATGCTTAAAGAAAGTGCTTCGCCTGTAGACATGCTGAAGGCAGTATTTCATGTCAATTATTTGCATTGGTTAGAGAGAAACGCTGGAATAACAGCAAGAAGTGCTTCTAATGACTGCAGACCAGGAGGAAGGCTACAAATGTCTTTGGAGTATGTGGAGAGGGAATTCAAGCATGTCAAATATGATGGGGAATTGGCTGGTTGGTCGACTGATGGCCTAATTGCAAGGCCCTTAACTACTAGGATTTGTGAATGTCATGTAACTTAG MYGVLPFSYQAPPPEPIPFRPVYVDVLNYVPVRRFHHCLDSSMRRSCTALRPSLSVFPHFLKPTKLFQGYSSPCNGTRIKPALVHSPLLAGDGHGCDGNNNGGWNNSNPFGGFGWWQYDGDSPPWSDNAFLAFFFSSVLGCFCLFQLAVALARNNMNTESIWEVKGGKRIRLILDTYRDEFHVATGMPSSSLSFSFVNVWLRCSDIFTRLMLPEGFPDSVTSDYLEYSLWRGVQGIASQVSGVLATQALLYAVGLGKGAIPTAAAVNWVLKDGFGYLSKIFLSKYGRHFDVHPKGWRLFADLLENAAYGMEMLTPAFPLHFVVIGAAAGAGRSAAALIQAATRSCFYAGFAAQRNFAEVIAKGEAQGMVSKSIGMMLGITLANRIRSSTSLALGCFSIVTLIHMFCNLKSYKSIQLRTLNPYRASLVFSEYLLSGEVPSIKDVNNEEPLFPAVPLLNRKLACDEPKLSLLSAEAKESAANIEKRLQLGSKLSDVATCEEDVLELLSLFNKENYILSEHRGKYCVMLKESASPVDMLKAVFHVNYLHWLERNAGITARSASNDCRPGGRLQMSLEYVEREFKHVKYDGELAGWSTDGLIARPLTTRICECHVT* Homology
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. NCBI nr
Match: XP_011651345.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650562.1 hypothetical protein Csa_009558 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1243.4 bits (3216), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/612 (100.00%), Postives = 612/612 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. NCBI nr
Match: XP_031738101.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1195.6 bits (3092), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/612 (96.90%), Postives = 593/612 (96.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. NCBI nr
Match: XP_008449956.1 (PREDICTED: protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1179.1 bits (3049), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/612 (95.26%), Postives = 593/612 (96.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. NCBI nr
Match: XP_038881395.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1147.5 bits (2967), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/611 (92.64%), Postives = 578/611 (94.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. NCBI nr
Match: XP_023528607.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1015.4 bits (2624), Expect = 2.1e-292 Identity = 514/610 (84.26%), Postives = 543/610 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7X6P3 (Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 623.6 bits (1607), Expect = 2.3e-177 Identity = 328/518 (63.32%), Postives = 396/518 (76.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84JB8 (Protein root UVB sensitive 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 3.1e-44 Identity = 133/439 (30.30%), Postives = 221/439 (50.34%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YU2 (Protein root UVB sensitive 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 6.0e-40 Identity = 120/436 (27.52%), Postives = 198/436 (45.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W34 (RUS family member 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rusf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 165.2 bits (417), Expect = 2.3e-39 Identity = 108/336 (32.14%), Postives = 172/336 (51.19%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499P8 (RUS family member 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Rusf1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 162.5 bits (410), Expect = 1.5e-38 Identity = 88/243 (36.21%), Postives = 139/243 (57.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP56 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491686 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1179.1 bits (3049), Expect = 0.0e+00 Identity = 583/612 (95.26%), Postives = 593/612 (96.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F2S0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1012.3 bits (2616), Expect = 8.6e-292 Identity = 515/610 (84.43%), Postives = 541/610 (88.69%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1U0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1007.7 bits (2604), Expect = 2.1e-290 Identity = 515/611 (84.29%), Postives = 541/611 (88.54%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M2 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1005.7 bits (2599), Expect = 8.0e-290 Identity = 511/610 (83.77%), Postives = 542/610 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7Y8 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1001.1 bits (2587), Expect = 2.0e-288 Identity = 511/611 (83.63%), Postives = 542/611 (88.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. TAIR 10
Match: AT3G45890.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 623.6 bits (1607), Expect = 1.7e-178 Identity = 328/518 (63.32%), Postives = 396/518 (76.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. TAIR 10
Match: AT1G13770.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 2.2e-45 Identity = 133/439 (30.30%), Postives = 221/439 (50.34%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. TAIR 10
Match: AT5G49820.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 4.2e-41 Identity = 120/436 (27.52%), Postives = 198/436 (45.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. TAIR 10
Match: AT2G31190.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 1.8e-36 Identity = 86/250 (34.40%), Postives = 139/250 (55.60%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020160 vs. TAIR 10
Match: AT2G31190.2 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 1.8e-36 Identity = 86/250 (34.40%), Postives = 139/250 (55.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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