CsaV3_3G017550 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATAAACTGCTGCCATTGGGCTTGACTGCAATGCCGTAAGGATCCGAAGAGGTTTATTCGCTCGTACAGAAAATGGGATATTCAGTGACGCATAGGATATTTTCCACGTGAAGCCAAGACGAAGAGCAGGTACCTCATCCTAATACACATTTTCTCTCGAAAATGCCCGTGGATCTCCTACTTCAATAACTCATTACCAAGAACAAAGAAGGTTAAAGAATGATCGAAACTGCTCTGGCCGTTCGGTTTCCCGCCGGCGCAAACTTCTGCTACTCCTCTGCCGTGTCCTGTAATTCTCCCTCTCTTTCTTCCCCGCCATTACTTACTTCAGAAGACGAGCTATACTTTTTTTTATCCATGTTTTTTGGTCGAGTTATACGAAAGTGAAAGAGGAAACGTTTCTTTTGATTGCTTAACTTGCTTTCTGTTGAAATCAATGGAGCTCAAGAGTCCACGATTGCTTAACTTGCTTTCTGTTGAAATCAATGGAGCTTAAGAGTCCACATCTTTTGTTTTTGGCGTTCTTTTTCCTGCATTTTACATTGTTGCCAAGCTTACTAGCTGACTAATTTTCGTAGATGTCTTTCGAATTAGACGAAAGAGAAAGAGGAAACAATTGTTATTATTGCTTAACTTGAATTCTATTGAAAGTTTTGGAGTTTAAGATTCCACGGCTTTTCTTTTTGGCGTTCTTTTTTCTGCATTTTACATGGCTATCAACCTTACTAGCTGACTATTTTTCTTCTATGTTCTTCGAATTAAATGCAAGAGGGCGAGAAACGATTGCTATTATTGCTTAACCTGAATTCTATTATAAGCTTTGGAGCTTAAGATTCCACAGCTTTTCTTTTTGGCGTTTTCTCCAGCATTTTGCTTTGCTGCCGAGCTGAGAGTATTTTTCTTCTATGCTGTTGGAAATAAGGGAAAGCGAAAGAGGAAACATTCGTTTTGATTGCTTAATGTGATTTCCGTTTGAAACAGTGGAGCTCGAGATTCCATTGCCTTTCTTTTTGGTGTCCCCCCCGCATTTTCTTGGCTGCCAAGCTGAGACAAGTGTTCTATAATTTCTTTGAATTAAGTGTTAGTGGCAGATGAAACAATTTTTTTGGTTGCTTAAATTGAATGAAGCAAACGATTACGCAGCGTTTGTTTTTGGAAAATCCGGTGTTTTTTTGGATGTATAGCTGAGACTAATTTTCTTCCTTGTGTTTGGTTGTGTGCATGTACAGATCACCGTCCAGCTTGGACTTCGGAGGATGTAACTAGTATAGGCAATGCTAGCAGCTTCTGCCGGCTTTTGCATTCTTGCACTTCCGACGTGCATTGGTACTTAGCTTGAGCTTGCTCCTTTCTTTTCCTCTTTTTATTATTTGTTTTTTATTAAATAATTTTGTCAATGAGTTTCTTGGTACCATATGCGTGTGGGGCAAAGCAATCACAGTTCAATGCAGCATGCGAGTGTTTAAGTAACCACGGGTCTCTAGTCCTTATACTGCTCCCACTGGCCAGAAATTGTAATAAATTGAAAAAAATTCTGACTTGAATATAAATTTATGATTAGAAAATACTTAGCCTAATGCAATGAGAAAGAACTCTTAATTGACAATATTTTTTTTATTCTTATAAGCCACTGTAATATGTGGTATTTACGGAATCGCAATTGGCTGTCAGGCTACCAATCCCAAATATCAAATAAAACACACAAACAATGGCAAACAGAGACGGTACTCTTGTGTTCTTTATTTATACATAAATGCCAAGATGTTCACAAGCTACGATATAAAGATAACAAGGAAAGAAAAACATAAAAGAAACATAATAGTCCCCTTTTACATCAATGGAGACCCCTGCCGGCTACAACAACCTACTCTCTTAAAGATAACAAAAAAAAAACCCAGCTACACTCTCTCTATCAATCACTATTTAAAGCCTTTCCTAAAATTCTTCCCTGTGGGCCCTACTCTACACAATCTTTTTCTCCAATCATTCCTCCTCATTAATATTAGGTGTATTTACATTTCTACTCTTTCTCACATACGTATGAATGATTGGGGGCCTTACAATACCCCTCGGTTCTAGGTTCACCTTGTCCTCAAGGTGAAAGGTGAGGAACTACTGGTTCATCTGGTAAACGGCTTCCCACATAGCTTCAGTCTCAGAATCTTTTCACTTTACCAACCATTCGTTGCCTTTGAGGTCCTTGTTCCAACGAACTCCTAGCACAGTTTCCGGCCATAGTTGCAGCTCGAAATCTTCAGTCAATATGGGTTGTTGATGTTGAACCACTTGCTGATTTCCTAACTTGAGTTTTAGCCTGGAGATGTGGAAGACATTGTGTATCACTGCTTCTGGGGGAAGTTGGAGTCTATAAACTACTTCACCTATTTCCTCAATTATCTTGTACGGCCCATAGAACTTAGGAGCCAATTTCTCACTCCTCTTGCATGCTAAGGAACGTTGCCGGTAGGGTCTCAGTTTCAGATACACCTCATCCCCAACCTTGAATTTGAGCTCTCTTCTCCTAGTATCCGCCATTTTTTTCATCCCATTTTGGGCTATGCTCAAATTCTCTTTCAATGCATTCAGTGCCAAGTCCCTTTCCTTCAGCATAGATTCTACCTCATCGTTCAGCGTTTTTTTATTCCCATATGATAACAGTGGAGGGGGTTGTCTTCCATACACTATCCGGAAAGGATTGCTTCTCGTGGAGGCATGAAAGGTGGTATTATACCACAACTCAGCCCATGGAATGAATTTATCCCAATTATGGGGTTCATTGCAGAAACATCTCAAATATGTTTTTAAACACTGATTTACCCTTTCGCTTTGCTTGTCGGTTTGTGGGTGAAAGGCTGTACTTCTCTTCAAGACTGTACCCATAGTAGCGAATAATTCCTTCCAAAAATTGCTGATGAAGATCTTATCCTTGTTTGAGATAGTCGATTTTGGTATGCCATGCCTGCTGCTTATTATGTCAATGAAGAATTTAGCTACTCTTTTGGCTGTAAAAGGATGCTTCAAGGTAATAAAATACGAGAACTTGTTGAGTCTATCAACTACCACCATGATCACATTCATCCCTCCAGCTTTTGACAGCCCTTCAATGAAGTTCATGGACCATTCTTCTAGAATTTTCTTTGCTATTGGAATTGGTTGTAAAACCCCTGCTGGCTTGGTTGCTTCATACTTATTCCTCTGGCAGATCTCACATTGCTCAACATAGTTTTTGACGTCTGTTTTCATTCTTTTCCAATGTAGTTCTCCATTCATCCTCTTATATGTCCTTAGAAATCCGGTGTGACCTCCTAAAACTGAATTATGAAACGTATGCACCAAGTTCGATATCAGTGATGAGTGTTTGGACAACACTATCCTGTTTTTATACCATAGTCTCCCATTCTCCCAACAATATTTACTTGTCTCTTTAGTCTTTTGTTTCAACTCTTCTATGATCTTCTTAAGATCTTCATCTTGTTGTACCTCCTCTTCAACTAACTCCATATTCACAATTCCAGTGGTAGTCATGGTATTGAGTTCTAGGGGTTGCTCTATCCGAGATAGGGCATCAATAGCTTTGTTCTGTAATCTCAGTTGATACAAAATCTCAAAATCATATCCTAGGAGTTTGGTCAACCACTTTTGGAACTTGGGTTGTGCCTCTCTCTGTTCTAAAAGAAATTTCAACGCTTTCTGATCAGATATGATTGTGAACTTCTTCCCTAGAAGATAATGTCCCCATTTCTGCGCAGAGAGCACTACAACCATAAGTTCCCTCTCATTTATAGATTTGGTTTGTGCCCTAGGAGATAGTTTTTGACTAAAGAAGGTGATGGGATGATTGTTCTGAGATAACACAGCCCCTAATCCTATTCCAGATGCCATCCGTTTCAACTATAAAAGGTAGGTTCCAATCAGGTAGTGCAAACACTGGTTTGGTTGTCATTGCTATCTTCAACTTATTGAAGGCAATTGTGGCCTCTTCATTCCATAGGAAGGAATTCTTTTGTAACAGTTTAGTTAGGAGTCACAATTTCCCCGTACCCTTTCACAAATCTTCGATAGTATTTGGTTAAGCCCAAGAATCCTCTCAAACTAGTAACATCCTTCGGTTGCGGCCAGTTCACCATATCTTGGATTTTCTCTTAGTCGGCTTCTACACCCTTATTGGAAATCAAGTGTCCTAAGTACTGGATTTGAGAATAAGCTATAACACACTTTTTCTTGTTGGCAAAAAGCTAATGATAACGTAGTACCGCAAATACCATTCCTAGGTGCTTCTCATGTTCCGTGATATCTGAACTATACATAGGTATATCGTAAAAAAAAAACCAATACACAACGCCTCAAAAAAGGTTTAAATACCTGGTTCATTAATGACTGAAAGGTGGTAGGTGCGCTCGTGAGGCCGAAGGGCATAACTACGAACTCATAATGGCCTTCGTGAGTTCTGAAAGTCTTCTCAATATCTTCCTTCTTATTTGGTGATACAGACTTCAAATCCATCTTTGAGAATATAGTGGCTCCTTGCAATTCATCCCGCAGTTCTTTGGGATAGGAAATTTGTCAGAGGTAGTCACCTGGTTTAGCTTTCGGTAATCTACACAAAATCTCCACCCTCCATCCTTTTTCTTCACTAACAAGACTGGACTGGAATAAGGACTATGACTGGGTCTTATCACTCCTGCTTGAAGCATCTCCACAACTAATTTCTCAATCTCTTGCTTTTGAATGTGTCCATATTTGTAAGGCCTCACGTTAATCGGTCTCTGTTCAAGCATCACCATGATTCGATGATCTACTTCTCTCTTAGGAGGTAACCCTTTTGGGTTTTCGAAAATGTCTAAATACTGTTGCAACAAGAATCTCATGGGTGTATCTTCTTCGTCCCCCTTAATTTCTTGTTCTTCTTCCAGGTCGTCATTCATTTCTATGTCATAGTTTTGTAGTTCCAAGAGGAAGCCTTGATCTTCCTTTTCCCATGTTTTCTCAATGGTT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ATGATCGAAACTGCTCTGGCCGTTCGGTTTCCCGCCGGCGCAAACTTCTGCTACTCCTCTGCCGTGTCCTATCACCGTCCAGCTTGGACTTCGGAGGATGTAACTAGTATAGGCAATGCTAGCAGCTTCTGCCGGCTTTTGCATTCTTGCACTTCCGACGTGCATTGGAAAAGATGCCAGAGACTTAATAGTAGGTCTCTCTTGGGAAGAAGCTATCTCAAAAAGATTGGAATCCAAGCATCAGCAGAGCCTTTGGGCTCTGCATCAGATCCAATTAAACAAAATAGGGGATTGCAGTATCATCCATCTGAGGAGCTTGTGAAATCAATAACTGAGATTGCTGATGATGTTAGACCTACCTCTGCAGAAACTACTAGAACAATCATTGAGGTAAATAGCAAAGCAACATTAATGTTTGCGGGTTTGATTAATGATGAAGTTCAGGAAAACATTATCTGGCCAGAACTACCGTATGTAACTGACGCACATGGAAATATCTACTTTCAAGCGAAGAATACTGAAGAGGCCATGAAAAATCTAACATCAGAAAATAACTTTGTGCAAGTGCTTATTGGCATTGATACTATGGAAATGATCAATGAGATGGAGTTGTTTGGTCCATCAGAAATTGATTTTGGATTTGAAGAGCTTGATGATGGAGCTTCAGATGATGGAGATGATGATGATGATGGTGATGGTGAAGATGAAGACGAAGACGACGATGAGGATGAGGATGATGACGACGACGATGCAGATGATGAATACAATAGGGACTGGGTTTCTGTCATAGATGATGAAGATGATCAAAATCACTCTGATGAAACCTTGGGAGATTGGGCAAAACTGGAGACAATGCGTTCTTCACATCCGATGCATTTTGCCAACAAGCTTTCGGAGATTGCATCAGATGATCCTATTGATTGGATGGAACAGCCCCCAGCAACTTTAGTGATTCAAGGTGTTCTAAGACCTGCATTCAATGAAGAGCAGACTGTTATCGAAAAGCATCTATCCAGCCGCCATTTGAGTAATGGTGACATAAACGAGGCTCAGGAACTTGAAGAGAACCTTGAAGGTCATGGTAGGATCAATCATCATGGTCATGAATCAAGTTCATCCAAAGATGGTTTAAACTTGATGGAGGCATTGGATGAAAGTATTCCAGCGAGTGAGGCTTCATTTTACCGGCTGGAGATGATAAAAGTTCAGCTATTTACAGGAAATTCACACCCAAGCAACGTTGAAATAGAAGATCTCATGAAAGCTCAACCTGATGCGATTGCGCACTCAGCCGAAAAAATTATTTCTCGTCTAAGAGCAGGTGGAGAAAAGACCACACAAGCGCTCAAGTCTCTCTGTTGGAGATGCAAGGGCATTCAGGTTGAGGAGGCAGTAATCAATGGTATCGATTCACTTGGATTTGATGTGAGGGTTTGCTCCGAAACTCAGGTCCAAACATTGCGGTTTGCTTTTGATACACGAGCAACCTCAGAATTCAGTGCGGAAAAACAGCTGAACGACTTGCTTTTTCTCGAGAATTAA MIETALAVRFPAGANFCYSSAVSYHRPAWTSEDVTSIGNASSFCRLLHSCTSDVHWKRCQRLNSRSLLGRSYLKKIGIQASAEPLGSASDPIKQNRGLQYHPSEELVKSITEIADDVRPTSAETTRTIIEVNSKATLMFAGLINDEVQENIIWPELPYVTDAHGNIYFQAKNTEEAMKNLTSENNFVQVLIGIDTMEMINEMELFGPSEIDFGFEELDDGASDDGDDDDDGDGEDEDEDDDEDEDDDDDDADDEYNRDWVSVIDDEDDQNHSDETLGDWAKLETMRSSHPMHFANKLSEIASDDPIDWMEQPPATLVIQGVLRPAFNEEQTVIEKHLSSRHLSNGDINEAQELEENLEGHGRINHHGHESSSSKDGLNLMEALDESIPASEASFYRLEMIKVQLFTGNSHPSNVEIEDLMKAQPDAIAHSAEKIISRLRAGGEKTTQALKSLCWRCKGIQVEEAVINGIDSLGFDVRVCSETQVQTLRFAFDTRATSEFSAEKQLNDLLFLEN* Homology
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. NCBI nr
Match: KAE8650472.1 (hypothetical protein Csa_009877 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 981.9 bits (2537), Expect = 2.2e-282 Identity = 513/513 (100.00%), Postives = 513/513 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. NCBI nr
Match: XP_004140749.2 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein At3g49140 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 976.1 bits (2522), Expect = 1.2e-280 Identity = 510/510 (100.00%), Postives = 510/510 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. NCBI nr
Match: XP_008439307.1 (PREDICTED: uncharacterized protein At3g49140-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 925.6 bits (2391), Expect = 1.8e-265 Identity = 483/510 (94.71%), Postives = 499/510 (97.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. NCBI nr
Match: XP_038880477.1 (uncharacterized protein At3g49140-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 874.8 bits (2259), Expect = 3.7e-250 Identity = 460/512 (89.84%), Postives = 486/512 (94.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. NCBI nr
Match: XP_022141265.1 (uncharacterized protein At3g49140-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 825.1 bits (2130), Expect = 3.4e-235 Identity = 431/511 (84.34%), Postives = 469/511 (91.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WMN5 (Uncharacterized protein At3g49140 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g49140 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 6.2e-107 Identity = 242/516 (46.90%), Postives = 330/516 (63.95%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AY35 (uncharacterized protein At3g49140-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484131 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 925.6 bits (2391), Expect = 8.9e-266 Identity = 483/510 (94.71%), Postives = 499/510 (97.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CHK0 (uncharacterized protein At3g49140-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011706 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 825.1 bits (2130), Expect = 1.6e-235 Identity = 431/511 (84.34%), Postives = 469/511 (91.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E9X9 (uncharacterized protein At3g49140-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430699 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 807.0 bits (2083), Expect = 4.6e-230 Identity = 420/510 (82.35%), Postives = 461/510 (90.39%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JB77 (uncharacterized protein At3g49140-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482881 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 805.8 bits (2080), Expect = 1.0e-229 Identity = 419/510 (82.16%), Postives = 462/510 (90.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HTI8 (uncharacterized protein At3g49140-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467691 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 1.8e-221 Identity = 414/510 (81.18%), Postives = 451/510 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. TAIR 10
Match: AT3G49140.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 389.4 bits (999), Expect = 4.4e-108 Identity = 242/516 (46.90%), Postives = 330/516 (63.95%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. TAIR 10
Match: AT5G24060.2 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 365.5 bits (937), Expect = 6.8e-101 Identity = 225/479 (46.97%), Postives = 301/479 (62.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. TAIR 10
Match: AT5G24060.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 4.4e-100 Identity = 229/502 (45.62%), Postives = 309/502 (61.55%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G017550 vs. TAIR 10
Match: AT3G59300.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 2.2e-35 Identity = 123/422 (29.15%), Postives = 195/422 (46.21%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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