CsaV3_3G001270 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_3G001270
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 989501 .. 993181 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_3G001270
SyntenyCsaV3_3G001270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAAGTTTTTTTATCCACGCGCCTCTGAAGAGCGTGTAAATAAATGCGGACACGACCAAGATATTTGTAAGTTACGTGGAATTGCTGTTTCAAAAGCACTTCGAAGAGCGTGGCCAATCATCTCCATTCTCACGGTAACGGTAACGTTAAACTTTCACGCCAATATTTTTTTAAAGAATTTTAAAAAGTAAACAATATTATAAGTTGTAATAGAAATAAAATTCAAATTTTTGGGATAGCTTATAAATACTCTAATTTATTTTTCTATTTTAAAAAAGGTTTCATACTTTTTTTTTTTAATTTCCAACCTCACTATTTGTTTTATTTTGATAAATTTTGCATCATGAAAAGAAAATTAGAAAAAATGATGCTATCAATATCAACCATAATTGTGAATGGCAAACTTATAATTTTTTTAAAAAATAAGTGATTAATAATTTTTATATTGAAAATTTTTAAAAGAATATTAGATTTTACAAAATATCTACTATCACTGATATGTTATAGATAGAAGACGGTTGACGATAGAATTCAAAATTTTGTTATAACTATAAATATTTTAATTTATCTTACTATTTTTAAAAACGCTCCTATTATATTTATACTATATTTGCTGTAATTTTTCTTTATTTATTAGTTAATAGTTGAGAGTCGTAAATTTGAATGTTTGCTAACATTTTTAATAATGAAGGGTGAGGTGGGAGCCCCCGAGGAGGTGATTTTAATGATAACCACGTGGAGGGCAGTAATTAAGTGTGGAGGTGGGACCCTTCACGTCTGAGGTTCTTTTTCCCTTTTAATCAGAGTTAAAAAGCAAAAATACATAAATAATATTTTGTTAATTTAAGTAACAAAATACAAAAATATTTATGGCTAACAAAAATTATCAGGTCTTTTAAATATTTTCATTTATCTATTTAAAAGAGTTCATTAAAATGTTTTTTTATTTATATTTCTAAAATAAAAATTTTTTTAAATATCATTTTAAATAATATGTCGTTTATACTATTGTTTAAATTTAAAGTTTTTTTTCCTATCGTTTAAAACGAATTAAATGATGATGTGACATAATATAAACAATCAATTACCATAGTTAATACGATCGTTTACCATAATTAATACGATTGCTTGTCATGGTTGACATGTTTAAAGTTTAAGCATTTTTTTCGACATTTAAAAAGAACAACGCTATCAAGTATCATAACCTAAACGATCATAGATGATTCATTTAAATTGTAATATACAATCGTTTAGAAGAATATAACTAATGTGTATGTATTCAGTGGGATAATTTTCATCCCAAATCTATGAGTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAATTGTTTTTTATGGTGCAAATGTTTTTTAAAAATTTCATAATATTGTTTTTGTTGTATTATTCATTTCATATAAAAGGAAGAAGGGAGTGCAGAAAATAATTATTGGATTTGGTTTAAAACTTATTGACTTATTTATTTATTGCCAATTGGCCCCTCTCTATTTTATTGTATTAAACTTTCTGTCCTTTCCTCTATGCCAAATCCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTTTGTTTTTTCATTTCATTTATGTCCTCCATTTCTTCTAAATTTAAGCACATTGCCTAAAGCCAACTTTTGTAGCTAAATGCCAAAAAAGTATATCACTAAAAATTATACTTTTTTTTTTTATCATGAATTTTGACATTGAAATTTTTTTCTATACCTTTTGTAACAAAAGGTTGAGTTTAGCCTTTTGGATATTTTTATTTAAATAAACATTCAAAACTTGACATGTCACGGATGAATGGATTCTACACAAGCAAATGAGCATGCAGATTAATTCAATGCAAAGTGAAGAACATTAGCATGAATCCTATTAGGTAGGTATTCAAAAACTTTAACACAAGTGGTGCATGGACATCATGAGCTTGCGCTATAAGGTATTAGGTTAAGTCCCACAACTAACACATCCTTCATGTTTAGTTGCTAATGGGTGAGGTTAGAATCCTAAGCAAACGGTCGAGGATAAACATGTATCGAAATTTGAATTTTATGAATTTATGGATAAAATATCTAACATCCACAAATTTTTTTTAAAGTCACAAAATTGCTTCTATAATGAGAGTTTAGATAAAAGCTTTGAAAAACGAATATTTTCTTCCTTCGTTAATGTTCGTTGTCTACCCGGCAAAAAGAAAACCCTCACCTTAGTCTCCTTCTTCCTCACTCTCGCAACGTTCACTCCCCGCGAATACCGAGTGGCACGAACTCCGGTTGACGGCAATCGAACGGCGGCGACAAACACGATTTAGGTATTATTCATTTGTTCCTTTACCCTCTCTTCACTTCCATCTACGATCGCTCAGCGTTGTTTGATCTGAATATCGAAACACGCCATTTGAAGATTGTGATCACACGGGAACTCTGGAACTTCAGCGTTTTCGACATTCAGCTGAATCAAGATCCTGTGAAGGATTTGGAAGTCGATTCTTGAGTTTTGATTTCTCAGTTTATCGTTTTCTCTTACCCTGAAATCAGGCGGTCAATCATTTCGAACACGGCTGGATTTGATTACTGCACTTTTTTAACTTTGAAAATTTGAGTCACTAAATCTCGTTTTCTCTGCGCATCGTTGGTTCTGTGTCTTAATTTTTCATTTTCAATCATTAGATCGATGATTATGATTTTCTTACAGATGTAATAATGAGATTGGGATGACTTTCGAATCATGGAGTGTGTTTTGTTTGTAGTGTTTTGATTAGAGGATTTAAAGTGATCATGGATATTCTAAAACATTTGAGTAGTTTAGGAGTAGTTGTTCAATTTCTTCCAAAAATGTTCTTTACAGCACTTTTTTCAATTTCAAATCCTCCTGAAGTTCTGTGAAATCTTGCCTCGATTAATTTCACAAGCCATTTTACTGTAGGCAATAGCATGCTAGTCATGAAGTTGTTCAGTGTTTCTTCAACAATTTTGCATGTTTAAGTAGTTCCTCAGCCCCTATTTGATAGCCAGTTCAATCTCTTGGTTTGGTTTTTTATCATTGAAAATTAAACTTATAGTCACTTCTTTTACTTTTGGATTTCTTTGGTTTGTTATATTCCTTTTACAAATGTTTTCAAACCCAAGTCAAAGCAAACACTTGGTTTTGTTTTTTGAATTGAACTACCATGTAAAGAAATGGGGGAGAAATTAGGCGCAATTTTCAAGAACCAAATGGATCAAATGGGGTTCTTTTACATGTTAACTATATAGACCCCAAGAGGTGGTGCTCAATCATGGATCTCTTGTCTTCCAACAAAGTCAGACTTGATATTATGGTCTTTTTCAGTCTTGTATCCTGTTACTGTGAAGTTTTCATGCCATTTGATGTTTTTTAGAAATAGCTTCATCAGATGAAATTTATTGTTCGGTTCTCACCACTGATCTGATTCATAGAACACGAAAACTTGATTCTATTTTGACGTGTTCGTTTGCTATCATAATCGGGTACAGGATAAAATTAGAAGAGGAAAGCAACTTGCAGTTCATAACAAGTTTATATAGTTCTTTAATGACAAGGTTTTATTAGTTTGCAAGTCTCTAGTGTCATCGTATCATTTATGAATCTCTGCGTTCTTTTGTCTCTTCATTTTATCTTTAAATTTCTTTCTGAAATTTCTCAGTTCTAGAGATAAGATGCTTCCATAG

mRNA sequence

TTAAGTGTGGAGGTGGGACCCTTCACGTCTGAGTCTCCTTCTTCCTCACTCTCGCAACGTTCACTCCCCGCGAATACCGAGTGGCACGAACTCCGGTTGACGGCAATCGAACGGCGGCGACAAACACGATTTAGTTCTAGAGATAAGATGCTTCCATA

Coding sequence (CDS)

TTAAGTGTGGAGGTGGGACCCTTCACGTCTGAGTCTCCTTCTTCCTCACTCTCGCAACGTTCACTCCCCGCGAATACCGAGTGGCACGAACTCCGGTTGACGGCAATCGAACGGCGGCGACAAACACGATTTAGTTCTAGAGATAAGATGCTTCCATA

Protein sequence

LSVEVGPFTSESPSSSLSQRSLPANTEWHELRLTAIERRRQTRFSSRDKMLPX
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_3G001270 vs. NCBI nr
Match: KAE8650017.1 (hypothetical protein Csa_023719, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 1.6e-18
Identity = 52/52 (100.00%), Postives = 52/52 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  LSVEVGPFTSESPSSSLSQRSLPANTEWHELRLTAIERRRQTRFSSRDKMLP 53
          LSVEVGPFTSESPSSSLSQRSLPANTEWHELRLTAIERRRQTRFSSRDKMLP
Sbjct: 1  LSVEVGPFTSESPSSSLSQRSLPANTEWHELRLTAIERRRQTRFSSRDKMLP 52

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_3G001270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8650017.11.6e-18100.00hypothetical protein Csa_023719, partial [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_3G001270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G001270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_3G001270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..23

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_3G001270.1CsaV3_3G001270.1mRNA