CsaV3_2G003480 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTGAATTTCTAGAGAGGTCAAAATTAATTTTTTGAGTATAGTCTTAATTAAAATCAAGAATACAATGATTGTTTATTAAAAAAAAGAGATTTACTTGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGGGAAAGAACGGTTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTGGTCAGAAGTCCGACGCGGAATCATTTTCAACCTTTGTCGTCATCTCGTAGTTTTGACGAACCATCCCCCAATCTCCCTCCAAAATCCCACAATTTTCCCTCTCAATTCCGATTGTCCTAACCATTTTTCAATCCTTCAGATCACTTTCTTCTTCCGATCACAATCACCGCCGGAGGGAGACCGGGGATGGAGCCATCGCCGTTTAAAAAAACCGGAAGCGAGAGTGAAAGCTCAGGGAATAGTTTTGTCGGAGGACGGGAGGAGAGGGGTTCGTGTGATTATTTCGGTTGGGTCTATCATATTGGAGTTAATTCCATTGGGCATGAGTATTGCCATCTTCGATTCCTCTTTATTCGCCGTAAGTACGTTGAGTTGTACAAACGTGATCCTCACGAGAATCCTGGCATTGTAAGATTTTTTTTTCTTTTTACGCTTTTGCTCTTTACCTCGTCTTTAAATGTTATGGTGGCAAGAATAAGATGTATGTTTGATTGTTTATTGTATTTGTTTGGTTGAAATTAATTGCTTGCTTGATACACTGCCGGTAGTTAAAGTTTTCTATACGTGCTTGTTGTAAATTAGTTCCTCTTTGATGGTGATCACACCCGTTGTTATTTTAAGATGAAATTTCCAAGTTGATTGGGTTATTTTCTTTTGATATAGCTTGAGAATGTACAAATGTTGATGCTTACTGCAAATAAAACCTCTCGTGATGGGTGGAAGTCGATCATATGAGCAATGGCTTTATATTAGTCTATAAGCTCTCAAGATTACCCCATTTTGGTTTCAAACTTTTTAAATTAACTTTCGGTGTTATTCTATTTTCATATTTGAACTTTTAAATTATCCATTTCAGCTTATGAACTTAAGAAAACTACTAATACGTTCCTTAATCAAAACAGATGACATGACTATGAGCATGTCTATTTATTTGTTGATAACTTGGAGTCACACAAGTAATGGCTAAGAACGATTATTTTGTGGACCAATAGGTAACAAAATAGCAAAATGTAAAATGATTGTTCTTCTACCAAGTTAAGCGATTGTTATAGACATTTGAAATAGAATTAAAAACCTCATCGTATCATCAACAGTGAGACTGCGTTCTCATGGATTGGATTGGAGTCTTGTCCTTCTACAATAATGTTTACTATGGAAGTAACATTTAGTACATGTATTCAGAACTTGGTTTGCCACTTTCTGTCTTTTTTGTTCTTGCTCATCAATGTCTCTATACTGCTATCTTTTTTTATTTGTTCATTTGTACTTCTTTTGTAGAAACCTATCAGGAGAGGTGTTGTGGGGCCGTCACTTATGGTTGAAGAGCTTGGACGTCGAAAAGTCAACCATGGGGTAAGGAAATAGTATATCTATTATCTACTTGCAAATTTACTGTTGGATTAGCAAATTCATTTTATAAGGTTGATTAAAGAAATATCTCTTGTCGTCAAGTTCAACAGTTAATCTCATAGTATCGTTACATTCAAATCTTAATGGTCCACAGAAGATAATGGGAGCTAAAGTTGATAATTTTGTTGGTTACTGCAGGATGTTTACGTCTTACGAATTTATAACCGATTGGATGATTCTAAGAAAGGAGAAGTAAGTGATCTACAAACTTATCTTCATAATTTTTGTGTTTGAGATAGAACTAACCTTATTGCTATTTAGTCAAATTGAAAACTTGGTTACCTAGTCATTTGATATTTTCTTTTGGCATCATTTCACGCCTTTTCCCCTTGTGAGTTGGATCACCTAAAAGAAGAATTAAAAATTTTCTGTATTCCACGTCTAAGGGAATTCCCAACTGAAGACACACACACCAAAAAAAAAAGTCGCCACCGGAGGAGAAGAGACTGTTGAAATTGTTAAATCTGACATTTAAAGAAGTTGGACGAAAACAGGTTATTTCCTGCTTAAGTGACCAATTCTACAATTTGGAAAGACAGATCACTATCTGAGTGGCGAAATATCAAATAAGAGTCAAGTTCTTCCTTTAGTCTACTGTGTGCGGAAGGCTGAACATCAATGGATAGGCTCCAAGGAGATGCTCATAACTCCAACTTTCACCATAAGATGAACAACAAGACTTACTCTTACTATTTTAAATGGGTAGCACTTTGTTTCAGAACTACACAATGTATTGGCTTTAATAATAAAAGGAGAAGAAATACTGTATGATTCAGAGGGTATTCCTTTGGAAGTGCAGAATCTGCTCGCACAGCATCCAAAATTAATGGATATTCCATCTGACACTTCAAGAAATTCAGCATGGTGTTACAATTCCAAACTTACCTCATTACAAGATGAGCCCTAGGGAATATGAAATACTGAATGAACATATTGAAGAACTAATTTGCAAAGGACATATCCCACGGTACGAGTTCATGTTAATTCCTAAAAAGAGATGGCAGTTGGAGGACGTGCATTGACAGCTGGGCAATCAACAAAATTACTGTCAAGTCCATGTTTCCCATCCCTCGTATCAGTGATCTCTTGGATTGATTAAATGGTGCCTCATTTTCTCAAAATCAAACTTGCAGAGTGGTTGTGATCATCATATTCAGATTTGCCTGGGGATGAGTGGAAGACTGCTTATGAAGGACTTTTTGAATGACTTTGTTATGCCATTTAGACTATCTAATTCCTCAAGTACCTTTCTGTAACTTATGTATTAGTTTCTTCATCCTCACATGAGTAAGTTCTCGGTAGTTAAGAATTAGAATGAGCTTTAGATGGTTTGTACGAAAAGAGTGCACAGAAAAATAAGATTGAAGTGTTATTTTCTGACTCCTTCGAGTAAGGGGCTCTCCTTTTTTGAACATTTTACTTCTTCAACAAATAGTTGTTTCTTGATAGGGAAAAAACCACCAACCACTCATAGATGAAACCTAAACAGGAAACAATGTAAGAGTACTACACTGGACTAACTGAATCAATATAAACCTCTTCTGTTAGTGGAAACATTTTTCCATCTAATTTGAGAATTATGGTTTCTTCTAAAATTTCTCTTTATTTGATGAAATAATTTTTTCTTAGCCAAAGTCTTTTTGGTAACCGTAATCTTGTAAACTTTTGGGAATCAATTGGTGGCTTGTGCATTTTCTTTACATTCTCATTTTGGTGGATAAGATCAGTCTCATTGAGACACGCCTGAAAACTCGCCTAAGGCAAAGACTAGGTCTTCATGCCTTGAAAACACCCAAAGTGGGCACCTTTGGCAAGGTGCTCACCATTTTGTGCTTTTAGTCGCTTTGAAAATACAGGCACTTGCCTTCTTCAATTGTTCAATTATTTATTTATTATTATTATCATTATTTTTTTTTTTTAAAAAAATCTTCTTCAATTCTTTTATTAAGAAGAATTATCAAAATATGTAAAGATAGATTTAAAGAAAAATTAAAGGAAGACGAATTGAAGAAAAAGAGGAGTCAAAGAAGTAGAAACATAATGGAATATGCCATCTCTCTCTTTATTGTTAAGCTATTCATTAGCGGTTTATCAAAAAAGGAAAAGAAAAAAAGGAAGAAGAAAAGCAAGAAGAAGAAATAAGGGTTGAAATTTAGAAGGGAAGAAGAAAAGTCCATGGAAAGCTCTCTTTTCTTTCATATCTTCCTAGAACTGAATGGTGGGCTACCGGAAAGAATAAAGAAATCATAGATGCATGCTAAACAAATTTCCAAATAGAAATATTTTGACTCTAAATAAAGACTACTCATACCACTATTGTTTTACCTATTTAAAAATCATTTCTACTTGTATTTCTTTTTTCCAAGATTTTTTCTTCTTCAACATTATTTGAGTTAATTTCTTTCCAATCCTAAGTATTTGTTTTTGTTTATAATAATATTATTTATTATTTTGTTGATTGTACCTCACGTTAATTAGGCAATGCCTCTTTGTCGCTTATTGCCTTGAAGCAATTAGAAAGTTTGTTTCCTTAGCCTTGGGCTTTGAAAACATTGGCTGAGACATACTCAACTGCTATATTTTCTTCTCGCAACTAATTTATAGTTAATGGGGCTTCCTTTTTTTTCTTTAGTGGACAAAAATTGTTGTATGTATCTAAGAAAAAAATGTTCCTCTTAACTTAAGTGTGTGTGTGTTTTTGCTTAAGATTGCTTGTGCCACGGCTGGAGAGGTCAGAAAATGGATGGAGGCATTTGATCACGCCAAGCAGCAGGTACAAAAAATCTCAAGTGGAAGGTTAACAAATTTTCATGTCTGGATGGGCGATAAATGTAACCAAAACAAGCAAAAATTTATCATTGCCTGTTAACAAGAATGCAACATGGAAACTTTTTTGTGAAGCCTGACACTTGGTTCTGTTACATTGTAATGCCACAATTGGTAAAAGGACTATTTATCTGGTGTTTATTTAATTGACATTAATTTGATAGGCTGAGTATGAGCTGACCAGAGGAGGTAGCCCCCGAGACAAACTGAACATGGAGGAAGAGTAAGCATTTTTTTTAAAAAAACTCTGCACGGAGGTTTGCACAGATTCATTTTTTGGTATGATTAATTAACCGAGATTTACTGATTGGATGAATGCTTTGTTGTAAACTATGCGATAGTTTCGAATGAAGCCATGGTGCTTTTATTTGTGTGCAGGGAGAACTGCTTATCTATTAAGGGCAGACTTTTCTGATGTAGTTAGTTCTTGAGTTTTCAAGTAAAGATAGTTGCTTGCTCCCTGTATTTACAGTTAATGATGGCTGTGGACTGGTTTAGCAGGCTACCAGTTCTGAATCATCATCACCTAAAATGAAGATCAATATACCAAGTCTCAGTGGGAGATGAAACATTGAAGAAGTTCTTGATTGAACATCGATGTAG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ATGGAGCCATCGCCGTTTAAAAAAACCGGAAGCGAGAGTGAAAGCTCAGGGAATAGTTTTGTCGGAGGACGGGAGGAGAGGGGTTCGTGTGATTATTTCGGTTGGGTCTATCATATTGGAGTTAATTCCATTGGGCATGAGTATTGCCATCTTCGATTCCTCTTTATTCGCCGTAAGTACGTTGAGTTGTACAAACGTGATCCTCACGAGAATCCTGGCATTAAACCTATCAGGAGAGGTGTTGTGGGGCCGTCACTTATGGTTGAAGAGCTTGGACGTCGAAAAGTCAACCATGGGGATGTTTACGTCTTACGAATTTATAACCGATTGGATGATTCTAAGAAAGGAGAAATTGCTTGTGCCACGGCTGGAGAGGTCAGAAAATGGATGGAGGCATTTGATCACGCCAAGCAGCAGGCTGAGTATGAGCTGACCAGAGGAGGTAGCCCCCGAGACAAACTGAACATGGAGGAAGAGATAAATCTGGATGGACACAGACCAAGAGTTAGACGGTATGCACATGGATTGAAAAGGCTAATAAAAATTGGACAAGGTCCAGAGACACTTTTGCGTCAATCTTCAAACTTGAATACTCGTACTGGTTCAGATGGCTTCTTTGAAGGAGATTTCGGTGATGCACTTGAAAGACATAGGTGGAAATGTGTTCGCACATTTAACGGTGTTAGAATTTTTGAAGATGTTGCTGATAGTAAGAGTGGTAAAGGGGTTCTCGTGAAGTCTGTTGGTGTGGTCGACGCTCATGCAGATACTGTTTTTGATATAGTTTTAAACTTTGACTGGAGTCAGAGATATGAGTGGGATACACTGATAAGTGACTTGGAACTGGTTGAATCTTACGATGGACATTATGATATTCTTTATGGGACAAATAATCCCACGTATCTTAGCCAATCCCAATGCAAAAGAGACTTTATCTTCTCCCGACAATGGTTTAGAGGACAAGATGGAACATATACAATATTGCAGGTTCCTTGCAGTCATAAAAAGAAGCCACCTAGATCTGGATACCGACGTTCACGGATTAACCCTTCAACGTGGGAAATAAGGTGCTTAAATACAGCTATGGGTTCAAATGCTCCAAAATGTCTTGTTACTCAAATACTAGAGATACAACCGGCAGGCTGGTTCAAATGGCAGAGAAATCACCCTTCAAAGTTTGAAAAGAGTGTTCCTTATGCATTGTTGTGCCAAGTTGCAGGTCTAAAGGAATATGTTTTGGCAAATCCTGCTCTAAACTATGAAAACCTGCCCACTGTTGTCCGTTCAAAAATCTCAGATGGCTCTACTACGAACAGTGACTATGATGATGGAGAAGTGCAGGATGAATTTTATGATGCAATTGCTGCCGATTCATCATCTTCGGAAGAGGAAAGTGATAATGATAAAGAACTTAACAATAAGGAATTAAAAGTGAAGCTGAAAAATGTGTCATGGGCTATAGCTGGCTTTTCTTTGAAGCGAAAATCAGCTGTTGATGCTAATAAGGAATTAGATCCTAATGTTGCTCCTATCATCTTGGAAACAAGCCAGTTTCATGGTTCTTTGCAGAGAGGAAGGGATGAAAAGGATACAAACTGTTGGACTTCTCCTAGTGGAACGGGATTCATGATAAGAGGGAAAAATTACCTCAAGGACAACTCTAAGGTAATGGGAGGAGATCCTCTTCTCAAGCTCATAGCAGTAGATTGGTTCAAAGTCGATAATAGCTTTGATGGCATTGCATTGCATCCCCGGAATTTAGTTCAGTCAGAAGCTGGAAAGAAGGTCCCCTTCATGCTTGTCATTAATCTCCAGGTTCCAGCCAAGCCAAACTATAGTATGGTTATGTATTATGCTGCAGATAGGCCTGTAAACAAAAATTCTTTGTTGGGTAAATTTGTGGATGGAAGTGATATGTATCGAGATTCTAGATTTAAATTAATTCCCAGCATTGTTGAGGGATATTGGATGGTTAAGCGTGCAGTTGGAACAAAAGCTTGCCTTTTGGGCAAAGCAGTTACATGCAAGTACCTCAGGCGAGACAATTTTCTGGAAATTGATGTGGATATTGGATCATCAACAGTAGCCAGGAGTGTTATTGGCCTTGTCCTTGGATATGTCACAAGCTTAGTCGTTGATCTTGCCATCTTAATCGAGGCAAAGGAGGAGGAAGAATTGCCTGAGTATATTCTCGGAACAGTTCGATTAAACCGTGTGAAGCTTGATTCGGCAATACATTTGGAAACTTGA MEPSPFKKTGSESESSGNSFVGGREERGSCDYFGWVYHIGVNSIGHEYCHLRFLFIRRKYVELYKRDPHENPGIKPIRRGVVGPSLMVEELGRRKVNHGDVYVLRIYNRLDDSKKGEIACATAGEVRKWMEAFDHAKQQAEYELTRGGSPRDKLNMEEEINLDGHRPRVRRYAHGLKRLIKIGQGPETLLRQSSNLNTRTGSDGFFEGDFGDALERHRWKCVRTFNGVRIFEDVADSKSGKGVLVKSVGVVDAHADTVFDIVLNFDWSQRYEWDTLISDLELVESYDGHYDILYGTNNPTYLSQSQCKRDFIFSRQWFRGQDGTYTILQVPCSHKKKPPRSGYRRSRINPSTWEIRCLNTAMGSNAPKCLVTQILEIQPAGWFKWQRNHPSKFEKSVPYALLCQVAGLKEYVLANPALNYENLPTVVRSKISDGSTTNSDYDDGEVQDEFYDAIAADSSSSEEESDNDKELNNKELKVKLKNVSWAIAGFSLKRKSAVDANKELDPNVAPIILETSQFHGSLQRGRDEKDTNCWTSPSGTGFMIRGKNYLKDNSKVMGGDPLLKLIAVDWFKVDNSFDGIALHPRNLVQSEAGKKVPFMLVINLQVPAKPNYSMVMYYAADRPVNKNSLLGKFVDGSDMYRDSRFKLIPSIVEGYWMVKRAVGTKACLLGKAVTCKYLRRDNFLEIDVDIGSSTVARSVIGLVLGYVTSLVVDLAILIEAKEEEELPEYILGTVRLNRVKLDSAIHLET* Homology
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. NCBI nr
Match: XP_004139274.1 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN60739.1 hypothetical protein Csa_019235 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1529.2 bits (3958), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/749 (100.00%), Postives = 749/749 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. NCBI nr
Match: XP_008456782.1 (PREDICTED: protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 [Cucumis melo] >TYJ97873.1 protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1489.6 bits (3855), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/750 (97.07%), Postives = 741/750 (98.80%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. NCBI nr
Match: KAA0063546.1 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1476.1 bits (3820), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/774 (94.06%), Postives = 741/774 (95.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. NCBI nr
Match: XP_038890260.1 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1440.6 bits (3728), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/749 (94.39%), Postives = 728/749 (97.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. NCBI nr
Match: XP_022946654.1 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like [Cucurbita moschata] >XP_022946655.1 protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1401.0 bits (3625), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/750 (91.33%), Postives = 716/750 (95.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZF6 (Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EDR2L PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 9.1e-91 Identity = 230/737 (31.21%), Postives = 360/737 (48.85%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JSE7 (Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EDR2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 335.1 bits (858), Expect = 2.0e-90 Identity = 229/738 (31.03%), Postives = 358/738 (48.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LI72 (START domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G009280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1529.2 bits (3958), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/749 (100.00%), Postives = 749/749 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BF27 (Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold285G00860 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1489.6 bits (3855), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/750 (97.07%), Postives = 741/750 (98.80%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C416 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496625 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1489.6 bits (3855), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/750 (97.07%), Postives = 741/750 (98.80%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VAV2 (Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold329G00520 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1476.1 bits (3820), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/774 (94.06%), Postives = 741/774 (95.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4I3 (protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450658 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1401.0 bits (3625), Expect = 0.0e+00 Identity = 685/750 (91.33%), Postives = 716/750 (95.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. TAIR 10
Match: AT5G35180.1 (Protein of unknown function (DUF1336) ) HSP 1 Score: 1055.4 bits (2728), Expect = 2.1e-308 Identity = 516/745 (69.26%), Postives = 609/745 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. TAIR 10
Match: AT5G35180.2 (Protein of unknown function (DUF1336) ) HSP 1 Score: 1055.4 bits (2728), Expect = 2.1e-308 Identity = 516/745 (69.26%), Postives = 609/745 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. TAIR 10
Match: AT5G35180.4 (Protein of unknown function (DUF1336) ) HSP 1 Score: 1031.2 bits (2665), Expect = 4.2e-301 Identity = 515/778 (66.20%), Postives = 608/778 (78.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. TAIR 10
Match: AT5G35180.3 (Protein of unknown function (DUF1336) ) HSP 1 Score: 730.7 bits (1885), Expect = 1.2e-210 Identity = 356/553 (64.38%), Postives = 432/553 (78.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_2G003480 vs. TAIR 10
Match: AT5G45560.1 (Pleckstrin homology (PH) domain-containing protein / lipid-binding START domain-containing protein ) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 6.5e-92 Identity = 230/737 (31.21%), Postives = 360/737 (48.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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