CsaV3_1G033210 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGATTGGAAGACACGGGATGCGCGCAGCTGCGGTTCATGCACGAAGACAAACGCAGACGAACGACGCTCCAACTTCAGCTCCAACGAAATGACGAACGGCATGGGACGCGTTGTGTTTGGGTAGTTGTTGACTGTAAAGAGACGTGCGCGACGACGGCTTCACAAACGGAAAAATGGATGCGGTCAGAAACGAGTCGTCGGTGGCTGCGCTTCACGATCGAAGACCAACCGCGGTCAAAAGAGAATGGTCGGCGACTTCAACTGGACTTTGATCGGACACGAACTGCACGTGACACAACGGCTCGAGATGCGGCTGTTGAAGGCGAATGAAATGCGGCCGGTGGTGAGGCTAGGATGAAAGTGCGGCTAGGACGTGAGAAAGAAAGAGAATAGTGAGGAAGAGATGCACACAAATCGAGAAGTTTAATAATAATAATAAGAAAATAATTTTAATTATTATTATTATTATTACATTTTTTATTTAAATTTTTACCTCTTTTCCTTTCCATCCAAAGCTAAAGTATATTAACACCCAAAATTTAAATTGTTTAATAAATAAGACAAATTTGATTAATAACAATAGGTCTAAAATTCTGAGGTGTTACGATAGAAGTCTATATGAAATATCTTACCATTTCGTGTATTAAAAAAATAAAGATGAAACAAAGAGGGAAAAGAAATGCGTGAGGGAAGATGAATGGTAACTTTGTAATTTCATATGTTTAAAAGGTAGGTTGAGCTTGCATTTTGTTATATTTGCAAAAGTACAAATCGTGTGGTATGAACCTAATTTTTTATAATAAATTTTCGATATCGGTGAGTGCTCCTTAAAAAAAATATAATTTAATCTTCATAATTTATATATATAATTTAATCATTATGATTTTAATAAAACACTTATAATGAAAGATTATTATAAAACTAAATTCAAACTTTTCAAGTTAAACAAACTAAATTTAAGGAGTTTTTTTTATTAGAATAGGAATGTTGAAGTCAAAGAAAATCAATCATATAGTACAGATTGGAACTGACCATCCAACTTTTGATAATTTAATGAACAAAAAGTTCCAAAATGTGTGTAATGTTGACTATGCCCAATTTAATCTATATGCACAAGAAACTTAAATTTTAAATCATTAGTAACCATTGAAAATACCTCCTAACATAGAACACACTTAAATTTTGGGAGAATGATTTTAAATTTATCTGATAAATTTATGTTTATAATAAGAAGTTTAGTAATTTCAATCAAGATACTTATCTGATAAATTGTTTAGTATCCTAAATTTTAATGGTTCACGTATAGCTTTCTCTTTAGTTTTAATTTAGGCTCTCTCTAAGTTTGAGCTCCATTTAATTATTTCCATAATAATACTTATTCAAGCCTTTGTATGAGATTCTTTCAATACATATGTTTAGGCTTTTCCAAGAGTGAGACCAGTCTCTCTCCATATATATGTTTTGCCTAAATACTATATCAAAAGGACAATCTCTTCCAAAATCTACGATAACTATCAAAAACTCAACCTTAATGAAGAATAGATAGAAGTTTAAGTTTAAGATTTAGATCAACGCTGAGCTCAAAACATTAAATTTACAAACTTTTCTAATGAGGTGAGTGAGGCTGGTTTGAGCCATTTGAGCCATCTTATTTTGTGTAGTTACGATGTATTTTGTAAGAGCACCGAAATAGAGTTCTATTATTAGTTTTTCACACCCTTTACTCATATACTTTCTTTGCTTTTATTTCATAACAAGTTATTTAAGACAATTTCACTCTTTTAAACGTCCGTCACACGCACGAGGAAGCAAAAGGGGAAAATAAACTCAGCTCTGTCATTCTTGTTGTATCAACCGCACAACAGCCACCACCGCACGTCCGATTGCCGTCTCCGCCGTCTTCCTTGCTGCATCGCCTTGGCCAGTCGCCCAGCTCCGACATCTTGTCGGCAAACCGTTTTTAGTTGAAACTCATCTCGTCCGGTGTAAGCTCATGTTCCATTCTTCTTTTAGTTATACTCATGGCCTTCGTACTTTTAATGCTTGAATTGTTTTGATAAGGAAAATTCATACCATTTAGTTTCGTATAAGAATTGAATGTTGGTAAGTGTTGAAAGGTACTTTTAATGCTTGAATCTCAGCTTGCATCCGTTGTCCTTCCACCATTCGTTGCTTTGTCCTCCTCGGATCGGTGAGATTCTTGAAGTTTTAATGTCCAATTTCAAATGGGGTGAGTGGTCTCTCAAATATTTCTCTCCCATTAGGAAGTAATCATAGAAGTGTTGATACCTTCGCTTACAGATTTAGGTAGTGAGAAAGTTCCATGTGAGAGATTGACCTGACAAAAGCTGTTTTTCTAGTCCATCCTTTTTGGGAGGAGCTGAATTGGATGTGGGAAGTCATTTGGTTAGCGGAAATTAACCTTATTACTCTAGGGCAGAGAGGATTAACCCATAACACTAGAAAATAAATGAAGTCTTACTGTAAAATTGGTTATGGAAGTTTCTTTGAGAAGACAGAAAGTCAATCAAACTAAGCATGGGTTAGATTCAAATGGCTAGTTCCATATCCGTTGTGTGAATGGTGCTATAATAGTGCTTGGTGCCCTAAATTGGCCACATTCATTCATGGTAGGATGGTGGCTTGGTCGAAGTTGTTTCTTAAAAGTTAAAGTTACCTTTTGTCTTTTCCCAACTTGAGAAGATTCCTAACCTGCCTACTTATCTTGAGACTTATATGAATTGTACAAATATGGAATATTTTGACCCCTGTTTTTGTTCATCCGCTACGAGTTGGTTAGAGACAATTGGAATTATCCTCGTCAATAAAATGTATGGTTTTATGCTGTCCGAATGATTTTGTTGGTTGGTTTCTCAAAATTCTCTTAATGTGAAAATGTGAAAATGGAAAGTTTACAATCTTTTAGAATTCAACTTGCAGATTTATTTTAATAATGAACAAAAACAAATAGGGTTGATTATATATCAAAATTGAATCATTACATCAAAGGCTTTGTTGTAAATCTATTGAGTTGATAGATGCGATTCTTTTGTTTTTCTATCTTCGTTTTTGGATTGGGATTTACTACTTTCATTTCCTCGACGAACCTCTTAGTGTTGAGAATTTCAAGTACAATGGTACAGATGGCCTTATAGATAAGCATTCAGACCATAACATTGTATTCTTATTTTCTTTCAGTTATGATGAAGGTGGAGCTGCATAATTCTGTTTGTATTTGTTTATTGTTTGGAATTTCATTGATATTCTACCCTGCAGTTGGCTCTTTCCTTGATGGCATTTCACACTCTAGTAAGGTCAGTCCTGATAATTTATTTCTCATTTCCGTTTTTTCATGTTTCATGTTTCACGTTTCTTATCTTTTCAATTGTATGTTCTGAAAGCATTTAATTTGAAAATAAACTTAGAATACGAGCTAAAGAAGAACTTCATTTGCTTGATTTATGATTATTTTTATTATTATTTTTTCATAAGAAACAAAGATAACATATATTCTCCTTTTGCTTGATTAAGAAACGGAAGAAATTTCTTTTGATCAGAGATTCATAGATTTGAGATCAATTAGATTGGTTACAAATCTGTACAAGAATGTTGCTATGGTGCTAGTTGAAAGACTAAAGTCTTCTTCCTCCCTAATTTATTTTAAGAAAAAAGGCTAGAGTATGTATAACTTTTTACCATTTTGTTGATAAAAAAATGCTTTAATAAAGAAAGGAAACCCTGGACATCTGGTGTTTATTGCTAAGGGAGTAGTAGAAGATTATGTAACTAAGGATGAATATTTTTGAGAAATTATTTCAAATGGTAATAATACTAGTAGACAATGATAAACTTCTATTAGTGTCTATCAATGCCATTTATAGACATTGATAGAATTTATCATTCATAAATTTTGAAATTTTGTTATATTTTGGTTTATTTTGCTATATTCGAAATCAACCAAATATTTTAATTAGATTTAGAATAGAATGATATAATTGTTGGAATTTAATGTATGAGGTGTTGCTAAAGAAAGCCTTGGGGGCATGTAGATTTGTTGGATTACAGATTGTATTTGTGAATCAGGATTAATTACTTCCTTTGGAACTTTAAACTTATCTTCTTGGAATGCTTAACTCAGGATTAGATATCTCCCTTGAGACGCTAAACCTATCTTCTTGATATGCTCAACTCTTTCTCACTCGTCTTCTCCTTGTGATAGACAGTGAATGCTCACTCCTTCTTGCCAGACTTCATTCCTCGCTGCTATGCAGAATGCCTAACTTCTTCAATCAAAACGTCTGCTTCATTGCAACAACTCTTAAACGCAAACACTTCTTCCCATTTTGCCTTCCTTTGAAACGCAACCTTCTCCGCAAAATGTCTCAAAATTGAACTTAGCCAAAATAATCCATTCATCAAGGCTCTTCTTCAACAGAACTCCATTCTGGATCTGGGCCTTCAACTTGTGTGCTTACACCCCTCAACAAAATAGTGTTGCTGAGTGGAAAAATTGTCACCTTTTGGAAGTAACCTGTTTCGTCTAGTTCCCTTCCTTCTTCTCTGTAGGGAGATGATGTTCTTATTGCAGCTTATCTCATCAATAGGATGCCCTCTCGTGCCCTGCATCTCCAAACTCCCTTAGATTGTCTCAAGGAGTTGCATCCCGCTACCTGCCTCACTTATGAGGTTCCACTTAGTGTGTTTGGGTGTACTGCCTATGTTCATAGCTTTGGCCCTAAGCAAATCAAATTCACCCATCGAGCTCCGGCATGTGTTGGGTATCCCCTTCATCAACGGGGCTATAAATGTTTCCTCCCTCTTTCCTGTAAATACTTTATCATTATGGATGTCATCTTTCGTGAGGATCGACCTTTCTTTCCCGTTAGCTTTCTTCAGGGGGAGAATGTGAGTGAAGAGTCTAACTGTTCCTTAGAGTTTACTAGGCCTACCTCTGTTACCTTACCCGACCTCGATCCTCATCCAGAAAGGAT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MRLEDTGCAQLRFMHEDKRRRTTLQLQLQRNDERHGTRCVWVVVDCKETCATTASQTEKWMRSETSRRWLRFTIEDQPRSKENGRRLQLDFDRTRTAPTTARPIAVSAVFLAASPWPVAQLRHLVGKPFLVETHLVRFMMKVELHNSVCICLLFGISLIFYPAVGSFLDGISHSSKVGRHIMESYYEKHESFIDSLFDDFLTRDLPVNICEVLPSDLNTLLSLSIWSRIKGDGSHRQLSSTIKFKIEKSLFHVPTHHCKFIIIERLPSGVFVDPFELEHLLHRAVFSDVAVFGDTNLELPSVLSNISVVEVHKDIGLNILSHNKNLIDFTVDLPLHSRYPRLDESGYVEVRLKAPDLFLQCSIQEKPHNRTCFFRLETDDEEADLTWSIPADQSALVALKSHITNDPFGITTNNWSTTTSVCNWVGIECGRKHNRVTILNFSFMGLTASFPPELGALSFLTYITIKNNSFHGPLPIEILNLPRLKVFDIGNNEFSGEIPAWLGKLPRIERLLLYGNRFYDSIPVSIFNLTSLLTLSLQNNQLSGGIPREVGNMTILEDLFLDGNQLTEIPSEIGKLGRLKRLNLESNLISGPVPGGIFNLSSLIALDLTRNNFTGGLPDDICENLPALKGLYLSVNHLSGRLPSTLWRCENIVDVGMADNEFTGSIPTNFGNLTWAKQIVLWGNYLSGEIPKEFGNLPNLETLVLQENLLNGTIPSTIFNLTKLRIMSLFRNQLSGTLPPNLGTNLPNLVMLFLGENELTGSIPESISNASMLSKFDLSQNLFSGPISPALGNCPSLQWLNLMNNNFSTEESSSRTSIFNFLANLTTLVRLELSYNPLEIFFPNSIGNFSASVEYLSMADVGIMGHIPADIGNLRTLTVLILDDNGINGTVPPSIGKLKQLQGLYLRNNYLEGNIPIELCQLDNLFELFLDNNSLSGALPACFENLSYLKTLSLGFNNFNSTVPSSLFKLSNILSLNLSSNLLTGSLPIDIGNVKLMLDLDVSKNQLSGQIPSSIGDLTNLIGLSLSRNELEGSIPNSFGNLVSLRVLDLSNNNLTGVIPKSLEKLSLLEHFNVSFNQLVGEIPDGGPFSNLSAQSFMSNPGLCADSSKFQVQPCTRNLSQDSKKKSNKLVIILVPTLLGTFLIVLVLLFLAFRGKRKKEQVLKDVPLPHQPTLRRITYQELSQATEGFSEKNLIGQGNFGSVYKATLSDGTIAAVKVFNLLSENAHKSFEIECEILCNVRHRNLVKVITSCSNMDFKALVLEFMPKGSLEIWLNHYEYHCNLNTVERLNVMIDVALALEYLHYGFGEPIVHCDLKPSNILLDEDMVAYVTDFGISKLLGGGDSITQTMTLATVGYMAPELGLDGIVSRRGDIYSYGVLLMETFTRKKPTDQMFCGGEMSLREWVAKSYPHSITDVFEDSALLTKNDETLKHRTEIECLTSIISLALSCTVESPEKRPSAKHVLDSLNNIKTAFMKYERS* Homology
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. NCBI nr
Match: KGN65971.2 (hypothetical protein Csa_020121 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2950.2 bits (7647), Expect = 0.0e+00 Identity = 1480/1480 (100.00%), Postives = 1480/1480 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. NCBI nr
Match: XP_004150224.2 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2166.0 bits (5611), Expect = 0.0e+00 Identity = 1090/1093 (99.73%), Postives = 1091/1093 (99.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. NCBI nr
Match: XP_008443430.1 (PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2073.1 bits (5370), Expect = 0.0e+00 Identity = 1036/1093 (94.78%), Postives = 1064/1093 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. NCBI nr
Match: KAA0057051.1 (putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1991.1 bits (5157), Expect = 0.0e+00 Identity = 1007/1096 (91.88%), Postives = 1038/1096 (94.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. NCBI nr
Match: XP_008446690.1 (PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1528.5 bits (3956), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/1091 (69.75%), Postives = 910/1091 (83.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGP4 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g47570 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 609.8 bits (1571), Expect = 8.4e-173 Identity = 383/1113 (34.41%), Postives = 568/1113 (51.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FL28 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FLS2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 2.4e-167 Identity = 399/1174 (33.99%), Postives = 604/1174 (51.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1MX30 (Receptor kinase-like protein Xa21 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=XA21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 588.2 bits (1515), Expect = 2.6e-166 Identity = 372/962 (38.67%), Postives = 526/962 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SD62 (Putative receptor-like protein kinase At3g47110 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g47110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 587.4 bits (1513), Expect = 4.5e-166 Identity = 389/1119 (34.76%), Postives = 554/1119 (49.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2R2D5 (Receptor kinase-like protein Xa21 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=XA21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 585.1 bits (1507), Expect = 2.2e-165 Identity = 370/963 (38.42%), Postives = 530/963 (55.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7Z8 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2073.1 bits (5370), Expect = 0.0e+00 Identity = 1036/1093 (94.78%), Postives = 1064/1093 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UU68 (Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold96G002390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1991.1 bits (5157), Expect = 0.0e+00 Identity = 1007/1096 (91.88%), Postives = 1038/1096 (94.71%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BF66 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489334 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1528.5 bits (3956), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/1091 (69.75%), Postives = 910/1091 (83.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CF20 (LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010898 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1518.1 bits (3929), Expect = 0.0e+00 Identity = 773/1117 (69.20%), Postives = 905/1117 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M083 (Protein kinase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G470320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1490.7 bits (3858), Expect = 0.0e+00 Identity = 753/1129 (66.70%), Postives = 903/1129 (79.98%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. TAIR 10
Match: AT3G47570.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 609.8 bits (1571), Expect = 6.0e-174 Identity = 383/1113 (34.41%), Postives = 568/1113 (51.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. TAIR 10
Match: AT5G46330.1 (Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 591.7 bits (1524), Expect = 1.7e-168 Identity = 399/1174 (33.99%), Postives = 604/1174 (51.45%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. TAIR 10
Match: AT3G47110.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 587.4 bits (1513), Expect = 3.2e-167 Identity = 389/1119 (34.76%), Postives = 554/1119 (49.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. TAIR 10
Match: AT3G47580.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 583.6 bits (1503), Expect = 4.6e-166 Identity = 373/1111 (33.57%), Postives = 560/1111 (50.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G033210 vs. TAIR 10
Match: AT3G47090.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 581.3 bits (1497), Expect = 2.3e-165 Identity = 375/1110 (33.78%), Postives = 558/1110 (50.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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