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CsaV3_1G014320 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGAAATTAAAATATTTTATTCGTTCAAAATATCCACATTATCCATTACAAATTCATTTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAAAAGACACCCTTTATTCTCTTCTTCTTCCTTCGAAGCTCCCATTTCTTCCAACAACCAATCCTTCTTTAATGTTCATAACCAAAGAGCTCAAACCGCTCTCCAATGGCCCTCTCTTTATCCCTACAACTCATTCGCTTCCCTCCTCAACCTCCATCCCCATCCTCTCACCTCGCCTCTCTCTCCCGCTTCTTCCCATCTCCATGCCTTTCCTCTTTCGCTCCGTCCCGAGACTATGCCGTCAAGTTATCTTCCAGAACAAAGTGTTTCTCCATGTCCACTGAGGAGGACAAGTGGAGTGAATCTGATGCGTTTGTCTCCGATGTCGACGAAGGGGGAGATCTTGAGGATGACATTGATATTAGTGTTCGGGAAGACAGCCCTGTGGCCACTGCTGCTTCTGCGCAGAGGATTTCTTCTTCACCCAGTGATTATCTCTCGCTTGCGATTCGTGAGCAGGTTTATGAGGTCTGTTTCTTTGATGCATTTTTCTATTTTTAGTTCATTTTGGATGTGTTTGCTGCTACTTTGAATTGCGTTCGATTGAAGTGGGGAATTTGACTCTCAAACCGGAAAATTTCAATCAAGTTCAGATAGCCTGTTCAAATGCCTAACTAATTATTTGATTCTTGAGGGAAATTAGCTGAGCAGTGTTGTGTCTACCAATGCCTAATCGTCCTTAGTTGCTAACTGGGGTCTTTTTTCTTTTTGTTGATGTTGAAGAACGTTTAAACGGGTTAATAGTAACTAACTGTAAGGTTCCTCGCATATGATGCTATGTTATAAAAGGTTTAGTATTAAAATTTTAAACGGTTGTAAGTGCTTCTAATCTTGTAGTAATTTAATGTTTCCTTCATTGATTTTTGAACATAAAAAACATTGGCAGCATACAATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTATTTTAAAGGAGGACAGATTCAAACCTCTTATCTTTAGAGCGAAGAAATGATGTAAAGTTATGACATTATATTGTTTTTTTGGATGAAAATAACACCTTTAATTGGAAAAGAATAAAAGAATACAAGTACATACAAAAAAAAAACCAACCCAACACAACACTTCATTCAAAAATAACCAAGTAAAATGTTGCCTATGCAATAATTATAGAAGCTCCTTGAAATCAAAGCTCAAAGGGACATGTGAAATCTAAGCAAACAAATCTCACTAAGCCCTCTCTCCCTACCCTGAAAAACTCGATCGTTTCTCTCCTCCAAATGTCCCAAATAACAGCGCACACCCCGGCAAGCCATAAGAAACCCCTTTGTCTCTTTGGTGACCATACGTACATTTGATTAGTTTGGAGAATAAATCATATAAAATAATCACTACACCCATCAAAGAAATAATACAAAGTAATTACTTTTGAGGGGTTCTACTTTTGCACTCTTCTTTGAGGTCACTATTTTTTTGGATATGAAAAAAGGTTCTGTTTGAAGGGCGGAACATTTAAATTTTTTTAACTCAAGTTAAGACCTTGTGCTGTAATCCTTCCACCGGTTGGAGTTAATGGTTTGGAGGTAGGCTAGTTATAGTTTTGATTCCAAGATCAAATCTTTTCCTGTTAGAGATATATTTATGGGTTTCTTTCTTTGATAAAGGGAAGTTCTTACAGATGTTCATCTTTATTGACCACCTAGGTGTTAGAGGTTAAAGCTAATGGAACCGTATCCACCAGGAAGGTTAACAGACGGCAGCTGTTGAAGTCAAGTGGTGGGTAGATATTTCCAGAAAGTTCAGCTTCACATTTCAATGCTTAGTTTCTGGATTTATGCTGTTGAAAACTTTTAGCCTGCATTGACTTATGAATACTTTCTTTTTTGGAATATCAATTACTACTGGATGATCACTGTTGTTTTTTCTGGATTCACACTGATAGATAACCTGGGATGACAAATAATATTACGACCTACTTTTTGTCAAGAAAATATATCTTGTCGTTTCATTATTTTCCTCTTGCTGATATATGTATTTTCTAATTGTCAGGGCTTCGTCCTCGTGATGTCCGAAGTGTTGATCCATCTTTATTTTTGACAAACTCAATGCCTACATTACTGGTACATTAATTTTCATCTTTTTTAATTTGTGGTCTTCTTTTTATGTTGAAGAATTAGCATATGGGATAAACATATGAAATTAAGAAATTGAAGTCTATAAATAATACTCAGCAACAATTATATTTGTGGTTCACATCCCAGGTACGTGAACATGCTATTTTGCTTAATCTGGGATCGTTGCGAGCAATAGCCATGCAGGATTGTGTCCTCATATTCGATCATAACCGGTATCCATCTGACTTGAAAATGGTGCCATGTTTATTTCTCATACAAAATTTCGATATTGCATTTCTTTTTGCATGATGGTGATCATCTTCAGTCCAGGAGGACAAGCTTTTATTGAATCATTGTTGCCTCGATTGAACCCAAAAAACATGAATGGGGTGCCAGCAATGCCATTTGAACTCGAGGTTAGTGATTCTTGTTAATATAATGCGTCTTTACATCATATAAATAGAGTTGGCAGATGAAAGCAAAATTATCTTACAAACTGTACTTCTGTAGCTCTCTACATCTAACAATAAGATGTTTCCTGGTTGGAATTTGGTCCCCGATAAGCTTACCCCTCAAAGCAAAGAAAAATTACCTCTAACTGCCTTTCAGCATTCTTATGTCATTCTGTGAATCCCAATGGAAATTGCTGAGAAGATCAGATGATTATTCTAAGAAGCAGGGACACGGATACGAGACACGAATACGACACAGAGACTGCGACATGCCATATTTTAACAATCCAGAATACGACACGTGAAGGGCGCGTTTTCTAAAATATTCATTTTAAAAATATATATAATTTTTATAGTAAAAGAAAATTCATAGTAAATGAATTGATGCATTTATATGCTTAAAAGACTTAGCTTAATGTATTCCACACTGAAAAATGAGAATATGTGTCTTTTTAGTCTACTCAGCGAGTGTTCTATGCATGTCTAATACATTTGTTGCACTAACAAACGTCTGAAAGGTGTCTACCAAGTGTCAAAATGTCCAAGTGTTCAACTCATGTCGGATATGGACACGCTAGCCAAACTAAAGTGTCTGTGCTTCTTAGATTATTGTTAGCAGATAAGTGGAGATCAGCTTTTGGATTGGGATTTGTTCATATATTCTGACCTCAAAGGTTTTCAAATTAAAATCTGGCCTTGAGAGGTCCGTGAAGGTTCCAACCAATTCTGTAACTTACATTGAATAATATCTATGATGGAGGCCAGCCAATAAAATTTTATTAGATAACTGTTGAGGGGAAGACCTGAAAAAGCAGTGGGCCATTGTTCAATGTCACAACCTGCTACGGAGGCTGAACTTTTCACTACCAGATCATCTCTCGGCTCCTAATATCATTCTCATTCTCAGATTATTCTTCAGACCTGAGAAAGTCTAAAAAGCTTGATGATATTGAAGAGATTAACAAACTCATCTTCAAGAGCAATTGGAGAAGAATGGTACAAAATTTCATACAACCCTTGATCCAACCTTGGTTTTACATAAGTAATAATGATCTTTTAATCTTCTGGTCTTAGCTCGTCATTGGCTTCTTCACTTCCACGATAGCGTTTACAGAATCTAAATAAACTACAACAAAGGCCTTTTCCAGGTCCAGTTTAACGTCTGCACCCTTCTTCTTCCTTATTCAAACATCAAGGAGTGCTGGACAAGAATCAATAATTTGTTTCTACCGGAAAAAGCTTACTGGTGTTCTATACTTGTGTATCATATAATCTTTTAGACATTTTAATAAAAACTTAGTGGGTAAGGCCACTCAGTTTGAACTAATTGCCTTTTTTGCATTGCACTTCATTAGATTAAGGAAACTGCACATCTCATTAATGCTCATTGCTCATGTCATTAATGTCGTTTTAGATAAGTCCATGGAACAATTTCATTAACTTTTGCAGAAGAATGCTGCTGTTAAACAGTCTAGCCGCTAGGGGTCTACCCAAAAGCTTTGCAAATCTTTCAAGATCTCACCTTAGTAAAACTGCTTCCTGCAACTTCCTTTGGTAATCACTGATCTGAGAGAGTTCAAATCAAGATTAGATTGGAAAACCTTGCCGTTGTACTGGGGGAATGTAAGAAGTTAAAGAACTTCCTTAACCTGCCACTCTTTTACTGAGGTTTGGGAATGCAACTAAAGTTCCATATTGGTTACACAAGGGGAAGATCATAATTCAGGACTGTATAAGCGAGAGACAAGATCTCCATTGATAGTGACCTTTGGGTGAAACAAAAAACGAAGATATGAGACTACGCCAAAGTGGATAATATCATACTATGGTATAAAAGTGAGAATAATTATCTCCTATGGGAACTTTTGGGTGAAACCAAAGGTAAAACTGTGAGGGCTTATGCTCAAAGTGAGCAACATTATGCCATTGTGAAGATGTGGAGTGTTTATTGTCCCTAGTATGAGATATTCAGAGGGTTCGTAGTCCATATATCTCTATATATGTCCACAATGGTTTGATATTTTCTACATATCTCTGCTGTTTCTTTGGTCATATCTTCATTGACTTGTTAGGGATGTCCTTCACATATCTCCACAATGGTATGATGTTGTTCATTTTAGGCATAGGTCCTCATGACTTTACTTTTGTTTGCTCAAAATACCTTGTTAAAGTGGACTATTTACCTCTTTTCTATGCATAGCATGAATATTTTTCTTGGCTATATAATGTGGGGCTTTGTTTGCATTCCTGTAAAGCTTTCTTGATGTAGGAGTTATAACCTATTGTTGGTTATCAATTAGTAGCAATTAGTTAGTTTAATCTTTTCTTTAAATTCTTGATTTCCAACCAACCTCTAGTTGGTTATGA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ATGGCCCTCTCTTTATCCCTACAACTCATTCGCTTCCCTCCTCAACCTCCATCCCCATCCTCTCACCTCGCCTCTCTCTCCCGCTTCTTCCCATCTCCATGCCTTTCCTCTTTCGCTCCGTCCCGAGACTATGCCGTCAAGTTATCTTCCAGAACAAAGTGTTTCTCCATGTCCACTGAGGAGGACAAGTGGAGTGAATCTGATGCGTTTGTCTCCGATGTCGACGAAGGGGGAGATCTTGAGGATGACATTGATATTAGTGTTCGGGAAGACAGCCCTGTGGCCACTGCTGCTTCTGCGCAGAGGATTTCTTCTTCACCCAGTGATTATCTCTCGCTTGCGATTCGTGAGCAGGTTTATGAGGTGTTAGAGGTTAAAGCTAATGGAACCGTATCCACCAGGAAGGTTAACAGACGGCAGCTGTTGAAGTCAAGTGGGCTTCGTCCTCGTGATGTCCGAAGTGTTGATCCATCTTTATTTTTGACAAACTCAATGCCTACATTACTGGTACGTGAACATGCTATTTTGCTTAATCTGGGATCGTTGCGAGCAATAGCCATGCAGGATTGTGTCCTCATATTCGATCATAACCGTCCAGGAGGACAAGCTTTTATTGAATCATTGTTGCCTCGATTGAACCCAAAAAACATGAATGGGGTGCCAGCAATGCCATTTGAACTCGAGGTTGTTGAAGCTGCATTGCTTTCACGAACTCAGCGTTTGGAGCAACGACTAATGAAAGTAGAACCTCGTGTTCAAGCTCTGCTTGAGGTATTGCCCAACAAATTAACTGCAGATGTGTTGGAACAACTTCGTATTAGCAAGCAGACACTGGTTGAATTAGGTTCCAGAGCAGGGGCTCTGAGACAAATGCTTCTTGATCTTCTGGAGGATCCGCTAGAAATACGGCGCATCTGTATTATGGGTAGAAATTGCACGTTGAATAAAAGAAATGATGATGTGGAGTGCACTCTTCCTTTGGATAAGCAGATTGCTGATGACGAGGAAGAAGAAATAGAAATGCTGTTGGAAAATTATCTCCAGAGATGCGAATCTTGTCATGGTCAGGCTGAAAGGCTTCTGGATTCTGCAAAAGAAATGGAAGATTCAATTGCCGTAAATTTAAGCTCACGGAGACTAGAGGTTAGCAGAGTGGAATTGCTTCTCCAAGTTGGGACATTTTGTGTGGCAGTTGGTGCTTTAGTTGCAGGAATATTCGGCATGAACTTACGATCATACCTTGAAGAACACGTGTTTGCTTTTTGGTTAACAACAGCTGGGATAATCGTCGGTGCTGTTGTTGCATTCTTTCTCATGTATTCATATCTCAGAGATAGGAGAATCCTATAG MALSLSLQLIRFPPQPPSPSSHLASLSRFFPSPCLSSFAPSRDYAVKLSSRTKCFSMSTEEDKWSESDAFVSDVDEGGDLEDDIDISVREDSPVATAASAQRISSSPSDYLSLAIREQVYEVLEVKANGTVSTRKVNRRQLLKSSGLRPRDVRSVDPSLFLTNSMPTLLVREHAILLNLGSLRAIAMQDCVLIFDHNRPGGQAFIESLLPRLNPKNMNGVPAMPFELEVVEAALLSRTQRLEQRLMKVEPRVQALLEVLPNKLTADVLEQLRISKQTLVELGSRAGALRQMLLDLLEDPLEIRRICIMGRNCTLNKRNDDVECTLPLDKQIADDEEEEIEMLLENYLQRCESCHGQAERLLDSAKEMEDSIAVNLSSRRLEVSRVELLLQVGTFCVAVGALVAGIFGMNLRSYLEEHVFAFWLTTAGIIVGAVVAFFLMYSYLRDRRIL* Homology
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. NCBI nr
Match: XP_031741504.1 (magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741505.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741515.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741526.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741533.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741541.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741543.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741545.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >XP_031741547.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8652790.1 hypothetical protein Csa_022786 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 844.3 bits (2180), Expect = 4.7e-241 Identity = 449/449 (100.00%), Postives = 449/449 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. NCBI nr
Match: KAA0052093.1 (magnesium transporter MRS2-11 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00707.1 magnesium transporter MRS2-11 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 798.1 bits (2060), Expect = 3.9e-227 Identity = 434/459 (94.55%), Postives = 441/459 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. NCBI nr
Match: XP_008462287.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 2.5e-226 Identity = 433/459 (94.34%), Postives = 440/459 (95.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. NCBI nr
Match: XP_038894959.1 (magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 781.9 bits (2018), Expect = 2.9e-222 Identity = 422/456 (92.54%), Postives = 437/456 (95.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. NCBI nr
Match: XP_038894956.1 (magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038894958.1 magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 2.3e-219 Identity = 421/463 (90.93%), Postives = 436/463 (94.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q058N4 (Magnesium transporter MRS2-11, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MRS2-11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 5.5e-160 Identity = 318/441 (72.11%), Postives = 363/441 (82.31%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8APK3 (Magnesium transporter MRS2-A, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MRS2-A PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 529.3 bits (1362), Expect = 4.4e-149 Identity = 284/392 (72.45%), Postives = 339/392 (86.48%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AUK4 (Magnesium transporter MRS2-A, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MRS2-A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 529.3 bits (1362), Expect = 4.4e-149 Identity = 284/392 (72.45%), Postives = 339/392 (86.48%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7SFQ9 (Mitochondrial inner membrane magnesium transporter mrs2 OS=Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) OX=367110 GN=mrs2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 115.5 bits (288), Expect = 1.5e-24 Identity = 99/374 (26.47%), Postives = 181/374 (48.40%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4WCV3 (Mitochondrial inner membrane magnesium transporter mrs2 OS=Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) OX=330879 GN=mrs2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 3.4e-24 Identity = 88/298 (29.53%), Postives = 145/298 (48.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U838 (Magnesium transporter OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1371G00610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 798.1 bits (2060), Expect = 1.9e-227 Identity = 434/459 (94.55%), Postives = 441/459 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CI47 (Magnesium transporter OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500679 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 1.2e-226 Identity = 433/459 (94.34%), Postives = 440/459 (95.86%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HK11 (Magnesium transporter OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464814 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 734.9 bits (1896), Expect = 1.9e-208 Identity = 405/456 (88.82%), Postives = 421/456 (92.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I090 (Magnesium transporter OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469313 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 731.5 bits (1887), Expect = 2.2e-207 Identity = 404/456 (88.60%), Postives = 421/456 (92.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHI9 (Magnesium transporter OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020540 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 718.4 bits (1853), Expect = 1.9e-203 Identity = 396/465 (85.16%), Postives = 417/465 (89.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. TAIR 10
Match: AT5G22830.1 (magnesium (Mg) transporter 10 ) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 3.9e-161 Identity = 318/441 (72.11%), Postives = 363/441 (82.31%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. TAIR 10
Match: AT5G09690.1 (magnesium transporter 7 ) HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 1.2e-21 Identity = 96/358 (26.82%), Postives = 172/358 (48.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. TAIR 10
Match: AT5G09690.2 (magnesium transporter 7 ) HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 1.2e-21 Identity = 96/358 (26.82%), Postives = 172/358 (48.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. TAIR 10
Match: AT5G64560.1 (magnesium transporter 9 ) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 4.8e-18 Identity = 94/364 (25.82%), Postives = 167/364 (45.88%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G014320 vs. TAIR 10
Match: AT5G09690.4 (magnesium transporter 7 ) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 4.8e-18 Identity = 94/358 (26.26%), Postives = 167/358 (46.65%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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