CsaV3_1G006490 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTACGCATAGATATTTTAGTAGGCCAACGAAAATATCAGGCGAAAGAGGCAAATTTAATCGAGGAATGTACTAATTCGGCGGTTTGGTGGAGCGACAATGGTGTGTTTCGTCTTTATTTTCTCTATCATGCTTAAATTTTGTAACCTTGCCAACTTTCGGAGTTTCGATGAGAGTTTCGCTGGTCTTGGATTCCGACTATTGCAGAGGCAATGAAGTTAGTTTACAAGTTCAGTCCATTTCCTTTGTCTAATTGAACGTCACGTTTCGTAACTCTATTTATTTCTTCGTACTAGAGACGTTTTCCTAATTCGAGTCAAGGGCATTTTTCCTTCTAATTGTTATTATTATTTTAATTTTTATAATTTTGATTATTATTTTAATTTTTCTAATTTTGATTATTATTTTAATTTTTACATAAAGATCAACCTGATTTCATTTTATTGTAAAGAAAATATACACAAACTTCTCAATTAAAAAATATTCAAGATTTATTCGACATAAATATAAGGATGAAGTTTGGAGTTGGACGTTTGATTGGAAGTTTGATGGAATGCATTGTACACTGGGGTGTTATAGAAAGTTTAATTAAAAGTTCCATGAAAGTCATGGAATGCAATGCATAATGGGGGTAAAAGAAATCGTACAAATACTGATAGAATATCAGTATAATATGGTGATTAGAAGGGATAAATTAGTAATTAGATAGTAAGTCATTAGAAAGGATATTATGTTAGTAATTAGATGTAAGTAGGGAAGACTTTTTGGTTACAAACGGTGAGTGAGAGTGAAGTTAGATGTGCGAAATTTTTATTGGATTTTTGTTCTTCTGAGAATTTGGGAGAACTAGTTATCTTGAAAAGTTAGCGATTACTTTGCTACTCCTCATATGATATTGTAACTTTAGATATTTCCATGAGAGATGCTTACTTTTGGGAAGATCATTGAGTGGGTGAGAGACCTCTTTTCGTTGTGTATCATCCTCGATTGTATTACTTCTCTCAACAGTCATTTTGTAGTCAATGTTTTGGTGTGGGTTGGGAGCTCTTGTTTTTTTCGTTTGGATTCTATAGCCCTCTTTTCTATTAGGAAGCAATGGATGTGGCTGCTTTTCTTTCTTTACTCGATAGGTTGGGGAAAATGGATGTTAGATTTTGGAGTCCCAATCATTTGAAAGTGTTATCGTGTAAGTCTCTTTGTGATTTAGCTGATCCTTCCCCTTAGGTCATTTGATCTTTTCGATGCTTTGGGGGATTAAGGTTCCTAGAAATATGAAATTCTTTGTTTGACAAGTTCTTTACAATCATGCTAACACGCTGGACAGGCTTGTCAAGAAGTTACCTTTGCTTGTTAGGATTTTTTTGTTGTATTCTTTGTTGAGAGGTGGAGGAAGACCTTAACCTATATTTTGGCGATGTGACTTAGTGATTGTTGTCTGGGATTTCTTTTGGAAGACGTTTGGCATGAATCGCATGATAACCGTTTGTGACAAAGATCTCAATACTATAATTTCTCCTCAATTTTCTTTCTGGGGAAAGACTGGTTTTTTGCCTAGCAGGAGAGTGTTGTCTTATAAGTTTTGCTAGTAAGCGGAACAGTAGGGTATTTAGGGGTGGTCTCTCGTTCATTTTCTTGTTTTTTTTTGTTTGTTTTGATTTTGGAAATCTCTTGTAACTATTCTATACACGTGATTTCACATAGTTAAAGTTCTTTGTTGTAATGTGAGTTCCTCCATTATTTTGTGGGCTTGGTTTCTTTTTAATGTTTGTGTTCTTTTCATTTTTTTCTTCAACGAAAGTCGTTATTTTTATGTATATTTCAAATTTCTGTGTATTTGAGTTTTTCTGTGTTCCTTGGTAGGTGGTATCCTAACATATGTTAAAGATGAGATGGATGTTTGAACATTTACCTAGTTTATCGATTCAGTCTCTTTTGCCTTTTATTTTCTATTTCTGTTGCATCAATCTGAATATTCTTCAACTCCTTAAACTCCTATAACTTATCTGTTAATGCGGCTGATTCAAGGGACTTGTTATTTATTTTTTAAATCAAGCTGAAATAGGGACTTATCTGAGTTTCTGGGGAAGCAATGTGGTTGTTTAATATGGAGCAAGACTGGCAGATGTTTTACAAGAATATATGACATGAGGTAGTTGGCCATTGTCCTTTTAAATATGGAATGATTGCGTTCTCAACTTTTTTGTGTTTATGTGGTATATAAAATGGCAAGTGTTCGAAATTTCTCCTCTTCTTTCCAACTTGGATGAAATGGTTGAATGATATTATGAAGATCAGTTCTACCTGGTTGGTATTGTGGTGGTCTAGTTGTCGTGTTGTGGTTGATGTGATAACTTTTGTTCATTTCTTGCTTTGAACTCCTTTTGCTTGGACATTTTTATTTTTTAACTACTGTTTATGCTATTGGTTTGCCATGATGGGTCTCTTGAATTTACTTTCACTTCTACTGGCACCGGTGCATTTTCCTTTTCTCAATCCATTAACTGTGAAACCCGAGTAACATATAATTTGGCCTGTGGGATTCTGTTTAGTCCTTGATTTTGGTTTTCTTGGTCAAAATTGTACGATAAAATCAATCACTTTTCAGTTCTATTTCTGAACACTGTCTCCTATCATCAACAGATTGATGACATGGTGTTCTAAAAGAGGGGGGACTTCTTTTATTTCCCTGTAGAGGGAGGGTGGAGAGATTAAAATGATAGGAATTCAAGTGAGAGATTGGAGAACGGGTAAAAGTCTATAATGATAAGATTTGTCTCTTTACTAGATAGAGTGCATGTGTCTGAGAGACCATTGTCCGTCATATATCTCTAGCCGATGTAAAACTTTATTCTCTTATCGGCATTTGATTCCACTTGAACATCTTGAATATTAACGGACTCATGGTTACGTAGATTTGCATGATCCAGGAACTAAGATCATTTATCATGAGCAATTACTTTTTAGGGTAGATTAAATACCCCTTTTCCGTTTTAAAGGTTTGAACTAGAAGTTTCCTTAGTTTCTAGTTTTGAAAAATATAGTAATTCAACTAGATAAGGATCTTCTAAATTGTTATTGGGAACGAACCGCTGTTGGCAGATTCGACGAAGGCTTTGATGTGTTTTTGAGTTTGGATACAGTTCTCTATGTTCCAACAATGATGAAATGGTGAAGGGATTGATTCACTATTTAATTTTGAGGTCGATTTATTTTTGTTCAAGCCACTTTTTTGTTCTTTTTTCTAGAGAAAATCCGAGGTTGACTGGGTTAAATTATAAAAATATATCTTTCTACTTTGTCCTTTGTTTCAAAAGCACTCATATTTTTTCGGAAGTTGCAATACCTTAATTCTTGACCTTACATTTAAATATTTCTAAATTAATTTGATATAGAAGTTTTTTAGAATGATGAGGGAAAACAGACGTAACGGGTGTGGCAGTGACCTAGAACAAATGTACTTTTTCTTCTTATTGAAAAACATTTATTGGAAAATAGAAAGACGACAAACATAAAAACATAAAACGGTGTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTCGTGCCTAATAGGTAGTATGCATTAACAATCATAGTGTGTCCTGAAGAACCATTCAGAAACAGGTTTGGTTTCTGAATTTAGTGATAAAAAGAACTCCAGCCCAAAATTTATGGGTTATCAACTTAATGAGTAATCTATCTATTCCTTTTTCTGAATAATTGAATGACTTGGATTTAAATTGTTGTCTTATATTTACATATATTGGTCTATTTATCTTTCTTATGACCTGTTATTAAAATGGAAATACTTAATCCCCTTCGGAAACATTAAGCCACTCTAGTGATAGATAACCACTTTACTTTTGTTGTCCTATTGTGACTGGACTTGGAGTGTACACAAACAATTGAGAAGTTTGTAGTTGGGGGTACCTTAAATATCCATGGTCCAGGTGAAATCTTAAAATAGCATAATGCCCATAACCGCTATTTCAAGATGTATATACAATTCTTGAATAAGCCTCAGTACTCTTGTTGTAATATTGCATGCCAAAAAAACCAAAGAACAGAAAGTTGGAGCATTGTACTTGTTCTTCATAAAAAAAAAAAAAGAAGTGTCTGAGACCAAACAAGGACAATCATAAAAATGGATTTCCGCTGAAAGTGTTCCTACTATTTTGAACAGAACAAGAAGATAGGAAAGTAACAGAGCGTAATGCATTTTGTGGGAAATGAAGGAACAAGTTTCTTCTTCCCAAGATGTAAACGTGGAGTCATTTTAACCATCTACTTTTTCACTAAGTTTTCACTTCATGTTGAAGGGAAATTAGTGTGTGTTTCTCATTAGGACAGAAAGTATGATGAGCATCAATGTTGTAGCAACTTCAACTTTAAGCTCTGATAAGTCTTTTTTGTATGTGGACCAAAAGCTTAGCTTCCAAATATGGACCAGGAAATTTCAGAGAAAGGGTGTGTTCAGGGTAATAACAAGCTTTTGTAGTTCAGCCACACTTTCTTATCTGAAGATAGGATTTTAAATCTTGCAATGGTTGGATGAGAAACCCTCAAAAGCCAAATGAAACTGTACAATTTTGATTTATGTTTTCAACTTTATCCTAAAGTTTCTGTATTTAGTAAAAGATTCATTATTTTTCTTTTTCTTACCAGGAATGAGCTGGATGAGCAAACCTCTCTGGCGGGCTTGCCTTGTTTTACATTTCCCCTTTCAATTCATGTCAGGTACGAAATCTCCTCCCCTCTCCACACGTTTTTCCCCACCTCATCAGCATCACATGAACTAAAATTGGAATTTTGCTTACTTTTCTTATCTGATTGACTCATCAACAAACACATAAACACAAAAGAGAAGTGAAGAAAAGTAGTCCACCGCTCCCTTTAATTCTGCTGACTCCATTTTTAGATATTTCAAGATGGGACTTAAAATGTGCAAAGCAGGCAATTGGGTTTAGGAAAGATGATTTACTTTAACG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BLAST of CsaV3_1G006490 vs. NCBI nr
Match: KAE8652537.1 (hypothetical protein Csa_014315 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 1.2e-105 Identity = 191/191 (100.00%), Postives = 191/191 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. NCBI nr
Match: XP_011650456.1 (transcription factor TCP18 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 4.7e-49 Identity = 109/134 (81.34%), Postives = 114/134 (85.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. NCBI nr
Match: XP_038895175.1 (transcription factor TCP18-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 143.7 bits (361), Expect = 1.7e-30 Identity = 81/118 (68.64%), Postives = 91/118 (77.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. NCBI nr
Match: XP_023000972.1 (transcription factor TCP18-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 3.6e-25 Identity = 70/95 (73.68%), Postives = 77/95 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. NCBI nr
Match: KAG6584372.1 (Transcription factor TCP18, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7019957.1 Transcription factor TCP18 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 3.6e-25 Identity = 70/95 (73.68%), Postives = 76/95 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1YKT1 (Transcription factor TCP18 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TCP18 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 2.2e-25 Identity = 70/144 (48.61%), Postives = 87/144 (60.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LN68 (Transcription factor TB1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TB1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 9.3e-16 Identity = 41/69 (59.42%), Postives = 54/69 (78.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93WI2 (Transcription factor TEOSINTE BRANCHED 1 OS=Zea mays OX=4577 GN=TB1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 1.2e-15 Identity = 41/69 (59.42%), Postives = 52/69 (75.36%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FYG7 (Transcription factor TCP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TCP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 1.2e-15 Identity = 40/71 (56.34%), Postives = 56/71 (78.87%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0AQW4 (Transcription factor TCP12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TCP12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 2.7e-15 Identity = 41/69 (59.42%), Postives = 54/69 (78.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G042180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 2.3e-49 Identity = 109/134 (81.34%), Postives = 114/134 (85.07%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KF56 (transcription factor TCP18-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495251 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 1.8e-25 Identity = 70/95 (73.68%), Postives = 77/95 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KJS3 (transcription factor TCP18-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495251 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 1.8e-25 Identity = 70/95 (73.68%), Postives = 77/95 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E7D2 (transcription factor TCP18-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431477 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 5.1e-25 Identity = 69/95 (72.63%), Postives = 76/95 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E7Y5 (transcription factor TCP18-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431477 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 5.1e-25 Identity = 69/95 (72.63%), Postives = 76/95 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. TAIR 10
Match: AT3G18550.1 (TCP family transcription factor ) HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 1.6e-26 Identity = 70/144 (48.61%), Postives = 87/144 (60.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. TAIR 10
Match: AT3G18550.2 (TCP family transcription factor ) HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 1.6e-26 Identity = 70/144 (48.61%), Postives = 87/144 (60.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. TAIR 10
Match: AT1G67260.1 (TCP family transcription factor ) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 8.7e-17 Identity = 40/71 (56.34%), Postives = 56/71 (78.87%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. TAIR 10
Match: AT1G67260.2 (TCP family transcription factor ) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 8.7e-17 Identity = 40/71 (56.34%), Postives = 56/71 (78.87%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G006490 vs. TAIR 10
Match: AT1G68800.1 (TCP domain protein 12 ) HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 1.9e-16 Identity = 41/69 (59.42%), Postives = 54/69 (78.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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