CsaV3_1G004890 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTCGGATGCTTCCTTTGTGTTTGTAATTGTGTTTGTAATTGTGTGAAATAAAAGTCAAACTAAAAAAAGTAATAAATAGTGTGAAAAAAGATCTCAATTCAATCAACAAGGAAAAACAACCGAAAAATAAGAGCCTCGAGATCGCCTTTAAAAGGGTCGAGGGAGCTGAGGAAAGCTCTGTGACTTGCTGGCATGGCATTTCAAGGAAAGAAGCTCATCAACAATCCCGACAGTCAGTTCTCCTGCTTGGGACTGTTTATTTACCTGATCCTTTCCTCTTTCCATCCCCACCGATCCCGATTTCGTTTGTTTGACTTTTTGAATGTCCGCTGATTCATTATCGAGAAAGAATAACTGAATAAGCTTCTATTCTTCTACATTTGCTGATATACTCTGCATTCTCCATTTATGATTTATCTCTAATTATAGTTGCATATTAAATACTTGGAACGAAAGCAGGCAGAAAACAAAATGTGTTAAACTGACATCTATTCTACTTGCTCACACGTACTACTAGTTCGTGAAAACCCGAATTCCTGATTATTAGACATTTCTTTTGGTGTTTTTTTCCCACCCCATCAACAAAGGATACAACGCTGCTCCTTCTTTTTCTCCTCATTTTTTCTTTCTTAACCTGAATAGCTGTAGAAAGAGCAAGGACTCATTTAACTGTTTTTTTTTTTTTATTATATGGATGCATTTCAGATGTGGTGACGGAATTTATTGAAGGTTTGGTGGAAACATATCCTGGTTTACAGTACTTGGATGGTTTCCCTAAGGTTACTACGTTTGTCTACCCAATTTGATTCAGAAATGATCTTTGGTAATACTAATACTAATTTTGACCAATCCTTTTATGGCAATACAGGTGAAGGTTGTTTTACGAGCTGATGTTTCAAGTGCAACATACGACAAAGTCGCCATTATATCAGGTGTACAATTCTAAATAATATTATAATATCATGAAGTGTTTGTCAACTTTAATATACGTTGTCCTAGCATGCTGAACTGGGTTATGAGCTATAAAGATGACAACCTTGTAGAGGCCATTCGAGGTCGAATATGCCTTACTCTTGACATGTGGAGTTCTAGTTGATCAGTAGGTCATGTGTTTATTATGGGTAGTTTTATTGACAGTGAGTGGAAGTTGCACAAATGTGTTTTGAATGTTGCAATGGAACCATATCAAGAATCGCCTAATGCACTTAGTCATGCTGTTGCTGCATGTCTCTCTGACTGGAGATTAGAAGGGAAGTTATTATAATCAACGACAGAATGAAGCTGCCCTTGACAACCTCAGGCCCCTAATTGCCATAAAAAAAATCCCTTATTCTCAATGGTTAGTTTTTAGTTGGAAGTTATATTGCTTGGACTTCAATCGACAGTGCAAAAGATGTATTAGATGCAGGAGAAAATAAGATAAGAAAATTTGGGACAATGTGAAATATGTCACAACTTTCGATTCTCATGAGGAAAAGTTTTTAGAGCCTAAGCAACAACTTCAAGTGCCTAGTGAGAGAAATCACCTTCTTGATGATCAAATGCAATGGAATACAACTTATCATATGTTGGTGGCTGCCTTCAAGACAAAAGAAGTATTTTCCTGTTTGGATACCTCTGATCCTGATTATAGGAAGCACCCTCACTGGAAGAGTGGAAGTTGGTCAAGATTCTCTGCATGTACCTAAAAATTATTCTTGATACAACAAACATCCTTACCACCATGACTCACCAATCTGCCATTACGTCTTTCATGAAATATGGAGAATTCATTCAGAATTAACTCCAGCAATTATGAAGGAGGATCCCTTCATAAGCAGCCTTAGTAAAATGATGCTGGAAAAGTTTGATAAAGATTGGAAAGATAGCAACATAGTTTTGGGCAGCTGCTGTCGTGATAGATCCTGGGTTCAAAATGAAGCTTGTTGAGTTTAGTTTCACCAAAGTCTATGATGAATGTTGGAATTAGTGTACTTGTTGTGTGTTAAAAGCTCAAGGGTAGTTTTGTAATTTATGTTAACCTAACTATTCTTTCCTTTTTTATTTAGGCTCTTGTTGCCTATTAATTTCCCCCCTTTGTAATTCTTTGCATAAGAAAATAATAAGAAAAGTTCTATTGTGGTTTTTATCTCTGTACAACTTTGTGTTATTTCTTTTTGTCGCTTTCAATATGGTATCAGAGCGGGATAACGACAAAACTCTAAACACTGGTCTTGATGGAACCAGAATAGAGAACCACACTACTGGCGAGACTGTCATCGTCGACGCTCGGACTAGTGCCGTCTTGGACAATTTGGTCTGCTTCCTTCAGATCATGCCGACCAATACTTTCCTCCTCACACGTGCCACAACTTCCTCCAGAGCCAAACGTGCTGCCGTCAAAACCTTCTGTCTACGCGTCGTCGCAAACCTAGCCAAACCCCACTGCGCTTGTGCTGCTGCTGCAAAACCAGTCAAACACCACTACCCTTTCGTCGTCGCCGGAAACCAGCCAATCCCTACTGCCCACGCACTGCCACAAACACAACACATGAATCTGCTGCATCCGTCTTCCTCCATCCTACCATCCTTTGTGTAGTCGTAAACCCTAGGTCAACCAAACCAACTTCTTCCTCGACACTATCCAACCAAAAATTATATCCTATTGGAAACTCTATCCAACGGTCATCCTAGTGTTGGTAACTTCCATACCCAATCGGAATTTGAAGTTGGTGAGTCCTCGGTCCAATCCAAACCCAAAGTGTAGAATACCACCCAACAATAATTGGCTATGTTTCGTCAACAACTTCCAATGTTTGAGGAGCCCTTAGAGCCCCTACACGCATACCTAGTCCTAACATCCCAACCAACTCATCGATATATTATGAGAATTCGGTAATTTTGTTTCGTAATTTGTCTTCTACTTACGTGTTTGGTTTTATGGCACAAACTACAGAAGTCTTTATAGGGGAGAAGTTGAATGACCAGAACTACTTCTCTTGGTCACAATCTGTTGAAATGATCCCAAAGGCGCGCCACAAATTTGGCTTTCTAACAGGTGAGATACCTCTGTTGATTTTATGGAATAAATCTATATTTCATTAATTACTTAATAGAGATACAAGCCTATATATAACCATAGAGAAATACACTTAAGGAAATAATATCAAATAATATCTCCAGAATAATATCTCCTAAGAATAATATCTCCTAAGAATAATATCTCCTAAGAATAATCTAATTATATTAATAACCTCGTCCTCCATTTGGTGATTTCTAGGAACATGTTTGGAATGGGGAGAATCCTTTCACTCAGACCATGTTAATCAACAGTATGGAGCCATAGATTGGAAAGCCTTTGTTGTATGCTGCAACTGCCAAGGATATATGGAACACAACTCAAAAACTTTATTCGAAGTGTCAACATGCCTCTTGTCTCTATACTCTGAGAAAACAAGCCCATGAATGCAAGCAGAAGACTATGGATGTCACATCTTATTTTAACAAACTTTCCATCATTTGGCAGGAAATGGTTCTTTGTAGAGGAATTGTCTGGAACTGTCTTAGTGATGGCATATAACACTCTAGACTTGAAGAGGTTGACAAAATTTATGACTTCATTGCTGGTCTAAACTCAAAGTTCGATGTAGTTTTATGGTCGTATATTGGGCTACAGACCTATTCCCTCCCTAATAGAGGTTTCTTCTAAAGTCCGCCTTGAGGAGGACCATATGAGTGCTATGAACATTCTGACCATTCTTGCCATTGATTCTGTTGTCTTTAGCGAGAGGTCCTCTACTCATGACAGTGAGAAACACAACGGAAAATTGGTTCCTATTTGTGAGCATTGTAAGAAAAAATGGCACACCAAAGAACAATGTTGGAAATTACATGGTTGTACCCCAGGAGGTAAGAAGCGTCCTCTGAACGACAAACAGAATTCAAGGCGAGCTTATGTGAGTGAGTCTATTGGAACCCCTCAACCATCTAGTCTCACTGGTAACCAGAACTATCCCAGTTTGTCCAAACTCGGAGCTATTGGCGTGTTGTCTTAGCTCTTTGTACTAGGCTGGACTATGTCTCCATTGTATGTTGACATATTTTATTTTTAGCTTTAATTGGGATATGATGTTTTGTGCTAAGAGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGTCTGGGTGCACCTTTTGATCCCCCTTCGCTTATCTTCTCTAGGCTTCTTTATTACACTCATTGTATAACTCTCTTGTACTTTTAATTTTTATTATCAATAAAGAAGTTTGTCTCCGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAATCATGGCGTGTTAACTAATTCATTCAAGAAAATTGAAGGCTTAATCCAGAATTTTTATGAACAACTTTATTCAAAAAGCCCAGGCTTGAGGTACCTCCATTTGAACTTTGCTTGAAAATGTATATCTCCAAGGCAGAATTCAATACTCACAGTTCCATTTTCAGAAGTGGAGATAAAGGCAGCCACCAAGATGCTTCACAAGAATAAAGCACTTGACCCAGATGGTTTTTTTTGGACCAACCCTCGATAGGGTCCTTATCCAACCCTCTAAACATCCTATTGTTTCTCTCCTCTCAAATGTCCCACTGTACAATGCACACCCCAACATACCACAACAAACAACCTTTCTCTCCAAAAGGTGTATGGAAGAGGAACTCCTTGATCATTGCACGAATTTCCCTCTAGTCAACAATCTGAATGTCAAACTCTTGCAAGAAACAACTCCACACAGACCTCGCAAACTGGCATCCTTAAAGAAGGTGATCTAGGTTTTCCTTTGCCTTCTGGCAGAGAATACAATAAAAGAGGCCCATCAACAAGGCAAATTGTTCACACGACCAGGCAAAACTTGCTAGGTAAAGAACTTGATTTTCTTTGGTATCTTGATCCTCCAAACCATATCAAAAACCAACTCACTAATAAGAGAGAGCGCTTTTTATTTCCTTCACTTGTTTCTCTTCATCCAATCAAATAAAATTTTTATTTTGAAA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ATGGCATTTCAAGGAAAGAAGCTCATCAACAATCCCGACAATGTGGTGACGGAATTTATTGAAGGTTTGGTGGAAACATATCCTGGTTTACAGTACTTGGATGGTTTCCCTAAGGTGAAGGTTGTTTTACGAGCTGATGTTTCAAGTGCAACATACGACAAAGTCGCCATTATATCAGGCGGTGGAAGTGGACATGAGCCTGCACATGCTGGATTTGTTGGGGAAGGAATGCTGACAGCAGCTATTTGTGGAGATGTTTTTGCCTCACCACCAGTTGATTCGATTTTGGCTGGAATTCGAGCTGTAACTGGACCTATGGGGTGTCTTCTCATCGTGAAGAATTATACTGGTGACCGTTTAAATTTTGGTTTGGCTGCTGAGCAAGCAAAATCAGAAGGATATAAAGTAGAGACTGTTATTGTTGGGGATGATTGTGCCTTGCCACCACCTCGAGGTATAACTGGCCGGAGAGGATTGGCTGGGACTATACTTGTTCACAAGGTTGCTGGAGCTGCTGCTGCAGCGGGGCTTTCTCTTTTAGATGTTGCCACAGAAGCAAAACATGCAGCTGAAATGATTGGAACGATGGGAGTTGCATTGTCAGTTTGCACACTGCCTGGCCAGGTCACATCAGATCGTCTGGGCCCAGGGAAAATGGAACTTGGTCTTGGAATTCATGGTGAACCTGGTGCTGCTGTGGCCGATCTTCAGCCTGTTGATGTGATAGTATCTCATGTTCTCAAACAAATATTATCACCGGAAACTAATTATGTTCCAATAACACGAGGTAATAGAGTGGTGCTCATGGTTAACGGGTTAGGTGCTACCCCGGTGATGGAATTAATGATTGCAACTGGGAAAGCAGTTCCTAAGTTGCAGTTGGAGCATGGGTTGGCTGTTGACAGAGTGTACAGTGGTTCATTTATGACTTCTCTTGATATGGCCGGGTTTTCAATTACCATCATGAAATCAGATCAAACAGTTTTGCAACGGTTGGATGCTGCAACCAAGGCTCCTTGTTGGCCCATTGGTGCTGATGGTAGTCATCTACCTTCCAAAATACCTGTTCCACTACCACCACCTGCTCTTGCTACAAAGAACAGTGAGACACTCGGTGGACCCGTTCAACTAAATCAACAAGGCATTATTCTAGAGGCTGCAATTGAGGCAGCTGCCAAAGCAGTGATCAATCTCAAGGACAAATTAAATGAATGGGATAGCAAAGTGGGCGATGGTGATTGTGGGTCAACGATGTTCAGGGGTGCAACAACTATTATTGAGGACCTAAAATGCTATCCACTGAACGATGCTGCTGAGACAGTGAATGAAATTGGATCGTCCATTAGAAGGGTTATGGGAGGAACTAGTGGGATTATATATACTATATTTTGCAAGGCAGCATATACAAAATTGAAATCAGCCAACCTAGATAACATCACTTCGCAAAAATGGGCTGAAGCATTAGAAGCTTCCATAGCTGCAATTAGTAAGTATGGTGGGGCTACTGCTGGTTATCGAACATTACTTGATGCCCTCATTCCAGCCTCTGAAGTTCTCAGGAAGAAATTAGATACTGGTGAAAATCCGATCACCGCTTTTATTCACTCATCTGAAGCAGCATTGGCTGGGGCTGAAGCAACAAAAAACATGCAGGCTCAGGCTGGCCGTTCGTCATATGTATTTGGGGAAATTCTCGCTACAGTTCCAGATCCAGGTGCAATGGCCGCAGCAGCATGGTATAGAGCTGCGGCTATGGCTGTCATGGAAAGGTGCCACGCTGCTTCATGA MAFQGKKLINNPDNVVTEFIEGLVETYPGLQYLDGFPKVKVVLRADVSSATYDKVAIISGGGSGHEPAHAGFVGEGMLTAAICGDVFASPPVDSILAGIRAVTGPMGCLLIVKNYTGDRLNFGLAAEQAKSEGYKVETVIVGDDCALPPPRGITGRRGLAGTILVHKVAGAAAAAGLSLLDVATEAKHAAEMIGTMGVALSVCTLPGQVTSDRLGPGKMELGLGIHGEPGAAVADLQPVDVIVSHVLKQILSPETNYVPITRGNRVVLMVNGLGATPVMELMIATGKAVPKLQLEHGLAVDRVYSGSFMTSLDMAGFSITIMKSDQTVLQRLDAATKAPCWPIGADGSHLPSKIPVPLPPPALATKNSETLGGPVQLNQQGIILEAAIEAAAKAVINLKDKLNEWDSKVGDGDCGSTMFRGATTIIEDLKCYPLNDAAETVNEIGSSIRRVMGGTSGIIYTIFCKAAYTKLKSANLDNITSQKWAEALEASIAAISKYGGATAGYRTLLDALIPASEVLRKKLDTGENPITAFIHSSEAALAGAEATKNMQAQAGRSSYVFGEILATVPDPGAMAAAAWYRAAAMAVMERCHAAS* Homology
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. NCBI nr
Match: XP_004137378.1 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN63936.1 hypothetical protein Csa_013554 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1159.8 bits (2999), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/595 (100.00%), Postives = 595/595 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. NCBI nr
Match: XP_031744151.1 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1142.5 bits (2954), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/629 (94.59%), Postives = 595/629 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. NCBI nr
Match: XP_008451799.1 (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/595 (98.49%), Postives = 588/595 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. NCBI nr
Match: XP_008451073.1 (PREDICTED: putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1130.9 bits (2924), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/613 (95.60%), Postives = 588/613 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. NCBI nr
Match: XP_038893514.1 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X6 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1102.8 bits (2851), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/595 (94.45%), Postives = 578/595 (97.14%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04059 (Putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=DHBK PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 930.2 bits (2403), Expect = 1.1e-269 Identity = 474/595 (79.66%), Postives = 532/595 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4KLZ6 (Triokinase/FMN cyclase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Tkfc PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 395.2 bits (1014), Expect = 1.3e-108 Identity = 251/581 (43.20%), Postives = 345/581 (59.38%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VC30 (Triokinase/FMN cyclase OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tkfc PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 394.0 bits (1011), Expect = 2.9e-108 Identity = 254/583 (43.57%), Postives = 344/583 (59.01%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q58DK4 (Triokinase/FMN cyclase OS=Bos taurus OX=9913 GN=TKFC PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 390.2 bits (1001), Expect = 4.2e-107 Identity = 248/581 (42.69%), Postives = 343/581 (59.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1RKQ4 (Triokinase/FMN cyclase OS=Sus scrofa OX=9823 GN=TKFC PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 387.5 bits (994), Expect = 2.7e-106 Identity = 248/582 (42.61%), Postives = 336/582 (57.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LV99 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G030620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1159.8 bits (2999), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/595 (100.00%), Postives = 595/595 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRR7 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1142.1 bits (2953), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/595 (98.49%), Postives = 588/595 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS0 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1130.9 bits (2924), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/613 (95.60%), Postives = 588/613 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTZ0 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1092.0 bits (2823), Expect = 0.0e+00 Identity = 570/600 (95.00%), Postives = 574/600 (95.67%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KEW3 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495186 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1087.0 bits (2810), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/590 (93.39%), Postives = 571/590 (96.78%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. TAIR 10
Match: AT3G17770.1 (Dihydroxyacetone kinase ) HSP 1 Score: 913.3 bits (2359), Expect = 1.0e-265 Identity = 466/596 (78.19%), Postives = 525/596 (88.09%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004890 vs. TAIR 10
Match: AT1G48430.1 (Dihydroxyacetone kinase ) HSP 1 Score: 912.9 bits (2358), Expect = 1.3e-265 Identity = 461/586 (78.67%), Postives = 522/586 (89.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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