CsaV3_1G004790 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ACGGCATCCAGTGTTTTTTTGGTGTGTAATTGTATTTTCGCTTCCGAAGCGAGGAAAGTAAAGGAAAAAGAGAGAAAAAAAAGAATATAAACTAGAACTTTTGATCAAACCTATACCCACTCTGACTTTGTCATTGTTATTTTATTGTCTTTCCACGACTTTGATGGAGTGCAGAAAGGGATGGCTTCCGTCGTCATCAGCTACAGCAATTTGAAACCAAACTAAAAGTAAAACTCAATAACAATAGATGCTAACCTTCTACAGCCACCATCACCTACTTTGCCTTTTCATCTTCTGAAACCCAAACATCTGTTCTCAACTACTCATCCTCCCCAAAGCTTTCAATTCTTTGTGTATTTTGAGTGCTTCCACTTCTGAAATGTGTCGTCGATCACAGCAGTGGGCTTATGTAGCCCTTCTGCTCCTCTGCTTCTCGTCGTCCTTACTAGTTGTTGTTGCAGCAGAAATGGGTACCCACCCCTCTGAAGGTAATTCATCCTCTCCCTTCTAATTGATTTTCACTTCTCTTTCCCACAAAACCATTCTTCTTCAATTCTCCAAATTATCTGAAGCTAGCATTGCGTTCACCAGTTTGTAGATTCAGAAAATGTCACGATTGAATTCGCATCTTTTTCTGGACACTTTATCTATTTTTAGCACCAATTTTTTAAACTCAGAAGACTATGGACCAACTTAGCTCTTAATTCTAACTTCCTTGAAGTTCTGGTCACTCTTTCTTTTTTGTTTTCAGTGGACGCTTTGCTCCTCATCAAAAGTAGTTTGTTCGATCCTAATGGGAATCTGAGCAACTGGAACAAAGGAGACCCTTGTAATTCAAACTGGACTGGTGTTCTGTGCTACAATACGACATTTGATGATAACTATCTACATGTTGCTGAATTGTATGATTTCAAGTACTTATGGACTTTCATAACTTATGTTAAGACGTATCTCCATCTATCCTTCGGTACCAGTTTGAATTTGTTTTTTGTAATTGTTACTTTGGAAATTGTTGTTATGGAAAATCTCAAAATTTTAATTTTATTAGTTAGTCGCCGACCTAACTTTGGGACTTGAACATTTATGAAACGGCTTCTTGTTCAAATAATCGACTGCATACTTCAAATTTGTAAATTATTGCGTAGTGTGGTTATGTTTGCATCTCATATTTTGGTTGGTCACATATAAGACGTTAAATTCTACTTTTCCCCTCGTACCTTTTCATGAACAAGAAGCTAAACCATCAATCTGTATAATCCTCTGCAGGCAACTTCTAAATATGAGTTTATCAGGAAAATTGTCACCTGCGCTTGGCCGTTTATCTTACCTGAGAGTTTTGTAAGTAACTAAAGAATAGGAAATAGAACTTTCATTGAGTTTAAACTATCATCTCGTGGGTGCCATATGGTTTTCTCATTCTGCTAACAGATTTTTTCCTACTTTGTGAGAAGGGATTTTATGTGGAATAAGATAAGTGGGGAAATACCAAGAGAGATAGGCAACCTAACGTCCTTAGAACTGTTGTAAGTTGTTCTCCTTTTCTGCTGGTATACTTATTCACTTTGACAAAGTTTGACTGGTTTATCTAAAATATACTGATACACCATTATATCTTCACTTAAGTTTTTAGTATGCTCATCTTCCATGAACAAGTTCTCACAGTGTTAGTATATATAAACCACTTGATGTAAATGAATATTTATTATTACAAGGAAATACTCGTAATATGGATCTGATGCTTTCTATTTCCTCTCCTGCACTGCTTCACTTTCTATAAGATGTTTTACAGGCTTCTGAATGGGAACCAGTTGTCAGGTTCATTGCCTGAAGATCTTGGTAATCTTCTACATTTAGACAGAATACAGATTGACCAGAACCATATATCAGGACTAATACCCAAATCTTTTGCAAACTTAAAAGCAACAAAGCATTTGTAAGCACGTTTCTGTTTCTGGAAGGAGAAAATATTCCTGCAACTTCCTTTTCATCTTAAAGGTTTTTGTAATCCTCGTTTGACTTTTTGGCTCAGTCACATGAATAACAACTCTATCAGTGGTGAAATCCCGTCTGAGCTATCTGGATTGCCCAATCTTGTTCACTTGTAAGTTGCTTGCCCCTCCCTTACGACCAGCAAAATACTTTCTAATGCAAGTTTTGTTTCCTGCAAATTTGTTGGCTTCTCCAGGCATTCTAGTGTGCGCATACACTCTACACTCAACACTGTACTTCTTTTAATGTAAAAATTATTTGAATGCTTATACTTTTGGCTAATGACATATTTTTCCACTCTTGGCAGCCTTCTTGACAACAACAACTTGTCGGGGAAACTTCCACCTGAGTTGTTTCAATTGCCAAACTTAGAAATACTGTATGCCTTCATCTCCTACCACCTTAATTGCTTTAAATATATGAACACCCTTCCCTGGCTCAGTCTTCCAACAGTTTGTTTTTTATCTCTCACCTTTTTCTTCTGTCTGTCTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTGGGCGGGGGTGGGTGGGGGCATAATATATATTGTAAACTCCATTATAAAGCACGAACACAAGCACAACCATGGAGCCTAGTGCTAACTTTCTCACCCTGCTAACCTACCAAGAGTGTAAGTCACAATATTTGCATGTTTGTTCCAATTTTTTCGGATATCCCCAACAGAAACGTACTCTAATATTCAAACTCGTTCATTTTTTTTAAAGGAAACAAACCTTTTCATTAAATTAATGAAAAGAGACTAATGGTCAAAGTACAAGGAAACTAAAGAATCAAAGAAAATTATGAGACAGACGTATTATCTTTTTTTATTTTGAAAAGGAAACCAGCCTCTTTATTGATAAGAATGTAGCTCGAGGTACAAAAGGTTTATACAAAGAGCTAAACAAAAAAGAGACCATAGGATCAGCAAGCGCACCTGGACATCTCAACTAGGTTGGCACCCCCTTAGCACCCTTATCATATCCAACAAAAATAAAGCCCAAAGATACAAAGTATAATCTTTGAAGAGTACAAAGCTGAGACAAAACATATTATCAATTACATCATTCTAAGAAATACGACAAAATAAGCTACGCTACAAAATAAATGCCCCCCAATTCAAACAAATATCTTGGATGGAAAAATTCCAAAAGAGCTAAGAAAGAGAGCACCAGGTCGAGCCGTTGATCCTTGCAATTTCGGATCGATCTAACGATTGAAGGGATTTATCATGGAACCTCCTTTAGATTCTTTCATAAAGTAGATGAATTTTTTATCGGAAAAGGCGTGAGGGTAGTTACCTACTTGTGCCAAGGAAATACAAAGATTACCAGATGAGACATTGGGTCGTAGCAGTTGTGGAGTTTGATTAATTTGCTCGATGCGGGAAAAAAATGAACCACACCCAATCTAAACTAGCCAAGTTCAATCACAAAACGACCTACAAACCAAACATCCAAACAAATTTAGGGTGGAACTCCAGCTGAGGCAATGGAGAACGCAACAACGCGTGATTTCAGGGAGTTTAGGTTGAAAAATCCCACTCAATTGTGTGGGTATAAGTTTACGACTGGAGAAGACAGTCGTAACTAATCCCTTACCTCTGCAAATAGGAAAGTTTGGTCTGGAAGTAGGATGCGCCGCTGATTTTGACATTTAGGGTTTCAATGGTGAGGCTAAGAATGTGCAGCTATGGTTAAAAATACCAACGTACAGCAGAAAACGCAGCTTCCAATGACATCCTACAAGGCGTGATCAGAGGCGGTGGATGGTGATGGAATCGATGGTGGACGACATAGAAAGAGGCGACACGCAAGGACCATGATGAAGGCGAAAAAAAAAACCATCACTTACAGCCAAAAAAACGCAAGAAACGTGGCTGCTGGCGGTGTCCGGTGAGTGATGGTCACTGCTGATCATTGGTCGGAGTAGTATGACCGGCAGTGACAATCCTCGAGGCGGCAGTGGCGGGTAAGGGTTTTAATGTTTTTTTAGGTTTTTAGCAAATTAGGGTTTTTTGTTAGGGTTTCAACATAAAAATGGGAACTAAAAAGTTCAATACTATTCATCTCTAACTATTGAATGAAATACAAGGTCTTATATCGAGAAAGACCAACAACAGATAAGAAAAAGTTAAAGAAAGACCAACAACAAATAAGGAAAAAATATAGACAAATTAAAAATAATATTACTAGAGAAAGGGAAATTCAGCAAGTTTCATCTGCTGTCAATTGTTTGAAAAGAGAGTTAATCAGAAAATATTCCAGAAGACTCCAGTTAGAATCGTCACGACCCTAACGAAACCAAATTAGTTTGCTTTTCTGATAGAATCATGCTGTTTAGTGAGATAAATTCCCTTTGATTGCTGCACAAATAGGCACTTCCATTTCAGAAAAAGCAGAAGCCTCGGCTTTTGATTCAAGGAAAGACAAAACATTCTGGAAGCTCTTTCCTTCTTTTTTCTTGGAGTTCAACAGTTGCCTTCCACTTTTTAACAGCTCCTTTAACCTTTCTCAGGTCAAAATGTATAACAAAACCTATCCATCCTTGAATATTACAGCCAGCAACGGAATCTTCAATAATTTTAAGTCTATTGAAGAATTTAAAAGGTGAAGGACTCCAAAAATTAAGGAACGGTGGATGGGTCTTTGGAAAACGTTTGATCTCTTGTCAGTTTCCATTTCCGATGAGTTTTGTAATGTTAGTTTAATTTTAGGTTAAAATATCATTTTGGTCACTATACTTTAGAGTTTGCTCACTTTTAGTTTTTGTACTTTCAGATGTTCAATTTTAGTCCTTGAACTTAATTTAGTCCTTACTACTAGTTTATTGTAGATTTTAAAAATCATAAGTCAACACTGTCAATTTTCAAAAGCAACCCCTCACAAAAAGGTAAGTTCTCTCCCTTCTCTCTCCTCTCTCCTCTGTCCCACCCTCTTCTCCCCTCTCTCCGGCCACAGCATCTCCGGTCACGTCTTCTCCTAACTTTCTTAGCGGCCACGTCTTCTC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MCRRSQQWAYVALLLLCFSSSLLVVVAAEMGTHPSEVDALLLIKSSLFDPNGNLSNWNKGDPCNSNWTGVLCYNTTFDDNYLHVAELQLLNMSLSGKLSPALGRLSYLRVLDFMWNKISGEIPREIGNLTSLELLLLNGNQLSGSLPEDLGNLLHLDRIQIDQNHISGLIPKSFANLKATKHFHMNNNSISGEIPSELSGLPNLVHFLLDNNNLSGKLPPELFQLPNLEILQLDNNNFSGATIPDSYGKMTKLLKLSLRNCTLQGSIPDLSRIKNLGYLDLSSNQLSGLIPRGKLSENITTIILSDNRLTGTIPSSLLGLPHLQKLSVANNSLNGSVPSTIWQSRMLNSLDSLTVELQNNNFSDILGSIHLPLNVSVRLQGNPACANNSLLDFCGSESEDIIDIPTNNPLGCSGPICPPSYECYSAKCPSSCLCSAPLLIGYRLKSPGFSRFSPYQHMFEEYLTSGLKVHLEQLDIGSAVWEKGPRLRMSLKVFPLYVADSNSSHMFNDSEVLRIVYKFTNWKIQDSDIFGPYELLSLTISDVYKKVFFTPSSDSTMSKGALAGIILGAIAGGAMLSAIVFIFIIRSRVRGHHISRRRHLSKTSIKIKGVKEFGYREMALATNNFHCSMVVGQGGYGKVYKGILADSMAVAIKRAQEGSLQGEKEFLTEIQLLSRLHHRNLVALIGYCDEEGEQMLAYEFMSNGTLRDHLSVNSAEPLSFATRLKAALGAAKGILYLHTEADPPIFHRDIKSSNILLDSKYVAKVADFGLSRLAPLPNAEGDVPAHVSTVVKGTPGYLDPEYFLTHKLTDKSDVYSLGVVFLELLTGRHPISHGKNIVREVNSAYQSGKIFSIIDGRLGSYPAECVEKFVTLALKCCQDDTDARPSMVEVVRTLENIWLMLPESDSKISEPLINDVIKVTSPPSSSSNMNYYISEVSGSDLVSGVTPTIMPR* Homology
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. NCBI nr
Match: XP_004137372.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN63926.2 hypothetical protein Csa_013573 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1894.4 bits (4906), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/952 (100.00%), Postives = 952/952 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. NCBI nr
Match: XP_031744486.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1831.6 bits (4743), Expect = 0.0e+00 Identity = 928/952 (97.48%), Postives = 928/952 (97.48%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. NCBI nr
Match: XP_008457284.1 (PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1827.8 bits (4733), Expect = 0.0e+00 Identity = 919/952 (96.53%), Postives = 932/952 (97.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. NCBI nr
Match: KAA0059968.1 (putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1791.9 bits (4640), Expect = 0.0e+00 Identity = 908/960 (94.58%), Postives = 922/960 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. NCBI nr
Match: XP_038895828.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1786.5 bits (4626), Expect = 0.0e+00 Identity = 908/953 (95.28%), Postives = 921/953 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGD7 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06840 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1183.3 bits (3060), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/941 (63.76%), Postives = 734/941 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGU1 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g37450 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g37450 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 906.7 bits (2342), Expect = 2.1e-262 Identity = 483/958 (50.42%), Postives = 655/958 (68.37%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LFG1 (Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g53590 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g53590 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 888.6 bits (2295), Expect = 6.0e-257 Identity = 483/927 (52.10%), Postives = 624/927 (67.31%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZ99 (Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPCA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 496.9 bits (1278), Expect = 5.1e-139 Identity = 359/986 (36.41%), Postives = 503/986 (51.01%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LT96 (Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g49770 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 3.5e-132 Identity = 327/922 (35.47%), Postives = 477/922 (51.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C580 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1827.8 bits (4733), Expect = 0.0e+00 Identity = 919/952 (96.53%), Postives = 932/952 (97.90%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UXL0 (Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold340G00070 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1791.9 bits (4640), Expect = 0.0e+00 Identity = 908/960 (94.58%), Postives = 922/960 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HP93 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1701.4 bits (4405), Expect = 0.0e+00 Identity = 856/953 (89.82%), Postives = 898/953 (94.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I144 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469562 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1699.9 bits (4401), Expect = 0.0e+00 Identity = 855/953 (89.72%), Postives = 897/953 (94.12%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DW20 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024918 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1680.6 bits (4351), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/951 (88.43%), Postives = 885/951 (93.06%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. TAIR 10
Match: AT1G06840.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 1183.3 bits (3060), Expect = 0.0e+00 Identity = 600/941 (63.76%), Postives = 734/941 (78.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. TAIR 10
Match: AT5G01950.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 1001.5 bits (2588), Expect = 4.5e-292 Identity = 530/950 (55.79%), Postives = 668/950 (70.32%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. TAIR 10
Match: AT5G37450.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 817.0 bits (2109), Expect = 1.6e-236 Identity = 455/982 (46.33%), Postives = 618/982 (62.93%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. TAIR 10
Match: AT3G53590.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 4.2e-213 Identity = 423/868 (48.73%), Postives = 542/868 (62.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_1G004790 vs. TAIR 10
Match: AT1G79620.1 (Leucine-rich repeat protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 499.2 bits (1284), Expect = 7.3e-141 Identity = 336/943 (35.63%), Postives = 482/943 (51.11%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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