CsaV3_1G003620 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_1G003620
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 2250257 .. 2257236 (-)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_1G003620
SyntenyCsaV3_1G003620
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGTGTGTTTGGTATTTTTGAAGTTTGTAATTCAAAGTCTAAAATTTGAAAACATTTCTGGCCAATGTTGGTTGTATTGGACTGTTATAGAATATGAGGTGTAATATAATTCAAATTTTATGTTTTTGATTGAATGTTATAAGCTTCAATTATAATATTAATTAAACATAATTTGTTCAACAATCTAACTTATTTGTCCACCTTTCATGATTTCATCTTTGTTGTGTCTTCCATCATGATTTTGCATAATTTTGATTACATTTGTGTTATTAAAACACACCCTTTTTATGAATTTTGAATGTGTATATATTTTGAATTTAAGATTTTATAATGTAAAACTAGATTATAATAAGATAAACGCGATTAAGAAACACAATATCTCGTGTTGTAGGCTAAGTTTAATTTTTTTTTATAATACTCGAAGCACTCATCTCTATGATTTACCATCTTATATTATTCATACAAAAAAAATATTTAAAAAGGAAACAAAGATTAAATTAACACGTGACAAACTATACATATAAATGAACAATTTAGTGATATGCACTAAATATGGAGGATGCTTGAGATGTGTACATGAATATTTGAGTTCAAACATGTATACATTTCAAACAATTGTTTAAACTAAAATCCAACTTTTCAAATCTATTATCGATCACATGTATTTTGAAAACATGAAATACAATCCTTGTACTGAATATTCAACCTTTTTTTAATCCCCCACACACATCCAAATTAGGTTTACTCTATACACATCCAGATTTCTTGATAGAAAGTCCACAGTAATCAGATTAACTTAATGGAAATATACGAACAAAATCACTCTCTACATATTTGAAGACCATCCAGTCTCAGTCAAGAGATGGGAAGTTGGAAATCAAAGCCATATAGAACTCTAGGGTAGAGTTGATATGATCCATGCAAAGTGGTGAAAGGAACAAATTAAGGAGAGAAACGAAATCACGCAAACCCATCAATCTTAGATATTACACTGACGCACCCTATACACAATTCTACAGTTACCAATAACCCTCTCTATCTCTCTTCTTTTCTAATTAATTTCCATGTCCTTTTTTTCTTTCAATTTTTTCAAACAACCCCCTTCACTTTTCATTATTTAAAACCTACCCCCTCCCACTCCTTTTCCTTTACTGCTTTCTTCCCCTTATCTTCTTCCTCCCACCACTTTTTTAATTTAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGGTTTTATTCTAATTCTCATAGCCATATATTACATAAAGTACTTACTCTTAATTATTGTATATACTGGGGTTTCTTGTTCTTGCACTGTGACATAAATTCATGCATCTTTCTCACATATTTTTCAAATGATTATTATGGTTTTCTTGTTTTTAATTGTTTTTTTTTAACACATGCAGTGTTGAATTGATTTGATATGCACAAATTAATCACATTTATTAAGACTTTTGCAAATTGGATTTAGAAAACCACAAGTTAACTATTGATTTATATTTCTTTGATTTCTTTTTCCTTTTTACTCTAACCTGCTTATTGACTTGAATAAGCAAAAATAATTACAAATTATAAACATGTGTTGTTATAAGAATAAAGGTTATTTGTTGTGTGACAGTAAGAATTTAAACAGATAGCTCAAACTCGAACTTGAGTATCATCAAATTATGTTTTATGTTGGTGTGGGATGATTTTAAAAAGTTGTATTTCTTCAGGCTTAACCTTTAATATATTTGGGGATTAATTAAGTTGATTTAAACACTCACCCATTTTAAATAAAACCTTCTGTTCAAACCATACATGATGATCATTTAACATTGGTTAGTGGGGATCATATGAAAATGGTAAATGATTTCTAATTATTTCTCCCAAGTTTCCTCTTTTTGTGCATTACTGTGCAAAATCTTCTATTTTTCTTCAATCATTCTCTCCACTTTCATTTTTAAGGTTCATTGAATTGGATCAAAAACTTATTATATGTTTACTATTTTTTTCAAACAAAATTAAGTCAATCATATTTCTTTTGATTGTAATCTTTGATTTTGATTCATCCAAAATTCATGTTTTGGTTTCATTTCTTTCTGTCCCCTTTCATTATGTTAACTCAATAATGATGGAAAGTAGGCTAATTAATTATCAACATAAACTTTCACATCACATCTAATTTATGTATTTTTTTTTATATAAAAAAACCTTTATTTGACCTCCCCCTTTCATATCCAAAATATATAATTTTGTTAGTAACATTCTTCATGAAATTTTATGTTTTTGGTACAATTTCGGGACACAAATTGTTGTCCATTTTACTACACGTTGTATTTTGGTATCACATATCGCAAATTCATTTATATGTTTGTTCATTCTACACTTTAGAAATGTTTTTAAACCTACCAACAATACTGAGTTTTAAATAATTTAAAATATCCCAAGTTTTATATTTTTACCCCTAAAAAGGAACATTGTATTAAAAAAAACATATGAAATTTCCTATCAATATTTAACTATATTGATGGGGAAAAATCCTAATATTTGGCTTAGAGAAAAATTATCCCAATAAACCCCATTAAGTTTTTGGCACATAATTAAGGAATGAGTAATGTTTATGAGCAAAAGAATTTAAAAAATTAACAGTAAACATTGATAAATTAGTCCGACGGGATAATATATACCAAGATAAATGACTAGAAAATGAAAAAAATATATATGTAAATTTGTTTTCTTATTTTTCCATCAATGAGCAAAATATAATATATGAAAAAGTTAAAAATGTGGTAACTCTTTAGGGCAGAGAAAGAAAAGAGATATTTGGTTGGCTCCTAAAAAAATATGGTTATCATCCTCAAATTTAATTTTTCATAAAAAAAAAATGCTTAGATAGTATATTAATAATTTTTGGATAAGACAGTATACTATTTAAATACATTTTCTATATTTTGAATAGAATATGCTTTTAAAAATAACAATATATTAGAGATATCGTTATAGTTTAAGATGAGCTAAAAATACATAAATCAAAATGAAAAAAGAAAAAAGTATTTATACTTAAAATTACTTCATACTACATTTCAAAAATTTGGCAAATTATAACCTGCATGGAACATGTATGTGCCTTAACACAAGTTTTTCGCATATATATATATGTAACCTTTTTAACGTATAGTTCGACTAACATGAAAACTATATTATTAACTTTCATATGGAAGAATCAATTTTTTGAAAAGAAAAAGAAAAAATCAATGGTTTCATACGAAGGGAAGCACAAACCTTAGAAACCCGCATGGAAGGGAAGTTAAAGGCAGCATGGGTTGTGTGGTGCAGCCATATGATAATGTAAAATGCTTTAATTTCGCCCACAATCTTTGATTCAATGTAAGCAGTCAATTATTGTCCAAACCCACACTTATATTATATTGTCATTTTCTTTGTTCATTCCTCTTTCATCCATAAGCATGTGAATTGATTTTTCTTTTTGGGGAAAATGCTTTTTGTTTTGTCTCAATATTTTGGTTTTTAAATTTGAAAATGTTACATATTGTTTCAATTCAATTTAATCAGCCTGTTAGTTTAAAAACATTGAACAATTTACCTGAAAATTTTGTTTAAATTTGGTCTCTAATTAAATACTCACTTTTAGTTATTGTTGTTAATTAGTTTAAAATAATTATAATGTGAAATTTTAAATTTAATTTTAACAATGATAAAAAAAACAATGAAACTTGATTAATTATGATTATTTTAAATAAATTAACAAATATTAATAAGAGTAAGGATGAAAAGTGAAAAATCAAGCTTAAAAGTTCAAAGAAATGTGTAGACAAAAATTCAAACTTTAATAGTAAAATTGTAGTATGGTGAAATCCCATATGGACTATTAATTAGCCATCCATTTGTTCAACTAAGTTATCAACTCAATACCTTGTACACATAAATTTGATTAAAGATAATTTAAGTGTGTTTTGGAGAGGTTAAGAATATAAGATTATCATTTCAATGAAACAATTAATAATAGTAATAACAAGAAATATTTTTAAATGGGTGAAGTGAAAAAGAACAAATAAATAAAAAAAAAAGAGGGTTTATTTTTAACTTTTACTTTACCAAAATGATGGGAATATGCTCTTTTGCATTTTAGAGGAAAGATAACTCTCATGTATGTTCCCCCACTTTTTCTTTCTTCTACAAAAACAGATTGTAAAAAAGAAGGAAAAAAATCTATCTCTCTTTCTCTCAATTTATTTTGAAAAACAAATAGGGTTTTCTTTGTCTTTCTACTTGCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGTAATTATTTTATTCATTTTGGAATTTATAATTAGTCAAATATATTCCATTTTATTTGTTAGAAATATACTATTATTTTTTCTGAGAAAATTATTGTTGGTCATCTTTGTTTTCTGCCTGTTTGGATATGTATTGAACAAATCGATGGCTGAGTTACATTTATATGATGATTTTTTTGTATATCTATATCTATATAACTCTCGATTTGCCATATTTTATATAGGTCATCCCCTCTATCTAAAACTTACCGTACCTATTCCTAGTCAATCATGGTTCAAACCACGATTACTACGTCTTCCAATTTAGGATCACCCCACTAATTTTGTTGACATACCTGATAACTCCAACAATACTGTAATCAAATTAGAGACACAACTCTACACCACTTTTGATAGGAGTAATACTGTTCTTCACACATCTCTACAATAGTGTGTGATGATATTGTCTCTATTTTAGAACACTGCATTCAAACAACAACGTACCGTGGTTGGAGACAGTGTTCTTAGTTATACCTTCGTCTTTTTCTTCTACAGTGCACTAACGAAA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mRNA sequence

ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGGGATCTCAGTCTGAGCTTGAAGATATATGCATAGTAGAAGTTAACATATGCTATGATTGTTGTAGGGCTCCCATGATTTTACCAAAAATTGAAAATCTCCATATGGATGCTGAAATGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGGGATCTCAGTCTGAGCTTGAAGATATATGCATAGTAGAAGTTAACATATGCTATGATTGTTGTAGGGCTCCCATGATTTTACCAAAAATTGAAAATCTCCATATGGATGCTGAAATGTAA

Protein sequence

MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHLLQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_1G003620 vs. NCBI nr
Match: KAE8652456.1 (hypothetical protein Csa_013782 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 234.6 bits (597), Expect = 4.2e-58
Identity = 109/109 (100.00%), Postives = 109/109 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL 60
           MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL
Sbjct: 1   MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL 60

Query: 61  LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM 110
           LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM
Sbjct: 61  LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM 109

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_1G003620 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8652456.14.2e-58100.00hypothetical protein Csa_013782 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_1G003620 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_1G003620 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_1G003620 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_1G003620.1CsaV3_1G003620.1mRNA