CsaV3_1G002090 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3

Overview
NameCsaV3_1G002090
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Chinese Long (Cucumber (Chinese Long) v3)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 1353020 .. 1358790 (+)
RNA-Seq ExpressionCsaV3_1G002090
SyntenyCsaV3_1G002090
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCAAGTGGAAACCAAAGCATGGCTCGTGATTGGGTACGGCAAAGGCAGGAGCGGCGCGTGGTGGTGCGGTCGTTTGGTGCTACCAAAGCAGAGTACCACGGTTGGTGTACGGAATCTACGTGTTCTTTCTTATAGGGACACCCAAAACACACTATCACGTGAAAATTCCTCTCTTGTCCCTTCATTTTCCACTATGCTTTTCCAATCCCACACCTTCCCATGCCAAATCATATCCATGCACCTCACTTTTCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCGGCCTCTCGAACTTTCTACCTAGATAGTTAGAGGCTTTTGTGACGTAGAGTGAGTTATTAGAATATGTGGTTATATTGAAGTCTTTGAATTATAATAGTTTATAAGGGGTAGATTATTATAGTTTGAATTATTATAATCTATATTTGAAAAAAATAAATAATAGTGAAATGGGAGAGTGAAGATTTGTGATGTATTGGAGAGACGGGAGGTGAGGAATAGTGAAAGGATGGAGGAAGAAATATAAGAAATAATGGAAAAAAAATAGAATAGTTATAATTATGTTATTATGATAATCTTTGAAACAAACATACAGTGGGCTAACTCCTTCATAAACAAACATAACGTGAAACGACCCCTAAAGATGTTAAAATTTTCTAAAGTTGTTGAAATTTTATAATTTACCATAATTATAAAAATTGGATATCAAACTTATATAATCAATACAATTTATACAATTATGTAAGCTCAAAAGTTTAATTTCAAAGTTTGAATAAATTTGACATGCCCAGTTTTTTTAATTTGAAAATTTAAGGATGATTTTTGCAATTTTACACTACATGGTGTCGAACTATTGAACATTTTACTTTTTCTTAGTTGATAGTATGACTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGGGGTATTTTAAAAAATATCAAAATAAATTAAAATATTTACGAGCTATGACAAAATTTTGAATTATATCAATGATAGTTTTATATCACTATAGCATAGACTAAGACACAGACAAGTGTTAAAAAATTATACAAAATAATATATCAACTAATGACATGATAAAGTAAGAACGTAAGGAATATACAGTAACCCAATTCTAGAAAAGTAGTGGTTGGATTGTACATATTCATATTTCGTCTATACTCAACATTTTACTATATGATAATATAATTTAAATTGTCAATAGCAAGTACAACTATATAGAAATTGAAATTGGACTTCTCATCCTCATAAATTTCTCAAACCTTGTCTGACTTTGTCGTCACATGCAGTCTTACACGTCCTCGATTATTGACCATTTTTTCAAACCAACATTGCTTTATCGAAGTAATAAACATCTTTATTTTATACCAACTATTTTTAAAATATTAAAAGTTATTTATTTATATTTATACTTAAATGATAAAAAAAACAACTTTTTAAAACAAAAGTCTATTATTATAAGTGTCTATTATATTGTAATATGAGTTTATAGACGATAAAATTTGTTTTCAATTATTGAAAAGAAAAAGGAATGAAAAAGAGAGAAGCAATAATGTAAGCAAGCAAAGGATAGGTGGCCTTTTAAAAGCACTCAAATTGCCTTTAAAAGAACTTTGTCTTGGAAATTGGAGAACCTTTATGGAATCAAAAGTTGTGCATTGCCTTTTAAGAAAAACTTTATATAATTTTCTCACTTTGTTTTAAGATATTTATTTTATAAATAAATAAATAAATAAATTTTCTTTTTGTTCCTTGTGATGGCTTTTATTAAATTAAGATAGATTTTAATAACTTCAAATTGGATATGTTACAAAGTAAGGTTAACAAAATTGAAAAGAATGGGTAAAAAATTGTTCAGAAAACAATGATAAATAAATCGAAATATTTATGAGTTATAGGAAGATTTTGAATTCTATTTTTTTCAAAAATTTCATATTTTACTTTTAAAAATTCTTCTAAAACGAATCTTAATTATTTTTTTTAGAAATAAGCTTATAAGCCCTACTTAGTTTATATCATACACTTTTAAATAATGTTTTTAAAACTAAACTATATATAATTTTTAAATTTAGACTTTTACTAAAATATAATTTCTTAACCAAATTGAGAAAATTAAATTTGAATAATTATAGTTGGACATTTAATCTAAACAACTCCTTTTACTTTAGTTTTAATTAATTTACAAGTGGGTGCACCAAATTTAGAAGCTGAATGATATTGATTTTTTCTTTTTTATAAACCAATGAATGAATTAGTGGACATAAAAGTTGATGGTGCAATAGATTTTATTTATATTGTTGGGTTATTGTGAGCCAATGACATACATCAAAGATGGTGTGATCCATTTGTAATATAGTGGTTGAGTTTGAAGGTTAGGTACAACCACAAATATGTATGATATGGATTACCAAACATCTAATAGGCATGATTTCTCCACCATTTTTCCTAACTATCTTAATCTAACATTATTTAGAGTATAACCCGATATCATTTTAAATACTATTCTTGTTTTACGTATGACTTAAGTTTTGGTTCATTTCATATGTCACTGTACTTTTAAAATATCTACGTTGGTTTTTATACTTTTAAAACGTGGCAATAACTTTCATGAAGACATCAAAATGGTTGCTTTTGAAAAGTTTCGGGGCCAAATCAAGTAGAAAGTATGAGAATAAGTGTGTACGTTTGGAAGTACAAAAACTAAAATAAACCAATGTCAGAAAGTACATTGACGACCAAAATTAACAAAAACTAGAAGTTGAAGGACTATAATAGTATTTAAACCTACTAACACGACCATTCACTATAAATAGATATTATTATACATTTTTCTCAACACGTGTCGATATATTAAAATCTCGATCTCCTGTGCACCCATTTTCCAACTACATGAATGTGATAGATTTCCTCTACTTAATTTATCTAAATTTACAAGGCTAAACTCAATAGTATCGAAAGTTATTTCAACACTCTTTCATCTCACGTGCTTCTAAACATTTATTTTCATTATACTTTTACACTTCGATTTTACCGAGTTAAAAAACAATAACAAATAACATAGAATGTATTACACGTGTATTTTCCTATTATGTAGACATAGCCGTACAAATTAAGAATGAACCGTGGTTATGAATTGTCATACCTAATTAGTTCCTAACTAATTGCTGGGTGGTAGAGAAATATGTGATATTGTGACAAAGTTGATTTGATGAAATTTGCAAAAATTAACCAAAGTTTGAATTTGTTAGGCATTTGTAGAATTGGAAGGGGATAAAGTTATTGGATGAGGATAAGGTGTAAATGCAAGCATGTGCAGTTCATTATTTTTAGCTCTACCTCTCTCCATTACCATTTCCCACAAGTTTACAATCTTTTTCTTTTTCTATATTAAATGTATAAATATCATTTCCTCAAGAACAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAGTATATATATAAATAAACTTCCTTATATTTATTTTTATTGTATTTTCTTTTAAATTTTAATCCCAACCTTATATATACAAAAAAAACGATAACATTCTTGGATTTGTAAGAATTTTACAAACAAGAATAAAATGATGAGATGTTTAAAGATATAAACATCAAAATGAAGTTGATAAATGTAACAAATTAATATCTATAGATAATGATCGTTGAACTATGTTTACTTTAATAATAAATTGCAAAAACGAAAATCGACCAACTTGTAAAGAAAGAATGACCATAGGTGTTATAGTCGAGCTAAATTCGACATTAAATATACATAAATATGTGTGTATGTATTGGTTAATTTTGTGTGTGGAGTCCATTACCGGTGTCACTATCTCTCTCTCTCACTCCGCCCACGACTGGCTATATTTTTTTTCATTCTTTCCTTCATTCTCTTTCTCCCTCACTCTCAAGTCTCACATCTTTCTCTTCCCTCCTTAACTCTCCCTCTTTCTTACTTCTCATATCATCTCTCTCCTCACGTTCTCCATCTTCTTCCGTTCTCACTTCCTCTCTCTGCCTTTTCAGTTTTTTCCCTCTCTGCCATACTTTACTCAGTGTAATTTGTCCGGAAACATGCTCAAATGGGTGCCTGAATCGACTGCTCATCTTTGTCCGGCGAGAGATTAGGTCGAGTTCTCGTCATTCAACTTCAAAAACCTGTAACAGAGCGTTCAACCGGAGACATCTCAATCTTTCTCACCAGCGCTACTGCGAATCGTTATCTAGCATTGGGATTTGAGTCTATCATAGGTATTTTTCTTCCTTTCATACTTCTCTATTTAATTATCGTGGGCTTCAACTCTGAAAGTGTTACTAATCTTGAGTTCAATTCCGTTTTTTTTCTTCGTGTTTTTGTTATTATCATTATGATTCTTGTTTAGAGCTACTACTTATCAATTTTTGTTTTTAGTTTAGAATTTTCAATGAAGAAATGAGTTTGGGTTACTTTTTATTTGTTTATTTGAGTAGGGCTTGACCGGTTTAGAAGTGCGCGAAACCTGTTGTCGAGTAAAGTGATTTTTTTAAAAAAACAAAGACAATGTTAAATCGAATAGGTTAAAATAGTTTAGGGTTTATTGATAATGAGTAACATGTCTTTTCGAATTTCGAAGAGGAATTGAAAATTTACTCCACATTAAAAAGATAAATTAAAATTTTAAATATTTTTATGTTGTTTTATATTTAATTATCTTCTTTTGAAACACAATGATGAATTTTCATTTGACCGTAAAATTATCCCTCGGAATTTTTTTTTCTTCTTAATTTTAATGCTTAATTCGTAAATTTCCTTCCTATAAAAAAGTTGAATTTAGAGTTTAGTTTGCGACAATTTTTAAGATTTTTTTTAGGAAGGAGTAAATTATTAAGACTATGACACCATTTTAGATATTCTATTTTAGGGACTAGTCATATATTTTTTTAAAAAATTTGTATCCAAATAGTAAAAACATTTATAAAAAATAGCGTATAATTTTTTTTTTATTTTGGACTAGTAATTAGAGGATTATTAATTTTTTAATTTGTTATTTTTGTAATTTAAATAATGTAATACCTTCTATTATCATAAATTTTATTTTTTTATTTACAAAGGCTTACTTTCCAATTTAAATCATATATTTAAAATGAGATTAAATTATTTTTTAAATGGTACCAAATTTAGAATTAACCTGTTTTTGATTTAAATATATGAATTAGAATCGTTGGGAATATATTTGTCTTAATTAGTTGAATAAGGTTGGTATGATTTTGTGGAAAACTGATTCCACCAAATTGAATTGTTGTTTATTTTGACTAATTTTGACTTAAGTTCTTACTGTTTTTTCTGATTACGTAGTCTATTAAACTCATGTATAGTTTCTCAGTTATAATAATTCCCTAAATTTAAATTCCACTTGAGTGTAAAAGGGAAAATAGAAGTTGAATTCATCAAAATGACCACATTAAATGGATAGATTAATGACATTTTTCCCCCCTTCTTTAGAGTGGTAGCAAGGTTTGAAGTTTTGCACTTTTCATAAAGATTATTTAATGGGGGATTATTATTTTAACTAACCAACTCTACTGCTGCTCTAAACGCTACATGCAGTTGCTCTCTGTTTCTGCATTTTTTTTTTTTAATTTTTGGAAGCTGATGGGCTTCTCATTTTCTGCTCCAGAATTTTCACCGTTGATTTCTCGCTTGGTTTGATATCCTTTTGTTATTTCGGTAATCTGAGGAAACACTTTCTTGCCTTGTATTTGGTGGTTTGGTTTGTAGTGTTTGGTGACCATTGGAGATTTTGA

mRNA sequence

ATGGCAAGTGGAAACCAAAGCATGGCTCGTGATTGGGTACGGCAAAGGCAGGAGCGGCGCGTGGTGGTGCGGTCGTTTGGTGCTACCAAAGCAGAGTACCACGAGCGTTCAACCGGAGACATCTCAATCTTTCTCACCAGCGCTACTGCGAATCGTTATCTAGCATTGGGATTTGAGTCTATCATAGTGTTTGGTGACCATTGGAGATTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAAGTGGAAACCAAAGCATGGCTCGTGATTGGGTACGGCAAAGGCAGGAGCGGCGCGTGGTGGTGCGGTCGTTTGGTGCTACCAAAGCAGAGTACCACGAGCGTTCAACCGGAGACATCTCAATCTTTCTCACCAGCGCTACTGCGAATCGTTATCTAGCATTGGGATTTGAGTCTATCATAGTGTTTGGTGACCATTGGAGATTTTGA

Protein sequence

MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFESIIVFGDHWRF*
Homology
[Close]
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. NCBI nr
Match: KGN63645.1 (hypothetical protein Csa_013502 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 1.4e-30
Identity = 70/70 (100.00%), Postives = 70/70 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES 60
          MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES
Sbjct: 1  MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES 60

Query: 61 IIVFGDHWRF 71
          IIVFGDHWRF
Sbjct: 61 IIVFGDHWRF 70

[Close]
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LP17 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G008510 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 142.5 bits (358), Expect = 6.7e-31
Identity = 70/70 (100.00%), Postives = 70/70 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES 60
          MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES
Sbjct: 1  MASGNQSMARDWVRQRQERRVVVRSFGATKAEYHERSTGDISIFLTSATANRYLALGFES 60

Query: 61 IIVFGDHWRF 71
          IIVFGDHWRF
Sbjct: 61 IIVFGDHWRF 70

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN63645.11.4e-30100.00hypothetical protein Csa_013502 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LP176.7e-31100.00Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G008510 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CsaV3_1G002090 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsaV3_1G002090.1CsaV3_1G002090.1mRNA