CsGy5G009580 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACTTCAAAACCCTATTTCATTTTCAGCCACATTGCACTCCACCGACTCAGCGCCGCCGCCACACACTTCATTCTCAGCCGTCCGACCAAATTTTCGCCGCCTTCTCCCTCTCCCACTTTCTCGCCTCCTTGAGCCATTACAGCTACATATCTCTGTTTTATTTCTCAGAAACGCAGTTGTTCAACCCCTAGCCGGCGCCGTTGGTGAGATGGTGCCGCTGCCCCTCATTTCTCAGATCCCTAAGGTCTTATTTTTTATATTGTTTCCTTGGATAAGAAAATTTAGAACAGCCCTGTAGTTTTGTTGGCTATAAAAAGACTTGTTGGAATTATAAACTATAAAATATTCAAATTAAATTTATCAATTCGATAAACCCACCAAAATACAATGCACAGGCTAAATTGAAAACTTAACTTTGACTCTAGTTTGATTGAATAGCACTGAGTCTCGTTGAATATAGAAGAAACTTCATGGCAATTGGAGGCGGCTAGGCAGATATTATTATATTTGTAGAATTGGAAACATAATTGTTCAAGTTTACGAAGCCATCGTGGGTGTTTTATCGGTAAAAAGGAAACATACTCTTAATAACTCACCAATAGATCCTGACACTTACTTGAAAATTAATTTTTTAGGTTCAAATGTTATAGAACACGCTGTTCACTCACGAATATTCATAAAAGAAGATTTAAAATCCTCTCTTATCAGACCTATGTAAACCAATTTATTTTATTTTATTTAAACAAAAATAAGATTTCAAGATTCCTACCCCCATTTTTATGCATCCTAAATTAATTTGAAGTTCTTTCCACATTAAGGGATTCCAAGCAGAGGGTTAGCTTTATCTATTATGAAAATATATTTTATAGTTTATAGGTTTTCCTCTCTGTGCCTTAATCTTTACTGTTGTCTATTTTAGTTCAATCAAGTTTCTAGATTTTGTATGGCCATGAAGAAGCAGGATGAAATGGTTGTAGCTTCAAGTAATCGAAATGAGACGTGTATTCCCCATGTGTTGAGTGTTGCTGGTTCTGATTCGGGAGCAGGGGCTGGAATCCAAGCAGATCTTAAGACTTGTGCTGCTCGTGGAGTGTATTGCTCCACTGTGATAACTGCTATTACTGCACAGAATACTGTGGGGGTTCAGGTCATTATCACACACTCATTATTATTATTATCTATATTTATGTATTGTTTTTTTTTGTTTTGGGTTGAAAGAATAATGGGAAAGACTGGTGTATGAATAATCAAACGTTCACTTGCTATTTGTCCGACTGTTTTGGTATATTGGAGTGTAGAAAATGGTTTTACATGCTGCAATGGGCAAATTCTAATGTTTTTTTTGAGAGTTTGGGATAATTTTTGAAATCATGCTTTTAAGTGAAAGCTAATACTTCGTTAGCACTTTATTAAATGCTGTCTAGGGTGTGTTTAGGGTTGCTTTTGGCATGGTGAAAAGCACCTTTCTCATGGCTAAAGTACTAGTGATATGATCAAAGAGTTCTTCCTCCATCCATTTGGTGAGAAAAGCTAATTCTTGTGCCTTGCCGAAGTGTGCACTGTTTTGTGAGGTCTTTGATATGTGTGGAATAATAGTGTTTAGAGGGTTGGAAAGGGATCCTAATGATGTTTTGTTTTTTGTTGGATCTCACGTTTCCGTTGGGTGCGTTCAGTTTCGAAGATTTTTTGTAATTATTAGTATTTTCAGGTGACCCAAGTTGCATAATTGCAATGTTATTTACTACAGTATTTAAGGGTTATATTATTATTTAGTTAGACAAGTTGTTAGGATACTTGGTTATAAATTGAGATAGAGAGAGGGAGTAGTAAGACAATACTGTGGTGGTTGAGTTAGGGTTTGAGAGAGATCTCAAGAGGGGAGAGTCTAAGTACCTTGAATCACTTGACTATCTTGTAAGTTCTAGACACATACAAAGGTACTAGATTCGATTTGGTATAAGAACAGTTTGATTATGACCATGGGGTTGAGAGCTATATATAAAGTTAAGTGAAACAATATTAAACACTTTATGTGAAGCAATGGACCCTTTGAAGAATCCCTTGGATAACCAAATGAAATTGATGTTTCAAACGATATAGAGTACAATGACACTGAGTTCTGGTCTAATTAGAGAAGTACTTAACACTTATTCTACGAACACTTAAATACATGCATAGTTCTCTAAATAATTTTCAAAACCGCTTTTAAATACCTAATTAAACATTACGAAAAATTTGAGTAGTACTAGCATAAAACACTTTTCACCTTTGCAAAAATCATTCTAAACTCACTCTTAGAATATATTTGTTGTAGTTAGCTTTTGCTTGTTTTGAATTAATATTAACTTAAAATTTTGTTTAACAATAAGCTGCAATAACTTTTTCAGGATGTAAACGTTGTTCCGGAGGGCTTTGTTTCAAAGCAGCTGAAATCTGTTCTCTCTGATATGCAAGTGGATGTGGTGAGTATAATTAAATTAGGTTTGATGTGGTGAGTATAACTAAATTAGGGTTGAGAGTAGGCTCTTCGTAAATCCATCAATATATATATTAAATAAGAAATTTCAAGGTATGGTTGCCTACTGATTTTTCTTAGGAGCTCATGCTAACAAGAATGTGGACTGTTCATGTATGGGATATTGCACCGGGTAGCTTTTATTGTTCTTTCAGAGTACATACTAATATGTACTTTATTTAATCTGGTAAGCACGGATAGAAGATTACTAATGATTACATTAATTTAGGTGAAAACAGGAATGCTACCTTCTACTGGCATCGTTCAAGTTCTACATCAGTGCTTGAAGGAGTTTCCCGTTCGAGGTATAAAGTAATTAAGGAAGTTGTTGGTGGATTTCTTTGATTTAATCGTGGTTTAAATTTTAATGTAATTAAAGGCAGCTTTGGTGGTTGATCCTGTCATGGTGTCTACTAGTGGAGATGTTCTGGCTGGTCCTGCTATTATTTCAGTGTTACAGTAAGTTGATGCTTTCTTGAAATGGAATATCTTCAGTCCTTCAAGGGGATTCTATTTGTATGATTATGATAATTTCTTTCGTTCCATATTTTCATTTTTTCAATATCTTCATAATTGGGACAGTGTTTTCTGGTTTAAAAGGCTTCCGAAACTTATGTGTGGAGCTCAAACTTTTAACGTTAAAGCTTACATCTGACGCACGTTTATAAGAGCTTATTGAGGCTTGAAATCCTCATGAATCACACAATAATTTGAAAAATAATACTATTTTGTTCCTCTCCCCACCATGATTTTAGATGGCATCCATTCATCATAGCAAGAGCTATATGAATCTGCCTATAATGTGATGTTTTATCTTTTATGTGGTATTGCTACTATGTTCACTTTCACTTGTTAGATTGAGGGTTTCAAAACCTCTCCGCTTGTGTAGGCTGCTTTAGAAGCTTTTCTTTTATACAATTTCTGGCATGTTTCTAATAAAAAAAGAACTCGTATTATCGCTGAAATATGAGGGACTACACGGGGTTGATGGACATTTGGAGAGCACTCATATTATCGCTGAAATGTTCAGGAGCTTTAAATAATGAGATTTCAATGTCACAGCAAGAATGTGATCCAAGTGAGTTCTGCGATTGCATTTGCCATAGCTAGATATTCTACCTCAACGCTGGATCTAGAGACAGTTGGGTGCTTCTTCGAAACCCATGAGATGAGGTTGGATCCAAGATACACACAAATGCCTGAGGTGCTCCTCCTTGTGGTTGGACAATCAACCAATCTGTATCACTAAAATCATAGTGCTTAAGGCAATTGTTTTTAAGAAAAATGATGCCATGATGCATACTATGCTTAGAGTGCATTTAACTTCCCTGGAGTGCTGCATTGTGGGTAGTTGCATCTTTTACAAGCTTTGTTGATGGCAAAGGCGATGTCAGGTCTTGTTAAGGTGAGGTATTGGATGGACCCAGCAAGGCCTCTATAAGTGGTAGGATCGACTAGTTCATCATCTCTTGGGCATTTTTTGTTGCTTGTTGCTGTTGGAGTTGATATTGGGTAAACATTTAGTTAGCCTTAGCTAGATATCTACTGTGTGTGTATACTTAATTTGAGTGATGTGAAAACCATGGGGTATATGCTTTACTTCAACTCCTAAGAACTAGTGAAGGATCCTGAAATCTTTTAAAGCAAGTTCTTGACCTAACTTGGTCACTAAGGTGGCAATAAAGGCTGGGTCATTGCCAGTGAGAATAATATTATCAACGTAAAAAAGCATAAGAACTAAGGTACTAGAATTTTTGAAAAGGAAGAGAGATGGGTCGAAGGTGCTACATGTCCTATGTGAGTAAGGAAAGTGGACGATCTATCGAACCAAGCTCTAGGTGCTTGTTTTAAGCCATAAAGTGATCATTTCAATAAATAGACAATCAGGATGAGCAACGTAAGTGAAACCTGGAGGTTGAGCCATGTACACTTTTTCTTTGAGATAACCGTGGAGGAAGGCGTTTTTGACATATATTTGTTTCAGGGGCTAGTTGAAAGAAGCAGCAAGAGCAAGTACTAATCAAATTGTTGTTGGTTTAACAAGGCTAAAGGTTTCCTCATATTCGAGACCTTCAATTGAAGAATATCCTTGAGCTACTAGTCTCCTTTTGTGTTTCTCTATGGTTCCATCTTCTTTGAATTTTCTTTAAAGATCCACTTGGAGCCAACTATGTTGGTGTTGGGTGGCTTAGGTACAAGTTTCCATGTTTGCTTCTCATGTAAGGCTTTAATTTTTGCCTCCATTGCATCCTTCCACACGGAAATTTTGAGTGCAGAGCGAGATGTCTTTGGTTCAAGAGATGGGCTTCAAGTGGCACTAACTAGGAAGGTTGTGTAGGAATGGATTTTGTTATGTATTTTGGTTTCACTTTGGACCGAGTGACCATGGGATTTAAAGAGAGAGGTATTACTGCTGGTTTGTTTAGGATGGGCTACATGATCTTGAGTTGGTAATGGAGGCAATGAATCTGTAGCATC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Match: Q5M731 (Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 689.9 bits (1779), Expect = 2.3e-197 Identity = 348/490 (71.02%), Postives = 414/490 (84.49%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O48881 (Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme BTH1, chloroplastic OS=Brassica napus OX=3708 GN=BTH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 673.3 bits (1736), Expect = 2.2e-192 Identity = 339/490 (69.18%), Postives = 409/490 (83.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2QWK9 (Probable thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os12g0192500 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 668.3 bits (1723), Expect = 7.2e-191 Identity = 333/508 (65.55%), Postives = 412/508 (81.10%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P61422 (Thiamine biosynthesis bifunctional protein ThiED OS=Geobacter sulfurreducens (strain ATCC 51573 / DSM 12127 / PCA) OX=243231 GN=thiDE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 2.0e-55 Identity = 129/255 (50.59%), Postives = 168/255 (65.88%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P56904 (Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase OS=Rhizobium meliloti (strain 1021) OX=266834 GN=thiD PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 8.5e-51 Identity = 124/257 (48.25%), Postives = 164/257 (63.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. NCBI nr
Match: XP_004140412.1 (thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1038 bits (2684), Expect = 0.0 Identity = 531/532 (99.81%), Postives = 531/532 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. NCBI nr
Match: KAE8648089.1 (hypothetical protein Csa_004689 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1004 bits (2597), Expect = 0.0 Identity = 519/532 (97.56%), Postives = 519/532 (97.56%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. NCBI nr
Match: XP_031741473.1 (thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1000 bits (2585), Expect = 0.0 Identity = 517/532 (97.18%), Postives = 517/532 (97.18%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. NCBI nr
Match: XP_008460243.1 (PREDICTED: thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 993 bits (2568), Expect = 0.0 Identity = 509/532 (95.68%), Postives = 520/532 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. NCBI nr
Match: XP_038876926.1 (thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 959 bits (2478), Expect = 0.0 Identity = 489/532 (91.92%), Postives = 513/532 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCI6 (Thiamine-phosphate pyrophosphorylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499122 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 993 bits (2568), Expect = 0.0 Identity = 509/532 (95.68%), Postives = 520/532 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CDB7 (Thiamine-phosphate pyrophosphorylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499122 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 953 bits (2464), Expect = 0.0 Identity = 489/512 (95.51%), Postives = 500/512 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GYV1 (Thiamine-phosphate pyrophosphorylase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458768 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 920 bits (2378), Expect = 0.0 Identity = 469/531 (88.32%), Postives = 498/531 (93.79%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KCE1 (Thiamine-phosphate pyrophosphorylase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 912 bits (2356), Expect = 0.0 Identity = 466/531 (87.76%), Postives = 495/531 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZX4 (Thiamine-phosphate pyrophosphorylase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458768 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 888 bits (2295), Expect = 0.0 Identity = 452/511 (88.45%), Postives = 481/511 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. TAIR 10
Match: AT1G22940.1 (thiamin biosynthesis protein, putative ) HSP 1 Score: 689.9 bits (1779), Expect = 1.6e-198 Identity = 348/490 (71.02%), Postives = 414/490 (84.49%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. TAIR 10
Match: AT5G37850.1 (pfkB-like carbohydrate kinase family protein ) HSP 1 Score: 43.1 bits (100), Expect = 8.0e-04 Identity = 31/104 (29.81%), Postives = 53/104 (50.96%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy5G009580 vs. TAIR 10
Match: AT5G37850.2 (pfkB-like carbohydrate kinase family protein ) HSP 1 Score: 43.1 bits (100), Expect = 8.0e-04 Identity = 31/104 (29.81%), Postives = 53/104 (50.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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