CsGy4G007580 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAATTTGTAATTTCACATTGTTTTTCTTTTTGAAAACTCTCCTTTCTCCCTCTTCATCTTCTTCTTTTTCCTTCCCGCCGTCCTCCACTCTCCACTCTCCCCGGCGGTTCGGTTCGTTCCGAACATCAAAATTAGCTTCCACGAGCTTCGTCTCAGCTCTCAAGGTGCTAGCTTGCACTTGATACCCTCTTAAGGCTATACCTGCATTTGAGTTTTGAACTTTGTGGCTATCATTTTCTGTGAATTTTACCGTGAACATTTTGGTGCTGGTTGTAGATGGTGCACCTGGACTAACAATGCTTTGAAATTTATTGCCTAAGAGAAATCACATCTTCTTCAAGGCAGAGAAAGCAGGAGAATTTGGCTCTAAAATGGCTGGGATTTTCAAATCGCAAGGAGGATTTGCGGTTACGCCGCACAAAGTTTCTGTCTGCATACTGCTTCAGATTTATGCACCGCCAGCTCAAATCTCAGTACCCTTTCCTTTCTCTTCAGTGACTCAGCATAATCGTCTTGGTCTGTTCTTGTTGGCTCTCACTAAGGTACTTCACTAGTTCCAACGTTAACCTCTGCAAATCTTGGTTCTTGCCTTCATAAACATGCTCATATTTCCCGTGAATGCTTGTTGGTAGTATTATAAATTTTTGTTTTAGATTGTTATGCAGTGGAATGTTTTGTTTTCCAGTCGTGTGACGATATTTTGGAACCCAAACTTGAAGAGCTCATAAATCAATTGAGGGAAGTTGGTGGGTTACTAGATCACTGGTTGATTGATCACTTAACAAGTAGGCTGTCATCTTTAGCTTCCCCCGACGATCTGTTTAACTTCTTCAGTGAGATGCGAGGTTAGTTCTGCAAATTTGTATTGTTGTTTACCTTCAACCCTCGTTCATTTCTCATCAAACTTTCTAGTTTTCTTCCTTAAGTTCTAATTTATGGGGAATATTGTTCTCTTACGCTGTATAATGTGGTAATTTTTCTCCCGTTTTCTCAATTTCCTCAACCTTGCATTGCAATAATGTAGTTAAACGTCGATTTAATCAGGAATCCTTGGAGGTCCAGATTCAGGTGTTGTGGAAGATGACCAGATTATTTTGGACCCCAACAGCAACTTAGGAATGTTCCTTCGTCGCTGTGTTCTTGCTTTCAATGTATTATCATTTGAGGTACTCTAGTTTACATACTGTCTTAATAGTTAGTTAGTACCCCCTTCCCTCTTAACATCTTGAAAATTGGTTTAATGTATTGGTAGTTGTTTTTAGTGTGGAATCGGAGCTATGGAACAAATGGATAAAAGAACATTGAGTTTTGTTTTTGTTTTTAACTTTCTTGTTACACAATATCACCAAACATCATTTGATTCAAATCTCAATTTCTTTGGTCACCAGAAAGTATTGAACTTGTGTTTTAATGTTGCTTTACAAGTTAGATGTTCATTTCTGAAAATTCAATGCAGGGTGTTTGCCATCTTCTTACAAATATCGGAATGTATTGCAAAGAAACTCTTTCAAGTTGTCCTTATGGAGCATCTGAATTAGATGATACCAGGAATGATTTGGAGACATTGCCAGAATATGAAAGTATGGACCTGGAGAATCTTGTTTTTGAAAAGGTTAGTGAAGAAATTGAAGCAAGAAAAAGGACCGCTCAGAGCATCCCTTTTCATTTTCATGTGCCCGAAGCACTTTCTGGATTGGTTGAAGGTACAGGCACATGTTTACTCATTGGCTTGTTAGATGAAAAACAACTTGGAAAATTAAATAAACCATGTATATAATAAATGATCACATTTTTTTTTCTTAGACCATTTGATTAATTTTCTTGAGAGATTAAAATCTATGTATCATCTTTTGTTTCCATCATTAATTCCTTCGTTTTATAGTGGGGAATGAGGTACATCAGTGCTATAACATAATTGATTCGGAATGAAATAGCCCACTTTTAGATGAAAAAAAGGGAAAAATTTCGTCAGGAACCAAGTTGGATTTTCTTTATGTTAAGTTATGAGTTTTTTCTTTCTTACATTTAATTTTTCAGTTTAATCTTTTTATTTCTTTTTTCCTTTAAAGTTAGATCTAACATTCACTTTTTTTCTTAGTTATGAAGTTTATGTTTTTAGTGTTGCTTTTAATTTGTAAGTTAGTACTATTAACATTTTCACCTTTTCTACTTCAATAAGAAGTTTATTTGTGCTCTCTTTTTATTTAATTCTCCTTGTTTAACAAACATTGAGACATTGATTTGCCACTGCAGCACTTAATTTTTTTGTTGATTTCATTTTTTTCAAAACTTTAAGATTTTGGCTTCTCTATGGTATGCTCTCTTAATTTCTTTTTGTAATATAGCCTCAACCTGAGCTCCATGCCTTGACCAATTACAAATTACTGAATGGTTGGGTTAGGTTAGGATATATGTAATAATTTAGTCTAATTTAGAACACTTTATTTAGAGAATCAAAATGTGAAATAACAAAACAGAATGAGGAATGTGATTATTGTGCGGCAAGGTTTTCAACTTAGTATTGCTTTTTTGATTAACATATTACGAATTAAAACTACAAGATCTAGTCCCAAGCTTATGATAAATTATATTCTTTTTTAAATGGTCTCAACATTTGGCCTCAGTGAAGGGGGAGGTTAACTCTTGCCGATGCAGTTCTCTCAAGTATCCCCCTCTATTATTTATTTGTTTCTAAATGCCCGACAAAGGTTGTGAAAAGTCTTGAGAGGATCATTGGAGAATTCTTTGGAAGGAGCTAACCTTGAAGTGGGATCCCACTTTGGGAAATGGGATATTTCTTCTATGCCTATTTTGGAAGGGGGTTTAGGAGCTACTAGTTTGAAGCTAGAAACACAGCATCCTTGCAAAATATGGGTGGTGGTTCATGAATGAAAAGATTTTCCTATGAAGGAACCTTATATGGCTCTCATTACCTAAAGCTGGGCTCGTAAATTCAAAGGTTCTTCAGTCTTCATTGTTAAGAGTTGCCTTGTTTCTGAGGTGGCATAAGATTGAAATTGGTAGAGGCATTCCTTCCTTTTCGGAAGAAAATTGGCTTTCATCCCAGCTAGCTTGGACTTTCCCAGGCTATTTGCTCAGCCTCTTTGTCCAGTTTAGAAGGAAATTGGTTGATGCTGAAATCGAGGATGCACTTTGCCTAACCTCCTCTATTCCCTTTTCTCAATGACAGAGAAGACAAGATTTGGCTGCTTGAAGAACATGAAACTTTCCATATAAGCTCCTTGGTCCCTAAGGTCTTGGCCGACCAAGCTGGTATGTCATGTGTAAACTGAGCCGGGTTTTCCTGTGGATTTTTTTCTCTCTTCAAAGGTTGAATTCATGCTGTGAGTTGTTGGAAAGAAAACTTTATATGTTTTTGTCTCCCTTTTTTAGCTGGTGTGCCATGTGCAAACAATAAACATGGGGAGGAAGATCAAGGCCATCTCTTATTTGGTCGTTTCTTTCTTCTGGTTGCTGAGTTAGACTCCTCAAGTCTGTCAATACATGTCAGGCTTTCTCAATAACAGCGCTGATGTCTTCTTCCAGGTTCCAGCTTATTGCTGGTGGTCCCTTCAAAGATAAAATTGGTATCTTATGGTCATTGGGAAGGCTATTGTTTGAAAGGAATGCTAAAATGAAAAATCTTCAATGGAGAAGAGACAAGCTGGGAATTTCTTTTGTTCCTCTCAACGTCTTCCTGCCAAGTACTTTTATAGTTATCTTTTAGCTAAAATTTTCACCAACTGTGCAATTGGGAAGGCTTCTTGTAAACCCTTGGTGTGGTGGGAATATTTCATCTCCCCTCTCCTTTTATATTTTTTATATATCTCAGTTTCTCATTAAGGAAAAGATACATTTGTTTTCAAAGAGTATTTCCAAATTCTCCTCAAAATGTATAGACTTGGTTAACAATCTAAAGAGATAATTGGTAAACTGAAAACTTAGTACTGAATTATTAAGATATAAGGAAGAGAATGGTTACAAAATTCCCATACCATTTGATACTATGAGACTCGGTGCCTATATCATTATCTAAATAGTCACGTAACTTAGGGTCGGCAGGCCCCCTTGAGCTTCCTTGGATACTTGAACTTAATCTAAGATGCACTAACTCTATCACAATCTTATGTAAGTTGCTACTAATTTTGCAAATCCTCAGTTTTCCCATAGAATTAAATAATTTAAGCCTCTTATCATAGTGATTGATTTGTATTTGTCAAAAGTACAGATGTTGATGTTCCATCATTCCCAAAGTGCAAAAGTACTAGTAAAGCTAAAGAAGGTTATTCCTACTCCAACTCTCTTTCCAATACCTCGAGAGATATTGATCCCAGTGGTAGCGCATTCCTGAGGACAAATTGGCAGATGCAAGGTTACTTAGATGCACAAGCTGAAAAAATTGAGAAGTAAGAGTAAATAGTACTTAGTTGGAACTTGGAAGCTCTTTCTTTGGGGCATTTTTGTGGGCTTGGCTATGTTTGTATGCCCTTATATTCTTTCATTTTTTTTCTCAATGAAAGTAGTTGCATAATCAACCCAGAAAATGTTGTTCCTTGCTACAACACTAATCAGCTTTTTAAAATTGGTGCAGGTTTGGAAGCTTATTTTCTCTCAATGCTTTTGAATTGGTCCTCAAACAGCTCCAAAAAATGGCACCGGAACTTCATCGAGTAATTGGATCTTTTTCCTTTTATGTTCATGATTATTTATTCTATTAGATTCCATTTAACATTTAATGCGGTGCTTATCTCTTTGTTGTGCTGATGCAGGTTCACTTCCTGCGTTATTTGAACACCCTTTATCATGATGATTATTTTTCTGCTTTAGAAAATGTCCACCGGTATTTTGACTATAGGTAAGTGGCTAACCATACCTTTTCCTTTCATACGTTGGTTGGTGATTTCCCAAGCCGATATGGATACCCTTTCTCTGAATGAAGAGATATGCATTTTCAAATATTGTAATATGGAGAACTATTATCGATAAAACGAAC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MAGIFKSQGGFAVTPHKVSVCILLQIYAPPAQISVPFPFSSVTQHNRLGLFLLALTKSCDDILEPKLEELINQLREVGGLLDHWLIDHLTSRLSSLASPDDLFNFFSEMRGILGGPDSGVVEDDQIILDPNSNLGMFLRRCVLAFNVLSFEGVCHLLTNIGMYCKETLSSCPYGASELDDTRNDLETLPEYESMDLENLVFEKVSEEIEARKRTAQSIPFHFHVPEALSGLVEDVDVPSFPKCKSTSKAKEGYSYSNSLSNTSRDIDPSGSAFLRTNWQMQGYLDAQAEKIEKFGSLFSLNAFELVLKQLQKMAPELHRVHFLRYLNTLYHDDYFSALENVHRYFDYSAGTEGFDFIPPGSGCNSFGRYEIALLCLGMMHVHFGHPKQALEVLTEAVHVSQQQSNDTCLAYTLAAIGNLLSESGFSRTSGILGSSYSPLLSMGISLSVQQQLFVLLTESLRRAESLKLKRLVASNHLAMAKFHLMHVQRPLLSFGPRASAKLRTSPISVCKELRLSTHLICQYGTESSTKTTDGSFSTAWLTNLQKPAGSHVLCRDNESGNNSSELPFFAQPTSIPGSVLQLLGSSYLLRATAFEIYGSAPLARINAILYATCFADTSSSSDASLAYVKLIQHLAIFKGYKEAFSALKIAEERFLSLSKSRILLLKLQLVHEHALHRGCLKLAQQACNELGVLASSVTSVDLDLKTEASFRHARTLLAANQFSEAARVAHSLFCLCYKYNLQVQNASVLLLLAEIHKKSGNAVVGLPYALASLSFCQSFNLDLLKASATLTIAELWLSLGPSHSKRALNLLHGAFPMILGHGGLELRARAFIVEAKCYLSSPTFSVSEDPEVVLDPLKQASEELQLLEYHEMAAEAFYLMAMVYNKLGRLEEREEAADSFKKHIVALENHEEGESSLLNIS* Homology
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H1U4 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=APC5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1189.1 bits (3075), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/920 (66.96%), Postives = 745/920 (80.98%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54VV5 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=anapc5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 94.7 bits (234), Expect = 5.7e-18 Identity = 104/513 (20.27%), Postives = 210/513 (40.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9P4W7 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=apc5 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 2.2e-06 Identity = 34/140 (24.29%), Postives = 68/140 (48.57%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_011653278.1 (anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031739826.1 anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN53549.1 hypothetical protein Csa_014885 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1793 bits (4645), Expect = 0.0 Identity = 921/921 (100.00%), Postives = 921/921 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. NCBI nr
Match: KAA0063020.1 (anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1761 bits (4561), Expect = 0.0 Identity = 904/921 (98.15%), Postives = 912/921 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_008451782.1 (PREDICTED: anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1759 bits (4555), Expect = 0.0 Identity = 903/921 (98.05%), Postives = 910/921 (98.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_038899012.1 (anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038899021.1 anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038899030.1 anaphase-promoting complex subunit 5 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1720 bits (4455), Expect = 0.0 Identity = 879/921 (95.44%), Postives = 899/921 (97.61%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_023553172.1 (anaphase-promoting complex subunit 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023553173.1 anaphase-promoting complex subunit 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1675 bits (4337), Expect = 0.0 Identity = 854/921 (92.73%), Postives = 890/921 (96.63%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KXJ1 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G081270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1793 bits (4645), Expect = 0.0 Identity = 921/921 (100.00%), Postives = 921/921 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V702 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold468G001230 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1761 bits (4561), Expect = 0.0 Identity = 904/921 (98.15%), Postives = 912/921 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BSC5 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492966 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1759 bits (4555), Expect = 0.0 Identity = 903/921 (98.05%), Postives = 910/921 (98.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JA17 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483079 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1672 bits (4331), Expect = 0.0 Identity = 852/921 (92.51%), Postives = 889/921 (96.53%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EUD6 (Anaphase-promoting complex subunit 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437648 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1670 bits (4324), Expect = 0.0 Identity = 850/921 (92.29%), Postives = 888/921 (96.42%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy4G007580 vs. TAIR 10
Match: AT1G06590.1 (unknown protein; Has 380 Blast hits to 268 proteins in 109 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 245; Fungi - 73; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 13 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1189.1 bits (3075), Expect = 0.0e+00 Identity = 616/920 (66.96%), Postives = 745/920 (80.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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