CsGy2G007580 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAGGAAAGAGAGAGAGGAAAAAGAAAAGAAAATTCACATCGTTAAAAAGATACTAACTACGATCATTTTTCGGTTAATAAACTAAGAGTGAAGTTAACTAAAGACCACCAAATAGCTAAGAATTTCGCTCGCATCTCTATGCTCTACTACCCTTCGTCTCCAACGCAAAACTCACACCACCCACCTTCTTCCCGTTTCTTCTACTGACCAACACCATCCGTCAGACCTACGCCGGTCGCCGCCGCGCCTCAATCTCGCTGCAGCCTCGCCACCGTCAGTTCCAAAGCTCTCTGCCTTTCATATACTTTTTTGTCTTTTTGTTTCCCCTCTCTCTTTCTGAAACCTCCTTTAGTTTTAATTTAAATACTTAGGTAGCTAGTTAAGTAATATGTCATCTTCATCCTCAAGCCAAAGTCAAGTCTCAAATCATTCCATATAAATTAAACTTCCTCCATTGTTGAAGATGATTCAAAACCCTTTTGGCGAATCGTTCTTAAACAAAGTGTATTTTATGCTTTGGTGGAATACAGTTATGTTTATATTAAATTTATATATACAAGAAAATGTATAAAAAATGAATAAAAAATGACGTATCCTCGATATATTCTTATTTTAGTTCTTAATCGTTGTGTCTGATCGTATTTGTATAGCATATGTTTATCCATGTACGTGCTTCTTAAGATATAGGTATGGAATAATTTTTGTTTTATTCATTTTTTTTGTCCGACCACGAATACAGATTTTCTCTTTGGGTGGAAAGCCCCCTGAAAAAGCGATTGAAGGAGAAACAAATTTTCCTTCATTTCTACCAGTGCCGGAAGCTACCTAAACCCCAAAGAACAAGCTGAGAAATTTCTTTCGGTAGGGTGATCGAAGATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGTGGCAAAGACAGTTGCTTTGCCATGATGAAGTCTATTCAATATGGCCATGAGGTTTTGTCTTCTCTTTTGATTCCCCATGTTTACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGTCTGGTTTCGAGAACATTGTTGATTGGCTGCTATGTTTACTTCTTTTTTCAATATATGTTTGTTTGATTTTTAATTTCTTGTAAACTGATGCCTGTGCTTGGTTGTGTCGTTCTATGTTTGGTCTAGATTGTAGCGTTAGCTAACTTGATGCCTGCCGATGATTCTGTGGATGAGCTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTAAGTCTTCCTGCCTTCTTCCTTATGCAAAATATTGTACACTCGTTCACTTAAATTTTTGAAGTCAATGGTTGATTTGGGTCGTTGTCAGTAATCATGAAAGTGGTTACTTTTTTGGTGCATCATGCATTCCACTAATGTGAAAGTATATTGTATTTTTGTCGTTAGTATGAAGCGACATTATTTTATCTACCTCAAGTACAACAGTTAACTCAGTCCTTTGAGTTGAGCCTTGAGTTACCTCACTCCTTTGGGTTTCTATAATCTATATATCTTTTCATTTCAAAGGTAATTGAACACCTGTAATCCATGATTGCTAATTTGGGTTATTGGCTATCAATCTTCAGGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTACGCAGAATGCATGGGAATTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACAAGGCAAGCCTATTAAACAAAATAATTTATTTGATAAAAAAGATAAATTTTGGTGCGTGCGTTTTCTTTTTTGAATAAGAAACATGTCAATTTTCATTAAAAAGTCAGGAAAAAGCATTGAAAATTACGTTTTGGAGAATCTTGTCGGTCCACTGTGGAGGAAGTGGTATTTCATCACCATCTTTTTCTGGCTGGGGGAAGCTATTCGACAAGGGCTTATTGTTATTTATTTATTTAATAAAATTATTATTGCAATTTTACAAAACATTTTGCTTGAGAATTTTAGGAGTGGTTATAGTGATGTGGATACTTGAAGACTTGTTTTTGTCCTTGGTTAGGTTTAACGTTTTCATTTGAGTTTTGGTAACATAGGAGTTAGGTTTTTAGTACTTTTCCTTTGTCAGGAGCTCATTTTGTTATAGCTAGTTGGTTCTTGTTTTTTTCCACTGAATCTCATTTTCCTGGGCTTCCATTTTCTGTATTGATATTCTGTACTCCTATTTAATTATATGGAAGCTAGTTTTTCATTGATGTTTGGCTGGCAGCCCTAGTCTCCCTTCTCTTTTTCCCACTCCTTGGGGAGTTTGTATCATTGAACATAATTGTTTCTTTTTCATTAATCATAAAGTTTGTATGTTCATACAGGAAAGATATATGCATTAGGTTGCCCTTCTTTCTTATGGTTATTATTTTCTGGATTATTCTAGGCATCAGAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTAAATGAAGTGAAGAAGCAATTACCTAGTGTCATGGCAGTATCCTCTGGTGCCATTGCATCTGATTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTTCAAGGCTAGGACTTGTTTCTTTAGCATATTTGTGGAAACAGGATCAATCTTTGCTTCTACACGAAATGGTATATAACATTTATATGAGCTATGAAATGGACATGCAACATTTGGATTCAACTCATTTAAGTCTTCCCCTCTTCTTTTGAACTAGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTATAGTACGATTAATTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTGCATTAAATTACACATGCACGGTCTGTCTAATTAGTCGTAAAGATTTTTCCATCATTAACCTATTTTGTGCTCTGGCTAGATGTGATAGAAAACTTAATTCATTTTGTAAAGATAATGGATGTTTTAGTATGTTTATCTTTTTTTAACATGGATAATGTTCGAAGGTTCAGAGCAATATTTTATACTAAAAGTTCGAATTGTGCTTTCACTATTTTATTCTAACATTTTTAATTGTGCTTTATTGTATCTTATTTTTATTTTTATCCTTTTTATCACTTAAAAATTTGAAGTGTGTAGGGATATGCATCCGTCTGCAGATGGCCAGAATTAATTTCCGAACCAGAAGTTAGACATCTTTGTTCTCCCCTGCCTATTTGACCATCGAAGTTCTTTTTATGTGAATGGTTGATATTTGTATGGGGGCATTGAAAAGATTTTAAGATGGAGAAGAGAGTTAGGAGCTCTCCTACCCTCCCTATCTCAACATATTGGAATATTAATCAAATGTTTGCCAACCTCCCCGAGCCTCCTAACCCGCACCACTTAAACCTCTTTCGGTACCATTAGAAAATTTACTTCTTTCCAACCATTTCACCATTTCAAACCCTAATTGTCCCGTATTATATTACACAATTTTTAGGATATACAAGGGAAGAGCTTACCAAGTAGGGACTTTGCATTGCAATATAAAAGAGAGGATATCTTGAGATAGCCCTTTGAGAGCCTTCTCATAGTTATCATTTCCAAAAATTATGCTTTTGCGCCAAACTTCAAAATGATTTTGTGCTTTGCAAAATGATTAAGCTGTGATGAAATAGCATTGTTAGTGGGTACCTCCTAGACATGCAACAACAACTCTTTAACACATCCCCAAATAGAGATTGTGAACACCTAAATTCAAGAGGGGTACATGAATGCATCGAGACACATCATCATCTAAATAAGAGGTATCTTGAGAATATGAAAGTATAGTTAAGATGGACTTTAAAGAATTGAAAGTTACTATCTATGCTAATAAGATGCATATTCCTTTTTAGTGGCCCAATCATAGGAATTCCAAAGTTAAATAGGCTTAGTGTCACGAATGGTGTAGTGGTGTATGCGCATAACGGGTGTGCGGGAGGTATGCGGAAGTGTGCATTGGTTTGCATGTGTGTAAAGATACTACAGATGTATCTTAAGACATTGAATTTCCTCAAAAATTACAAAATGGAAAATATGAAATTACTCACAGAAACTTGATCACAGATGATCAATCAGCCAAAACACAAGAAAAAAAAAAAAACTTACTAAAGTAATTTCTAAACCAGAAAACGCAACAATGAACAATGATCAACAAAATACAATGAAAAACGAAGATCAAACAATAGAACCTGGACCCTCCGCTTTCCTTCCCACGCAAGGAGGATTGCAGCCTCTTCCCTTCTCCAGAAAATATCTTTGATACCCCCCTCCTTTCTCTTTCATCCTCTTTTATTCTATTTTGCTAACTAACTACCGATCCCCACTGAATGGTCCCCAACTTCCTTCCTCTCCTAAACTCCCACATGTGGCTCTATTATTTTCTTTATTTCTTCTGCTGTATTTAAACAATATTTGGGGGCCTAGCAGTGTGGTTGGCACTCATGGGCCCGTGGCTTGGGGACTGCCTTTGGTTACATGTGGTAAAAAGTCGCTGTTGCTAGAATTATGGTTTGAGAGAACCAAAGGCTAAAGGTATTCCATGATAAATATTTTGCTTGGTTGGATTGCTTTGAAGTTGCTCGTAAGAATACCTCCTCGTGGTGTTCCTTCTCCAAGCCTTTTGAGAGCTACAACATTCAAGAAATGTACTTTGGAGAGTTTATATTTTCCCAGCTTAATCTACTTGTTTTGAGTTAACTTCTTTTTTGTGCTTTTTGATATAGGTCTTTTGTAGGTTTCAATGTTGAAACCTTTGTAAGGCTAGTGATTTATAGTCTTTTTGTCCTTTTTGTAATGGCTGAATATATAAACCTTGGTCGAGATTTTTTATGTTTGTTTGAAGGATATGATAAGGGTGCTAAGGGGGTGTCAACCTAGTTGGGATGTTTGGGTGTGCATGCTGATCCTGTTTATGCTTTTTGTATAACCCTCGTGTACTTAAAGCATTAGTCCTTTTTAATTTATATCCATATGAATAAAGCGACTCGTTTCTTTTAGTTTGTGTGTTTTGGTGCACTTGTTTTTTTGTATTCCCTTATATTCTTTCTTAATGAAAGTTGTTTCTATAAAAAAATGTCCAACC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MKVVALVSGGKDSCFAMMKSIQYGHEIVALANLMPADDSVDELDSYMYQTVGHQIIVSYAECMGIPLFRRRIQGSTRHQKLNYRITPGDEVEDMYILLNEVKKQLPSVMAVSSGAIASDYQRLRVESVCSRLGLVSLAYLWKQDQSLLLHEMINNGILAITVKVAAMGLDPVKHLGKELTSLDSDLHKLNRLYGINVCGEGGEYETLTLDCPLFKNARIVLDKFEVVMHSSDSIAPVGILHPVSFHLKYKAKTSSLGSICDNTNLVDHEKGGLLFEIQGDCFQNCDILQSVADVSSDNHILDEVPDDRLQISCSRMQNTFLICCWLQNSCGTSPGLQDDLKTVLRKIESELLARGCGWKNVLYIHLYLADMNGFGLANETYVSFITQEKCPFGVPSRSTVELPLQQVQLGNAYIEVLVANDQTKRVLHVQSISSWAPSCIGPYSQATLHKEILYMAGQLGLDPPTMTLCSGGATQELEQALKNCEAVAECFRSSVSTSSVIFVTYCSTRIQPEERRRIEEKFHGVLEEMRHSDKASLSKLLDSIFLYVNVPNLPKGALVEVKPILYVQETLDTVEQTPHDSPRLYIPTDWGFQHEHWHKSCIQKCIVNGKVCVTVLSITNELARNISSCLLGNQITEENLELVSKFCIYLLNEILLDSAFCWEDIKNLRFYFPTSLNITLEAASIIFSRAFNELAESNPTVHVDRFFNLIPVIGAGRTPTSMDDVLTCELFAQKS* Homology
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USQ7 (Diphthine--ammonia ligase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=mug71 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 313.2 bits (801), Expect = 8.1e-84 Identity = 195/512 (38.09%), Postives = 281/512 (54.88%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RV01 (Diphthine--ammonia ligase OS=Danio rerio OX=7955 GN=dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 3.9e-78 Identity = 148/257 (57.59%), Postives = 188/257 (73.15%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7L8W6 (Diphthine--ammonia ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPH6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 280.0 bits (715), Expect = 7.6e-74 Identity = 144/255 (56.47%), Postives = 186/255 (72.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HJF5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Bos taurus OX=9913 GN=DPH6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 278.1 bits (710), Expect = 2.9e-73 Identity = 147/266 (55.26%), Postives = 188/266 (70.68%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.9e-72 Identity = 145/255 (56.86%), Postives = 181/255 (70.98%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_004152819.2 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1479 bits (3828), Expect = 0.0 Identity = 735/735 (100.00%), Postives = 735/735 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_011649008.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1464 bits (3790), Expect = 0.0 Identity = 731/735 (99.46%), Postives = 731/735 (99.46%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_008441829.1 (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1437 bits (3721), Expect = 0.0 Identity = 709/734 (96.59%), Postives = 725/734 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. NCBI nr
Match: XP_008441831.1 (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1423 bits (3683), Expect = 0.0 Identity = 705/734 (96.05%), Postives = 721/734 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. NCBI nr
Match: KAA0049946.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK07678.1 diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1386 bits (3587), Expect = 0.0 Identity = 683/708 (96.47%), Postives = 699/708 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKJ7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G075360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1479 bits (3828), Expect = 0.0 Identity = 735/735 (100.00%), Postives = 735/735 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z6 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1437 bits (3721), Expect = 0.0 Identity = 709/734 (96.59%), Postives = 725/734 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3V7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1423 bits (3683), Expect = 0.0 Identity = 705/734 (96.05%), Postives = 721/734 (98.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U6Y7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold105G00870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1386 bits (3587), Expect = 0.0 Identity = 683/708 (96.47%), Postives = 699/708 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9W6 (Diphthamide synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1300 bits (3364), Expect = 0.0 Identity = 638/735 (86.80%), Postives = 684/735 (93.06%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. TAIR 10
Match: AT3G04480.1 (endoribonucleases ) HSP 1 Score: 882.9 bits (2280), Expect = 1.8e-256 Identity = 447/741 (60.32%), Postives = 559/741 (75.44%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G007580 vs. TAIR 10
Match: AT3G20390.1 (endoribonuclease L-PSP family protein ) HSP 1 Score: 44.7 bits (104), Expect = 3.8e-04 Identity = 25/69 (36.23%), Postives = 36/69 (52.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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