CsGy1G031110 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1

Overview
NameCsGy1G031110
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionUnknown protein
LocationGy14Chr1: 29876457 .. 29880233 (-)
RNA-Seq ExpressionCsGy1G031110
SyntenyCsGy1G031110
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAAGTTAAATGTTAAGTTCGGGGCATTTTGGTCATTTCTCATTATTATTATTAATTTCTTCTTCTTCTTTCCTTTCAGTGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTATTTTTTGACCATTTCACCTCAAATTTTAGATTAGGAGTAAGTTTCATTGTTTTACTTGGATTTTTTTTTTTAGATTTTCGAATACCCATTAAAATTTTGATTGAATTAAACATTACCCATAACGTTTTAATGCTAGATTTGAGTTTTAGAAGAGTTTGAGATGCTGCCCAGCCACTCAAAAGCTCGAATTTAGGCGTTTCGGCACCACTTGGGTAAGGTTCAAAGTTTTGGGGTTGACCTTGAGTACCCATCTAATCCTCGTGATAGTATTGGTGTAATCTGGGATGGTGTATGCTTGTTTGTGAATTTAGAAAGTGGTTAGGATGTTTTCCATTGAAGTTAAAGTTACTTTGCTAAGTTCTTGTTGAGGGTCAGAGTGATTTAAGTGTGTTTTCTTCAAGTTCACAAGTGGCTATTGAGTCTAAGTGTTAAGATTAAATTACCCATAGTACTCGGGTTCTAAAGATAAATGTTAGAGGTTGAAATTGAGTTTTTCTTTAACTTGGAGTATGTTTGGGTGTTTACTTCTATGAAGTTCGAATTATAAAATGAATTTTGGTGATTTTAGGAAGTGTTTGAGTTGTTTGACTCATAGTAATATATTGAGTATAAATCCCAAGCATCATCAATAATGGAGGTAAAAGTGTATCTATATAAAAGAATCGTTGAGTTTTGAACTAAGTTAGGTTTGAGTTAAGTATCTAGATTTCGAGCCCAAGGGTTCGTATGTGGAAAGTTTAGTCTAATCCTAAGCGCTTTGTAAATTCAAAGACCTTAGAAGCATCAAATATATTTTGGTGACCTTGTGAAGTATTTTACATATAGTTGTAGCATCATGTCTTATGAAGATAACTAAGAGACCTTGATCGTTGTTTCAAGCCAATTTATTGTGGGGAAAGCGTATAACCTCGGGGGATTGAGTTATTGATTGTGAGTGGCTCATTTTTAAGTTTTCTTTGAATTTGTACATGTCATTTTATGATATCACTTGAAAACTACCATGACTTAAACTTTTTATGACTATGTGTTTCATTTATACTTAAGCAATGTGTTTACACTCATCAAAATTTTAAGAATGTGTATGGCTTGAACTTTATAAAAACGTGATATAAAGTTTCTGATTGTACTTGTTTTTTTTAAATATGATTGATCGATATGTTTATGATGAACGAGAAGGTGATTTCCCTGAGGCTATGTGAATGTCTTTTCCATAGCACCACCTACGTTGTTAGGGGGTTCCGAAGCAAAAAGAGGTTGTGATCGGAGATCCAAGAACCTGAGCCTTGATGTGGATATGGATGGAGGATTGAGATATGGCTTCAAGCCTAATTTAACACTATGAGCGAATGTGTAGATTGTTACTGTGGTGGGTACTAAGTATGGATGAGCTCAGTTTGGCAGCGTGTGTTCTTGTGGATATGAATCACGTGTGAGCTATTCTCGATCGTTATTAATAAAGTGTTATTATTGTAATTTCAGTAAATGTTATTGATTATATTTTTAGTTTTGTCTAAATAAACCAAATTCAATAAACTAACATTCTAAGTTGTTTGGTAAGTCATGAACAATATGTAGAGACATAAAGTGATTAATGTTTGAGATCAGCTTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAATGTTAGGCACCTTATTCTAGTAACACTATGAATACAACTCACTTTTGTATTTGCTACAAACACAATGATTCAAAGTGTTTGTGAATGTGACATGCGAGTGAGGGTATCTTATATAATAAGTTTGCATGAGACCAAACCACAAAATAGTAACCACTAGATGTAACTTTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCATTAGGATGACCTAGGTAACTTAGTTTTAACCCTGAGTGTATTATGAACTCCCGTTAGTGAGGAATTGTCCTTTGATTTGTACGGGTGGGAGTGGCCAGATTGTGGACTCAATATGATTTTCATTTTGGAGACAAGATTGAGTGGAGAGTTGGAAACATAATCACACAAGATGGAATTCACTCATTTCCGACTATAGGGTAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAATGGTGTCTTCGAGACTTGAACAAAGGGTTCTACCCTCTCTATGACACGAGAGGAGTTTCTATTTATTGGTGGACCATAAACATGTTGTTCATTCGAGGAGCACTAGTATTTAAAGGACTAGAGGTAATCTCAGGATAAAATGGTAATTTTAGCTAGTTGGTGTTACAAACATTCTTGAAGGATTAACTTGATATTATAATGTAAGTAAAAATCTGGAGGTCATTTGTTTAAGTCCCGGAGACACCATTTAAGAGAACATTCATCTACTTACCCTAAAGTAGGGAAAAAGTGAATTTCATCTTGTGTAATTATGTTTTTAGCTCCCCACTCAGTCTTATCCTCAAAATGATAAGCTTATTGGGTCAGCGATCTGACCACTTTCACTCATACAAATCAAAGGATAATCTCTCACGAACAAGAGCTTATAATACACTTAGGATGAAGACTAAGTTACCTAGCTCATCCTAATGAAACAGAAACCTAACTAGTTAACGGAGTTACATCTAGTAGTTACTATTTTGTGGTCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCTCACTCGTATGTCAACTACACGAACGCGTTAGATCATTGCATTTGTATCAAATACAAAGTGAGTTGTATCCATAGTGTTATCAAGATAAGGTACTCAGCCTTATCCCTATAATGTAGACTGTTTAAGCTAATTTTGAACATTGATTCATGTATGTCTCTACATACTGTTTCAGATTCATCAAACAACTTAGGATGTTAGTTTATTGGATTTAGGTTATTAAGAAAAAACTAATAATATAATCAATAATATTTATTGAAATTACAACAATAACACTTTATTAACAACGATCAATGGATTATATTTACAGTCTACGAGTTTTAGGACATAAATTCCAACACTATTCTCATCACTTAGTCGGTGCATGTCGTCAACTACCCAAGAGGGCAAGTAGCAAGGACAAGACTAATGCACAAGGATGAGTTTGGCGATAAACTCCTCCTTGGTGAGAGGACTCACATTACTTGTATCCTGAAAGGTGAGCAAGTGTGGACATGTGGTGTCGAGAGGTTCCCGTTCTTAACGTGGGGCGCTATAAGTAGTATAAATGACCACTTCTAGAATTATATCACTTTGTTAAGTTAGTCACATGGATCCTGACAGGCAATCATGTAAAGGTGTTTAATGACTCTAAAAGGAGCACGCCTTAATCATAAGATAAATAAGTAAATATATTTCGCA

mRNA sequence

ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAATGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTATTTTTTGACCATTTCACCTCAAATTTTAGATTAGGAATTTGAGTTTTAGAAGAGTTTGAGATGCTGCCCAGCCACTCAAAAGCTCGAATTTAGGCGTTTCGGCACCACTTGGGTGATTTCCCTGAGGCTATGTGAATGTCTTTTCCATAGCACCACCTACGTTGTTAGGGGGTTCCGAAGCAAAAAGAGGTTGTGATCGGAGATCCAAGAACCTGAGCCTTGATGTGGATATGGATGGAGGATTGAGATATGGCTTCAAGCCTAATTTAACACTATGAGCGAATGTGTAGATTGTTACTGTGGTGGGTACTAAGTATGGATGAGCTCAGTTTGGCAGCGTGTGTTCTTGTGGATATGAATCACGTGTGAGCTATTCTCGATCGTTATTAATAAAGTGTTATTATTGTAATTTCAGTAAATGTTATTGATTATATTTTTAGTTTTGTCTAAATAAACCAAATTCAATAAACTAACATTCTAAGTTGTTTGGTAAGTCATGAACAATATGTAGAGACATAAAGTGATTAATGTTTGAGATCAGCTTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAATGTTAGGCACCTTATTCTAGTAACACTATGAATACAACTCACTTTTGTATTTGCTACAAACACAATGATTCAAAGTGTTTGTGAATGTGACATGCGAGTGAGGGTATCTTATATAATAAGTTTGCATGAGACCAAACCACAAAATAGTAACCACTAGATGTAACTTTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCATTAGGATGACCTAGGTAACTTAGTTTTAACCCTGAGTGTATTATGAACTCCCGTTAGTGAGGAATTGTCCTTTGATTTGTACGGGTGGGAGTGGCCAGATTGTGGACTCAATATGATTTTCATTTTGGAGACAAGATTGAGTGGAGAGTTGGAAACATAATCACACAAGATGGAATTCACTCATTTCCGACTATAGGGTAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAATGGTGTCTTCGAGACTTGAACAAAGGGTTCTACCCTCTCTATGACACGAGAGGAGTTTCTATTTATTGGTGGACCATAAACATGTTGTTCATTCGAGGAGCACTAGTATTTAAAGGACTAGAGGTAATCTCAGGATAAAATGGTAATTTTAGCTAGTTGGTGTTACAAACATTCTTGAAGGATTAACTTGATATTATAATGTAAGTAAAAATCTGGAGGTCATTTGTTTAAGTCCCGGAGACACCATTTAAGAGAACATTCATCTACTTACCCTAAAGTAGGGAAAAAGTGAATTTCATCTTGTGTAATTATGTTTTTAGCTCCCCACTCAGTCTTATCCTCAAAATGATAAGCTTATTGGGTCAGCGATCTGACCACTTTCACTCATACAAATCAAAGGATAATCTCTCACGAACAAGAGCTTATAATACACTTAGGATGAAGACTAAGTTACCTAGCTCATCCTAATGAAACAGAAACCTAACTAGTTAACGGAGTTACATCTAGTAGTTACTATTTTGTGGTCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCTCACTCGTATGTCAACTACACGAACGCGTTAGATCATTGCATTTGTATCAAATACAAAGTGAGTTGTATCCATAGTGTTATCAAGATAAGGTACTCAGCCTTATCCCTATAATGTAGACTGTTTAAGCTAATTTTGAACATTGATTCATGTATGTCTCTACATACTGTTTCAGATTCATCAAACAACTTAGGATGTTAGTTTATTGGATTTAGGTTATTAAGAAAAAACTAATAATATAATCAATAATATTTATTGAAATTACAACAATAACACTTTATTAACAACGATCAATGGATTATATTTACAGTCTACGAGTTTTAGGACATAAATTCCAACACTATTCTCATCACTTAGTCGGTGCATGTCGTCAACTACCCAAGAGGGCAAGTAGCAAGGACAAGACTAATGCACAAGGATGAGTTTGGCGATAAACTCCTCCTTGGTGAGAGGACTCACATTACTTGTATCCTGAAAGGTGAGCAAGTGTGGACATGTGGTGTCGAGAGGTTCCCGTTCTTAACGTGGGGCGCTATAAGTAGTATAAATGACCACTTCTAGAATTATATCACTTTGTTAAGTTAGTCACATGGATCCTGACAGGCAATCATGTAAAGGTGTTTAATGACTCTAAAAGGAGCACGCCTTAATCATAAGATAAATAAGTAAATATATTTCGCA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAAAACTAGGCCAAAGTAGAATGAGTTATTTAAAAGAAAAAACGAGGGATAAAAGGAGTTCGGGAAACTTCACGAGTGGCAAGCGCTCATCTCTTCTCTTGGAGCCATTTGTCATTACCTCGTTCTCTCTCGATCGCCGAACACTATTTTCACTTCCCTTGCACATTAACCGCAACACACGTCGGAACAACATCACACCCAGTCGTTATGCGTTGCATTTCTCTCTCACTCTTTCACACCGACTCCACCAGTCATTGTGCACCGCTCGCCTCGCCAGACTTGGTCGCTACTCCAGTTGCGGTTTTGATCTGTCGTTCTGTCCAAGTTCTTCAAATTTTGTTGCCAGTCCAGCTACTCTAACACCCAGTCACCATTCGTCACTATTTTGGAGCTGTATCGCCATTAGCCTTGCTATTTTTTGA

Protein sequence

MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRNTRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPATLTPSHHSSLFWSCIAISLAIF*
Homology
[Close]
BLAST of CsGy1G031110 vs. NCBI nr
Match: KGN66656.1 (hypothetical protein Csa_007126 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 277 bits (708), Expect = 9.68e-94
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60
           MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN
Sbjct: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60

Query: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120
           TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT
Sbjct: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120

Query: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLAIF 141
           LTPSHHSSLFWSCIAISLA+F
Sbjct: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 141

[Close]
BLAST of CsGy1G031110 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M357 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G654850 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 277 bits (708), Expect = 4.69e-94
Identity = 140/141 (99.29%), Postives = 141/141 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60
           MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN
Sbjct: 1   MEKLGQSRMSYLKEKTRDKRSSGNFTSGKRSSLLLEPFVITSFSLDRRTLFSLPLHINRN 60

Query: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120
           TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT
Sbjct: 61  TRRNNITPSRYALHFSLTLSHRLHQSLCTARLARLGRYSSCGFDLSFCPSSSNFVASPAT 120

Query: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLAIF 141
           LTPSHHSSLFWSCIAISLA+F
Sbjct: 121 LTPSHHSSLFWSCIAISLALF 141

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsGy1G031110 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G031110 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN66656.19.68e-9499.29hypothetical protein Csa_007126 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsGy1G031110 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0M3574.69e-9499.29Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G654850 PE=4 SV=1[more]
BLAST of CsGy1G031110 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..24
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..26

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G031110.2CsGy1G031110.2mRNA