CsGy1G004680 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCTCCAACCGCTGCATGAACACGTCTTGCCCAGCCCCCACCTCCCTACACTGGACCAAAGGATGGCCTCTGGGATCCGCCGGATTCGCAAATCTCTGCCTTAACTGCGGGTATTTTCCCTTCTATTTCTTCATTTGATTTTCCCACCCCAGTTTCCTTAAATGCATTCCTTTCTTTCCCTTTTCCCTCTACCCATCTTATATATCAAAATTCCTAATATTGCCCTTCCCCCTTTAACTATCTTTTCATTTACCGAAAATTACTCGCATCCTCCTATCCAAAATTTCCAATTAATTAACTAGGTCATTTAGATTTATCAATTGGTGAATATTCGTTATGACTACTTTGAGTTGAGCTTGTACTACTTAATGTCCAATTTGAGTGTGTGAAGCATAAGATGTTCCATCCACATTGACCGATTAGATGAGAGTTTAATTTCAAAGTTTGGATTATGCCTCCACATTCTCTCTGGAAAATGGGTTGCTCAAAGGGCAGGATTGACAAGGAAAGTTTATACATGCATACACATAGAATTTAATTTCCTATTTCTTTTTAATAGTTATAATTAAAGAAAATATTCTCTTTTCTAGTTTCTATTCATTGCTGTCGAGAATTCTATTAAAGAATTTAAGAAGCGTGTATAACAGAGTTTCATACGGTGCAGAGGATTTTTCATTTCCTTTTATTACCACCCATACAGTTTAATCTCTTCATGTGAATCTCGCTATACATATTGAAGCTTAATTTCTCTCAGTTAATACTGATGTTTGTAATTTTGTTAGCTTTAGAGGGCAACATGTTTGTTTTCTTTTATTTTAATTTCTTTTTAAATCACTTTTTTTGTTTTGGGCTACTTTTTTACCCAGTTTATTTAGTTCCGTAGGCTGTTTAGGCTTTTATTTCATGCTACGAGGGATCTATCTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTATCATTGACAAGAAAAGATTTATATATTGTAGTGTTATGCTATATTAAAATTGATGTCACTATCTTCTGTATCTTCTAATCCTTCACTGTCCCTTCATACTGTGCGTGATTTAGATCCGCTTATGAAAATTTAGTCTTCTGTGATACATATCACTCAGAGGAAGCTGGTTGGAGGGATTGCAGTTTTTGTGGCAAGGTATGCAAATGTGCTGGTAATGACCTTTAGTTTAAATGCCTTCTCTCAGTCTCAATTTATGTGTGTGCAAGTACGTATGTAGGAATCTGTCCATGTCCAATTCTAATTGTGATCTTATATGTGAAACATTTTTTCTATTTCAGAGAATTCACTGTGGGTGTATAGTTTCTAAATCTATGTTTGAATGTCTGGATTATGGAGGTATTGGGTGCACAGGTTGTGTGAAAAGATCTCGACTTGGTGTGGTAAGATTGGTATCTGAATTAGCCAACTTCTGATTACACTTAGATTTGACATCAGTTTCTCTACCCATTTCAATGCTTCTCTTTGTTGCTTTTAGCATATTCAAATTCACATAAAATAAACTTTGAGTTGGCATGATATGGAAGGCTGCTCGTTTGTAATCAGTTATGGTTTTGATGATAAATTTATGAATGTTTTGTTAAAATGCAAACCCTTGCAGTGGAATTGTATCAGAGCATGTGGTCTAGGGAGGTCATGTGTTTAAGTCCCTACAATGTTATTTTCTCCCCAACTAAAATTGATTTTCACTTGTTGGGTGTTCATATATCAAGCCCACAAGTGAGGGAGAGTATTGAGTGATGTAATATTAAATTTGCCTTACCAATTTGCTTAAACCTTAGAGTCAATTGGTGATTTAAGAAGTTTATTCTTCACACACACACACACCTTCTTTGTGTTTTGGGTACTTCCGACCTTTGGCTCTAAGTGAAGCTGAAATTAGTACCAATCACTAGCAGAAAAGCCTGCAGGATATGCAATGTGGCTTTGTTTAAATATATAGCAACACTCGCTAGTCTAGAAGAGTCTTGAAGTATCCATAATACTTCATTAGTGTGTAAATTAGATTTCTCTAGAATTACGTTGAAAGGTGTAAATAAATATCTAAAAGAAAAAATCTAGAAATATCCTAAATTTTTTAGATTAAGAAATTCTAGAATTCTTTTAAATAAGGATGAGATGAAAAATATCTAGAATAGTTACAATTCTAGAGAAATATTTGGCTTGAGCTGCAAGGATTTCATGTCTATAAATAGAAGATGTGATCCTCATTTGTGAACCAAAGCAAAGAAAGAAAAGCAAGCAAAGTAAGCAAATAGAGGAAGAATGAAAGTAAGAGAGTTAGTGTCGAGTCATGCCCCCGTTCAAAATGTGACCTCTACGTACCAAGTATGGACATGACTTAGGCGAACCGACGTTTCGAGGTGAAACACCAGAACGTCTAAAACTTCTTGCAACTTAACCTAAACCTTAAGTGTGATCATGCTGGTGAAAGCTTCTACCATGCAGTAGGACAACATGCGATATAAAAAAAATTAGTAATCCTTTTATTAACAATCTTGTTACAACGCAAGCATACAACTTACAACATAAAGGATTACAAAACTTAAGCTAACTACTACGATGCAACACATCCAGTACTTAGCATTGCCCTCCGCTCATGTTATGCCCCGCCCCGCATGCGTTTTGAAGTTTTCCATGTGGCACGTGGTATGACTTGAGCTGTTATGACGCCTTGAATAAACGCCAGAACAATCAGCTTAAGTCTTTAACTTAATCACCTAGCAATTTTAAATTTAAACCTTAAATTTAGGCGGTAAGAAAATATTCCATAACGCAGTGGATAACAACAAAAACTTCTTTTATTAACTTTAAACCAAATGATTCAAATTTTACACTTTGCATGCTTTCTTAATACAAGAATTATAAAATAAACTTAAATGCCTTCAAGAGTCTTCCCACTTTAAACACCTTGCTTGCTCCCTCTACTCTTCTTTACTTGGCCTCAACGCCTGATCGTCTGAGGAAAGGGAAACTTAACACATAAGTCAACTACTTAGTGAGTGATAGTTTTGGAAAACCTTTTTGGGCATGCAACACATAAAATCATTTCATAAAACAAGCTTCAACGCCTTGTTTCAATAAATCATAAATCACACATTAGCCTTTCATTATTCCTTTCGCCAGGAACATGAACCATTCCCACAAAGACTACTGTGATGGCTTTTTCATCAACAGATCCCTTGGAGAATTTCGTAGTTCATTTCCATTTGCTCAGGCCGCTAAGCTCAATACATATCTTTTATGCATTGGCAAGCTTCACTCCACTATGCAGGCCTTTTCTACATGGTTGCCTTTACTCTTTATGTCCACATAATAGTCAACTCGTTGATAGGAATAAGACTAATGGTTTACAACAAACATAGCATTCAATAGAATCATCACGCATAAATTCTTACTTTAAGCATAACACGAAAATTTTCTTTATAAACATTACCATAAGAAACAACATTACAATCGAAAGGAAGCTTTTAAAATCTTTAACAACAACTGTCACTCTTGTCAGATGCGTGGGCCCACGTGCCTCTGCCGTTTTGCCTCACCGCCCATCCCAATCCCTTCTACTCGTCGTCGGCTGTCCAACGGTTATAGCCTGCCGGTCAATCGCAGCTCCACACGCCGCCCATGCCCTCTGATTATGGACAGCCACCACAAAAACTTTCAGATCTGTTTGTTCTCGATGTTGATCCTTTACAACAACTCTTTATCTATAATAACAGGACTGATGGTATCCATAATAGATCGGGGGTTGAAGCGGACGAGTCTTCGACACATTCCAAACCAACTGAGTTGCCGATATATTTCAAGAACCCGATAATTTCGCTTCCTAATGTGCCTTCGAATTATATAACTAACTCTGCTGCCTTTAGTGCTTGATTCTCGACCCATGATAATGAGAAGAATAGTGGAAAAACAATCCTCGTTTGTGAGCACTCTAAGAAACAACGACACATCAACAATTAGTGTTGGAAACTCTACGGTCGTTCCCCAGGAAGTAATAAACAATGTTCCTCCAACGAGCAACAGAACTCAGTGCGTGCCGATGTTAGGGAGACTGGCAGCACCTCTCAATCCACTGGCCCTATAGCTATCCAAACCAACCCTATTGCTAGCCAGACCAACCCTCATACTCTAAGCATCATTGCTCAGTCAGGTATGCCTTAGTCCCTTGACCCTATTAGCGTTGATGGGAAACATCCCTGGATTTTGGACTTGGGAGCCACAGATCACTTGACAGGTTTTTCGGAGCACTTCATCTCTTATACCCCTTGTGCCGGTTGTTAGAATTAGTGGGCTTCCTTAGAGTATTTTTGGAAAGAATATGGAAGATTTTTCCTATTTCCTAAATCTTTTCCTTTTTTCTCCTTATTGTATTCTGTTTATTCTCCCTCTTTGTACCTATTGTATTCATTCATCAGAAAAATAATAAAAACTAAAAACATTGGTTTTTCTCCCGGTTGTCGGGTTTCCACGTAAGTCTTGGTTTCACTTTTATTGCTTTCAAGATGGTATCAGAGCAAAGCAACAACGAAACTCTAGTAAACAGTTTAGGAAAAACCCAGATTGAACCGGAGGCTGCCGCTGGAATCGCTGCCGCCGCCGCCATTGAAAAACTATTCCAAAGGATTCAAATGTCGTCTCTCTATCGAATGGGTCAACCCTCACCGTCATCTGCACAACTATTTTGCCAGAAACCATTTCACCACCGCCTCTGTCAGGTGTGTGGGACCACCGCAGTTGCCCTTTCATCCCACCGCTCAGCCCAACCTCTTCTACGTCCAGTCGTTTATCCAACCAGCCTACCCTTTTGGTCATCTGCCGCCACACGTGTGCCCATCGCTGCCAGACAACAACCTGCAAAACTGTTAAATCTGTACAGCAATGCAAGTCTGTCCCTCGACCCTTTATAGCAACCTTTCTTCTATGGGAACGAGGCTGACTAACTCCATAATAGATAAGGGATTGAAGCGGGTGAGTCATCGGCACCCT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BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Z3U3 (B3 domain-containing protein Os07g0679700 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os07g0679700 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 753.4 bits (1944), Expect = 2.8e-216 Identity = 433/917 (47.22%), Postives = 562/917 (61.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4L5 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 3.1e-207 Identity = 398/814 (48.89%), Postives = 508/814 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5CCK4 (B3 domain-containing transcription repressor VAL2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 1.7e-197 Identity = 394/845 (46.63%), Postives = 501/845 (59.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0D5G4 (B3 domain-containing protein Os07g0563300 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os07g0563300 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 572.8 bits (1475), Expect = 6.7e-162 Identity = 373/892 (41.82%), Postives = 484/892 (54.26%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65420 (B3 domain-containing transcription factor VAL3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAL3 PE=4 SV=3) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 1.6e-86 Identity = 270/869 (31.07%), Postives = 379/869 (43.61%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. NCBI nr
Match: XP_031739529.1 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8652484.1 hypothetical protein Csa_013127 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1753 bits (4540), Expect = 0.0 Identity = 868/868 (100.00%), Postives = 868/868 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. NCBI nr
Match: XP_008457292.1 (PREDICTED: B3 domain-containing transcription repressor VAL1-like isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1698 bits (4398), Expect = 0.0 Identity = 839/868 (96.66%), Postives = 853/868 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. NCBI nr
Match: XP_008457290.1 (PREDICTED: B3 domain-containing transcription repressor VAL1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1686 bits (4365), Expect = 0.0 Identity = 839/890 (94.27%), Postives = 853/890 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. NCBI nr
Match: XP_008457289.1 (PREDICTED: B3 domain-containing transcription repressor VAL2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1680 bits (4352), Expect = 0.0 Identity = 839/903 (92.91%), Postives = 853/903 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. NCBI nr
Match: XP_031739531.1 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1662 bits (4304), Expect = 0.0 Identity = 834/868 (96.08%), Postives = 834/868 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5U6 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1-like isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1698 bits (4398), Expect = 0.0 Identity = 839/868 (96.66%), Postives = 853/868 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C585 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1686 bits (4365), Expect = 0.0 Identity = 839/890 (94.27%), Postives = 853/890 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Q5 (B3 domain-containing transcription repressor VAL2-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1680 bits (4352), Expect = 0.0 Identity = 839/903 (92.91%), Postives = 853/903 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GA64 (B3 domain-containing transcription repressor VAL1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452346 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1523 bits (3943), Expect = 0.0 Identity = 763/868 (87.90%), Postives = 800/868 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C6F8 (B3 domain-containing protein Os07g0679700-like isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497016 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1514 bits (3919), Expect = 0.0 Identity = 766/827 (92.62%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. TAIR 10
Match: AT2G30470.1 (high-level expression of sugar-inducible gene 2 ) HSP 1 Score: 723.4 bits (1866), Expect = 2.2e-208 Identity = 398/814 (48.89%), Postives = 508/814 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. TAIR 10
Match: AT4G32010.1 (HSI2-like 1 ) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 1.2e-198 Identity = 394/845 (46.63%), Postives = 501/845 (59.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. TAIR 10
Match: AT4G21550.1 (VP1/ABI3-like 3 ) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 1.1e-87 Identity = 270/869 (31.07%), Postives = 379/869 (43.61%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. TAIR 10
Match: AT3G26790.1 (AP2/B3-like transcriptional factor family protein ) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 8.4e-19 Identity = 43/109 (39.45%), Postives = 67/109 (61.47%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy1G004680 vs. TAIR 10
Match: AT3G24650.1 (AP2/B3-like transcriptional factor family protein ) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 5.1e-16 Identity = 46/138 (33.33%), Postives = 72/138 (52.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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