CsGy1G003530 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1

Overview
NameCsGy1G003530
Typegene
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. Gy14 (Cucumber (Gy14) v2.1)
DescriptionUnknown protein
LocationGy14Chr1: 2223213 .. 2230192 (-)
RNA-Seq ExpressionCsGy1G003530
SyntenyCsGy1G003530
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGTGTGTTTGGTATTTTTGAAGTTTGTAATTCAAAGTCTAAAATTTGAAAACATTTCTGGCCAATGTTGGTTGTATTGGACTGTTATAGAATATGAGGTGTAATATAATTCAAATTTTATGTTTTTGATTGAATGTTATAAGCTTCAATTATAATATTAATTAAACATAATTTGTTCAACAATCTAACTTATTTGTCCACCTTTCATGATTTCATCTTTGTTGTGTCTTCCATCATGATTTTGCATAATTTTGATTACATTTGTGTTATTAAAACACACCCTTTTTATGAATTTTGAATGTGTATATATTTTGAATTTAAGATTTTATAATGTAAAACTAGATTATAATAAGATAAACGCGATTAAGAAACACAATATCTCGTGTTGTAGGCTAAGTTTAATTTTTTTTTATAATACTCGAAGCACTCATCTCTATGATTTACCATCTTATATTATTCATACAAAAAAAATATTTAAAAAGGAAACAAAGATTAAATTAACACGTGACAAACTATACATATAAATGAACAATTTAGTGATATGCACTAAATATGGAGGATGCTTGAGATGTGTACATGAATATTTGAGTTCAAACATGTATACATTTCAAACAATTGTTTAAACTAAAATCCAACTTTTCAAATCTATTATCGATCACATGTATTTTGAAAACATGAAATACAATCCTTGTACTGAATATTCAACCTTTTTTTAATCCCCCACACACATCCAAATTAGGTTTACTCTATACACATCCAGATTTCTTGATAGAAAGTCCACAGTAATCAGATTAACTTAATGGAAATATACGAACAAAATCACTCTCTACATATTTGAAGACCATCCAGTCTCAGTCAAGAGATGGGAAGTTGGAAATCAAAGCCATATAGAACTCTAGGGTAGAGTTGATATGATCCATGCAAAGTGGTGAAAGGAACAAATTAAGGAGAGAAACGAAATCACGCAAACCCATCAATCTTAGATATTACACTGACGCACCCTATACACAATTCTACAGTTACCAATAACCCTCTCTATCTCTCTTCTTTTCTAATTAATTTCCATGTCCTTTTTTTCTTTCAATTTTTTCAAACAACCCCCTTCACTTTTCATTATTTAAAACCTACCCCCTCCCACTCCTTTTCCTTTACTGCTTTCTTCCCCTTATCTTCTTCCTCCCACCACTTTTTTAATTTAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGGTTTTATTCTAATTCTCATAGCCATATATTACATAAAGTACTTACTCTTAATTATTGTATATACTGGGGTTTCTTGTTCTTGCACTGTGACATAAATTCATGCATCTTTCTCACATATTTTTCAAATGATTATTATGGTTTTCTTGTTTTTAATTGTTTTTTTTTAACACATGCAGTGTTGAATTGATTTGATATGCACAAATTAATCACATTTATTAAGACTTTTGCAAATTGGATTTAGAAAACCACAAGTTAACTATTGATTTATATTTCTTTGATTTCTTTTTCCTTTTTACTCTAACCTGCTTATTGACTTGAATAAGCAAAAATAATTACAAATTATAAACATGTGTTGTTATAAGAATAAAGGTTATTTGTTGTGTGACAGTAAGAATTTAAACAGATAGCTCAAACTCGAACTTGAGTATCATCAAATTATGTTTTATGTTGGTGTGGGATGATTTTAAAAAGTTGTATTTCTTCAGGCTTAACCTTTAATATATTTGGGGATTAATTAAGTTGATTTAAACACTCACCCATTTTAAATAAAACCTTCTGTTCAAACCATACATGATGATCATTTAACATTGGTTAGTGGGGATCATATGAAAATGGTAAATGATTTCTAATTATTTCTCCCAAGTTTCCTCTTTTTGTGCATTACTGTGCAAAATCTTCTATTTTTCTTCAATCATTCTCTCCACTTTCATTTTTAAGGTTCATTGAATTGGATCAAAAACTTATTATATGTTTACTATTTTTTTCAAACAAAATTAAGTCAATCATATTTCTTTTGATTGTAATCTTTGATTTTGATTCATCCAAAATTCATGTTTTGGTTTCATTTCTTTCTGTCCCCTTTCATTATGTTAACTCAATAATGATGGAAAGTAGGCTAATTAATTATCAACATAAACTTTCACATCACATCTAATTTATGTATTTTTTTTTATATAAAAAAACCTTTATTTGACCTCCCCCTTTCATATCCAAAATATATAATTTTGTTAGTAACATTCTTCATGAAATTTTATGTTTTTGGTACAATTTCGGGACACAAATTGTTGTCCATTTTACTACACGTTGTATTTTGGTATCACATATCGCAAATTCATTTATATGTTTGTTCATTCTACACTTTAGAAATGTTTTTAAACCTACCAACAATACTGAGTTTTAAATAATTTAAAATATCCCAAGTTTTATATTTTTACCCCTAAAAAGGAACATTGTATTAAAAAAAACATATGAAATTTCCTATCAATATTTAACTATATTGATGGGGAAAAATCCTAATATTTGGCTTAGAGAAAAATTATCCCAATAAACCCCATTAAGTTTTTGGCACATAATTAAGGAATGAGTAATGTTTATGAGCAAAAGAATTTAAAAAATTAACAGTAAACATTGATAAATTAGTCCGACGGGATAATATATACCAAGATAAATGACTAGAAAATGAAAAAAATATATATGTAAATTTGTTTTCTTATTTTTCCATCAATGAGCAAAATATAATATATGAAAAAGTTAAAAATGTGGTAACTCTTTAGGGCAGAGAAAGAAAAGAGATATTTGGTTGGCTCCTAAAAAAATATGGTTATCATCCTCAAATTTAATTTTTCATAAAAAAAAAATGCTTAGATAGTATATTAATAATTTTTGGATAAGACAGTATACTATTTAAATACATTTTCTATATTTTGAATAGAATATGCTTTTAAAAATAACAATATATTAGAGATATCGTTATAGTTTAAGATGAGCTAAAAATACATAAATCAAAATGAAAAAAGAAAAAAGTATTTATACTTAAAATTACTTCATACTACATTTCAAAAATTTGGCAAATTATAACCTGCATGGAACATGTATGTGCCTTAACACAAGTTTTTCGCATATATATATATGTAACCTTTTTAACGTATAGTTCGACTAACATGAAAACTATATTATTAACTTTCATATGGAAGAATCAATTTTTTGAAAAGAAAAAGAAAAAATCAATGGTTTCATACGAAGGGAAGCACAAACCTTAGAAACCCGCATGGAAGGGAAGTTAAAGGCAGCATGGGTTGTGTGGTGCAGCCATATGATAATGTAAAATGCTTTAATTTCGCCCACAATCTTTGATTCAATGTAAGCAGTCAATTATTGTCCAAACCCACACTTATATTATATTGTCATTTTCTTTGTTCATTCCTCTTTCATCCATAAGCATGTGAATTGATTTTTCTTTTTGGGGAAAATGCTTTTTGTTTTGTCTCAATATTTTGGTTTTTAAATTTGAAAATGTTACATATTGTTTCAATTCAATTTAATCAGCCTGTTAGTTTAAAAACATTGAACAATTTACCTGAAAATTTTGTTTAAATTTGGTCTCTAATTAAATACTCACTTTTAGTTATTGTTGTTAATTAGTTTAAAATAATTATAATGTGAAATTTTAAATTTAATTTTAACAATGATAAAAAAAACAATGAAACTTGATTAATTATGATTATTTTAAATAAATTAACAAATATTAATAAGAGTAAGGATGAAAAGTGAAAAATCAAGCTTAAAAGTTCAAAGAAATGTGTAGACAAAAATTCAAACTTTAATAGTAAAATTGTAGTATGGTGAAATCCCATATGGACTATTAATTAGCCATCCATTTGTTCAACTAAGTTATCAACTCAATACCTTGTACACATAAATTTGATTAAAGATAATTTAAGTGTGTTTTGGAGAGGTTAAGAATATAAGATTATCATTTCAATGAAACAATTAATAATAGTAATAACAAGAAATATTTTTAAATGGGTGAAGTGAAAAAGAACAAATAAATAAAAAAAAAAGAGGGTTTATTTTTAACTTTTACTTTACCAAAATGATGGGAATATGCTCTTTTGCATTTTAGAGGAAAGATAACTCTCATGTATGTTCCCCCACTTTTTCTTTCTTCTACAAAAACAGATTGTAAAAAAGAAGGAAAAAAATCTATCTCTCTTTCTCTCAATTTATTTTGAAAAACAAATAGGGTTTTCTTTGTCTTTCTACTTGCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGTAATTATTTTATTCATTTTGGAATTTATAATTAGTCAAATATATTCCATTTTATTTGTTAGAAATATACTATTATTTTTTCTGAGAAAATTATTGTTGGTCATCTTTGTTTTCTGCCTGTTTGGATATGTATTGAACAAATCGATGGCTGAGTTACATTTATATGATGATTTTTTTGTATATCTATATCTATATAACTCTCGATTTGCCATATTTTATATAGGTCATCCCCTCTATCTAAAACTTACCGTACCTATTCCTAGTCAATCATGGTTCAAACCACGATTACTACGTCTTCCAATTTAGGATCACCCCACTAATTTTGTTGACATACCTGATAACTCCAACAATACTGTAATCAAATTAGAGACACAACTCTACACCACTTTTGATAGGAGTAATACTGTTCTTCACACATCTCTACAATAGTGTGTGATGATATTGTCTCTATTTTAGAACACTGCATTCAAACAACAACGTACCGTGGTTGGAGACAGTGTTCTTAGTTATACCTTCGTCTTTTTCTTCTACAGTGCACTAACGAAA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mRNA sequence

ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGGGATCTCAGTCTGAGCTTGAAGATATATGCATAGTAGAAGTTAACATATGCTATGATTGTTGTAGGGCTCCCATGATTTTACCAAAAATTGAAAATCTCCATATGGATGCTGAAATGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTTCAATTTTCACTACGTTGATTGTGGAAGGGCAAACTCTGTATTCCCCCATTGAAGAATATGGTGATGAGGAAAAGCTTTTGTTAGTAAAAGGCAGTTGCAAAATCCAGAGGCTTACATTTGATCATTTTGGAGAGGCTTTTTCGTGGAGTTATTGCTTGAAATTTCTGCATCTTCTTCAAAGGTTCTACCATTCCCCAACTAGGGGATCTCAGTCTGAGCTTGAAGATATATGCATAGTAGAAGTTAACATATGCTATGATTGTTGTAGGGCTCCCATGATTTTACCAAAAATTGAAAATCTCCATATGGATGCTGAAATGTAA

Protein sequence

MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHLLQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM*
Homology
[Close]
BLAST of CsGy1G003530 vs. NCBI nr
Match: KAE8652456.1 (hypothetical protein Csa_013782 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 233 bits (594), Expect = 2.19e-77
Identity = 109/109 (100.00%), Postives = 109/109 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1   MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL 60
           MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL
Sbjct: 1   MFSIFTTLIVEGQTLYSPIEEYGDEEKLLLVKGSCKIQRLTFDHFGEAFSWSYCLKFLHL 60

Query: 61  LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM 109
           LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM
Sbjct: 61  LQRFYHSPTRGSQSELEDICIVEVNICYDCCRAPMILPKIENLHMDAEM 109

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CsGy1G003530 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G003530 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8652456.12.19e-77100.00hypothetical protein Csa_013782 [Cucumis sativus][more]
BLAST of CsGy1G003530 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CsGy1G003530 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CsGy1G003530.2CsGy1G003530.2mRNA