Cp4.1LG15g03640 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAGTCTTCTGCCTGAAACTTGAGGCCACAGCAGCTCACTCTCTCAGCCATGGACATCTCCTTGGCGGCAATGGACGACTCTGCAACCAGTCCCGTCAAGGCCTTGGCTTCGTTTCTAATTCGCCGCCACTCCGATCAGCTTCTTTCCATTGCTCACTCCCCTGATCCTAAGCTCCATTACCCTCTATTCGTGGAGTAAGCAATTCCATTTCCATCATTGTCTTTGTCTCTCATTCTCGTGTTTTCTCATTTTTTTCACGCGTCTTCGTTCTATTAATCAGATTCGCAGAGCTGATGGACGACGATCCACCTCTTGCTCGTCTTGTTTTCTCCCATCCGACTGAGTACTTGCGTATTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCTCATGTTTGTAATCATATAGTGTTGCAAAGCTTATTTATTCTCGTCTCATGTGTTATTGATGTTTGTTTTTGTGGTGGTGGTTGCAGAAGATCACTTTGGGTGATTCGAAAGGTTGTATAAATGGAATTAAGAAAGATTTCATCCATGTTCGCATTAATGTCGCCGGCTCCCCTCTGGAATGGCCTGGTTTGATTCTGTTTCCGAGTTTATTACTGCAATGTTGATTACTCTCCTGTTAATAGTTGTGGTTACGTTTAATTGAGTTCTTATTGTTCGCGTTATGCTTGGTTTTAGAGACTTCTCCAAGTATTGGGTCTATCAGAGTGAAGCATCGTGGAGTGCTTCTCACACTTAAAGGGACGGTAATCAGATCTGGGGCAATTAAGATGTATGAGGGGGAGAGGTGGTACATTTGCCGGAAATGCAAGCACAAGTGAGTTGAATTTTCTCAAGTTTCAAACGTCATTTGTCTACTTATCTACTTACATGCAACGCATTGCTGGTTCGAGTTTTCACCGTGTTATGATTCGGTTCTACCATCTTTGGCTCAATTGTATGATCCACTTTTTCATCCTCTCCTTTCTCGATTGTATTAATTTTGAATATTCTCAAGCTTTGCAGAGGAGATAGAAGCCTTAAGGATGTTAGAGACGTAATAGGGGAAGTTTCCAAGCTCTTAGGTTCAATTACTAATGCTAAAATTGTTGCTGAATTAATATCGACAAGCTTGAATGGGCTAGAGAACGTTCGTATACTTTTTGAAGGGAAAGAAACTCTAGTAATTTGGTATTTGGTAGCCTTGCAGTTCAGATTTACTGTAATAAATGTGATAGCTGTGAACACAATGGCCTCCTTTCCTTTCCCCCTTCCCCCTTCCACAGACTTCCATGGCCTTTCCCCTTCCCTGATCACCGTCCAGTTGGCCACCTTTCACTATGAAAGATTGTAAAAAAACATTCTCATAATATTAAAATTGCATAATAGATAAATATCACCAAACTCAATACAGCACTTTGTAGAAGCATGCACAACTTCACAATGTTGCGTTAAACTTAACTAAAAACATAATTAAAAGTTACATACTGGGAGGTTGGGAGCGAAAGAGTAAAAGAGGGTGAGTGTGGCGTGGAGAATATCAATATTTCTAGCTATTTCCTTAGAATTTTCTGACATTTTCTCTATATTACTTAACACCTCAACATTTTACTCAACATCTTGATATTTTCTCGACATCTTAGAACAATAATATAAAAACCTCTTGTTGAGATGTCGGACCTAAATGTTGCTAAGTATTTTAAACACTGGTAGCGAGATGGGTATTATTTGCTGACATACTGTGAATTCCTCTACCATCTTAAATTTAGAAGGTAAGGTTCCTGATAAGTAAAGAGGGTTAAAACTTACCCTTTTTGCTTGTTTGGCTTGGTTTTGTTTTGTTTTTCCTTTTTCTGTTTTCATTTGCATTCGGCTTCCATAGTACCTCCAGTTTTTGGTCTGAAATATCCCCATGAATAAAAAAATGCTTTGTACAATTGAATATGATGTAAAATCATTCTGCAAAAAGGCAGTACTGTGTGGTATAACTTTTTTTTTTGTCATTGATGTTTCATATTTAATAGGTAACTGAAATCTGGTGGAACATCCATTTACATGAAGTAAAAAGGATAACTTTTGTGATGAATCTAATGTATAATTTTATTCCTCCAATCCTTTTAACAATGCGCTGGATTTTGATCTTTATTTGGGCCACCCTTATATGGATGCCAAAGCTATACTGTGGGTAATTATCAACCGAGCGTTCTTTTGGGTTACATGGAAATAGAGGAATCAAAGGGGCGTTTTTTTTGGACAAAGAGCACACCTTTGAATTGTTCTTTGTTCAAGTCATTTACTATGCTATTTCTTGGGGTAAATTGTGTCACCAACATAGATTATCCATCCATTTTATAAATTGTATACATCAATGAAATTGTTTCTTATATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANCCAATTGCTGAAGATAATCTAGCATGTCCGTTTGTGCTCACCATTTCTAGATTCTTCTTATTTCTTTAACAATTACTTTGCTCTGTGAAGGTTCCCAGTATATCCCGAGCTGGAAACCAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGTCCCTCTCAGGTACTTAGTTTTCTAATTCCATGTCATTTGTTTCATTTTTATTAGTTCCACATCCCTGACAAATGATCTCATGTTTCAAATCTCCCATGCATTATGCATATAGACCAACACGTTAGCATATTGCTCCAAATGGTTCTAATAAATCCTTGGTTTAATCAACATTAAGTTGGGGTTTGTAGCTGTAATAAGCCACCTGCTACGAGGTGCCCTTCTTTCTATTTGTAGCCACTTTGTATGGGTTTAAGAGGAACTTAGTTACGGTAACAATTGAGCCTTTACTTAAGGTACACATACTAGGAGAGCTAAACTACTGGTACATGATTAGACAATAATTGTCACAGAATTTACAATCATTGCAACTATATACCAGGAAATATGGTATTGACACTAATTACAGCATGGGGTGTGACACATTATAATTGCTCAGTGTTTGGAGGGAGGAAGAGAATAACATTAGGTCCAACAACATCATTTAGCATCATGTTCTCCCACCCCTTTAACAAGGGTGTGGATCAATAACCCCAATTTTGCTCTTGAGAAGCTAAATCTTGAGCTTGCTAATGGCTTAGTGGATGATCAACCATCTGATCCATGGATTCAACATAATGATCTTCAATTTGATCATGCGCAAGTGAAACTTGATTGTAAGCGACAAGAGCATCAATTTTTATATGGTTTCTTGGAGCCTGAGTCCTTTTAGGTTCGAAAATATGTGGTTTTCCCACCCATTATTCAAGGTTTCTATTTCTTTGTGCTGGGATAATAGGGTAAAGAGCAAATGAGAAGAATTATGTTTTATGATAATGGTGAGGAACCTTAAAGGAATTCTAAAAGGAACGGATCTTTTATGATTTTGGGAATATTAAGACTAGGAAGGCTGAAATTGTGGAAAGGACTATGGCTGTAGATAGTTTGGAGGAACTTGGAGAGTTTTCATTGGATTTGAGAGAGGAGAGGGCTTTATTGAAGGGGGAGTTTGAAACCCTCATTTGGAGGGAGAACACTGGTTTGAAACAGACAAGCTTTTCTCTTAACCTCGTAAGGGGTAGGCCTAATAAGAATCTTATTGAATACCTGGAAAATGATGATGGGGTTATCTTGATGGAGAACAAGAAGATAGAGGAGGTAAATATTTACTTCTTCATTAATCCTTGTGCCTTCTACTTTCCCATTCGTGGATGGGTTAGATTGGCGCGCAATTTTGAGGAGAGAGAAGGAGCTGTTGGTAAGCCCCCTTTACCCTAACAGAGATTCAAATAGTGATTTTTGGTTTTGATAGAAATAAATCTCCAAGGCTGGATGGGTTTTCCATGGCCTTCTTTCAGGATATAGCTGGGATTGCATTAAGGAGGTTTTATGGAAGGTCTTCTAAGAGTTTTATGAAAGAGGTGTTATAGAATGCAACCATGAACGAGACTTATGTGTCTTATCCTTAAAAAGGATAAGGCAATGAAGGTGAAATATTTTCGACCCATAAGTCTAGTTTTGAGTTTATGTAAGAGCATTGCTAAGATTTTGGCTAATGGATCGAGGTAAGTCCTTCCTAGTACAATTTCTAATGATCAAGTAGCCTTTCTTTTGTTGTTGATAGGAAAATCCTAGATGAAATTCTAATTGCTAATGAAGCCATCGAGGATTAGAAGTCTAGAAAGGAGGAAGGGATTATTTTTAAGATAGATTTGGAGAAAGCTAACGATCATTTTGACTGAGAACTTGTGAATAAAGTCCTTGAAAAGAAGGGTTTTTGGTAGACATGGAGATCTTCAATTTGGAATTGGATTAGGTTGGTTGATTTCTCCATTTTTGTTGACGGAGAGATTGAGAGGTAAGATTTTTGCATCTAGAGGTCTTAGGCAATGAGACCCCATCGTGCTCTTTCTCTATCTATGTTTAATGGATGTCCTGAGCTGGTTAGTGTCGTTAGGAGAAGCTAAGGGCTGGCTCGAGGGTTTTAAGGGGGGAAGGAGTTAATCCAGCTTTCTCATCTTCAGATGGCTGGAAATCCATATGTGATGCCATTGGCTGTAGTTATCTGTAAGGAAGCTAGGGTGAAAAGCCTCAGGAATTAAATCGCTAGGAGAGTGCTAGAAACCCGTTTATGATGCCTGAAACTGATATTACTGCCTCAACCAACTCTGCACAAGCATCTATCCTTGACCAGACCAACATATTTCACAATTTGTGTCCAAGGGCATGTGAATTGATGGGAGTTAATTGAGGGCCACAAATCTGTAGATGATTTCCCATATTTGGCATTAATTTGATCAACTTTCAGAGCAAAAATTAGTTCGTCTTTTTTCCAAAAGTAAAAATAAGGACGCTTTAGGTAGGGGTGAGCCCTATTATAGAAAAAGAAACTATCACAATATTTTAATAATTACAGCAAATAAGAGAAGAATATAATAAATATTTACTAA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ATGGACATCTCCTTGGCGGCAATGGACGACTCTGCAACCAGTCCCGTCAAGGCCTTGGCTTCGTTTCTAATTCGCCGCCACTCCGATCAGCTTCTTTCCATTGCTCACTCCCCTGATCCTAAGCTCCATTACCCTCTATTCGTGGAATTCGCAGAGCTGATGGACGACGATCCACCTCTTGCTCGTCTTGTTTTCTCCCATCCGACTGAGTACTTGCGTATTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCTCATAAGATCACTTTGGGTGATTCGAAAGGTTGTATAAATGGAATTAAGAAAGATTTCATCCATGTTCGCATTAATGTCGCCGGCTCCCCTCTGGAATGGCCTGAGACTTCTCCAAGTATTGGGTCTATCAGAGTGAAGCATCGTGGAGTGCTTCTCACACTTAAAGGGACGGTAATCAGATCTGGGGCAATTAAGATGTATGAGGGGGAGAGGTGGTACATTTGCCGGAAATGCAAGCACAAGTTCCCAGTATATCCCGAGCTGGAAACCAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGTCCCTCTCAGAGGGCAAAACCATGTGAAGGGAAAAGTTTTGAGTGCTTGGAAGGTTCTGTAGTACGCCATGATTACCAAGAGATAAAAATTCAGGAGAGTACACAAGTATTGGGTGTGGGATCCATTCCTCGTGCCATTCTAGTCATTCTCAAGGATGACCTTGTTGACCTTGTTAAAGCTGGAGACGATGTTATTGTTACAGGAGTATTGAGTGCAAAGTGGTCCCCAGACATCAAAGATGTACGGTGTGACCTTGATCCAATGCTAATTGCTAATCATGTGAGAAGAACCAATGAACTGAAGGCAGAGGTTGACATCCCTGATGACATAATTATGAACTTTAGGCAGTTCTGGTCAGATTTCAAAGACACTCCTTTAAAAGGTAGAAATGCTATTCTAAGAGGTATTTGCCCTCAAGTGTTTGGACTTTTTACTGTAAAACTTGCAGTGGCTTTAACACTCATTGGAGGTGTACAACATGTGGATGTATCTGGTACCAAAGTTCGAGGAGAATCTCATCTACTGTTGGTTGGCGATCCTGGTACTGGAAAGTCACAGTTCCTGAAATTTGCTGCCAAACTGAGCAACCGGGCTGTTATTACCACTGGATTAGGAAGCACTAGCGCTGGACTGACTGTTGCTGCTGTCAAGGATGGAGGGGAATGGATGCTGGAAGCTGGGGCACTTGTACTGGCTGATGGAGGACTTTGTTGTATAGATGAAGTGGACAGCATGAGAGAACATGACAGAGCCACGATCCATGAAGCAATGGAGCAACAGACTATAAGCGTCGCAAAGGCTGGTCTTGTAACAACTCTCAGTACTAGAACGATAGTATTTGGCGCAACAAATCCTAAAGGACATTATGACCCTGAACAACCTCTCTCTGTCAATACAACACTCTCCGGACCCTTATTGAGCAGATTTGATATCGTCCTTGTGCTTTTAGATACCAAAAATCCCGAATGGGATGCAGTTGTTTCATCACATATTCTCTCCGAGTGCCAACAAGAAAAGGGAAAGCGTGATAATGATCTTTCAAGTAACTGGCCTCTTACTATGCTTCGAAGATACCTCCAATTTGTAAAAGGATACTTCAGACCGGTCCTGACCAAGGAGGCTGAACAAATTATTTCAAGCTACTATCAGCTTCAAAGAAGATCAGCAATGGATAATGCAGCCAGGACAACGGTCCGCATGCTTGAAAGTTTGATACGTTTAGCACAAGCACATGCACGGCTCATGTTTAGAAATGAGGTTACTCGGCTCGATGCCATTACGGCTATTTTGTGCATCGAATCATCCATGACGACCTCAGCTTTAGTGGATAGTGTTGGGAATGCCTTGCACTCCAATTTTACCGAGAACCCAGATGAGGAATATGCAAAGCAAGAAATTTTGATCCTTGAGAAGCTCAAGTTACTGCGAAGAGATTATTTGGAGTTAACTAAT MDISLAAMDDSATSPVKALASFLIRRHSDQLLSIAHSPDPKLHYPLFVEFAELMDDDPPLARLVFSHPTEYLRIFDDAAVWAHKITLGDSKGCINGIKKDFIHVRINVAGSPLEWPETSPSIGSIRVKHRGVLLTLKGTVIRSGAIKMYEGERWYICRKCKHKFPVYPELETRNSIQLPSFCPSQRAKPCEGKSFECLEGSVVRHDYQEIKIQESTQVLGVGSIPRAILVILKDDLVDLVKAGDDVIVTGVLSAKWSPDIKDVRCDLDPMLIANHVRRTNELKAEVDIPDDIIMNFRQFWSDFKDTPLKGRNAILRGICPQVFGLFTVKLAVALTLIGGVQHVDVSGTKVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKFAAKLSNRAVITTGLGSTSAGLTVAAVKDGGEWMLEAGALVLADGGLCCIDEVDSMREHDRATIHEAMEQQTISVAKAGLVTTLSTRTIVFGATNPKGHYDPEQPLSVNTTLSGPLLSRFDIVLVLLDTKNPEWDAVVSSHILSECQQEKGKRDNDLSSNWPLTMLRRYLQFVKGYFRPVLTKEAEQIISSYYQLQRRSAMDNAARTTVRMLESLIRLAQAHARLMFRNEVTRLDAITAILCIESSMTTSALVDSVGNALHSNFTENPDEEYAKQEILILEKLKLLRRDYLELTN Homology
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IFF3 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 989.9 bits (2558), Expect = 1.3e-287 Identity = 494/630 (78.41%), Postives = 559/630 (88.73%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8B406 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 889.4 bits (2297), Expect = 2.5e-257 Identity = 453/636 (71.23%), Postives = 523/636 (82.23%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69QA6 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MCM9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 3.6e-256 Identity = 452/636 (71.07%), Postives = 522/636 (82.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I0IUP4 (DNA helicase MCM9 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=MCM9 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 592.0 bits (1525), Expect = 8.2e-168 Identity = 327/656 (49.85%), Postives = 426/656 (64.94%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1N2W9 (DNA helicase MCM9 OS=Bos taurus OX=9913 GN=MCM9 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 588.2 bits (1515), Expect = 1.2e-166 Identity = 326/651 (50.08%), Postives = 428/651 (65.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. NCBI nr
Match: XP_023554772.1 (probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023554774.1 probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1298 bits (3360), Expect = 0.0 Identity = 655/655 (100.00%), Postives = 655/655 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. NCBI nr
Match: XP_022952900.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022952901.1 probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1293 bits (3347), Expect = 0.0 Identity = 652/655 (99.54%), Postives = 653/655 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. NCBI nr
Match: XP_022952902.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita moschata] >KAG6571851.1 putative DNA helicase MCM9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1287 bits (3330), Expect = 0.0 Identity = 651/655 (99.39%), Postives = 652/655 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. NCBI nr
Match: XP_022971956.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1284 bits (3323), Expect = 0.0 Identity = 647/655 (98.78%), Postives = 650/655 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. NCBI nr
Match: XP_022971957.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1278 bits (3306), Expect = 0.0 Identity = 646/655 (98.63%), Postives = 649/655 (99.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLI2 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1293 bits (3347), Expect = 0.0 Identity = 652/655 (99.54%), Postives = 653/655 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLN8 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1287 bits (3330), Expect = 0.0 Identity = 651/655 (99.39%), Postives = 652/655 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4M2 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1284 bits (3323), Expect = 0.0 Identity = 647/655 (98.78%), Postives = 650/655 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I3C7 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1278 bits (3306), Expect = 0.0 Identity = 646/655 (98.63%), Postives = 649/655 (99.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C107 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1231 bits (3185), Expect = 0.0 Identity = 615/655 (93.89%), Postives = 638/655 (97.40%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. TAIR 10
Match: AT2G14050.1 (minichromosome maintenance 9 ) HSP 1 Score: 989.9 bits (2558), Expect = 9.6e-289 Identity = 494/630 (78.41%), Postives = 559/630 (88.73%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. TAIR 10
Match: AT3G09660.1 (minichromosome maintenance 8 ) HSP 1 Score: 258.8 bits (660), Expect = 1.2e-68 Identity = 200/596 (33.56%), Postives = 305/596 (51.17%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.1 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 3.4e-68 Identity = 189/547 (34.55%), Postives = 290/547 (53.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.2 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 3.4e-68 Identity = 189/547 (34.55%), Postives = 290/547 (53.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cp4.1LG15g03640 vs. TAIR 10
Match: AT2G16440.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 3.4e-68 Identity = 189/607 (31.14%), Postives = 303/607 (49.92%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita pepo (Zucchini) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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